Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3IP42

Protein Details
Accession A0A0C3IP42    Localization Confidence High Confidence Score 16.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
181-211AQKFDAKWRKVNKFSRKKEKRTFHPRNSFSEHydrophilic
250-271RECPDKGKTPQKKVKKIHKIVEBasic
504-526LAQEEHKKKPKPVLPKDYKDFASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
188-201WRKVNKFSRKKEKR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito_nucl 11.5, mito 8.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032567  LDOC1-rel  
IPR021109  Peptidase_aspartic_dom_sf  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd00303  retropepsin_like  
Amino Acid Sequences MSGSSMKALVGNATKATELKIGAPSDFDGDQKNAMSWLYSVQTYLLVNEELYDTDTKRVVYTLSYMKKGVTHSWATTFQKTSLEKNPPSFGTFADFVKDFKNSFTSPDTASTAITKLHTMKQKESVEQYITDFQTAAANSTITEDVALIEFFSQGLKPFITNRIHMMETTPTKITNWYTQAQKFDAKWRKVNKFSRKKEKRTFHPRNSFSEEKDPNTMDVDGVRLSKEERDHHIKEGRCFSCGNKGHLSRECPDKGKTPQKKVKKIHKIVEVEESDDEEKVAGPSVALVNIARALGKEVPQTKDSLVSVAPVLVSSTPEHTMQIPISLYASETTLKVVNTTTLVDSGAEISCIDWAFNADGTQNSKGRILFSATLYFKVKGLVHQSFFHVINCGTENVILGLPWLQENNPIVDWRMGTLSIDEKTDRSKELRRNISSIAVEELTVNLVTPTEKKGINKFIDYKEPEDKTICSHFVMSVGKLVGEAKKINPNNNLLRKITMATELAQEEHKKKPKPVLPKDYKDFASVFDKPSDGILPPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.21
4 0.2
5 0.17
6 0.18
7 0.23
8 0.23
9 0.22
10 0.23
11 0.22
12 0.22
13 0.22
14 0.2
15 0.19
16 0.19
17 0.21
18 0.2
19 0.19
20 0.17
21 0.16
22 0.16
23 0.12
24 0.14
25 0.14
26 0.13
27 0.13
28 0.13
29 0.15
30 0.14
31 0.14
32 0.13
33 0.11
34 0.11
35 0.11
36 0.12
37 0.1
38 0.12
39 0.14
40 0.13
41 0.15
42 0.17
43 0.17
44 0.17
45 0.17
46 0.15
47 0.14
48 0.19
49 0.25
50 0.29
51 0.31
52 0.31
53 0.32
54 0.34
55 0.36
56 0.35
57 0.32
58 0.31
59 0.3
60 0.35
61 0.41
62 0.43
63 0.45
64 0.42
65 0.37
66 0.4
67 0.4
68 0.41
69 0.43
70 0.48
71 0.48
72 0.5
73 0.53
74 0.48
75 0.48
76 0.42
77 0.34
78 0.3
79 0.27
80 0.22
81 0.21
82 0.2
83 0.18
84 0.2
85 0.21
86 0.16
87 0.16
88 0.21
89 0.18
90 0.22
91 0.25
92 0.25
93 0.24
94 0.27
95 0.27
96 0.23
97 0.23
98 0.21
99 0.18
100 0.17
101 0.16
102 0.15
103 0.16
104 0.22
105 0.29
106 0.31
107 0.34
108 0.42
109 0.45
110 0.47
111 0.49
112 0.47
113 0.42
114 0.39
115 0.38
116 0.35
117 0.31
118 0.27
119 0.22
120 0.18
121 0.19
122 0.18
123 0.16
124 0.11
125 0.1
126 0.1
127 0.12
128 0.12
129 0.08
130 0.08
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.06
142 0.08
143 0.08
144 0.09
145 0.11
146 0.18
147 0.21
148 0.22
149 0.24
150 0.26
151 0.26
152 0.25
153 0.25
154 0.24
155 0.23
156 0.25
157 0.23
158 0.19
159 0.19
160 0.22
161 0.23
162 0.22
163 0.24
164 0.25
165 0.31
166 0.34
167 0.37
168 0.36
169 0.38
170 0.34
171 0.4
172 0.45
173 0.44
174 0.48
175 0.54
176 0.61
177 0.66
178 0.75
179 0.76
180 0.77
181 0.82
182 0.86
183 0.88
184 0.9
185 0.9
186 0.9
187 0.89
188 0.9
189 0.9
190 0.89
191 0.9
192 0.83
193 0.8
194 0.79
195 0.71
196 0.63
197 0.61
198 0.54
199 0.45
200 0.44
201 0.38
202 0.3
203 0.29
204 0.26
205 0.16
206 0.13
207 0.12
208 0.09
209 0.09
210 0.08
211 0.07
212 0.08
213 0.1
214 0.14
215 0.16
216 0.22
217 0.29
218 0.31
219 0.36
220 0.42
221 0.42
222 0.43
223 0.49
224 0.43
225 0.37
226 0.36
227 0.31
228 0.35
229 0.36
230 0.35
231 0.33
232 0.34
233 0.38
234 0.41
235 0.43
236 0.36
237 0.4
238 0.38
239 0.34
240 0.34
241 0.35
242 0.39
243 0.47
244 0.52
245 0.55
246 0.61
247 0.68
248 0.76
249 0.8
250 0.82
251 0.83
252 0.82
253 0.79
254 0.79
255 0.72
256 0.63
257 0.61
258 0.51
259 0.41
260 0.33
261 0.28
262 0.2
263 0.16
264 0.15
265 0.07
266 0.07
267 0.05
268 0.06
269 0.04
270 0.03
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.05
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.05
279 0.04
280 0.04
281 0.06
282 0.07
283 0.08
284 0.13
285 0.16
286 0.19
287 0.19
288 0.21
289 0.19
290 0.2
291 0.19
292 0.16
293 0.12
294 0.1
295 0.1
296 0.08
297 0.08
298 0.05
299 0.06
300 0.05
301 0.06
302 0.06
303 0.07
304 0.09
305 0.09
306 0.1
307 0.1
308 0.12
309 0.11
310 0.12
311 0.1
312 0.09
313 0.09
314 0.08
315 0.08
316 0.07
317 0.08
318 0.07
319 0.07
320 0.08
321 0.09
322 0.09
323 0.09
324 0.09
325 0.09
326 0.09
327 0.1
328 0.09
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.07
335 0.06
336 0.06
337 0.05
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.05
342 0.06
343 0.06
344 0.07
345 0.07
346 0.06
347 0.08
348 0.12
349 0.15
350 0.16
351 0.16
352 0.18
353 0.18
354 0.19
355 0.19
356 0.19
357 0.18
358 0.18
359 0.24
360 0.23
361 0.25
362 0.26
363 0.25
364 0.22
365 0.23
366 0.22
367 0.19
368 0.26
369 0.27
370 0.28
371 0.28
372 0.31
373 0.31
374 0.31
375 0.28
376 0.22
377 0.17
378 0.17
379 0.17
380 0.15
381 0.11
382 0.11
383 0.1
384 0.1
385 0.09
386 0.07
387 0.06
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.08
392 0.07
393 0.11
394 0.12
395 0.14
396 0.14
397 0.14
398 0.16
399 0.16
400 0.16
401 0.13
402 0.13
403 0.11
404 0.11
405 0.12
406 0.13
407 0.13
408 0.14
409 0.14
410 0.14
411 0.18
412 0.2
413 0.22
414 0.24
415 0.31
416 0.38
417 0.47
418 0.56
419 0.56
420 0.57
421 0.56
422 0.57
423 0.5
424 0.43
425 0.36
426 0.26
427 0.22
428 0.19
429 0.17
430 0.12
431 0.1
432 0.09
433 0.06
434 0.06
435 0.07
436 0.09
437 0.12
438 0.15
439 0.18
440 0.22
441 0.29
442 0.38
443 0.41
444 0.46
445 0.5
446 0.5
447 0.57
448 0.57
449 0.56
450 0.55
451 0.53
452 0.49
453 0.45
454 0.42
455 0.37
456 0.39
457 0.35
458 0.27
459 0.26
460 0.23
461 0.25
462 0.27
463 0.22
464 0.2
465 0.19
466 0.17
467 0.17
468 0.19
469 0.17
470 0.18
471 0.2
472 0.21
473 0.31
474 0.35
475 0.41
476 0.45
477 0.51
478 0.57
479 0.64
480 0.65
481 0.57
482 0.55
483 0.5
484 0.46
485 0.4
486 0.33
487 0.26
488 0.22
489 0.23
490 0.22
491 0.21
492 0.25
493 0.29
494 0.29
495 0.37
496 0.44
497 0.47
498 0.52
499 0.61
500 0.63
501 0.69
502 0.76
503 0.78
504 0.8
505 0.84
506 0.85
507 0.82
508 0.76
509 0.69
510 0.58
511 0.51
512 0.48
513 0.42
514 0.38
515 0.33
516 0.32
517 0.28
518 0.3
519 0.28