Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3GAF0

Protein Details
Accession A0A0C3GAF0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
249-272NPVTSVGRRPRRAKIQKRDWAHVVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
257-262RPRRAK
535-556ARGAAPQRGSLRGGPPARGGQR
Subcellular Location(s) cyto 17, nucl 7, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MEARSDDRQNNMMDPAQQAEVIRQTLQIIPGNARKLLEDLGLTGLSSREQVHREIEAKLLLPRERIPDHWLPTYQIHWEHQLSIPSLLAFDPSPPPTNLSFVRTGLDGRVTGYIETRNSRISNGLTSTSLERAPGPSKSFVRGKSGYVPFWPGGLDDVLMDPEDENKLNGKRKGLRTVPPGFTRGLRLPGDESQDESLVELDEVSVTNHRRDIEGYDEVLSKSTAIEITSAGKASELDGLLPTTRTHLNPVTSVGRRPRRAKIQKRDWAHVVDINKPMTNFHEVVPVMAHKANIQAVPMYPFELDTFQKEAVYHLEMGDSVFVAAHTSAGKTVIAEYAIALAEKHMTRAIYTSPIKALSNQKFRDFKQTFSSSSVGILTGDVQINPEATCLIMTTEILRSMLYKGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDAERGVVWEEVIIMLPDHVNIILLSATVPNTKEFADWVGRTKKKDIYVISTAQRPVPLEHYLYAGRAMYKIVDSTRNFLGEGYKEASEALRRKQDKEREAAGLPPVQRVGARGAAPQRGSLRGGPPARGGQRGSAHSRVVPRSGGAGRTTRIAVDKNLYVHLLDHLRKKSLLPVVVFTFSKKRCEENAATLTNSDLCTSVEKSEVHVAVEKALSRLKGSDKKLPQIGRMRDLLSRGIGVHHGGLLPIVKEVVEILFARGLVKILFATETFAMGVNMPAKCVVFSGIRKHDGRSFREILPGEYTQMAGRAGRRGLDPTGTVVIVASDELPEQNTLHTMMLGIPAKLSSQFRLTYNMILNLLRVEALRVEEMIKRSFSENSSQRLLPDQQKKVIDNERALSTMEKLSCEVCLPDINGYYDDSYGVVAINQNLISMAICHPQGVKLLASGRVVVLHDGHFRLTNAAILLKATPPPSENRDKIKWYWVLALVHPDIKSGQLGKKNHIEPQAIPPRWPPVPHNLAVAHGTYEIVAVPYTSISIVTSRTIKVDVDAIVERHLVNRMDEAVNSLAEIVKEWVSAGTVSEVEWIRMRSLDFQEALRARNELAKRLDQYSCTLCGDFEHHYAVFHGEKVMKAIIAGLKLAISDQNLELIPDYEQRIEVLKELKFIDENSTVSLKGRVACEINSTNELVLTELILENTLANYDPEEVVALLSCFVFQEKTDIEPIIPPKLEQGRDAIIAISDRVGRVQDSHKVAVEDFRSNLKFGLVEVVYEWAKGMPFEQITTLTDVAEGTIVRVITRLDETCREVRDAARVIGDADLFKKMEEAQIKIKRDIVFAASLYF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.28
3 0.24
4 0.24
5 0.21
6 0.21
7 0.23
8 0.22
9 0.21
10 0.19
11 0.2
12 0.21
13 0.25
14 0.26
15 0.24
16 0.28
17 0.33
18 0.36
19 0.35
20 0.33
21 0.3
22 0.28
23 0.28
24 0.23
25 0.18
26 0.16
27 0.17
28 0.16
29 0.15
30 0.13
31 0.12
32 0.11
33 0.12
34 0.13
35 0.16
36 0.18
37 0.21
38 0.24
39 0.29
40 0.31
41 0.31
42 0.31
43 0.28
44 0.28
45 0.29
46 0.31
47 0.28
48 0.29
49 0.31
50 0.35
51 0.36
52 0.37
53 0.41
54 0.43
55 0.46
56 0.48
57 0.46
58 0.43
59 0.43
60 0.43
61 0.41
62 0.37
63 0.34
64 0.35
65 0.35
66 0.34
67 0.34
68 0.36
69 0.32
70 0.29
71 0.27
72 0.21
73 0.2
74 0.17
75 0.15
76 0.11
77 0.12
78 0.16
79 0.18
80 0.22
81 0.22
82 0.26
83 0.26
84 0.31
85 0.31
86 0.31
87 0.31
88 0.28
89 0.28
90 0.26
91 0.26
92 0.22
93 0.22
94 0.17
95 0.16
96 0.18
97 0.17
98 0.16
99 0.18
100 0.19
101 0.21
102 0.24
103 0.25
104 0.27
105 0.27
106 0.28
107 0.3
108 0.28
109 0.29
110 0.28
111 0.29
112 0.24
113 0.26
114 0.27
115 0.25
116 0.23
117 0.19
118 0.17
119 0.2
120 0.23
121 0.25
122 0.27
123 0.32
124 0.33
125 0.39
126 0.45
127 0.43
128 0.47
129 0.44
130 0.44
131 0.47
132 0.49
133 0.45
134 0.41
135 0.43
136 0.35
137 0.33
138 0.3
139 0.2
140 0.17
141 0.15
142 0.13
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.07
149 0.09
150 0.11
151 0.11
152 0.11
153 0.17
154 0.23
155 0.31
156 0.35
157 0.41
158 0.48
159 0.54
160 0.63
161 0.64
162 0.66
163 0.67
164 0.72
165 0.7
166 0.65
167 0.6
168 0.52
169 0.47
170 0.45
171 0.39
172 0.37
173 0.31
174 0.3
175 0.31
176 0.33
177 0.37
178 0.32
179 0.31
180 0.27
181 0.26
182 0.24
183 0.2
184 0.17
185 0.11
186 0.11
187 0.08
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.07
192 0.11
193 0.13
194 0.15
195 0.18
196 0.18
197 0.19
198 0.2
199 0.23
200 0.24
201 0.25
202 0.24
203 0.23
204 0.24
205 0.23
206 0.23
207 0.19
208 0.13
209 0.1
210 0.1
211 0.09
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.11
216 0.12
217 0.12
218 0.11
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.13
223 0.1
224 0.1
225 0.1
226 0.11
227 0.11
228 0.12
229 0.11
230 0.11
231 0.14
232 0.14
233 0.19
234 0.22
235 0.23
236 0.24
237 0.28
238 0.32
239 0.31
240 0.37
241 0.41
242 0.47
243 0.53
244 0.57
245 0.61
246 0.66
247 0.75
248 0.8
249 0.81
250 0.83
251 0.84
252 0.85
253 0.83
254 0.76
255 0.68
256 0.6
257 0.54
258 0.45
259 0.42
260 0.4
261 0.35
262 0.32
263 0.28
264 0.26
265 0.25
266 0.28
267 0.23
268 0.19
269 0.24
270 0.23
271 0.23
272 0.23
273 0.21
274 0.18
275 0.18
276 0.17
277 0.11
278 0.14
279 0.16
280 0.15
281 0.15
282 0.13
283 0.13
284 0.15
285 0.15
286 0.14
287 0.11
288 0.12
289 0.12
290 0.14
291 0.14
292 0.14
293 0.17
294 0.16
295 0.17
296 0.16
297 0.17
298 0.17
299 0.18
300 0.15
301 0.13
302 0.13
303 0.12
304 0.12
305 0.11
306 0.07
307 0.05
308 0.04
309 0.04
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.06
328 0.05
329 0.09
330 0.09
331 0.1
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.12
336 0.14
337 0.18
338 0.2
339 0.2
340 0.2
341 0.22
342 0.22
343 0.26
344 0.34
345 0.35
346 0.43
347 0.45
348 0.51
349 0.54
350 0.55
351 0.61
352 0.53
353 0.47
354 0.46
355 0.47
356 0.42
357 0.41
358 0.4
359 0.29
360 0.28
361 0.26
362 0.17
363 0.13
364 0.11
365 0.08
366 0.09
367 0.09
368 0.08
369 0.08
370 0.08
371 0.09
372 0.09
373 0.08
374 0.06
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.06
382 0.07
383 0.08
384 0.08
385 0.07
386 0.08
387 0.09
388 0.12
389 0.11
390 0.1
391 0.11
392 0.13
393 0.14
394 0.13
395 0.15
396 0.12
397 0.12
398 0.13
399 0.11
400 0.09
401 0.09
402 0.1
403 0.07
404 0.06
405 0.08
406 0.08
407 0.09
408 0.09
409 0.09
410 0.07
411 0.09
412 0.09
413 0.07
414 0.07
415 0.08
416 0.09
417 0.08
418 0.08
419 0.06
420 0.06
421 0.06
422 0.06
423 0.05
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.05
437 0.05
438 0.06
439 0.07
440 0.07
441 0.09
442 0.09
443 0.09
444 0.09
445 0.11
446 0.15
447 0.15
448 0.21
449 0.29
450 0.32
451 0.34
452 0.38
453 0.4
454 0.39
455 0.44
456 0.4
457 0.37
458 0.39
459 0.41
460 0.39
461 0.38
462 0.36
463 0.31
464 0.3
465 0.24
466 0.2
467 0.19
468 0.19
469 0.17
470 0.16
471 0.18
472 0.17
473 0.16
474 0.15
475 0.12
476 0.11
477 0.09
478 0.09
479 0.07
480 0.07
481 0.08
482 0.09
483 0.15
484 0.16
485 0.19
486 0.2
487 0.2
488 0.2
489 0.19
490 0.19
491 0.13
492 0.15
493 0.14
494 0.13
495 0.12
496 0.12
497 0.13
498 0.16
499 0.18
500 0.2
501 0.27
502 0.29
503 0.33
504 0.41
505 0.49
506 0.48
507 0.5
508 0.49
509 0.44
510 0.43
511 0.41
512 0.34
513 0.3
514 0.25
515 0.2
516 0.17
517 0.14
518 0.13
519 0.13
520 0.13
521 0.12
522 0.13
523 0.15
524 0.18
525 0.2
526 0.21
527 0.21
528 0.2
529 0.19
530 0.2
531 0.19
532 0.18
533 0.22
534 0.23
535 0.21
536 0.22
537 0.25
538 0.25
539 0.26
540 0.25
541 0.22
542 0.25
543 0.27
544 0.3
545 0.28
546 0.26
547 0.26
548 0.3
549 0.27
550 0.25
551 0.22
552 0.17
553 0.19
554 0.19
555 0.18
556 0.16
557 0.16
558 0.15
559 0.16
560 0.16
561 0.13
562 0.14
563 0.13
564 0.13
565 0.13
566 0.14
567 0.14
568 0.14
569 0.14
570 0.12
571 0.11
572 0.12
573 0.15
574 0.16
575 0.21
576 0.21
577 0.22
578 0.23
579 0.23
580 0.26
581 0.25
582 0.26
583 0.2
584 0.21
585 0.22
586 0.24
587 0.23
588 0.19
589 0.22
590 0.2
591 0.25
592 0.24
593 0.25
594 0.25
595 0.32
596 0.33
597 0.33
598 0.37
599 0.33
600 0.32
601 0.29
602 0.27
603 0.22
604 0.19
605 0.12
606 0.07
607 0.06
608 0.08
609 0.09
610 0.09
611 0.11
612 0.11
613 0.12
614 0.15
615 0.15
616 0.13
617 0.15
618 0.14
619 0.12
620 0.13
621 0.12
622 0.09
623 0.1
624 0.1
625 0.08
626 0.1
627 0.15
628 0.22
629 0.25
630 0.32
631 0.34
632 0.38
633 0.43
634 0.43
635 0.43
636 0.45
637 0.44
638 0.39
639 0.38
640 0.35
641 0.31
642 0.31
643 0.25
644 0.17
645 0.15
646 0.12
647 0.1
648 0.09
649 0.08
650 0.07
651 0.06
652 0.06
653 0.05
654 0.05
655 0.05
656 0.05
657 0.04
658 0.04
659 0.04
660 0.04
661 0.04
662 0.04
663 0.04
664 0.04
665 0.05
666 0.05
667 0.05
668 0.06
669 0.06
670 0.06
671 0.05
672 0.05
673 0.05
674 0.04
675 0.05
676 0.05
677 0.06
678 0.06
679 0.06
680 0.06
681 0.06
682 0.06
683 0.06
684 0.07
685 0.08
686 0.08
687 0.08
688 0.08
689 0.08
690 0.08
691 0.08
692 0.09
693 0.1
694 0.12
695 0.19
696 0.23
697 0.28
698 0.29
699 0.31
700 0.35
701 0.38
702 0.39
703 0.39
704 0.39
705 0.35
706 0.4
707 0.39
708 0.34
709 0.31
710 0.27
711 0.21
712 0.18
713 0.17
714 0.11
715 0.12
716 0.11
717 0.08
718 0.09
719 0.1
720 0.11
721 0.11
722 0.12
723 0.13
724 0.14
725 0.14
726 0.13
727 0.12
728 0.13
729 0.11
730 0.1
731 0.08
732 0.07
733 0.06
734 0.06
735 0.04
736 0.03
737 0.04
738 0.04
739 0.05
740 0.05
741 0.05
742 0.05
743 0.06
744 0.07
745 0.07
746 0.07
747 0.06
748 0.06
749 0.1
750 0.11
751 0.1
752 0.09
753 0.09
754 0.09
755 0.11
756 0.12
757 0.1
758 0.12
759 0.14
760 0.15
761 0.2
762 0.21
763 0.22
764 0.23
765 0.23
766 0.21
767 0.19
768 0.18
769 0.13
770 0.12
771 0.09
772 0.07
773 0.06
774 0.05
775 0.06
776 0.06
777 0.06
778 0.08
779 0.1
780 0.13
781 0.14
782 0.14
783 0.14
784 0.15
785 0.17
786 0.17
787 0.23
788 0.25
789 0.28
790 0.31
791 0.3
792 0.29
793 0.32
794 0.35
795 0.35
796 0.4
797 0.39
798 0.41
799 0.44
800 0.45
801 0.47
802 0.49
803 0.45
804 0.38
805 0.37
806 0.33
807 0.31
808 0.3
809 0.25
810 0.19
811 0.18
812 0.16
813 0.14
814 0.13
815 0.13
816 0.13
817 0.12
818 0.11
819 0.08
820 0.09
821 0.09
822 0.1
823 0.11
824 0.12
825 0.12
826 0.12
827 0.12
828 0.11
829 0.1
830 0.09
831 0.07
832 0.06
833 0.06
834 0.05
835 0.05
836 0.06
837 0.07
838 0.06
839 0.06
840 0.06
841 0.06
842 0.06
843 0.06
844 0.07
845 0.08
846 0.08
847 0.09
848 0.09
849 0.1
850 0.12
851 0.12
852 0.1
853 0.1
854 0.13
855 0.15
856 0.15
857 0.14
858 0.13
859 0.12
860 0.13
861 0.11
862 0.1
863 0.1
864 0.12
865 0.12
866 0.13
867 0.13
868 0.13
869 0.13
870 0.12
871 0.11
872 0.1
873 0.1
874 0.09
875 0.08
876 0.09
877 0.09
878 0.11
879 0.11
880 0.11
881 0.12
882 0.16
883 0.22
884 0.3
885 0.34
886 0.39
887 0.43
888 0.47
889 0.48
890 0.52
891 0.49
892 0.42
893 0.41
894 0.38
895 0.35
896 0.31
897 0.33
898 0.27
899 0.27
900 0.25
901 0.21
902 0.17
903 0.16
904 0.16
905 0.15
906 0.2
907 0.24
908 0.26
909 0.31
910 0.39
911 0.4
912 0.44
913 0.46
914 0.43
915 0.38
916 0.46
917 0.52
918 0.44
919 0.43
920 0.4
921 0.39
922 0.39
923 0.39
924 0.32
925 0.31
926 0.36
927 0.36
928 0.38
929 0.33
930 0.33
931 0.32
932 0.29
933 0.2
934 0.14
935 0.13
936 0.09
937 0.08
938 0.07
939 0.06
940 0.05
941 0.04
942 0.04
943 0.04
944 0.05
945 0.05
946 0.05
947 0.05
948 0.06
949 0.07
950 0.1
951 0.12
952 0.12
953 0.14
954 0.15
955 0.14
956 0.14
957 0.15
958 0.14
959 0.15
960 0.16
961 0.15
962 0.15
963 0.16
964 0.15
965 0.13
966 0.17
967 0.15
968 0.14
969 0.14
970 0.17
971 0.17
972 0.16
973 0.18
974 0.15
975 0.14
976 0.13
977 0.12
978 0.1
979 0.09
980 0.1
981 0.09
982 0.08
983 0.08
984 0.08
985 0.08
986 0.08
987 0.08
988 0.08
989 0.07
990 0.07
991 0.07
992 0.12
993 0.12
994 0.12
995 0.15
996 0.15
997 0.14
998 0.16
999 0.17
1000 0.18
1001 0.21
1002 0.24
1003 0.23
1004 0.23
1005 0.3
1006 0.3
1007 0.31
1008 0.26
1009 0.24
1010 0.2
1011 0.26
1012 0.27
1013 0.26
1014 0.29
1015 0.33
1016 0.35
1017 0.39
1018 0.4
1019 0.35
1020 0.38
1021 0.34
1022 0.32
1023 0.28
1024 0.26
1025 0.21
1026 0.2
1027 0.22
1028 0.21
1029 0.2
1030 0.2
1031 0.18
1032 0.18
1033 0.19
1034 0.21
1035 0.18
1036 0.15
1037 0.17
1038 0.15
1039 0.15
1040 0.17
1041 0.17
1042 0.14
1043 0.12
1044 0.15
1045 0.14
1046 0.13
1047 0.13
1048 0.11
1049 0.1
1050 0.1
1051 0.11
1052 0.09
1053 0.08
1054 0.09
1055 0.09
1056 0.11
1057 0.11
1058 0.12
1059 0.12
1060 0.11
1061 0.12
1062 0.13
1063 0.15
1064 0.14
1065 0.14
1066 0.14
1067 0.16
1068 0.16
1069 0.18
1070 0.2
1071 0.19
1072 0.22
1073 0.22
1074 0.23
1075 0.22
1076 0.22
1077 0.25
1078 0.22
1079 0.22
1080 0.22
1081 0.22
1082 0.21
1083 0.21
1084 0.23
1085 0.19
1086 0.19
1087 0.2
1088 0.2
1089 0.21
1090 0.21
1091 0.27
1092 0.27
1093 0.29
1094 0.28
1095 0.27
1096 0.23
1097 0.22
1098 0.21
1099 0.16
1100 0.12
1101 0.09
1102 0.08
1103 0.07
1104 0.08
1105 0.07
1106 0.07
1107 0.06
1108 0.06
1109 0.07
1110 0.06
1111 0.06
1112 0.07
1113 0.09
1114 0.09
1115 0.09
1116 0.09
1117 0.09
1118 0.09
1119 0.09
1120 0.08
1121 0.07
1122 0.07
1123 0.06
1124 0.06
1125 0.07
1126 0.07
1127 0.07
1128 0.12
1129 0.13
1130 0.16
1131 0.18
1132 0.19
1133 0.18
1134 0.23
1135 0.26
1136 0.27
1137 0.26
1138 0.24
1139 0.29
1140 0.36
1141 0.36
1142 0.32
1143 0.34
1144 0.31
1145 0.31
1146 0.32
1147 0.24
1148 0.18
1149 0.17
1150 0.16
1151 0.14
1152 0.12
1153 0.11
1154 0.11
1155 0.12
1156 0.12
1157 0.15
1158 0.2
1159 0.26
1160 0.31
1161 0.33
1162 0.35
1163 0.35
1164 0.35
1165 0.37
1166 0.36
1167 0.32
1168 0.28
1169 0.33
1170 0.32
1171 0.31
1172 0.31
1173 0.25
1174 0.22
1175 0.18
1176 0.24
1177 0.17
1178 0.16
1179 0.15
1180 0.19
1181 0.18
1182 0.17
1183 0.17
1184 0.11
1185 0.11
1186 0.11
1187 0.11
1188 0.13
1189 0.14
1190 0.15
1191 0.16
1192 0.17
1193 0.19
1194 0.23
1195 0.22
1196 0.16
1197 0.16
1198 0.15
1199 0.13
1200 0.13
1201 0.1
1202 0.07
1203 0.09
1204 0.09
1205 0.09
1206 0.1
1207 0.1
1208 0.11
1209 0.16
1210 0.17
1211 0.19
1212 0.24
1213 0.3
1214 0.34
1215 0.36
1216 0.37
1217 0.35
1218 0.34
1219 0.38
1220 0.37
1221 0.33
1222 0.3
1223 0.28
1224 0.26
1225 0.25
1226 0.24
1227 0.18
1228 0.16
1229 0.18
1230 0.16
1231 0.15
1232 0.16
1233 0.15
1234 0.21
1235 0.24
1236 0.27
1237 0.34
1238 0.43
1239 0.48
1240 0.49
1241 0.54
1242 0.48
1243 0.45
1244 0.44
1245 0.37
1246 0.32