Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3GKT7

Protein Details
Accession A0A0C3GKT7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-52IEKLTIKKPKRAETRPCPVCEEHydrophilic
118-144ASKTIQSIKMHRKKRHGKLREMTRDEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
128-135HRKKRHGK
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito 10, cyto_nucl 8.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006642  Rad18_UBZ4  
IPR031824  RNF220_mid  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF15926  RNF220  
PF13923  zf-C3HC4_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
Amino Acid Sequences MVVRGSVKGKKRAREESPAAESSSSSLSVPIEKLTIKKPKRAETRPCPVCEELIPLRLLPVHLDLELQRVEEIVKAVGSYEVLHDEAVAGPSTRKSITALNPHPRTNPTDLTDTLEAASKTIQSIKMHRKKRHGKLREMTRDEEDGRQVRATWGAGVGDGIVCPVCGVDVRGDRDVVEAHVDSCLAHEGRRLEEERRVAEEDVDISIDGDGDGTRLRATDGANLRGLGFHTRDQNHQDVDDEVDVDGDDEAVYGDAQFTEGDILGHTEDADVQIDGDSTGTSDEDEDGNMQRKTLRDLVAEGKVVRRRSPAGADGVNAVKAKMEEVMGVGDADKMDIAVNSARRNGNSSALIQALENKIKQLESMRVSSSTSSLCRICLDPYTEPTVSTGCWHTCCRECWLRCLGSTQLCPICKRITAAGDLRRVYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.76
3 0.75
4 0.75
5 0.68
6 0.61
7 0.51
8 0.44
9 0.35
10 0.3
11 0.22
12 0.15
13 0.14
14 0.13
15 0.15
16 0.16
17 0.15
18 0.16
19 0.17
20 0.2
21 0.28
22 0.37
23 0.4
24 0.47
25 0.54
26 0.61
27 0.7
28 0.77
29 0.79
30 0.79
31 0.85
32 0.85
33 0.8
34 0.76
35 0.67
36 0.59
37 0.49
38 0.46
39 0.39
40 0.35
41 0.32
42 0.26
43 0.25
44 0.24
45 0.22
46 0.17
47 0.16
48 0.14
49 0.13
50 0.15
51 0.14
52 0.17
53 0.18
54 0.16
55 0.13
56 0.12
57 0.12
58 0.12
59 0.12
60 0.09
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.07
67 0.08
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.08
72 0.09
73 0.09
74 0.1
75 0.09
76 0.08
77 0.08
78 0.09
79 0.12
80 0.11
81 0.11
82 0.12
83 0.18
84 0.25
85 0.34
86 0.42
87 0.51
88 0.55
89 0.56
90 0.58
91 0.54
92 0.52
93 0.48
94 0.44
95 0.36
96 0.36
97 0.35
98 0.37
99 0.35
100 0.3
101 0.24
102 0.22
103 0.19
104 0.15
105 0.15
106 0.1
107 0.1
108 0.13
109 0.16
110 0.16
111 0.25
112 0.36
113 0.44
114 0.53
115 0.6
116 0.68
117 0.74
118 0.82
119 0.85
120 0.82
121 0.84
122 0.84
123 0.88
124 0.88
125 0.82
126 0.75
127 0.67
128 0.62
129 0.53
130 0.46
131 0.4
132 0.31
133 0.28
134 0.25
135 0.22
136 0.19
137 0.19
138 0.17
139 0.11
140 0.1
141 0.08
142 0.08
143 0.07
144 0.07
145 0.05
146 0.04
147 0.04
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.04
155 0.07
156 0.11
157 0.14
158 0.15
159 0.15
160 0.15
161 0.16
162 0.16
163 0.12
164 0.11
165 0.08
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.06
171 0.09
172 0.07
173 0.07
174 0.09
175 0.11
176 0.12
177 0.15
178 0.17
179 0.16
180 0.21
181 0.24
182 0.22
183 0.24
184 0.25
185 0.22
186 0.2
187 0.19
188 0.15
189 0.12
190 0.11
191 0.07
192 0.05
193 0.05
194 0.04
195 0.04
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.06
205 0.06
206 0.12
207 0.15
208 0.17
209 0.17
210 0.17
211 0.17
212 0.16
213 0.16
214 0.12
215 0.11
216 0.12
217 0.17
218 0.18
219 0.21
220 0.25
221 0.27
222 0.25
223 0.24
224 0.22
225 0.17
226 0.17
227 0.15
228 0.11
229 0.08
230 0.07
231 0.07
232 0.06
233 0.05
234 0.04
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.04
244 0.03
245 0.03
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.04
255 0.04
256 0.05
257 0.05
258 0.04
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.05
271 0.05
272 0.06
273 0.07
274 0.09
275 0.14
276 0.14
277 0.14
278 0.15
279 0.16
280 0.21
281 0.24
282 0.24
283 0.21
284 0.24
285 0.28
286 0.29
287 0.3
288 0.26
289 0.27
290 0.29
291 0.3
292 0.29
293 0.28
294 0.28
295 0.3
296 0.34
297 0.31
298 0.32
299 0.31
300 0.29
301 0.28
302 0.26
303 0.25
304 0.2
305 0.17
306 0.12
307 0.12
308 0.11
309 0.1
310 0.09
311 0.07
312 0.08
313 0.08
314 0.07
315 0.08
316 0.07
317 0.07
318 0.06
319 0.06
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.06
325 0.09
326 0.13
327 0.15
328 0.2
329 0.22
330 0.22
331 0.27
332 0.27
333 0.28
334 0.27
335 0.27
336 0.24
337 0.23
338 0.23
339 0.18
340 0.22
341 0.22
342 0.23
343 0.22
344 0.21
345 0.21
346 0.21
347 0.23
348 0.22
349 0.25
350 0.25
351 0.28
352 0.29
353 0.29
354 0.3
355 0.29
356 0.27
357 0.23
358 0.21
359 0.22
360 0.2
361 0.2
362 0.21
363 0.22
364 0.22
365 0.24
366 0.27
367 0.27
368 0.3
369 0.36
370 0.34
371 0.33
372 0.32
373 0.28
374 0.23
375 0.22
376 0.23
377 0.19
378 0.23
379 0.25
380 0.3
381 0.34
382 0.37
383 0.42
384 0.48
385 0.47
386 0.49
387 0.55
388 0.52
389 0.48
390 0.5
391 0.48
392 0.45
393 0.45
394 0.46
395 0.44
396 0.45
397 0.45
398 0.45
399 0.43
400 0.38
401 0.39
402 0.37
403 0.35
404 0.39
405 0.45
406 0.48
407 0.51