Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3PHT8

Protein Details
Accession A0A0C3PHT8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-40LGDDRPRKKTRTSLKRKSTKSTQRTAEPRLFHydrophilic
787-806IEQRNRPKEPPKKPEQAPFFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-27PRKKTRTSLKRKS
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 10, cyto 5, plas 4, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011044  Quino_amine_DH_bsu  
IPR011047  Quinoprotein_ADH-like_supfam  
IPR007319  SSU_processome_Utp21  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04192  Utp21  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MAAPTEPDVLGDDRPRKKTRTSLKRKSTKSTQRTAEPRLFAPFRALGLITNHIPFYVQTRSHKGATDGPRIHILTCLGKSWALWEGGKMTLLFLTGQEVEDPISCVAMDGDAVWCASGMHAIKYLRGKEVFRVTNPLGSILSSLILFGSHLLALTEDGTRMLIWDVSTDGPSFFATIQFDIGFTAVQMLHPATYLNKVLVASREGNMQLWNIRTQTCIHAISTSKLLTVAGSNPHPTPIVTLSQSPAIDVVGVGFMSGEIYVYDIRADERLMRMYMEGGGVRALSFRSDGFPVLASVSSSGHLALWDLNSGGRLLHLVRGAHDGGITSAEWVPGQPVLITSGEDNSIKQWLFDSPTAAPRLLKFRAGHHSPPHLIRYYGEDGKQLLTASTDRSLRYTSVVRDSRSFELSQGSLARKATTLSKSLSSLKFPPVTSISFSTTRSKDWDDVLTAHVDEPLVRSWSVPNKRLGKHTWSYAESSKRNARSGSVKCVCVTACGNFGIAGSSTGEIHMWNMQSGIKRRVFKIGPCPQTASEPPGAKGETKTSGRAITGLATDSLNRVVIASTWDGTINFFDFHTANLQHTLTLSTPISSINLHHNSGLLAAICDDMTVRVIDIETRRVVRELVCGSKGRVLDIARRSLCAFSPDSRWIVITSLDSIIRTFDIPTCRLIDAFRVPSVATSIAFSPTGDFLATAHVDSVGIFLWANRAQFAEAGFRSVSEEDLAEVPMPSMQGEVEDETLEALTALTVEDKPVDIFSTPSQLDGDLVTLTLLPRSRWQTLLNLEVIEQRNRPKEPPKKPEQAPFFLPTLPGVEHRFAIDQKQSDTNEKKTRLDKAMAKSKSVFQKKLAGLEKKGQQNDLFDYIKSLSPAAIDVELRSLVTLHHHRQFLRALKQRLLSHRDFEAVQTLQNVFLRLHGDVLVENAELQSELEDLLELQKKESTRILELLSSSLGTLAFVRETM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.53
3 0.55
4 0.6
5 0.66
6 0.69
7 0.72
8 0.75
9 0.78
10 0.83
11 0.89
12 0.89
13 0.89
14 0.89
15 0.88
16 0.86
17 0.85
18 0.81
19 0.81
20 0.83
21 0.81
22 0.78
23 0.71
24 0.64
25 0.63
26 0.57
27 0.47
28 0.45
29 0.38
30 0.31
31 0.29
32 0.27
33 0.21
34 0.23
35 0.26
36 0.23
37 0.23
38 0.22
39 0.19
40 0.2
41 0.17
42 0.19
43 0.22
44 0.26
45 0.3
46 0.38
47 0.43
48 0.45
49 0.47
50 0.46
51 0.47
52 0.5
53 0.54
54 0.49
55 0.47
56 0.51
57 0.49
58 0.46
59 0.39
60 0.34
61 0.3
62 0.28
63 0.27
64 0.23
65 0.22
66 0.22
67 0.21
68 0.22
69 0.19
70 0.18
71 0.18
72 0.19
73 0.19
74 0.21
75 0.18
76 0.15
77 0.12
78 0.12
79 0.11
80 0.09
81 0.11
82 0.11
83 0.11
84 0.11
85 0.11
86 0.11
87 0.11
88 0.13
89 0.1
90 0.09
91 0.09
92 0.09
93 0.08
94 0.07
95 0.07
96 0.05
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.1
105 0.1
106 0.11
107 0.16
108 0.16
109 0.21
110 0.27
111 0.29
112 0.31
113 0.34
114 0.34
115 0.36
116 0.46
117 0.46
118 0.42
119 0.47
120 0.42
121 0.42
122 0.41
123 0.36
124 0.27
125 0.22
126 0.21
127 0.14
128 0.13
129 0.09
130 0.08
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.06
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.06
140 0.06
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.08
149 0.07
150 0.07
151 0.08
152 0.09
153 0.1
154 0.11
155 0.11
156 0.1
157 0.1
158 0.1
159 0.11
160 0.09
161 0.1
162 0.11
163 0.11
164 0.12
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.11
169 0.08
170 0.06
171 0.08
172 0.06
173 0.06
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.09
179 0.08
180 0.11
181 0.12
182 0.11
183 0.12
184 0.12
185 0.14
186 0.16
187 0.18
188 0.17
189 0.17
190 0.19
191 0.18
192 0.19
193 0.18
194 0.18
195 0.17
196 0.17
197 0.19
198 0.18
199 0.18
200 0.18
201 0.19
202 0.21
203 0.23
204 0.22
205 0.2
206 0.22
207 0.23
208 0.24
209 0.25
210 0.21
211 0.17
212 0.16
213 0.15
214 0.12
215 0.12
216 0.13
217 0.13
218 0.15
219 0.17
220 0.17
221 0.19
222 0.19
223 0.17
224 0.17
225 0.16
226 0.17
227 0.16
228 0.18
229 0.18
230 0.21
231 0.21
232 0.18
233 0.15
234 0.12
235 0.1
236 0.09
237 0.08
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.03
243 0.04
244 0.04
245 0.03
246 0.03
247 0.04
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.06
253 0.07
254 0.08
255 0.08
256 0.1
257 0.13
258 0.13
259 0.13
260 0.13
261 0.13
262 0.13
263 0.12
264 0.1
265 0.08
266 0.08
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.07
274 0.08
275 0.09
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.05
300 0.06
301 0.06
302 0.08
303 0.11
304 0.1
305 0.12
306 0.15
307 0.15
308 0.14
309 0.14
310 0.11
311 0.09
312 0.1
313 0.09
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.06
321 0.07
322 0.05
323 0.05
324 0.07
325 0.07
326 0.08
327 0.07
328 0.08
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.08
333 0.11
334 0.11
335 0.1
336 0.1
337 0.11
338 0.14
339 0.15
340 0.17
341 0.15
342 0.19
343 0.21
344 0.2
345 0.19
346 0.17
347 0.23
348 0.21
349 0.25
350 0.22
351 0.25
352 0.33
353 0.37
354 0.41
355 0.39
356 0.44
357 0.41
358 0.43
359 0.42
360 0.35
361 0.3
362 0.26
363 0.27
364 0.27
365 0.27
366 0.25
367 0.22
368 0.22
369 0.22
370 0.22
371 0.16
372 0.11
373 0.09
374 0.09
375 0.1
376 0.12
377 0.13
378 0.12
379 0.14
380 0.15
381 0.14
382 0.16
383 0.17
384 0.17
385 0.24
386 0.27
387 0.27
388 0.29
389 0.32
390 0.32
391 0.31
392 0.29
393 0.21
394 0.2
395 0.18
396 0.17
397 0.17
398 0.15
399 0.15
400 0.15
401 0.15
402 0.13
403 0.14
404 0.17
405 0.16
406 0.17
407 0.17
408 0.18
409 0.2
410 0.25
411 0.25
412 0.23
413 0.23
414 0.25
415 0.27
416 0.25
417 0.26
418 0.23
419 0.23
420 0.22
421 0.22
422 0.21
423 0.2
424 0.22
425 0.25
426 0.23
427 0.23
428 0.24
429 0.24
430 0.22
431 0.22
432 0.22
433 0.17
434 0.17
435 0.17
436 0.15
437 0.13
438 0.11
439 0.1
440 0.08
441 0.07
442 0.07
443 0.07
444 0.08
445 0.08
446 0.08
447 0.1
448 0.19
449 0.24
450 0.27
451 0.32
452 0.38
453 0.4
454 0.45
455 0.46
456 0.44
457 0.41
458 0.41
459 0.38
460 0.33
461 0.34
462 0.34
463 0.37
464 0.31
465 0.34
466 0.36
467 0.35
468 0.35
469 0.32
470 0.3
471 0.32
472 0.34
473 0.39
474 0.36
475 0.34
476 0.33
477 0.34
478 0.31
479 0.24
480 0.23
481 0.14
482 0.12
483 0.11
484 0.11
485 0.1
486 0.1
487 0.08
488 0.07
489 0.06
490 0.05
491 0.05
492 0.05
493 0.05
494 0.05
495 0.05
496 0.05
497 0.07
498 0.06
499 0.06
500 0.07
501 0.09
502 0.12
503 0.16
504 0.22
505 0.25
506 0.27
507 0.28
508 0.35
509 0.35
510 0.35
511 0.42
512 0.44
513 0.44
514 0.43
515 0.45
516 0.38
517 0.4
518 0.38
519 0.31
520 0.27
521 0.24
522 0.23
523 0.22
524 0.23
525 0.2
526 0.19
527 0.18
528 0.18
529 0.19
530 0.2
531 0.19
532 0.19
533 0.18
534 0.18
535 0.15
536 0.11
537 0.1
538 0.09
539 0.08
540 0.07
541 0.08
542 0.08
543 0.08
544 0.07
545 0.06
546 0.06
547 0.05
548 0.05
549 0.07
550 0.07
551 0.07
552 0.07
553 0.08
554 0.08
555 0.08
556 0.08
557 0.07
558 0.07
559 0.07
560 0.08
561 0.08
562 0.08
563 0.11
564 0.11
565 0.11
566 0.13
567 0.13
568 0.12
569 0.12
570 0.13
571 0.09
572 0.11
573 0.11
574 0.09
575 0.09
576 0.09
577 0.1
578 0.09
579 0.1
580 0.15
581 0.18
582 0.18
583 0.18
584 0.18
585 0.17
586 0.17
587 0.16
588 0.08
589 0.05
590 0.05
591 0.05
592 0.05
593 0.05
594 0.04
595 0.04
596 0.05
597 0.04
598 0.04
599 0.04
600 0.04
601 0.07
602 0.09
603 0.12
604 0.13
605 0.14
606 0.15
607 0.16
608 0.16
609 0.15
610 0.19
611 0.19
612 0.2
613 0.21
614 0.22
615 0.22
616 0.25
617 0.24
618 0.2
619 0.2
620 0.18
621 0.23
622 0.26
623 0.32
624 0.29
625 0.3
626 0.3
627 0.28
628 0.27
629 0.23
630 0.22
631 0.17
632 0.21
633 0.23
634 0.23
635 0.22
636 0.22
637 0.19
638 0.18
639 0.16
640 0.12
641 0.11
642 0.11
643 0.11
644 0.11
645 0.1
646 0.1
647 0.1
648 0.09
649 0.08
650 0.11
651 0.14
652 0.15
653 0.17
654 0.19
655 0.18
656 0.18
657 0.18
658 0.19
659 0.2
660 0.21
661 0.2
662 0.18
663 0.18
664 0.18
665 0.19
666 0.15
667 0.1
668 0.09
669 0.09
670 0.1
671 0.1
672 0.1
673 0.09
674 0.09
675 0.09
676 0.08
677 0.07
678 0.06
679 0.09
680 0.1
681 0.09
682 0.08
683 0.08
684 0.08
685 0.08
686 0.08
687 0.05
688 0.05
689 0.04
690 0.04
691 0.08
692 0.1
693 0.1
694 0.1
695 0.11
696 0.11
697 0.12
698 0.13
699 0.15
700 0.13
701 0.15
702 0.15
703 0.14
704 0.16
705 0.16
706 0.15
707 0.1
708 0.1
709 0.09
710 0.1
711 0.1
712 0.08
713 0.08
714 0.07
715 0.07
716 0.07
717 0.06
718 0.06
719 0.05
720 0.05
721 0.07
722 0.08
723 0.08
724 0.08
725 0.08
726 0.08
727 0.08
728 0.07
729 0.06
730 0.04
731 0.03
732 0.03
733 0.03
734 0.05
735 0.05
736 0.05
737 0.06
738 0.06
739 0.07
740 0.08
741 0.09
742 0.08
743 0.1
744 0.1
745 0.16
746 0.16
747 0.16
748 0.16
749 0.15
750 0.15
751 0.13
752 0.13
753 0.07
754 0.07
755 0.06
756 0.06
757 0.06
758 0.09
759 0.09
760 0.1
761 0.16
762 0.21
763 0.23
764 0.25
765 0.27
766 0.31
767 0.35
768 0.38
769 0.33
770 0.28
771 0.27
772 0.31
773 0.32
774 0.28
775 0.27
776 0.3
777 0.35
778 0.38
779 0.43
780 0.47
781 0.54
782 0.62
783 0.68
784 0.72
785 0.75
786 0.78
787 0.82
788 0.8
789 0.75
790 0.69
791 0.63
792 0.55
793 0.46
794 0.4
795 0.31
796 0.26
797 0.21
798 0.19
799 0.19
800 0.19
801 0.19
802 0.2
803 0.22
804 0.21
805 0.25
806 0.27
807 0.26
808 0.28
809 0.34
810 0.35
811 0.42
812 0.47
813 0.51
814 0.54
815 0.56
816 0.59
817 0.58
818 0.64
819 0.6
820 0.62
821 0.61
822 0.61
823 0.67
824 0.63
825 0.61
826 0.55
827 0.56
828 0.59
829 0.6
830 0.54
831 0.47
832 0.55
833 0.54
834 0.6
835 0.62
836 0.58
837 0.54
838 0.58
839 0.62
840 0.61
841 0.61
842 0.56
843 0.49
844 0.47
845 0.47
846 0.45
847 0.39
848 0.31
849 0.31
850 0.29
851 0.28
852 0.25
853 0.2
854 0.14
855 0.13
856 0.14
857 0.13
858 0.13
859 0.12
860 0.11
861 0.13
862 0.13
863 0.12
864 0.11
865 0.1
866 0.08
867 0.16
868 0.23
869 0.28
870 0.35
871 0.39
872 0.39
873 0.44
874 0.51
875 0.52
876 0.54
877 0.57
878 0.56
879 0.58
880 0.65
881 0.67
882 0.68
883 0.68
884 0.61
885 0.56
886 0.53
887 0.49
888 0.43
889 0.37
890 0.35
891 0.28
892 0.25
893 0.24
894 0.22
895 0.23
896 0.24
897 0.24
898 0.17
899 0.19
900 0.2
901 0.17
902 0.18
903 0.15
904 0.14
905 0.13
906 0.15
907 0.14
908 0.11
909 0.11
910 0.09
911 0.09
912 0.08
913 0.08
914 0.07
915 0.06
916 0.06
917 0.06
918 0.06
919 0.06
920 0.12
921 0.18
922 0.18
923 0.19
924 0.23
925 0.23
926 0.27
927 0.32
928 0.31
929 0.29
930 0.33
931 0.34
932 0.33
933 0.33
934 0.31
935 0.26
936 0.21
937 0.17
938 0.14
939 0.12
940 0.09
941 0.09
942 0.09