Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A0C3JVD6

Protein Details
Accession A0A0C3JVD6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-38MANPRQRRKRKSGHAPISHSRRAKKMLKKMPTIRGPKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-36RQRRKRKSGHAPISHSRRAKKMLKKMPTIRGP
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 8, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019002  Ribosome_biogenesis_Nop16  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF09420  Nop16  
Amino Acid Sequences MANPRQRRKRKSGHAPISHSRRAKKMLKKMPTIRGPKALQDAWDKTKTVRQNYLAFSLQHTLNPIPSGGTEVDLRHRCPDRVKTEVHSCHEGEKDPDGLSVVKKVVPSGFGRIVRDETGVVIGVELAEDEGRGPVPDMETLEPCAADADRQVWAQGGTADDNMTSPAESGVIRRLERLSEHTEVRVRHTSQGERMFMARLAKKYGDDYEKMARDRRLNPEQKTVGQLKRAVGKAGGIAELCRE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.91
2 0.89
3 0.89
4 0.87
5 0.84
6 0.79
7 0.73
8 0.69
9 0.68
10 0.69
11 0.69
12 0.72
13 0.73
14 0.76
15 0.81
16 0.83
17 0.84
18 0.84
19 0.82
20 0.76
21 0.75
22 0.68
23 0.62
24 0.6
25 0.52
26 0.46
27 0.46
28 0.46
29 0.44
30 0.45
31 0.41
32 0.36
33 0.42
34 0.45
35 0.44
36 0.46
37 0.44
38 0.48
39 0.5
40 0.53
41 0.49
42 0.42
43 0.37
44 0.33
45 0.28
46 0.23
47 0.23
48 0.18
49 0.16
50 0.17
51 0.14
52 0.11
53 0.11
54 0.13
55 0.1
56 0.11
57 0.11
58 0.11
59 0.2
60 0.22
61 0.23
62 0.26
63 0.29
64 0.29
65 0.35
66 0.42
67 0.4
68 0.42
69 0.43
70 0.43
71 0.49
72 0.53
73 0.5
74 0.46
75 0.4
76 0.39
77 0.38
78 0.34
79 0.26
80 0.22
81 0.19
82 0.16
83 0.15
84 0.13
85 0.12
86 0.12
87 0.12
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.11
92 0.1
93 0.12
94 0.12
95 0.15
96 0.19
97 0.19
98 0.2
99 0.21
100 0.22
101 0.2
102 0.19
103 0.15
104 0.1
105 0.09
106 0.08
107 0.07
108 0.05
109 0.04
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.02
114 0.02
115 0.02
116 0.02
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.04
121 0.04
122 0.05
123 0.06
124 0.07
125 0.08
126 0.09
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.09
131 0.09
132 0.07
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.07
137 0.07
138 0.08
139 0.07
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.07
145 0.08
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.06
152 0.05
153 0.05
154 0.06
155 0.06
156 0.07
157 0.12
158 0.15
159 0.15
160 0.17
161 0.18
162 0.18
163 0.2
164 0.25
165 0.25
166 0.25
167 0.26
168 0.28
169 0.32
170 0.31
171 0.35
172 0.37
173 0.33
174 0.35
175 0.39
176 0.39
177 0.43
178 0.49
179 0.44
180 0.39
181 0.38
182 0.34
183 0.31
184 0.34
185 0.3
186 0.26
187 0.28
188 0.28
189 0.29
190 0.31
191 0.35
192 0.34
193 0.31
194 0.34
195 0.38
196 0.42
197 0.44
198 0.47
199 0.46
200 0.47
201 0.52
202 0.57
203 0.59
204 0.62
205 0.64
206 0.68
207 0.67
208 0.63
209 0.64
210 0.63
211 0.57
212 0.54
213 0.53
214 0.48
215 0.51
216 0.5
217 0.45
218 0.37
219 0.33
220 0.3
221 0.28
222 0.25
223 0.18