FuNGI

A0A0C3JB60

Protein Details

Accession

A0A0C3JB60

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
280-309	AEEASKAKQKEKERERFKKKPRATVDWPWS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
269-301	LRMEKKKRSADAEEASKAKQKEKERERFKKKPR

Subcellular Location(s)

nucl 12, cyto 11.5, cyto_mito 7, mito 1.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004871 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C IPR018846 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding
Pfam	View protein in Pfam PF03178 CPSF_A PF10433 MMS1_N

Amino Acid Sequences

MKVVATYYPPSSVLDSAKCTLADDDGSEFLLVAKFNRVDVYAIRPDGLHHQTGIEIWGRVRAVRTVPTQYRAISALVLTDHPEPELIFLSLTQSGTVLTVTKRLSLFERSSRPAEFFHDVLVSPFGKYAVASVYTARLRIVLLDAEGQYDKDFDAPTKELNLLSIAFVAKNTLALLHVDYQQRLQLLARDISSSDFQLSPAASLLLPPFALPEDWFSTEEHPPRLVLVPPDQDEGQDFNGAVLVVGGRKILLYDLASNDAAAHNHSKALRMEKKKRSADAEEASKAKQKEKERERFKKKPRATVDWPWSEVTALCTLDESHTKFLIGDKYGQLAMLNVDITEGFSLTLIALGEASSPTTLTYLTNQVIYLGSHYGDSQLLRISQAPVSSLNSPTLPVPSSVRTVRPAELGALGKRRATDVADGVVVNGSGSHLAELERFTNLAPIVDAVLVEIDNTGQKEIVTCSGGRNTGSLRAVRRGADFKEAAIIKGVTSVTKVWTLRQKYNDSEHTHLVVSTLGRTHVFRFDEARGRVVSSLPEMPSGFETSTCTLGVSNVMRLTKKDSSLIYDEHSSLVVQVVPKGLVLLEYNLEAGQFTRRSELPLDKINDRNILPQALSGQEVVAADINASQVILAFKYGWMLQLAIVDGQFTSQRSRQFLDEISAVSCVPLSGKSFAKHTTHIAVSFWKSDHVKIVKLLSPREAAASLSDCLIADVCASERLPAAPRSLLLHAFGINGDDKQMHPHLLVGLVDGTVVSFAYKDNALVDMKLISVGVLPLSLHPVVVNGKSGVVACGSRASVLGWEKGRLVHSPLMIKDVNAAAYVNTRTYPASVVLAGMESLVIGAVTSFEKIHVRSVPLGYDSPRCIVHCPSWKAFAIACLRMTPARVSEVEGEIFNSSVQLFNETTFEKIAQLNVKNSEDVTALHYLTVTLAGQVINFVCAGVTVYDYHEREPSQGRVILLQKSTGNNLAATQALTVTITADVKGCIYALTSVGDTIVAAVNSSLVLLRIEYANKSISLREVTVWNHNYLITTLVSYGDLLLVGDALTSVSLAKVNDSQVELVAKDYGSLWPTCAQLLDEKSLIGANSDYNMFAFRLQKTELQKLLEREGHYFVGDIINKFVPGSLGLSEVSADVPLQAQQLFFTPTGQIGVIINVDEELSLHMTALQRNLSTYFERKEGVSHSRFRAPKNNWGRSDSEASSFGFLDGDFLERFSLLMEDSRALRQVMDGQGEPERLTISPQRIQKVLERLQSMH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.29
3	0.29
4	0.3
5	0.29
6	0.27
7	0.25
8	0.22
9	0.2
10	0.17
11	0.17
12	0.16
13	0.16
14	0.15
15	0.13
16	0.12
17	0.13
18	0.12
19	0.1
20	0.16
21	0.16
22	0.17
23	0.18
24	0.18
25	0.19
26	0.21
27	0.27
28	0.28
29	0.28
30	0.28
31	0.26
32	0.27
33	0.33
34	0.35
35	0.29
36	0.23
37	0.23
38	0.23
39	0.24
40	0.25
41	0.19
42	0.16
43	0.14
44	0.18
45	0.18
46	0.19
47	0.21
48	0.22
49	0.23
50	0.28
51	0.33
52	0.38
53	0.42
54	0.45
55	0.46
56	0.43
57	0.42
58	0.38
59	0.33
60	0.24
61	0.19
62	0.17
63	0.15
64	0.15
65	0.15
66	0.15
67	0.15
68	0.14
69	0.14
70	0.13
71	0.13
72	0.15
73	0.12
74	0.1
75	0.1
76	0.13
77	0.14
78	0.14
79	0.13
80	0.1
81	0.1
82	0.1
83	0.11
84	0.11
85	0.09
86	0.15
87	0.15
88	0.19
89	0.19
90	0.21
91	0.24
92	0.29
93	0.35
94	0.38
95	0.45
96	0.46
97	0.49
98	0.49
99	0.48
100	0.42
101	0.43
102	0.38
103	0.31
104	0.28
105	0.26
106	0.24
107	0.23
108	0.25
109	0.19
110	0.15
111	0.15
112	0.13
113	0.12
114	0.11
115	0.11
116	0.11
117	0.12
118	0.12
119	0.13
120	0.18
121	0.19
122	0.2
123	0.19
124	0.16
125	0.15
126	0.15
127	0.16
128	0.11
129	0.11
130	0.14
131	0.14
132	0.16
133	0.16
134	0.15
135	0.14
136	0.13
137	0.12
138	0.11
139	0.12
140	0.11
141	0.16
142	0.17
143	0.18
144	0.2
145	0.22
146	0.2
147	0.2
148	0.2
149	0.15
150	0.14
151	0.14
152	0.12
153	0.1
154	0.1
155	0.11
156	0.09
157	0.09
158	0.09
159	0.07
160	0.07
161	0.08
162	0.11
163	0.12
164	0.18
165	0.2
166	0.21
167	0.21
168	0.23
169	0.22
170	0.21
171	0.19
172	0.19
173	0.2
174	0.22
175	0.22
176	0.2
177	0.21
178	0.22
179	0.23
180	0.19
181	0.17
182	0.15
183	0.14
184	0.15
185	0.15
186	0.13
187	0.12
188	0.12
189	0.09
190	0.1
191	0.1
192	0.09
193	0.09
194	0.08
195	0.08
196	0.08
197	0.09
198	0.08
199	0.12
200	0.15
201	0.18
202	0.19
203	0.19
204	0.22
205	0.28
206	0.32
207	0.3
208	0.27
209	0.25
210	0.26
211	0.27
212	0.26
213	0.23
214	0.25
215	0.27
216	0.28
217	0.31
218	0.29
219	0.27
220	0.26
221	0.25
222	0.21
223	0.16
224	0.14
225	0.11
226	0.12
227	0.11
228	0.09
229	0.07
230	0.06
231	0.05
232	0.05
233	0.05
234	0.05
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.06
239	0.07
240	0.1
241	0.12
242	0.15
243	0.15
244	0.14
245	0.15
246	0.14
247	0.13
248	0.13
249	0.14
250	0.12
251	0.15
252	0.16
253	0.19
254	0.22
255	0.31
256	0.38
257	0.46
258	0.56
259	0.62
260	0.72
261	0.75
262	0.76
263	0.73
264	0.7
265	0.68
266	0.65
267	0.61
268	0.56
269	0.51
270	0.48
271	0.46
272	0.42
273	0.39
274	0.39
275	0.42
276	0.48
277	0.57
278	0.66
279	0.72
280	0.81
281	0.86
282	0.89
283	0.91
284	0.92
285	0.88
286	0.88
287	0.85
288	0.83
289	0.8
290	0.8
291	0.79
292	0.73
293	0.68
294	0.58
295	0.5
296	0.42
297	0.34
298	0.26
299	0.19
300	0.14
301	0.12
302	0.11
303	0.12
304	0.13
305	0.17
306	0.17
307	0.17
308	0.17
309	0.17
310	0.17
311	0.2
312	0.23
313	0.2
314	0.2
315	0.19
316	0.2
317	0.2
318	0.2
319	0.16
320	0.12
321	0.11
322	0.09
323	0.08
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.06
328	0.06
329	0.05
330	0.04
331	0.04
332	0.04
333	0.04
334	0.05
335	0.04
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.05
340	0.04
341	0.05
342	0.04
343	0.04
344	0.05
345	0.05
346	0.06
347	0.06
348	0.08
349	0.12
350	0.12
351	0.13
352	0.13
353	0.13
354	0.13
355	0.12
356	0.12
357	0.08
358	0.08
359	0.08
360	0.08
361	0.08
362	0.09
363	0.09
364	0.08
365	0.09
366	0.09
367	0.1
368	0.11
369	0.12
370	0.12
371	0.12
372	0.12
373	0.12
374	0.14
375	0.16
376	0.15
377	0.15
378	0.14
379	0.14
380	0.14
381	0.14
382	0.12
383	0.12
384	0.13
385	0.14
386	0.18
387	0.19
388	0.21
389	0.23
390	0.25
391	0.25
392	0.24
393	0.23
394	0.19
395	0.2
396	0.21
397	0.19
398	0.21
399	0.21
400	0.2
401	0.2
402	0.2
403	0.18
404	0.17
405	0.17
406	0.14
407	0.14
408	0.14
409	0.14
410	0.13
411	0.11
412	0.1
413	0.07
414	0.05
415	0.04
416	0.04
417	0.04
418	0.04
419	0.04
420	0.04
421	0.05
422	0.07
423	0.07
424	0.07
425	0.07
426	0.07
427	0.09
428	0.09
429	0.08
430	0.07
431	0.07
432	0.07
433	0.07
434	0.07
435	0.04
436	0.04
437	0.04
438	0.04
439	0.04
440	0.03
441	0.05
442	0.05
443	0.05
444	0.05
445	0.05
446	0.06
447	0.07
448	0.09
449	0.09
450	0.09
451	0.11
452	0.13
453	0.14
454	0.13
455	0.13
456	0.13
457	0.16
458	0.18
459	0.19
460	0.19
461	0.22
462	0.24
463	0.24
464	0.26
465	0.25
466	0.25
467	0.27
468	0.25
469	0.21
470	0.25
471	0.24
472	0.21
473	0.19
474	0.17
475	0.12
476	0.14
477	0.14
478	0.08
479	0.09
480	0.09
481	0.09
482	0.13
483	0.14
484	0.15
485	0.23
486	0.28
487	0.33
488	0.38
489	0.41
490	0.41
491	0.47
492	0.51
493	0.48
494	0.46
495	0.42
496	0.38
497	0.34
498	0.29
499	0.23
500	0.17
501	0.12
502	0.09
503	0.08
504	0.07
505	0.08
506	0.09
507	0.1
508	0.14
509	0.15
510	0.15
511	0.18
512	0.2
513	0.27
514	0.27
515	0.28
516	0.23
517	0.23
518	0.22
519	0.2
520	0.17
521	0.11
522	0.13
523	0.12
524	0.13
525	0.12
526	0.12
527	0.12
528	0.13
529	0.11
530	0.09
531	0.11
532	0.1
533	0.12
534	0.11
535	0.1
536	0.08
537	0.08
538	0.11
539	0.09
540	0.09
541	0.1
542	0.12
543	0.12
544	0.12
545	0.18
546	0.18
547	0.19
548	0.2
549	0.19
550	0.21
551	0.24
552	0.24
553	0.2
554	0.19
555	0.18
556	0.16
557	0.15
558	0.11
559	0.09
560	0.08
561	0.07
562	0.06
563	0.06
564	0.06
565	0.06
566	0.06
567	0.06
568	0.05
569	0.05
570	0.05
571	0.05
572	0.05
573	0.05
574	0.05
575	0.05
576	0.05
577	0.04
578	0.05
579	0.07
580	0.08
581	0.08
582	0.1
583	0.11
584	0.13
585	0.15
586	0.18
587	0.18
588	0.23
589	0.26
590	0.27
591	0.3
592	0.29
593	0.3
594	0.27
595	0.27
596	0.22
597	0.2
598	0.16
599	0.14
600	0.13
601	0.1
602	0.1
603	0.08
604	0.06
605	0.06
606	0.06
607	0.06
608	0.05
609	0.05
610	0.04
611	0.04
612	0.04
613	0.03
614	0.03
615	0.03
616	0.03
617	0.04
618	0.04
619	0.04
620	0.04
621	0.04
622	0.05
623	0.05
624	0.05
625	0.05
626	0.05
627	0.05
628	0.06
629	0.06
630	0.06
631	0.05
632	0.05
633	0.04
634	0.05
635	0.05
636	0.05
637	0.08
638	0.11
639	0.13
640	0.15
641	0.17
642	0.18
643	0.19
644	0.19
645	0.18
646	0.16
647	0.14
648	0.12
649	0.11
650	0.1
651	0.08
652	0.07
653	0.05
654	0.05
655	0.05
656	0.06
657	0.09
658	0.11
659	0.12
660	0.14
661	0.18
662	0.19
663	0.2
664	0.2
665	0.21
666	0.2
667	0.2
668	0.18
669	0.18
670	0.17
671	0.17
672	0.15
673	0.15
674	0.15
675	0.15
676	0.21
677	0.2
678	0.2
679	0.2
680	0.23
681	0.23
682	0.25
683	0.26
684	0.21
685	0.21
686	0.2
687	0.19
688	0.16
689	0.13
690	0.11
691	0.12
692	0.1
693	0.09
694	0.09
695	0.07
696	0.07
697	0.07
698	0.06
699	0.04
700	0.04
701	0.04
702	0.05
703	0.05
704	0.06
705	0.06
706	0.07
707	0.1
708	0.11
709	0.12
710	0.11
711	0.12
712	0.14
713	0.15
714	0.14
715	0.13
716	0.12
717	0.11
718	0.11
719	0.1
720	0.09
721	0.08
722	0.07
723	0.07
724	0.07
725	0.06
726	0.1
727	0.11
728	0.1
729	0.1
730	0.11
731	0.1
732	0.11
733	0.11
734	0.07
735	0.07
736	0.06
737	0.05
738	0.05
739	0.04
740	0.03
741	0.03
742	0.03
743	0.03
744	0.03
745	0.04
746	0.05
747	0.05
748	0.05
749	0.08
750	0.08
751	0.08
752	0.08
753	0.07
754	0.07
755	0.07
756	0.06
757	0.04
758	0.04
759	0.04
760	0.03
761	0.03
762	0.03
763	0.04
764	0.06
765	0.06
766	0.06
767	0.06
768	0.07
769	0.09
770	0.09
771	0.1
772	0.08
773	0.08
774	0.09
775	0.09
776	0.08
777	0.07
778	0.07
779	0.06
780	0.07
781	0.07
782	0.07
783	0.07
784	0.07
785	0.1
786	0.11
787	0.15
788	0.14
789	0.15
790	0.16
791	0.17
792	0.18
793	0.16
794	0.18
795	0.17
796	0.18
797	0.21
798	0.21
799	0.24
800	0.22
801	0.21
802	0.19
803	0.16
804	0.15
805	0.12
806	0.11
807	0.07
808	0.1
809	0.11
810	0.09
811	0.09
812	0.09
813	0.09
814	0.1
815	0.11
816	0.09
817	0.1
818	0.09
819	0.09
820	0.08
821	0.08
822	0.07
823	0.06
824	0.04
825	0.03
826	0.03
827	0.02
828	0.02
829	0.02
830	0.02
831	0.03
832	0.03
833	0.04
834	0.04
835	0.06
836	0.08
837	0.09
838	0.13
839	0.14
840	0.16
841	0.18
842	0.19
843	0.19
844	0.19
845	0.2
846	0.19
847	0.21
848	0.2
849	0.19
850	0.2
851	0.19
852	0.2
853	0.21
854	0.27
855	0.32
856	0.36
857	0.37
858	0.39
859	0.39
860	0.38
861	0.35
862	0.33
863	0.29
864	0.26
865	0.24
866	0.21
867	0.22
868	0.21
869	0.22
870	0.17
871	0.13
872	0.14
873	0.14
874	0.16
875	0.16
876	0.18
877	0.17
878	0.16
879	0.15
880	0.13
881	0.13
882	0.1
883	0.08
884	0.07
885	0.07
886	0.07
887	0.09
888	0.09
889	0.1
890	0.12
891	0.13
892	0.13
893	0.13
894	0.13
895	0.12
896	0.12
897	0.15
898	0.19
899	0.21
900	0.24
901	0.28
902	0.28
903	0.27
904	0.26
905	0.25
906	0.19
907	0.17
908	0.16
909	0.14
910	0.13
911	0.12
912	0.12
913	0.11
914	0.1
915	0.1
916	0.07
917	0.05
918	0.05
919	0.05
920	0.05
921	0.06
922	0.06
923	0.06
924	0.06
925	0.05
926	0.04
927	0.05
928	0.05
929	0.05
930	0.06
931	0.06
932	0.09
933	0.15
934	0.16
935	0.17
936	0.19
937	0.19
938	0.22
939	0.26
940	0.26
941	0.25
942	0.26
943	0.26
944	0.28
945	0.31
946	0.32
947	0.28
948	0.28
949	0.26
950	0.25
951	0.27
952	0.25
953	0.22
954	0.18
955	0.18
956	0.17
957	0.14
958	0.13
959	0.11
960	0.08
961	0.07
962	0.07
963	0.06
964	0.06
965	0.06
966	0.07
967	0.07
968	0.07
969	0.07
970	0.08
971	0.08
972	0.07
973	0.06
974	0.06
975	0.07
976	0.07
977	0.08
978	0.08
979	0.07
980	0.07
981	0.07
982	0.06
983	0.06
984	0.07
985	0.06
986	0.05
987	0.05
988	0.05
989	0.05
990	0.06
991	0.05
992	0.04
993	0.04
994	0.04
995	0.06
996	0.07
997	0.09
998	0.1
999	0.12
1000	0.13
1001	0.14
1002	0.15
1003	0.15
1004	0.16
1005	0.17
1006	0.17
1007	0.17
1008	0.2
1009	0.22
1010	0.3
1011	0.31
1012	0.29
1013	0.27
1014	0.26
1015	0.25
1016	0.22
1017	0.21
1018	0.12
1019	0.11
1020	0.1
1021	0.1
1022	0.1
1023	0.09
1024	0.08
1025	0.06
1026	0.06
1027	0.05
1028	0.05
1029	0.04
1030	0.04
1031	0.03
1032	0.03
1033	0.03
1034	0.03
1035	0.03
1036	0.03
1037	0.04
1038	0.06
1039	0.06
1040	0.08
1041	0.11
1042	0.12
1043	0.14
1044	0.16
1045	0.15
1046	0.15
1047	0.17
1048	0.15
1049	0.13
1050	0.13
1051	0.11
1052	0.1
1053	0.11
1054	0.11
1055	0.12
1056	0.12
1057	0.13
1058	0.15
1059	0.16
1060	0.15
1061	0.15
1062	0.14
1063	0.17
1064	0.2
1065	0.22
1066	0.19
1067	0.19
1068	0.19
1069	0.19
1070	0.18
1071	0.13
1072	0.11
1073	0.08
1074	0.1
1075	0.1
1076	0.1
1077	0.09
1078	0.11
1079	0.1
1080	0.13
1081	0.17
1082	0.16
1083	0.2
1084	0.22
1085	0.28
1086	0.32
1087	0.4
1088	0.41
1089	0.4
1090	0.44
1091	0.44
1092	0.49
1093	0.48
1094	0.44
1095	0.39
1096	0.39
1097	0.35
1098	0.31
1099	0.27
1100	0.21
1101	0.22
1102	0.23
1103	0.21
1104	0.2
1105	0.2
1106	0.2
1107	0.2
1108	0.19
1109	0.13
1110	0.11
1111	0.12
1112	0.09
1113	0.1
1114	0.1
1115	0.1
1116	0.1
1117	0.1
1118	0.09
1119	0.08
1120	0.07
1121	0.06
1122	0.06
1123	0.07
1124	0.09
1125	0.09
1126	0.09
1127	0.09
1128	0.12
1129	0.15
1130	0.14
1131	0.14
1132	0.13
1133	0.13
1134	0.15
1135	0.14
1136	0.13
1137	0.1
1138	0.11
1139	0.1
1140	0.09
1141	0.09
1142	0.07
1143	0.07
1144	0.06
1145	0.06
1146	0.07
1147	0.08
1148	0.08
1149	0.08
1150	0.11
1151	0.13
1152	0.15
1153	0.18
1154	0.19
1155	0.17
1156	0.19
1157	0.21
1158	0.22
1159	0.25
1160	0.29
1161	0.29
1162	0.29
1163	0.3
1164	0.29
1165	0.31
1166	0.33
1167	0.38
1168	0.38
1169	0.42
1170	0.45
1171	0.53
1172	0.56
1173	0.59
1174	0.63
1175	0.59
1176	0.63
1177	0.67
1178	0.72
1179	0.68
1180	0.68
1181	0.66
1182	0.61
1183	0.63
1184	0.54
1185	0.46
1186	0.39
1187	0.35
1188	0.32
1189	0.29
1190	0.23
1191	0.16
1192	0.14
1193	0.12
1194	0.1
1195	0.12
1196	0.1
1197	0.1
1198	0.11
1199	0.1
1200	0.1
1201	0.09
1202	0.1
1203	0.08
1204	0.1
1205	0.12
1206	0.13
1207	0.15
1208	0.18
1209	0.19
1210	0.19
1211	0.18
1212	0.17
1213	0.22
1214	0.24
1215	0.26
1216	0.25
1217	0.25
1218	0.29
1219	0.3
1220	0.29
1221	0.23
1222	0.2
1223	0.16
1224	0.21
1225	0.25
1226	0.28
1227	0.33
1228	0.39
1229	0.42
1230	0.43
1231	0.46
1232	0.48
1233	0.52
1234	0.53
1235	0.53

A0A0C3JB60

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer