Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3PN79

Protein Details
Accession A0A0C3PN79    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
291-315ILARRVKAKRVLKRKLRTPKAAESAHydrophilic
1079-1101EKLVQGHAKRVQRKYRGLRGLELHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
294-310RRVKAKRVLKRKLRTPK
Subcellular Location(s) mito 10, cyto 6.5, cyto_nucl 6, nucl 4.5, extr 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010675  Bin3_C  
IPR024160  BIN3_SAM-bd_dom  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR025313  DUF4217  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0008168  F:methyltransferase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF06859  Bin3  
PF00270  DEAD  
PF13959  DUF4217  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51515  BIN3_SAM  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd02440  AdoMet_MTases  
cd17949  DEADc_DDX31  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MSMASSIAPVYGNYHGYYSKRPFVRDPRLSLLPPSFFTGKAVLDIGCNEGWVTCEIGQIWGAARVIGVDIDETLIRGAWKRRRSLWSQQAPGRDVMERNENDNSSGVFKRSKLDRVTDSHSYDYFPASCEHSHEPLPIPTDTIKEGHFPTNVIFRTADFLAEPVGERYDIVIAYGCRSAGNSSHTEVPYSLSITKWIHLNCGDDGIKHFFRKVHESLNAGGTLVLEPQTWETYAKAKRLDEKLKENAKHLKLHPGNFPTILQDIGFGPPRHLGSVGEGGDYLHSLQQAGLILARRVKAKRVLKRKLRTPKAAESAVQSHEDEESHFEDEAVSSRPLKRLHLDKHPHPVVNPADGRSKPSTQIISSLFSHNPKIDIPQSTAGPKAIYKPSNAPLTNASGFAELGLHPLLVAHLENKMGVLKPTSIQRAAIPAFTRSPDLADRDLFIQSQTGSGKTLSFLLPIIHDLLPLSTHSYIDRSIGTLAVIIAPTRELAKQISNVLESLLKLKLRPETEPEEAEDSVRYTRWLVSGLLSGGATKTHEKARLRKGIPILVATPGRLLDHLQNTSSFNVGKCRWLVLDEADLLMELGFEKTIQGIIQGLDGRRRLAVQAMKEGKSLEVGSWDWEQRRRTILCSATIREDVQKLAGTALMNPIMITAFDDKQRSEENVSAGGGLPAGSTKFTPPSQLAQKYVVAPLKLRLVTLVALLRSVLAQNQAKEGCKVIVFLSCTDSVDFHWQLLGGTSMGGDDTNGDDSDSEGGNSGGEEKVAGSDLAGEEVAMRSPLLPDTLIFRLHGSLPTPMRLESLRGFSSTKGKCHGRSSVLLCTSVASRGLDLPLVRAVIQYDLPTEGGVTEYVHRVGRTARAGKGGEAWSLVAPSESEWVDWVQEKMRHNLQDSSSDTQGTKVTLEGTSVEDLLAKGLGGKGSEYESRATDVQLAFERWVLQRKEHTELARKAFLSHMRAYATHPASEKHIFHVRHLHIGHLAKSFALREAPKSITGSDRKAKSRAQATDNVQSKTDRAANAIRATSSGLHLSQRAGNAEARMKEVVRTQGRMSKKGGKMMSSGIDEFQIASGAALEKLVQGHAKRVQRKYRGLRGLELYFSSCLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.21
3 0.23
4 0.32
5 0.36
6 0.41
7 0.43
8 0.47
9 0.54
10 0.62
11 0.7
12 0.69
13 0.69
14 0.68
15 0.7
16 0.67
17 0.64
18 0.59
19 0.52
20 0.45
21 0.43
22 0.37
23 0.31
24 0.32
25 0.29
26 0.23
27 0.22
28 0.22
29 0.16
30 0.16
31 0.17
32 0.18
33 0.15
34 0.14
35 0.12
36 0.11
37 0.12
38 0.12
39 0.14
40 0.11
41 0.13
42 0.13
43 0.14
44 0.15
45 0.14
46 0.14
47 0.14
48 0.13
49 0.11
50 0.11
51 0.1
52 0.1
53 0.09
54 0.08
55 0.06
56 0.06
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.08
63 0.13
64 0.22
65 0.29
66 0.36
67 0.43
68 0.51
69 0.58
70 0.64
71 0.71
72 0.73
73 0.75
74 0.77
75 0.75
76 0.74
77 0.69
78 0.63
79 0.55
80 0.48
81 0.39
82 0.34
83 0.39
84 0.34
85 0.35
86 0.38
87 0.36
88 0.33
89 0.33
90 0.3
91 0.25
92 0.26
93 0.25
94 0.23
95 0.24
96 0.3
97 0.34
98 0.41
99 0.41
100 0.45
101 0.49
102 0.51
103 0.57
104 0.57
105 0.55
106 0.51
107 0.47
108 0.42
109 0.36
110 0.34
111 0.27
112 0.21
113 0.19
114 0.19
115 0.19
116 0.22
117 0.26
118 0.26
119 0.27
120 0.29
121 0.31
122 0.3
123 0.33
124 0.28
125 0.26
126 0.24
127 0.24
128 0.24
129 0.22
130 0.2
131 0.2
132 0.23
133 0.25
134 0.24
135 0.23
136 0.23
137 0.29
138 0.29
139 0.27
140 0.24
141 0.2
142 0.24
143 0.23
144 0.22
145 0.14
146 0.13
147 0.12
148 0.12
149 0.12
150 0.09
151 0.1
152 0.09
153 0.09
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.09
158 0.11
159 0.1
160 0.12
161 0.13
162 0.12
163 0.11
164 0.12
165 0.13
166 0.13
167 0.17
168 0.18
169 0.2
170 0.26
171 0.27
172 0.27
173 0.26
174 0.25
175 0.22
176 0.22
177 0.21
178 0.14
179 0.2
180 0.19
181 0.21
182 0.23
183 0.22
184 0.24
185 0.25
186 0.28
187 0.23
188 0.28
189 0.26
190 0.22
191 0.25
192 0.28
193 0.29
194 0.27
195 0.29
196 0.26
197 0.3
198 0.36
199 0.36
200 0.37
201 0.37
202 0.39
203 0.39
204 0.39
205 0.34
206 0.27
207 0.24
208 0.17
209 0.13
210 0.11
211 0.09
212 0.06
213 0.07
214 0.09
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.11
219 0.19
220 0.23
221 0.27
222 0.3
223 0.32
224 0.4
225 0.48
226 0.56
227 0.55
228 0.59
229 0.64
230 0.68
231 0.67
232 0.66
233 0.66
234 0.61
235 0.62
236 0.55
237 0.57
238 0.53
239 0.55
240 0.56
241 0.51
242 0.49
243 0.43
244 0.41
245 0.33
246 0.28
247 0.24
248 0.16
249 0.13
250 0.12
251 0.14
252 0.19
253 0.16
254 0.17
255 0.19
256 0.2
257 0.2
258 0.19
259 0.17
260 0.15
261 0.21
262 0.2
263 0.17
264 0.16
265 0.15
266 0.15
267 0.14
268 0.11
269 0.07
270 0.06
271 0.07
272 0.06
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.09
277 0.1
278 0.11
279 0.13
280 0.15
281 0.19
282 0.2
283 0.24
284 0.32
285 0.4
286 0.48
287 0.57
288 0.66
289 0.71
290 0.79
291 0.84
292 0.86
293 0.86
294 0.86
295 0.82
296 0.81
297 0.77
298 0.7
299 0.61
300 0.54
301 0.49
302 0.41
303 0.36
304 0.27
305 0.21
306 0.2
307 0.18
308 0.15
309 0.14
310 0.14
311 0.13
312 0.13
313 0.12
314 0.12
315 0.12
316 0.13
317 0.12
318 0.12
319 0.13
320 0.15
321 0.2
322 0.21
323 0.24
324 0.28
325 0.34
326 0.39
327 0.48
328 0.54
329 0.54
330 0.63
331 0.64
332 0.59
333 0.5
334 0.52
335 0.43
336 0.42
337 0.38
338 0.3
339 0.32
340 0.32
341 0.37
342 0.33
343 0.33
344 0.28
345 0.3
346 0.31
347 0.25
348 0.29
349 0.26
350 0.25
351 0.25
352 0.27
353 0.25
354 0.24
355 0.26
356 0.21
357 0.21
358 0.18
359 0.2
360 0.2
361 0.2
362 0.22
363 0.23
364 0.24
365 0.24
366 0.24
367 0.21
368 0.18
369 0.16
370 0.18
371 0.22
372 0.22
373 0.23
374 0.27
375 0.31
376 0.38
377 0.37
378 0.34
379 0.29
380 0.33
381 0.32
382 0.27
383 0.23
384 0.15
385 0.15
386 0.13
387 0.12
388 0.06
389 0.07
390 0.07
391 0.06
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.04
398 0.05
399 0.05
400 0.06
401 0.06
402 0.07
403 0.07
404 0.08
405 0.08
406 0.08
407 0.1
408 0.15
409 0.17
410 0.17
411 0.17
412 0.17
413 0.21
414 0.21
415 0.21
416 0.18
417 0.17
418 0.18
419 0.18
420 0.18
421 0.13
422 0.15
423 0.15
424 0.17
425 0.17
426 0.16
427 0.16
428 0.16
429 0.16
430 0.14
431 0.12
432 0.1
433 0.08
434 0.1
435 0.1
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.09
440 0.09
441 0.1
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.08
446 0.08
447 0.08
448 0.11
449 0.09
450 0.09
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.08
455 0.1
456 0.07
457 0.07
458 0.08
459 0.09
460 0.09
461 0.1
462 0.1
463 0.08
464 0.08
465 0.08
466 0.07
467 0.06
468 0.06
469 0.05
470 0.05
471 0.04
472 0.04
473 0.04
474 0.04
475 0.05
476 0.05
477 0.06
478 0.07
479 0.09
480 0.11
481 0.13
482 0.13
483 0.13
484 0.13
485 0.12
486 0.12
487 0.1
488 0.11
489 0.11
490 0.1
491 0.1
492 0.12
493 0.16
494 0.17
495 0.18
496 0.21
497 0.25
498 0.27
499 0.28
500 0.27
501 0.25
502 0.23
503 0.22
504 0.17
505 0.13
506 0.11
507 0.1
508 0.09
509 0.07
510 0.08
511 0.08
512 0.09
513 0.09
514 0.09
515 0.1
516 0.09
517 0.09
518 0.08
519 0.07
520 0.06
521 0.06
522 0.06
523 0.06
524 0.08
525 0.11
526 0.17
527 0.21
528 0.29
529 0.37
530 0.45
531 0.45
532 0.48
533 0.47
534 0.44
535 0.42
536 0.35
537 0.27
538 0.2
539 0.2
540 0.15
541 0.13
542 0.1
543 0.09
544 0.08
545 0.09
546 0.09
547 0.12
548 0.13
549 0.13
550 0.14
551 0.15
552 0.15
553 0.15
554 0.12
555 0.1
556 0.14
557 0.14
558 0.15
559 0.14
560 0.15
561 0.14
562 0.14
563 0.15
564 0.11
565 0.12
566 0.1
567 0.09
568 0.08
569 0.08
570 0.07
571 0.06
572 0.04
573 0.03
574 0.03
575 0.03
576 0.03
577 0.03
578 0.03
579 0.03
580 0.03
581 0.03
582 0.04
583 0.04
584 0.06
585 0.08
586 0.08
587 0.11
588 0.12
589 0.12
590 0.12
591 0.12
592 0.11
593 0.14
594 0.17
595 0.15
596 0.23
597 0.27
598 0.27
599 0.27
600 0.27
601 0.22
602 0.2
603 0.19
604 0.11
605 0.09
606 0.09
607 0.11
608 0.12
609 0.14
610 0.15
611 0.2
612 0.21
613 0.21
614 0.26
615 0.25
616 0.25
617 0.3
618 0.29
619 0.3
620 0.33
621 0.32
622 0.3
623 0.3
624 0.28
625 0.24
626 0.22
627 0.17
628 0.14
629 0.13
630 0.11
631 0.09
632 0.1
633 0.08
634 0.08
635 0.09
636 0.08
637 0.08
638 0.07
639 0.07
640 0.06
641 0.05
642 0.06
643 0.07
644 0.08
645 0.11
646 0.12
647 0.12
648 0.14
649 0.16
650 0.17
651 0.17
652 0.18
653 0.17
654 0.17
655 0.17
656 0.15
657 0.13
658 0.11
659 0.08
660 0.06
661 0.05
662 0.04
663 0.04
664 0.04
665 0.05
666 0.06
667 0.09
668 0.1
669 0.12
670 0.14
671 0.19
672 0.27
673 0.29
674 0.3
675 0.3
676 0.31
677 0.3
678 0.32
679 0.29
680 0.22
681 0.19
682 0.19
683 0.22
684 0.2
685 0.19
686 0.15
687 0.13
688 0.13
689 0.14
690 0.14
691 0.09
692 0.09
693 0.09
694 0.08
695 0.08
696 0.07
697 0.06
698 0.1
699 0.13
700 0.13
701 0.17
702 0.19
703 0.2
704 0.2
705 0.21
706 0.16
707 0.14
708 0.14
709 0.11
710 0.13
711 0.13
712 0.13
713 0.15
714 0.14
715 0.15
716 0.14
717 0.14
718 0.12
719 0.17
720 0.17
721 0.14
722 0.14
723 0.13
724 0.13
725 0.13
726 0.12
727 0.05
728 0.05
729 0.05
730 0.05
731 0.04
732 0.04
733 0.04
734 0.03
735 0.04
736 0.06
737 0.06
738 0.06
739 0.06
740 0.07
741 0.09
742 0.08
743 0.07
744 0.06
745 0.06
746 0.06
747 0.06
748 0.07
749 0.05
750 0.05
751 0.05
752 0.05
753 0.05
754 0.06
755 0.06
756 0.04
757 0.05
758 0.05
759 0.06
760 0.06
761 0.05
762 0.05
763 0.05
764 0.06
765 0.05
766 0.05
767 0.04
768 0.05
769 0.06
770 0.06
771 0.06
772 0.06
773 0.1
774 0.12
775 0.13
776 0.13
777 0.13
778 0.13
779 0.14
780 0.15
781 0.13
782 0.16
783 0.17
784 0.19
785 0.2
786 0.19
787 0.2
788 0.19
789 0.21
790 0.18
791 0.21
792 0.2
793 0.2
794 0.21
795 0.21
796 0.3
797 0.3
798 0.3
799 0.32
800 0.36
801 0.38
802 0.43
803 0.47
804 0.42
805 0.45
806 0.46
807 0.47
808 0.44
809 0.4
810 0.35
811 0.3
812 0.26
813 0.21
814 0.18
815 0.11
816 0.1
817 0.11
818 0.11
819 0.12
820 0.11
821 0.11
822 0.11
823 0.12
824 0.11
825 0.1
826 0.1
827 0.1
828 0.11
829 0.1
830 0.09
831 0.1
832 0.1
833 0.09
834 0.09
835 0.07
836 0.07
837 0.07
838 0.07
839 0.08
840 0.09
841 0.11
842 0.12
843 0.12
844 0.13
845 0.14
846 0.19
847 0.25
848 0.28
849 0.28
850 0.33
851 0.34
852 0.33
853 0.37
854 0.33
855 0.26
856 0.22
857 0.2
858 0.15
859 0.15
860 0.14
861 0.08
862 0.07
863 0.07
864 0.09
865 0.09
866 0.08
867 0.09
868 0.1
869 0.11
870 0.13
871 0.13
872 0.16
873 0.21
874 0.24
875 0.28
876 0.34
877 0.37
878 0.38
879 0.43
880 0.39
881 0.42
882 0.43
883 0.42
884 0.37
885 0.35
886 0.31
887 0.27
888 0.27
889 0.2
890 0.16
891 0.12
892 0.13
893 0.11
894 0.12
895 0.11
896 0.12
897 0.12
898 0.12
899 0.11
900 0.1
901 0.1
902 0.1
903 0.09
904 0.06
905 0.06
906 0.07
907 0.08
908 0.07
909 0.08
910 0.08
911 0.12
912 0.14
913 0.15
914 0.16
915 0.16
916 0.19
917 0.19
918 0.19
919 0.2
920 0.18
921 0.2
922 0.21
923 0.21
924 0.19
925 0.19
926 0.22
927 0.2
928 0.28
929 0.27
930 0.28
931 0.35
932 0.39
933 0.44
934 0.46
935 0.5
936 0.52
937 0.57
938 0.59
939 0.56
940 0.52
941 0.47
942 0.47
943 0.47
944 0.42
945 0.38
946 0.35
947 0.32
948 0.32
949 0.35
950 0.39
951 0.35
952 0.33
953 0.31
954 0.29
955 0.33
956 0.38
957 0.35
958 0.32
959 0.38
960 0.36
961 0.39
962 0.47
963 0.44
964 0.46
965 0.45
966 0.41
967 0.4
968 0.42
969 0.42
970 0.34
971 0.32
972 0.24
973 0.25
974 0.24
975 0.19
976 0.22
977 0.2
978 0.21
979 0.26
980 0.28
981 0.29
982 0.31
983 0.3
984 0.33
985 0.37
986 0.41
987 0.44
988 0.49
989 0.51
990 0.55
991 0.57
992 0.57
993 0.61
994 0.6
995 0.58
996 0.6
997 0.61
998 0.65
999 0.67
1000 0.6
1001 0.53
1002 0.46
1003 0.41
1004 0.39
1005 0.37
1006 0.28
1007 0.27
1008 0.31
1009 0.35
1010 0.39
1011 0.39
1012 0.33
1013 0.29
1014 0.31
1015 0.27
1016 0.24
1017 0.21
1018 0.18
1019 0.18
1020 0.19
1021 0.21
1022 0.22
1023 0.24
1024 0.24
1025 0.23
1026 0.24
1027 0.26
1028 0.31
1029 0.3
1030 0.3
1031 0.3
1032 0.28
1033 0.28
1034 0.31
1035 0.36
1036 0.35
1037 0.38
1038 0.39
1039 0.44
1040 0.49
1041 0.52
1042 0.53
1043 0.53
1044 0.53
1045 0.58
1046 0.57
1047 0.52
1048 0.49
1049 0.49
1050 0.47
1051 0.41
1052 0.38
1053 0.3
1054 0.27
1055 0.25
1056 0.22
1057 0.18
1058 0.13
1059 0.09
1060 0.08
1061 0.08
1062 0.08
1063 0.08
1064 0.08
1065 0.08
1066 0.09
1067 0.1
1068 0.12
1069 0.16
1070 0.16
1071 0.23
1072 0.31
1073 0.39
1074 0.47
1075 0.56
1076 0.65
1077 0.69
1078 0.79
1079 0.82
1080 0.85
1081 0.85
1082 0.8
1083 0.77
1084 0.74
1085 0.68
1086 0.6
1087 0.52
1088 0.44