Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3GC88

Protein Details
Accession A0A0C3GC88    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
139-167GSSSDSSRSRERNRKRRVPDTHKRASSRAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
87-109AKEKEREKDEGKGKEKSRKKAKR
147-163SRERNRKRRVPDTHKRA
183-190RSRSRGRK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039715  ZCCHC10  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13917  zf-CCHC_3  
Amino Acid Sequences MSKYAPHSRSHNNPRATSSTVCQKCLKTGHFIYECKAIRPYVSRPSRTQQLEKPGVLAKLKVDGKPSVEVPEEFKSKTGTANRILEAKEKEREKDEGKGKEKSRKKAKRDSDSDSSDSSSSSDSDSSSDSDSFSDSSSGSSSDSSRSRERNRKRRVPDTHKRASSRASSSSGSSESSIDDRSRSRSRGRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.66
3 0.62
4 0.54
5 0.48
6 0.49
7 0.45
8 0.46
9 0.45
10 0.41
11 0.43
12 0.47
13 0.45
14 0.42
15 0.42
16 0.47
17 0.48
18 0.48
19 0.44
20 0.46
21 0.44
22 0.38
23 0.38
24 0.29
25 0.26
26 0.3
27 0.33
28 0.34
29 0.42
30 0.44
31 0.46
32 0.52
33 0.58
34 0.59
35 0.6
36 0.55
37 0.57
38 0.58
39 0.53
40 0.5
41 0.44
42 0.41
43 0.35
44 0.3
45 0.2
46 0.23
47 0.25
48 0.24
49 0.24
50 0.23
51 0.24
52 0.26
53 0.26
54 0.21
55 0.2
56 0.19
57 0.2
58 0.23
59 0.23
60 0.21
61 0.21
62 0.2
63 0.18
64 0.23
65 0.23
66 0.23
67 0.26
68 0.29
69 0.29
70 0.29
71 0.3
72 0.29
73 0.28
74 0.27
75 0.28
76 0.27
77 0.28
78 0.28
79 0.31
80 0.28
81 0.33
82 0.37
83 0.39
84 0.42
85 0.48
86 0.5
87 0.55
88 0.6
89 0.62
90 0.66
91 0.67
92 0.7
93 0.73
94 0.79
95 0.8
96 0.79
97 0.77
98 0.73
99 0.68
100 0.63
101 0.54
102 0.45
103 0.35
104 0.29
105 0.22
106 0.15
107 0.11
108 0.09
109 0.09
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.1
114 0.11
115 0.11
116 0.1
117 0.1
118 0.11
119 0.11
120 0.1
121 0.09
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.09
126 0.08
127 0.09
128 0.09
129 0.14
130 0.17
131 0.21
132 0.26
133 0.34
134 0.43
135 0.53
136 0.63
137 0.69
138 0.77
139 0.82
140 0.85
141 0.88
142 0.89
143 0.89
144 0.89
145 0.88
146 0.88
147 0.86
148 0.81
149 0.73
150 0.68
151 0.65
152 0.59
153 0.54
154 0.48
155 0.42
156 0.4
157 0.4
158 0.35
159 0.29
160 0.25
161 0.21
162 0.19
163 0.19
164 0.2
165 0.18
166 0.2
167 0.21
168 0.28
169 0.35
170 0.37