Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3CDC6

Protein Details
Accession A0A0C3CDC6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
293-325AKAKGLCFSCRKPRHMRKDCPDKKKFQVREIITHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
70-83PAGPPAEKRKSHVK
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 12, nucl 10.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MKIYMETHLRDPHRLHPIIPVDLHRKDHNLQEGPPPPLNPPAGPPALGPPGPPGPPGPGPPPVPVVPAPPAGPPAEKRKSHVKKPDDLTESKQWDRFKRQTFVYIQENRKDFDTGESVIRFLLSFMTEGLPEKFAVNFIDDIAEEWEHEKAEARRLFLPPPPDPNWGTLTTFQEKCEATFGDQNKKSSAEHQLALLKQGTRSTKEYFQEFDQLSNRAFYAGGQLPGGYTDWKMSVINIDGLDRRRAEQRRALSVHYSHPTPKPASFPKAVTEKRTGTGVTYTGQGQKMDLDAAKAKGLCFSCRKPRHMRKDCPDKKKFQVREIITEFTEEEKKEMAEALKKEGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.46
3 0.47
4 0.49
5 0.47
6 0.47
7 0.45
8 0.43
9 0.46
10 0.5
11 0.44
12 0.44
13 0.43
14 0.47
15 0.5
16 0.46
17 0.44
18 0.49
19 0.52
20 0.53
21 0.52
22 0.46
23 0.39
24 0.41
25 0.41
26 0.32
27 0.3
28 0.3
29 0.29
30 0.28
31 0.27
32 0.26
33 0.28
34 0.27
35 0.24
36 0.22
37 0.25
38 0.25
39 0.25
40 0.22
41 0.22
42 0.25
43 0.28
44 0.27
45 0.29
46 0.31
47 0.32
48 0.35
49 0.3
50 0.31
51 0.28
52 0.28
53 0.25
54 0.24
55 0.23
56 0.19
57 0.21
58 0.19
59 0.21
60 0.22
61 0.29
62 0.35
63 0.36
64 0.39
65 0.48
66 0.56
67 0.62
68 0.69
69 0.66
70 0.66
71 0.71
72 0.76
73 0.71
74 0.66
75 0.62
76 0.61
77 0.6
78 0.54
79 0.53
80 0.49
81 0.5
82 0.56
83 0.59
84 0.57
85 0.56
86 0.55
87 0.58
88 0.56
89 0.54
90 0.55
91 0.55
92 0.53
93 0.53
94 0.53
95 0.46
96 0.44
97 0.39
98 0.3
99 0.24
100 0.22
101 0.18
102 0.2
103 0.19
104 0.17
105 0.16
106 0.16
107 0.12
108 0.09
109 0.08
110 0.05
111 0.05
112 0.06
113 0.07
114 0.07
115 0.08
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.08
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.08
125 0.07
126 0.08
127 0.07
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.1
137 0.1
138 0.18
139 0.2
140 0.21
141 0.24
142 0.25
143 0.27
144 0.26
145 0.3
146 0.24
147 0.29
148 0.3
149 0.31
150 0.3
151 0.31
152 0.31
153 0.27
154 0.27
155 0.23
156 0.23
157 0.25
158 0.24
159 0.23
160 0.23
161 0.22
162 0.2
163 0.2
164 0.16
165 0.13
166 0.18
167 0.2
168 0.26
169 0.29
170 0.29
171 0.28
172 0.29
173 0.28
174 0.26
175 0.3
176 0.24
177 0.22
178 0.23
179 0.25
180 0.24
181 0.25
182 0.24
183 0.17
184 0.15
185 0.19
186 0.19
187 0.19
188 0.22
189 0.24
190 0.28
191 0.3
192 0.32
193 0.3
194 0.29
195 0.32
196 0.29
197 0.28
198 0.25
199 0.24
200 0.22
201 0.2
202 0.19
203 0.13
204 0.12
205 0.09
206 0.13
207 0.13
208 0.13
209 0.13
210 0.13
211 0.12
212 0.13
213 0.13
214 0.08
215 0.06
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.1
223 0.12
224 0.11
225 0.12
226 0.15
227 0.17
228 0.2
229 0.19
230 0.19
231 0.26
232 0.3
233 0.35
234 0.39
235 0.42
236 0.48
237 0.5
238 0.5
239 0.47
240 0.45
241 0.46
242 0.41
243 0.38
244 0.34
245 0.34
246 0.37
247 0.35
248 0.34
249 0.36
250 0.39
251 0.43
252 0.43
253 0.41
254 0.42
255 0.49
256 0.5
257 0.48
258 0.48
259 0.44
260 0.42
261 0.42
262 0.36
263 0.28
264 0.27
265 0.24
266 0.18
267 0.17
268 0.18
269 0.2
270 0.22
271 0.2
272 0.18
273 0.17
274 0.17
275 0.18
276 0.16
277 0.15
278 0.16
279 0.18
280 0.2
281 0.2
282 0.19
283 0.22
284 0.24
285 0.27
286 0.31
287 0.38
288 0.46
289 0.53
290 0.61
291 0.67
292 0.76
293 0.82
294 0.85
295 0.88
296 0.88
297 0.91
298 0.93
299 0.93
300 0.91
301 0.88
302 0.88
303 0.88
304 0.84
305 0.81
306 0.81
307 0.75
308 0.76
309 0.72
310 0.65
311 0.55
312 0.49
313 0.42
314 0.36
315 0.36
316 0.27
317 0.24
318 0.21
319 0.21
320 0.2
321 0.23
322 0.24
323 0.26
324 0.28