FuNGI

E9D1M8

Protein Details

Accession

E9D1M8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
329-348	TVPGKLKKIRKKVTIKDARS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
87-141	PKAVARRSKEEREARERLEAERQRERISEAAAARRTATRGDRGRGRGRGRGGAFG
333-340	KLKKIRKK

Subcellular Location(s)

nucl 13, mito 10, cyto_nucl 9.5, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPKAASNRQSAARRPIQVDSASPTPGPSGTTPSESSRSSLPAQATPTARGGPVQRLQTLKKRAPSGSLVPLNPDGTAPKPTLKFQPKAVARRSKEEREARERLEAERQRERISEAAAARRTATRGDRGRGRGRGRGGAFGRITADVGGPLGSGRGSKFKGKYGQFGAKRSGVYGSGGHGGGGDVSSDEGSDYGPRFSIDQINISSDSESEAIDAGKDKMPAKSPVGGRGLRPIRVERQEHVERIMDINTDASSSKSAELRRQAKQKTGNDDSLFVESDDEELVEAEDVEMADSEQAPPIKEEPTDGDTGVADDIPAAGDKATAHARDTVPGKLKKIRKKVTIKDARSMLQTEEERQEYDRHEEDIEQLKQALGNISTADIATGAEAGDENKINAEAIKDERQGRLFLLQFPPMTPNLMTPSARQDQSDETTTLDGASTAQAPETITIKKENGTTAHIPLGGSASLTVPSKSASSIPFISATNSQLPPGRVGKLKVYRSGRATIDWGGISFELNKGTDVDFLQDAVVASDSKPGENHGADRKIWAMSQVTGKFVVTPDWDKLLSE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.64
2	0.6
3	0.59
4	0.56
5	0.51
6	0.47
7	0.43
8	0.38
9	0.34
10	0.3
11	0.27
12	0.23
13	0.22
14	0.22
15	0.17
16	0.2
17	0.21
18	0.26
19	0.28
20	0.31
21	0.35
22	0.33
23	0.33
24	0.3
25	0.31
26	0.29
27	0.31
28	0.3
29	0.29
30	0.32
31	0.36
32	0.35
33	0.34
34	0.34
35	0.31
36	0.28
37	0.27
38	0.27
39	0.29
40	0.33
41	0.34
42	0.36
43	0.39
44	0.45
45	0.52
46	0.58
47	0.56
48	0.58
49	0.6
50	0.57
51	0.57
52	0.57
53	0.54
54	0.54
55	0.53
56	0.47
57	0.44
58	0.45
59	0.4
60	0.34
61	0.29
62	0.22
63	0.18
64	0.21
65	0.19
66	0.23
67	0.25
68	0.28
69	0.38
70	0.44
71	0.45
72	0.47
73	0.55
74	0.57
75	0.64
76	0.7
77	0.7
78	0.65
79	0.71
80	0.74
81	0.72
82	0.73
83	0.73
84	0.73
85	0.71
86	0.74
87	0.67
88	0.67
89	0.6
90	0.53
91	0.55
92	0.52
93	0.5
94	0.52
95	0.52
96	0.47
97	0.46
98	0.46
99	0.38
100	0.34
101	0.33
102	0.28
103	0.33
104	0.32
105	0.31
106	0.3
107	0.29
108	0.28
109	0.27
110	0.27
111	0.29
112	0.33
113	0.39
114	0.46
115	0.51
116	0.58
117	0.62
118	0.63
119	0.6
120	0.57
121	0.59
122	0.52
123	0.53
124	0.47
125	0.45
126	0.41
127	0.35
128	0.33
129	0.25
130	0.24
131	0.16
132	0.15
133	0.08
134	0.08
135	0.07
136	0.05
137	0.05
138	0.05
139	0.04
140	0.05
141	0.06
142	0.11
143	0.14
144	0.21
145	0.23
146	0.29
147	0.37
148	0.39
149	0.44
150	0.46
151	0.53
152	0.51
153	0.52
154	0.51
155	0.46
156	0.43
157	0.38
158	0.32
159	0.23
160	0.2
161	0.17
162	0.14
163	0.13
164	0.13
165	0.12
166	0.11
167	0.1
168	0.08
169	0.07
170	0.06
171	0.03
172	0.04
173	0.04
174	0.04
175	0.04
176	0.04
177	0.04
178	0.06
179	0.07
180	0.07
181	0.08
182	0.08
183	0.09
184	0.1
185	0.15
186	0.14
187	0.16
188	0.17
189	0.19
190	0.19
191	0.19
192	0.17
193	0.12
194	0.12
195	0.1
196	0.09
197	0.07
198	0.07
199	0.06
200	0.06
201	0.07
202	0.08
203	0.09
204	0.12
205	0.13
206	0.14
207	0.18
208	0.21
209	0.22
210	0.26
211	0.26
212	0.29
213	0.33
214	0.32
215	0.29
216	0.35
217	0.36
218	0.33
219	0.34
220	0.31
221	0.32
222	0.38
223	0.4
224	0.32
225	0.38
226	0.39
227	0.38
228	0.37
229	0.31
230	0.25
231	0.23
232	0.22
233	0.14
234	0.1
235	0.1
236	0.08
237	0.07
238	0.07
239	0.06
240	0.07
241	0.07
242	0.08
243	0.11
244	0.13
245	0.17
246	0.25
247	0.3
248	0.35
249	0.43
250	0.44
251	0.47
252	0.55
253	0.55
254	0.55
255	0.54
256	0.53
257	0.46
258	0.45
259	0.4
260	0.32
261	0.27
262	0.19
263	0.14
264	0.09
265	0.09
266	0.07
267	0.05
268	0.04
269	0.04
270	0.04
271	0.03
272	0.03
273	0.03
274	0.03
275	0.03
276	0.03
277	0.03
278	0.03
279	0.03
280	0.03
281	0.04
282	0.05
283	0.06
284	0.06
285	0.07
286	0.08
287	0.09
288	0.09
289	0.1
290	0.11
291	0.13
292	0.14
293	0.13
294	0.12
295	0.11
296	0.12
297	0.11
298	0.08
299	0.04
300	0.03
301	0.03
302	0.03
303	0.03
304	0.03
305	0.03
306	0.03
307	0.04
308	0.06
309	0.08
310	0.09
311	0.1
312	0.13
313	0.14
314	0.17
315	0.19
316	0.21
317	0.27
318	0.28
319	0.31
320	0.35
321	0.43
322	0.48
323	0.57
324	0.61
325	0.63
326	0.71
327	0.75
328	0.79
329	0.82
330	0.76
331	0.72
332	0.67
333	0.59
334	0.51
335	0.44
336	0.34
337	0.29
338	0.26
339	0.23
340	0.23
341	0.23
342	0.21
343	0.21
344	0.23
345	0.19
346	0.23
347	0.22
348	0.2
349	0.19
350	0.19
351	0.22
352	0.27
353	0.26
354	0.21
355	0.2
356	0.19
357	0.18
358	0.18
359	0.16
360	0.08
361	0.08
362	0.08
363	0.08
364	0.08
365	0.07
366	0.07
367	0.05
368	0.05
369	0.04
370	0.04
371	0.03
372	0.03
373	0.03
374	0.04
375	0.06
376	0.06
377	0.06
378	0.06
379	0.06
380	0.07
381	0.07
382	0.07
383	0.08
384	0.12
385	0.17
386	0.21
387	0.23
388	0.25
389	0.26
390	0.27
391	0.25
392	0.27
393	0.24
394	0.24
395	0.25
396	0.26
397	0.24
398	0.24
399	0.26
400	0.21
401	0.21
402	0.17
403	0.16
404	0.17
405	0.2
406	0.2
407	0.19
408	0.26
409	0.29
410	0.3
411	0.28
412	0.26
413	0.27
414	0.3
415	0.32
416	0.26
417	0.21
418	0.21
419	0.21
420	0.18
421	0.14
422	0.1
423	0.07
424	0.07
425	0.07
426	0.07
427	0.07
428	0.07
429	0.08
430	0.09
431	0.11
432	0.12
433	0.12
434	0.16
435	0.17
436	0.18
437	0.2
438	0.22
439	0.21
440	0.26
441	0.28
442	0.27
443	0.28
444	0.26
445	0.24
446	0.21
447	0.21
448	0.15
449	0.12
450	0.1
451	0.08
452	0.09
453	0.1
454	0.1
455	0.09
456	0.1
457	0.1
458	0.11
459	0.13
460	0.13
461	0.17
462	0.18
463	0.19
464	0.2
465	0.2
466	0.22
467	0.21
468	0.23
469	0.24
470	0.23
471	0.23
472	0.26
473	0.27
474	0.29
475	0.3
476	0.31
477	0.29
478	0.32
479	0.4
480	0.44
481	0.48
482	0.52
483	0.54
484	0.56
485	0.56
486	0.6
487	0.52
488	0.45
489	0.44
490	0.37
491	0.34
492	0.28
493	0.24
494	0.2
495	0.18
496	0.16
497	0.14
498	0.13
499	0.12
500	0.13
501	0.13
502	0.13
503	0.14
504	0.15
505	0.15
506	0.16
507	0.14
508	0.14
509	0.13
510	0.13
511	0.12
512	0.11
513	0.11
514	0.09
515	0.09
516	0.14
517	0.15
518	0.15
519	0.15
520	0.17
521	0.23
522	0.24
523	0.3
524	0.33
525	0.37
526	0.37
527	0.39
528	0.38
529	0.33
530	0.32
531	0.3
532	0.23
533	0.23
534	0.31
535	0.3
536	0.3
537	0.29
538	0.29
539	0.27
540	0.25
541	0.25
542	0.22
543	0.24
544	0.25
545	0.28

E9D1M8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer