Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7S305

Protein Details
Accession R7S305    Localization Confidence High Confidence Score 21.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
98-142VTWAEKKGKHDEFPKKRKNDDDAAESTTKPKLQRKQTPKAGPSLSHydrophilic
340-365MAERMVRDKQRKKKEVREERKREVAEBasic
733-755GEQKEGKKSKKGRHTAVKQAKVVBasic
939-961REDEKAERAKRKRSVDDAKPGNSBasic
969-989KPGRTLGSIIGRKRKKRKTGHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
103-115KKGKHDEFPKKRK
233-248GLAKAKVKASASTKKA
343-374RMVRDKQRKKKEVREERKREVAEKRRLAKKVK
738-746GKKSKKGRH
869-953RRAAKIKEAKTGEGARGRRESDDRARGRDAQRGDRSKSRDGGERSKARNGDGRKSREGAGSDKKACAGEAREDEKAERAKRKRSV
970-989PGRTLGSIIGRKRKKRKTGH
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034808  Nop4p_RRM3  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG psq:PUNSTDRAFT_146379  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12676  RRM3_Nop4p  
Amino Acid Sequences MSSALGKRKEREDEDTTTANHGSTLFVSNLPYTATSTDLQTLFSDIAPVRSAFVVTEHGSGVSKGVGYVSFAIKEDAQGAYDKIAEEGIELDGRKLRVTWAEKKGKHDEFPKKRKNDDDAAESTTKPKLQRKQTPKAGPSLSKAPDPLAIRTVVVSGLPSGLDTKTLWKKVRKSAGAEKVDWPLKAADGSEDPAVAHVLFSTPAQAQDAVNKLHAHVYKGALLSATLKKRIQGLAKAKVKASASTKKAKDAPSPASRLIVRNLPFNVSEQDLRAVFLPCGPIYSVHIPTKRPETEDEDADANAGKKEPRQRGFAFVWMFSKKDAEKAIERCNGAKVRSGMAERMVRDKQRKKKEVREERKREVAEKRRLAKKVKENEEEGEDEGEEDGGEASAEDEEEEESATNERVIAVDWALSKGKWEEEKAKMEQEQEDVSDQEASSSNASSAEEEASSESEGSVSDAESAISDEEGDEDARSADGDDDAPQKPQLPATDVGTTLFVRNVPYEATEEEMRTLFRAFGPLRYARITIDPETGRCRGTGFACFWNKEDADKAIEQSELLKAETGLGSTPAKEKKNPFKLPSMLTPDPSAGLARNLVLHGRTLDVVRAVTRDEAGKLKEAGERAREKADKRNLYLLREGLILPNSPAAAGLAPAELEKRAAAHDARKRLLRTNPLLYVSRTRLSVRGLPTFVTDRTLKRMAIHAVRAFEAEVGEGVREPLSKEELFEPIHEDGEQKEGKKSKKGRHTAVKQAKVVLQTDRVDPITGKGRSKGYGFVEMHTHADALRVLRWANNNHELGALWREWWKAELEDLIKAEKGKKKAEGDDEARVKRMEEELERVREETGDGKVKAKGALIVEFSIENAQVVQRRAAKIKEAKTGEGARGRRESDDRARGRDAQRGDRSKSRDGGERSKARNGDGRKSREGAGSDKKACAGEAREDEKAERAKRKRSVDDAKPGNSDAKTDEDKPGRTLGSIIGRKRKKRKTGH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.58
3 0.52
4 0.46
5 0.41
6 0.33
7 0.27
8 0.21
9 0.16
10 0.15
11 0.17
12 0.14
13 0.15
14 0.17
15 0.16
16 0.16
17 0.16
18 0.15
19 0.14
20 0.14
21 0.16
22 0.15
23 0.17
24 0.21
25 0.2
26 0.21
27 0.19
28 0.2
29 0.18
30 0.17
31 0.19
32 0.14
33 0.16
34 0.17
35 0.16
36 0.16
37 0.15
38 0.16
39 0.12
40 0.13
41 0.16
42 0.16
43 0.17
44 0.16
45 0.16
46 0.16
47 0.16
48 0.15
49 0.12
50 0.1
51 0.08
52 0.09
53 0.08
54 0.09
55 0.12
56 0.13
57 0.14
58 0.14
59 0.16
60 0.15
61 0.16
62 0.16
63 0.14
64 0.13
65 0.13
66 0.13
67 0.13
68 0.14
69 0.13
70 0.11
71 0.11
72 0.1
73 0.09
74 0.09
75 0.09
76 0.11
77 0.11
78 0.12
79 0.16
80 0.17
81 0.17
82 0.16
83 0.17
84 0.24
85 0.31
86 0.39
87 0.46
88 0.55
89 0.59
90 0.66
91 0.73
92 0.7
93 0.7
94 0.71
95 0.71
96 0.72
97 0.8
98 0.82
99 0.8
100 0.82
101 0.83
102 0.8
103 0.78
104 0.73
105 0.69
106 0.63
107 0.61
108 0.56
109 0.48
110 0.43
111 0.37
112 0.35
113 0.34
114 0.39
115 0.42
116 0.51
117 0.61
118 0.69
119 0.76
120 0.83
121 0.87
122 0.81
123 0.81
124 0.77
125 0.7
126 0.65
127 0.63
128 0.55
129 0.47
130 0.45
131 0.37
132 0.36
133 0.35
134 0.32
135 0.26
136 0.24
137 0.21
138 0.21
139 0.2
140 0.14
141 0.12
142 0.1
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.08
148 0.07
149 0.09
150 0.09
151 0.17
152 0.25
153 0.32
154 0.39
155 0.45
156 0.53
157 0.61
158 0.71
159 0.68
160 0.68
161 0.71
162 0.74
163 0.72
164 0.67
165 0.6
166 0.58
167 0.55
168 0.47
169 0.39
170 0.29
171 0.24
172 0.22
173 0.2
174 0.15
175 0.13
176 0.15
177 0.14
178 0.13
179 0.12
180 0.12
181 0.12
182 0.09
183 0.08
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.08
189 0.08
190 0.09
191 0.1
192 0.11
193 0.11
194 0.15
195 0.19
196 0.18
197 0.2
198 0.2
199 0.19
200 0.25
201 0.26
202 0.24
203 0.23
204 0.24
205 0.24
206 0.25
207 0.24
208 0.18
209 0.17
210 0.19
211 0.22
212 0.24
213 0.25
214 0.25
215 0.27
216 0.3
217 0.35
218 0.36
219 0.38
220 0.43
221 0.49
222 0.55
223 0.56
224 0.53
225 0.52
226 0.48
227 0.44
228 0.43
229 0.41
230 0.4
231 0.47
232 0.48
233 0.5
234 0.55
235 0.54
236 0.54
237 0.52
238 0.55
239 0.53
240 0.56
241 0.5
242 0.49
243 0.46
244 0.41
245 0.37
246 0.35
247 0.29
248 0.29
249 0.29
250 0.28
251 0.26
252 0.26
253 0.25
254 0.21
255 0.21
256 0.17
257 0.18
258 0.16
259 0.16
260 0.16
261 0.15
262 0.12
263 0.13
264 0.14
265 0.11
266 0.12
267 0.12
268 0.11
269 0.14
270 0.19
271 0.23
272 0.26
273 0.29
274 0.29
275 0.32
276 0.4
277 0.37
278 0.35
279 0.34
280 0.36
281 0.37
282 0.37
283 0.36
284 0.29
285 0.27
286 0.25
287 0.22
288 0.15
289 0.12
290 0.11
291 0.1
292 0.14
293 0.23
294 0.32
295 0.34
296 0.4
297 0.41
298 0.47
299 0.48
300 0.5
301 0.42
302 0.35
303 0.35
304 0.29
305 0.28
306 0.22
307 0.24
308 0.18
309 0.2
310 0.21
311 0.21
312 0.26
313 0.31
314 0.38
315 0.39
316 0.4
317 0.37
318 0.41
319 0.4
320 0.34
321 0.34
322 0.28
323 0.25
324 0.27
325 0.28
326 0.23
327 0.24
328 0.27
329 0.23
330 0.27
331 0.29
332 0.32
333 0.41
334 0.49
335 0.54
336 0.62
337 0.7
338 0.73
339 0.79
340 0.84
341 0.86
342 0.88
343 0.89
344 0.88
345 0.85
346 0.85
347 0.76
348 0.71
349 0.7
350 0.69
351 0.67
352 0.66
353 0.68
354 0.67
355 0.71
356 0.71
357 0.7
358 0.69
359 0.69
360 0.7
361 0.66
362 0.62
363 0.58
364 0.54
365 0.47
366 0.38
367 0.28
368 0.19
369 0.15
370 0.12
371 0.1
372 0.06
373 0.05
374 0.04
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.06
398 0.06
399 0.08
400 0.08
401 0.08
402 0.09
403 0.09
404 0.12
405 0.12
406 0.15
407 0.2
408 0.25
409 0.3
410 0.31
411 0.33
412 0.32
413 0.32
414 0.3
415 0.26
416 0.21
417 0.17
418 0.16
419 0.13
420 0.11
421 0.1
422 0.09
423 0.08
424 0.08
425 0.08
426 0.08
427 0.07
428 0.07
429 0.07
430 0.07
431 0.07
432 0.07
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.04
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.05
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.03
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.04
461 0.04
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.06
468 0.09
469 0.1
470 0.1
471 0.1
472 0.11
473 0.11
474 0.13
475 0.12
476 0.12
477 0.13
478 0.15
479 0.16
480 0.14
481 0.14
482 0.14
483 0.14
484 0.1
485 0.1
486 0.08
487 0.07
488 0.07
489 0.08
490 0.07
491 0.07
492 0.08
493 0.08
494 0.1
495 0.1
496 0.1
497 0.1
498 0.1
499 0.09
500 0.09
501 0.09
502 0.07
503 0.06
504 0.11
505 0.11
506 0.12
507 0.16
508 0.17
509 0.19
510 0.19
511 0.2
512 0.16
513 0.18
514 0.19
515 0.17
516 0.2
517 0.19
518 0.19
519 0.22
520 0.23
521 0.2
522 0.17
523 0.16
524 0.14
525 0.15
526 0.17
527 0.16
528 0.22
529 0.24
530 0.25
531 0.25
532 0.26
533 0.25
534 0.22
535 0.21
536 0.16
537 0.16
538 0.16
539 0.15
540 0.13
541 0.13
542 0.12
543 0.11
544 0.11
545 0.09
546 0.08
547 0.08
548 0.07
549 0.08
550 0.08
551 0.07
552 0.05
553 0.07
554 0.07
555 0.07
556 0.12
557 0.17
558 0.19
559 0.23
560 0.3
561 0.39
562 0.5
563 0.56
564 0.54
565 0.56
566 0.58
567 0.57
568 0.55
569 0.53
570 0.44
571 0.38
572 0.36
573 0.29
574 0.25
575 0.22
576 0.17
577 0.09
578 0.08
579 0.08
580 0.07
581 0.07
582 0.07
583 0.08
584 0.07
585 0.08
586 0.07
587 0.07
588 0.08
589 0.08
590 0.08
591 0.08
592 0.08
593 0.08
594 0.08
595 0.08
596 0.08
597 0.08
598 0.09
599 0.1
600 0.12
601 0.13
602 0.15
603 0.14
604 0.16
605 0.17
606 0.18
607 0.19
608 0.23
609 0.25
610 0.25
611 0.31
612 0.33
613 0.33
614 0.41
615 0.48
616 0.46
617 0.46
618 0.53
619 0.5
620 0.49
621 0.5
622 0.41
623 0.32
624 0.28
625 0.26
626 0.18
627 0.16
628 0.13
629 0.1
630 0.1
631 0.09
632 0.08
633 0.07
634 0.06
635 0.05
636 0.05
637 0.05
638 0.04
639 0.04
640 0.05
641 0.05
642 0.05
643 0.05
644 0.05
645 0.05
646 0.06
647 0.09
648 0.11
649 0.19
650 0.25
651 0.31
652 0.34
653 0.38
654 0.39
655 0.43
656 0.47
657 0.48
658 0.48
659 0.47
660 0.48
661 0.46
662 0.46
663 0.42
664 0.41
665 0.36
666 0.32
667 0.28
668 0.26
669 0.25
670 0.27
671 0.3
672 0.28
673 0.29
674 0.28
675 0.27
676 0.28
677 0.28
678 0.25
679 0.23
680 0.22
681 0.19
682 0.25
683 0.27
684 0.25
685 0.24
686 0.28
687 0.3
688 0.32
689 0.36
690 0.32
691 0.31
692 0.3
693 0.29
694 0.25
695 0.2
696 0.15
697 0.1
698 0.07
699 0.06
700 0.06
701 0.05
702 0.06
703 0.06
704 0.06
705 0.07
706 0.08
707 0.13
708 0.12
709 0.14
710 0.15
711 0.18
712 0.19
713 0.19
714 0.21
715 0.17
716 0.18
717 0.17
718 0.16
719 0.13
720 0.18
721 0.2
722 0.17
723 0.22
724 0.28
725 0.32
726 0.41
727 0.49
728 0.52
729 0.6
730 0.68
731 0.72
732 0.76
733 0.8
734 0.82
735 0.84
736 0.82
737 0.73
738 0.67
739 0.61
740 0.53
741 0.47
742 0.39
743 0.34
744 0.29
745 0.28
746 0.28
747 0.26
748 0.23
749 0.21
750 0.22
751 0.25
752 0.27
753 0.27
754 0.28
755 0.3
756 0.32
757 0.33
758 0.35
759 0.29
760 0.35
761 0.34
762 0.32
763 0.33
764 0.32
765 0.32
766 0.26
767 0.23
768 0.13
769 0.14
770 0.14
771 0.12
772 0.12
773 0.12
774 0.13
775 0.16
776 0.22
777 0.24
778 0.3
779 0.35
780 0.34
781 0.33
782 0.33
783 0.3
784 0.27
785 0.26
786 0.19
787 0.13
788 0.15
789 0.15
790 0.15
791 0.17
792 0.17
793 0.14
794 0.15
795 0.19
796 0.18
797 0.2
798 0.21
799 0.21
800 0.2
801 0.21
802 0.27
803 0.28
804 0.32
805 0.34
806 0.41
807 0.45
808 0.51
809 0.57
810 0.58
811 0.57
812 0.61
813 0.64
814 0.58
815 0.55
816 0.48
817 0.41
818 0.34
819 0.33
820 0.28
821 0.23
822 0.29
823 0.34
824 0.38
825 0.39
826 0.37
827 0.34
828 0.3
829 0.28
830 0.23
831 0.22
832 0.25
833 0.25
834 0.27
835 0.28
836 0.3
837 0.3
838 0.28
839 0.25
840 0.2
841 0.22
842 0.22
843 0.2
844 0.19
845 0.17
846 0.17
847 0.15
848 0.12
849 0.09
850 0.08
851 0.1
852 0.14
853 0.15
854 0.2
855 0.25
856 0.29
857 0.34
858 0.35
859 0.42
860 0.46
861 0.51
862 0.55
863 0.52
864 0.51
865 0.53
866 0.54
867 0.52
868 0.51
869 0.48
870 0.44
871 0.46
872 0.46
873 0.44
874 0.45
875 0.46
876 0.48
877 0.56
878 0.55
879 0.55
880 0.58
881 0.61
882 0.61
883 0.6
884 0.56
885 0.56
886 0.61
887 0.63
888 0.64
889 0.64
890 0.67
891 0.67
892 0.67
893 0.6
894 0.59
895 0.59
896 0.62
897 0.65
898 0.68
899 0.66
900 0.68
901 0.66
902 0.61
903 0.61
904 0.58
905 0.58
906 0.59
907 0.61
908 0.59
909 0.6
910 0.59
911 0.57
912 0.53
913 0.51
914 0.52
915 0.53
916 0.51
917 0.49
918 0.48
919 0.43
920 0.41
921 0.38
922 0.32
923 0.31
924 0.36
925 0.39
926 0.39
927 0.4
928 0.41
929 0.42
930 0.46
931 0.46
932 0.48
933 0.52
934 0.59
935 0.66
936 0.74
937 0.76
938 0.79
939 0.81
940 0.81
941 0.83
942 0.82
943 0.78
944 0.71
945 0.65
946 0.6
947 0.5
948 0.42
949 0.34
950 0.33
951 0.33
952 0.33
953 0.4
954 0.41
955 0.43
956 0.44
957 0.46
958 0.39
959 0.35
960 0.33
961 0.3
962 0.34
963 0.38
964 0.43
965 0.49
966 0.58
967 0.67
968 0.77
969 0.81