Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E9D0Q3

Protein Details
Accession E9D0Q3    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-61VETDQPSKKSKKSFVRNAKAPTETKSKGASKDKKPNNVTNGKAHydrophilic
107-128VTNESVKPPKKKAKEEAKATTTHydrophilic
136-159KKDDAKAKEKKEPFKKSKKEVEVLBasic
199-224PQIPDSKQVKRKIRKLKKNHTDEPEEBasic
462-490TRKAQNGETKGKKDKRPKAKTPTIVTDNTHydrophilic
509-530IKDKLGKVEKPEKSKKSKKSKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-12KKDKKRKA
25-54SKKSKKSFVRNAKAPTETKSKGASKDKKPN
113-124KPPKKKAKEEAK
134-154SLKKDDAKAKEKKEPFKKSKK
208-216KRKIRKLKK
342-358SKKIAKEESKRAAKAEK
419-428KATKKSEKSK
453-482KPAKIKEADTRKAQNGETKGKKDKRPKAKT
493-530PSKSNPSEAKDPKGKEIKDKLGKVEKPEKSKKSKKSKA
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAAEKKDKKRKAASSSSAVETDQPSKKSKKSFVRNAKAPTETKSKGASKDKKPNNVTNGKATKPLNLDNAPARDIKPRKRAADFLSDEEDEIIKRDKKDALKDSASVTNESVKPPKKKAKEEAKATTTTTEKVSLKKDDAKAKEKKEPFKKSKKEVEVLADNDHESEDDHTLALIRGFDSSGEEDISGDEGFEPGQAVPQIPDSKQVKRKIRKLKKNHTDEPEEPGTVYIGRIPHGFYEHEMRAYFSQFGDITRLRMSRNRTTGRSKHYGYIEFASESVAKIVADTMDNYLMFGHILKCKFVPQDQLHPETFKGANRRFKSVPWNQIEKKQLEAGKTRDQWSKKIAKEESKRAAKAEKMKALGYEIDLPKLASVDGVPAQKTLAQAKTAIEDDNIEAPKAIEAPPKAITKPDAQEELKKATKKSEKSKDSANASAKKADAPVSEQTKEATHEKPAKIKEADTRKAQNGETKGKKDKRPKAKTPTIVTDNTEKPSKSNPSEAKDPKGKEIKDKLGKVEKPEKSKKSKKSKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.77
3 0.71
4 0.62
5 0.53
6 0.46
7 0.39
8 0.39
9 0.37
10 0.35
11 0.39
12 0.45
13 0.51
14 0.57
15 0.63
16 0.66
17 0.7
18 0.78
19 0.82
20 0.86
21 0.88
22 0.86
23 0.83
24 0.79
25 0.71
26 0.65
27 0.63
28 0.55
29 0.51
30 0.51
31 0.5
32 0.52
33 0.6
34 0.64
35 0.65
36 0.74
37 0.79
38 0.81
39 0.84
40 0.84
41 0.83
42 0.82
43 0.75
44 0.75
45 0.72
46 0.64
47 0.63
48 0.55
49 0.51
50 0.47
51 0.48
52 0.45
53 0.4
54 0.43
55 0.42
56 0.44
57 0.4
58 0.37
59 0.34
60 0.36
61 0.43
62 0.48
63 0.52
64 0.57
65 0.61
66 0.64
67 0.69
68 0.65
69 0.67
70 0.61
71 0.55
72 0.52
73 0.46
74 0.41
75 0.35
76 0.31
77 0.2
78 0.19
79 0.21
80 0.2
81 0.21
82 0.24
83 0.3
84 0.35
85 0.45
86 0.5
87 0.52
88 0.5
89 0.51
90 0.51
91 0.51
92 0.46
93 0.38
94 0.32
95 0.3
96 0.29
97 0.3
98 0.35
99 0.37
100 0.42
101 0.49
102 0.59
103 0.61
104 0.68
105 0.75
106 0.78
107 0.8
108 0.83
109 0.82
110 0.77
111 0.71
112 0.63
113 0.56
114 0.47
115 0.38
116 0.31
117 0.28
118 0.25
119 0.28
120 0.31
121 0.32
122 0.35
123 0.42
124 0.46
125 0.49
126 0.54
127 0.59
128 0.62
129 0.64
130 0.69
131 0.68
132 0.72
133 0.74
134 0.77
135 0.79
136 0.81
137 0.85
138 0.84
139 0.87
140 0.85
141 0.78
142 0.71
143 0.68
144 0.63
145 0.56
146 0.49
147 0.39
148 0.32
149 0.27
150 0.23
151 0.16
152 0.11
153 0.1
154 0.09
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.09
161 0.07
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.07
175 0.06
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.04
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.1
187 0.13
188 0.12
189 0.2
190 0.22
191 0.3
192 0.37
193 0.46
194 0.52
195 0.59
196 0.69
197 0.72
198 0.8
199 0.83
200 0.86
201 0.89
202 0.89
203 0.89
204 0.88
205 0.82
206 0.79
207 0.7
208 0.66
209 0.57
210 0.46
211 0.37
212 0.29
213 0.23
214 0.15
215 0.14
216 0.09
217 0.07
218 0.08
219 0.08
220 0.09
221 0.09
222 0.1
223 0.11
224 0.1
225 0.15
226 0.15
227 0.16
228 0.16
229 0.17
230 0.16
231 0.17
232 0.16
233 0.1
234 0.11
235 0.1
236 0.1
237 0.13
238 0.12
239 0.13
240 0.14
241 0.15
242 0.15
243 0.19
244 0.25
245 0.27
246 0.35
247 0.38
248 0.41
249 0.48
250 0.53
251 0.55
252 0.56
253 0.5
254 0.47
255 0.46
256 0.43
257 0.37
258 0.32
259 0.26
260 0.2
261 0.18
262 0.15
263 0.12
264 0.1
265 0.08
266 0.06
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.04
271 0.05
272 0.05
273 0.06
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.07
282 0.1
283 0.1
284 0.11
285 0.12
286 0.14
287 0.16
288 0.17
289 0.24
290 0.23
291 0.33
292 0.36
293 0.4
294 0.38
295 0.38
296 0.36
297 0.3
298 0.29
299 0.23
300 0.27
301 0.3
302 0.38
303 0.39
304 0.45
305 0.43
306 0.44
307 0.51
308 0.5
309 0.53
310 0.5
311 0.57
312 0.53
313 0.59
314 0.62
315 0.53
316 0.47
317 0.43
318 0.39
319 0.34
320 0.38
321 0.36
322 0.39
323 0.41
324 0.44
325 0.45
326 0.45
327 0.45
328 0.47
329 0.51
330 0.45
331 0.5
332 0.52
333 0.55
334 0.6
335 0.66
336 0.68
337 0.66
338 0.64
339 0.58
340 0.57
341 0.53
342 0.54
343 0.53
344 0.48
345 0.43
346 0.43
347 0.41
348 0.38
349 0.33
350 0.25
351 0.25
352 0.2
353 0.19
354 0.18
355 0.18
356 0.16
357 0.15
358 0.13
359 0.06
360 0.05
361 0.07
362 0.1
363 0.12
364 0.12
365 0.12
366 0.13
367 0.14
368 0.16
369 0.18
370 0.17
371 0.16
372 0.17
373 0.18
374 0.2
375 0.19
376 0.18
377 0.14
378 0.13
379 0.13
380 0.17
381 0.17
382 0.15
383 0.14
384 0.13
385 0.13
386 0.13
387 0.14
388 0.13
389 0.14
390 0.17
391 0.22
392 0.24
393 0.24
394 0.25
395 0.26
396 0.28
397 0.31
398 0.32
399 0.34
400 0.34
401 0.4
402 0.41
403 0.46
404 0.46
405 0.45
406 0.42
407 0.45
408 0.52
409 0.54
410 0.61
411 0.65
412 0.66
413 0.65
414 0.73
415 0.71
416 0.69
417 0.68
418 0.66
419 0.62
420 0.58
421 0.58
422 0.49
423 0.43
424 0.38
425 0.34
426 0.27
427 0.24
428 0.3
429 0.32
430 0.33
431 0.32
432 0.31
433 0.29
434 0.31
435 0.31
436 0.25
437 0.28
438 0.36
439 0.39
440 0.45
441 0.47
442 0.51
443 0.49
444 0.51
445 0.51
446 0.53
447 0.56
448 0.57
449 0.6
450 0.58
451 0.6
452 0.59
453 0.57
454 0.55
455 0.59
456 0.59
457 0.6
458 0.65
459 0.69
460 0.77
461 0.8
462 0.82
463 0.83
464 0.85
465 0.88
466 0.88
467 0.9
468 0.9
469 0.87
470 0.86
471 0.81
472 0.74
473 0.68
474 0.65
475 0.58
476 0.54
477 0.51
478 0.41
479 0.37
480 0.42
481 0.48
482 0.45
483 0.51
484 0.54
485 0.56
486 0.66
487 0.69
488 0.7
489 0.69
490 0.68
491 0.67
492 0.69
493 0.65
494 0.65
495 0.68
496 0.7
497 0.71
498 0.72
499 0.72
500 0.73
501 0.74
502 0.73
503 0.74
504 0.71
505 0.72
506 0.78
507 0.78
508 0.79
509 0.85
510 0.87