Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3BQH7

Protein Details
Accession A0A0C3BQH7    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
489-527TVTRPRDESKEDKKARKQAVKAERQARRVDKKATKEQFSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
278-283GKRRRK
498-523KEDKKARKQAVKAERQARRVDKKATK
536-547GIANKEKTKMRK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPPKSIFRQSGAQHFQLVHRSQRDPLIHDPEASQHVLKAFVPSNIKKGKSRAELETILAPSEVDHDKNARVGEASLYGVYYDDTEYDYMQHLRAVGVQEEGVESVLIEAPSTSKSKGKSKAKASEPISLKDIPAEALPSISELPRNYESQEAIPSSIAGFRPDMDPHLRQTLEALEDDAFVDDDLADDFFEELVKEGERDEDEEFEYEFEENGYIEGEVKEATVTGEEADESWEARFAKFKKEQNAAPPPSDSESDLDGNSEGGDTVGRLPKLPVIGGKRRRKGTSDASGYSMSSSSMFRTEALVTLDERFDHIMEKEYGEDNDEDEDLSGDNSDSAPDLITTREDFEEMMDDFLGNYELLGRKMKPVLPGDNGLDKLNTLRRALGQDERVRINEDDGSDEEKIPMAYEEEDKKDRWDCETILTTYSNLENHPRLIRARDNKPVPKITLDPRTGLPTVLDQANAIKPKIQPPIDSISEGEDDNQPVRMTVTRPRDESKEDKKARKQAVKAERQARRVDKKATKEQFSTEIKHQLKGIANKEKTKMRKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.46
3 0.46
4 0.46
5 0.44
6 0.43
7 0.44
8 0.44
9 0.51
10 0.51
11 0.47
12 0.52
13 0.52
14 0.47
15 0.46
16 0.44
17 0.4
18 0.4
19 0.37
20 0.29
21 0.22
22 0.21
23 0.22
24 0.22
25 0.23
26 0.21
27 0.24
28 0.32
29 0.32
30 0.4
31 0.45
32 0.49
33 0.49
34 0.54
35 0.58
36 0.59
37 0.62
38 0.58
39 0.58
40 0.56
41 0.53
42 0.51
43 0.42
44 0.34
45 0.29
46 0.23
47 0.16
48 0.18
49 0.18
50 0.14
51 0.15
52 0.17
53 0.19
54 0.22
55 0.23
56 0.19
57 0.18
58 0.17
59 0.16
60 0.16
61 0.15
62 0.12
63 0.12
64 0.11
65 0.1
66 0.1
67 0.09
68 0.07
69 0.07
70 0.08
71 0.09
72 0.09
73 0.1
74 0.13
75 0.13
76 0.13
77 0.13
78 0.12
79 0.12
80 0.15
81 0.16
82 0.14
83 0.13
84 0.13
85 0.12
86 0.12
87 0.12
88 0.09
89 0.07
90 0.06
91 0.05
92 0.07
93 0.07
94 0.06
95 0.06
96 0.07
97 0.1
98 0.12
99 0.13
100 0.15
101 0.2
102 0.28
103 0.38
104 0.47
105 0.54
106 0.62
107 0.69
108 0.72
109 0.76
110 0.72
111 0.71
112 0.64
113 0.58
114 0.53
115 0.44
116 0.38
117 0.3
118 0.26
119 0.18
120 0.15
121 0.13
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.12
129 0.11
130 0.16
131 0.18
132 0.2
133 0.2
134 0.21
135 0.22
136 0.21
137 0.24
138 0.19
139 0.18
140 0.16
141 0.15
142 0.13
143 0.15
144 0.13
145 0.11
146 0.1
147 0.1
148 0.13
149 0.13
150 0.16
151 0.18
152 0.2
153 0.21
154 0.26
155 0.25
156 0.23
157 0.23
158 0.22
159 0.19
160 0.17
161 0.16
162 0.11
163 0.11
164 0.11
165 0.1
166 0.08
167 0.06
168 0.06
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.07
185 0.08
186 0.1
187 0.1
188 0.1
189 0.11
190 0.12
191 0.12
192 0.1
193 0.1
194 0.09
195 0.08
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.04
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.05
217 0.05
218 0.06
219 0.05
220 0.08
221 0.08
222 0.09
223 0.14
224 0.14
225 0.23
226 0.3
227 0.34
228 0.39
229 0.44
230 0.46
231 0.5
232 0.59
233 0.53
234 0.47
235 0.42
236 0.36
237 0.33
238 0.32
239 0.23
240 0.15
241 0.14
242 0.14
243 0.13
244 0.12
245 0.1
246 0.09
247 0.08
248 0.07
249 0.04
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.05
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.09
258 0.1
259 0.1
260 0.11
261 0.13
262 0.16
263 0.25
264 0.35
265 0.43
266 0.48
267 0.52
268 0.54
269 0.53
270 0.53
271 0.52
272 0.52
273 0.49
274 0.44
275 0.42
276 0.4
277 0.37
278 0.31
279 0.23
280 0.14
281 0.1
282 0.09
283 0.07
284 0.07
285 0.08
286 0.08
287 0.09
288 0.09
289 0.1
290 0.11
291 0.11
292 0.1
293 0.11
294 0.11
295 0.09
296 0.09
297 0.08
298 0.07
299 0.08
300 0.08
301 0.1
302 0.11
303 0.11
304 0.12
305 0.13
306 0.12
307 0.13
308 0.13
309 0.1
310 0.1
311 0.09
312 0.08
313 0.07
314 0.07
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.07
329 0.07
330 0.09
331 0.09
332 0.09
333 0.09
334 0.09
335 0.1
336 0.09
337 0.09
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.05
344 0.04
345 0.06
346 0.07
347 0.09
348 0.11
349 0.12
350 0.13
351 0.17
352 0.19
353 0.23
354 0.26
355 0.29
356 0.3
357 0.33
358 0.33
359 0.33
360 0.32
361 0.27
362 0.23
363 0.18
364 0.19
365 0.21
366 0.21
367 0.18
368 0.18
369 0.19
370 0.23
371 0.26
372 0.28
373 0.31
374 0.33
375 0.36
376 0.37
377 0.36
378 0.37
379 0.33
380 0.3
381 0.25
382 0.2
383 0.19
384 0.18
385 0.21
386 0.18
387 0.18
388 0.16
389 0.15
390 0.14
391 0.12
392 0.11
393 0.09
394 0.09
395 0.13
396 0.17
397 0.22
398 0.24
399 0.24
400 0.28
401 0.31
402 0.31
403 0.31
404 0.31
405 0.26
406 0.3
407 0.34
408 0.31
409 0.28
410 0.28
411 0.24
412 0.21
413 0.22
414 0.17
415 0.14
416 0.19
417 0.19
418 0.22
419 0.24
420 0.25
421 0.26
422 0.31
423 0.39
424 0.42
425 0.47
426 0.53
427 0.6
428 0.65
429 0.69
430 0.69
431 0.62
432 0.58
433 0.57
434 0.55
435 0.55
436 0.5
437 0.46
438 0.42
439 0.44
440 0.4
441 0.35
442 0.28
443 0.21
444 0.22
445 0.21
446 0.19
447 0.14
448 0.17
449 0.22
450 0.23
451 0.21
452 0.22
453 0.24
454 0.3
455 0.39
456 0.38
457 0.34
458 0.36
459 0.43
460 0.42
461 0.4
462 0.34
463 0.29
464 0.27
465 0.26
466 0.23
467 0.18
468 0.18
469 0.17
470 0.19
471 0.16
472 0.15
473 0.17
474 0.18
475 0.18
476 0.25
477 0.34
478 0.37
479 0.41
480 0.46
481 0.49
482 0.53
483 0.6
484 0.62
485 0.63
486 0.67
487 0.72
488 0.78
489 0.82
490 0.86
491 0.85
492 0.81
493 0.81
494 0.83
495 0.83
496 0.83
497 0.84
498 0.81
499 0.78
500 0.8
501 0.8
502 0.79
503 0.76
504 0.77
505 0.75
506 0.77
507 0.82
508 0.82
509 0.78
510 0.72
511 0.69
512 0.67
513 0.65
514 0.61
515 0.56
516 0.58
517 0.53
518 0.52
519 0.49
520 0.46
521 0.48
522 0.51
523 0.54
524 0.54
525 0.59
526 0.63
527 0.68
528 0.71