Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3AXI3

Protein Details
Accession A0A0C3AXI3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
188-212GMEIKFGLSKKKKKKKGWNGSLLLIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
195-204LSKKKKKKKG
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
Gene Ontology GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
Amino Acid Sequences ERYHLTSQHVAKNKILEFYNLYFDFNGIIHNCSHPNDGDAHFRLSEEQIYIRLRRSSLLEYKTPENIFIAVDGVDSRAKMNQQRSRRFQTAQGAKELKEKAERNGEKLPHETAFDIPSWAKMNQQRSRRFQTEQGANELKEKAERNGEKLPHETAFDSKYITPGESPKSLLALLVILTTRKLWRTRTGMEIKFGLSKKKKKKKGWNGSLLLINFYLLHLSLIPECLDLEFRDIEPTLPFDCNLEHVIDDFILPAVFVGNDFLLHPGLHIHENGLERLFDVYKKNSAFFRYVAPSQLLMCSHWLRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.44
3 0.39
4 0.36
5 0.35
6 0.4
7 0.33
8 0.33
9 0.28
10 0.26
11 0.24
12 0.18
13 0.2
14 0.13
15 0.14
16 0.14
17 0.17
18 0.19
19 0.2
20 0.23
21 0.19
22 0.2
23 0.22
24 0.24
25 0.28
26 0.28
27 0.29
28 0.26
29 0.26
30 0.26
31 0.24
32 0.23
33 0.17
34 0.16
35 0.18
36 0.22
37 0.24
38 0.26
39 0.27
40 0.25
41 0.26
42 0.29
43 0.31
44 0.36
45 0.38
46 0.39
47 0.4
48 0.43
49 0.47
50 0.43
51 0.36
52 0.29
53 0.25
54 0.2
55 0.17
56 0.14
57 0.08
58 0.08
59 0.07
60 0.08
61 0.07
62 0.07
63 0.08
64 0.09
65 0.13
66 0.19
67 0.29
68 0.35
69 0.45
70 0.54
71 0.62
72 0.68
73 0.7
74 0.66
75 0.62
76 0.65
77 0.63
78 0.56
79 0.56
80 0.5
81 0.45
82 0.5
83 0.45
84 0.37
85 0.36
86 0.36
87 0.32
88 0.41
89 0.42
90 0.4
91 0.46
92 0.46
93 0.41
94 0.42
95 0.39
96 0.29
97 0.29
98 0.25
99 0.19
100 0.18
101 0.15
102 0.14
103 0.12
104 0.12
105 0.14
106 0.13
107 0.17
108 0.21
109 0.3
110 0.35
111 0.44
112 0.5
113 0.56
114 0.63
115 0.62
116 0.6
117 0.57
118 0.58
119 0.57
120 0.5
121 0.49
122 0.43
123 0.39
124 0.39
125 0.33
126 0.25
127 0.21
128 0.21
129 0.16
130 0.22
131 0.23
132 0.26
133 0.32
134 0.35
135 0.34
136 0.36
137 0.37
138 0.29
139 0.29
140 0.24
141 0.19
142 0.18
143 0.15
144 0.14
145 0.11
146 0.12
147 0.12
148 0.11
149 0.11
150 0.12
151 0.15
152 0.14
153 0.16
154 0.14
155 0.14
156 0.14
157 0.13
158 0.1
159 0.07
160 0.06
161 0.05
162 0.05
163 0.04
164 0.05
165 0.06
166 0.07
167 0.1
168 0.13
169 0.16
170 0.23
171 0.29
172 0.31
173 0.39
174 0.46
175 0.44
176 0.43
177 0.41
178 0.35
179 0.35
180 0.34
181 0.35
182 0.35
183 0.43
184 0.52
185 0.61
186 0.7
187 0.75
188 0.85
189 0.88
190 0.91
191 0.92
192 0.91
193 0.84
194 0.77
195 0.71
196 0.6
197 0.5
198 0.38
199 0.28
200 0.17
201 0.13
202 0.1
203 0.06
204 0.06
205 0.05
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.09
214 0.08
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.12
219 0.12
220 0.13
221 0.12
222 0.15
223 0.14
224 0.14
225 0.14
226 0.13
227 0.13
228 0.14
229 0.15
230 0.13
231 0.11
232 0.11
233 0.12
234 0.11
235 0.1
236 0.08
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.05
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.05
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.08
252 0.09
253 0.11
254 0.12
255 0.12
256 0.12
257 0.15
258 0.17
259 0.19
260 0.18
261 0.16
262 0.15
263 0.17
264 0.18
265 0.16
266 0.19
267 0.22
268 0.28
269 0.3
270 0.32
271 0.33
272 0.37
273 0.37
274 0.33
275 0.36
276 0.36
277 0.36
278 0.37
279 0.35
280 0.32
281 0.3
282 0.32
283 0.26
284 0.21
285 0.25