Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D7AE04

Protein Details
Accession A0A0D7AE04    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
58-78FPSPLRQKRKTQTKHHQEDHQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 4, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001529  DNA-dir_RNA_pol_M/15kDasu  
IPR012164  Rpa12/Rpb9/Rpc10/TFS  
IPR034004  Zn_ribbon_RPA12_C  
IPR001222  Znf_TFIIS  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003899  F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006379  P:mRNA cleavage  
Pfam View protein in Pfam  
PF02150  RNA_POL_M_15KD  
PF01096  TFIIS_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00466  ZF_TFIIS_1  
PS51133  ZF_TFIIS_2  
CDD cd10507  Zn-ribbon_RPA12  
Amino Acid Sequences MSSAHKIGALLFCPDCGTLLNLPDDGHSVVTCEQCNHEEPASSFDNIEVTTRSHPDAFPSPLRQKRKTQTKHHQEDHQGTLVAEKCPQCGHMQAFSKEMQLRSADEGSTIFYTCASCKHGWRINN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.15
3 0.13
4 0.14
5 0.12
6 0.14
7 0.15
8 0.15
9 0.15
10 0.15
11 0.16
12 0.13
13 0.12
14 0.1
15 0.1
16 0.12
17 0.14
18 0.15
19 0.14
20 0.15
21 0.16
22 0.19
23 0.2
24 0.18
25 0.18
26 0.18
27 0.22
28 0.21
29 0.2
30 0.17
31 0.14
32 0.15
33 0.13
34 0.13
35 0.09
36 0.09
37 0.1
38 0.11
39 0.13
40 0.13
41 0.12
42 0.15
43 0.18
44 0.2
45 0.21
46 0.26
47 0.33
48 0.39
49 0.46
50 0.47
51 0.51
52 0.57
53 0.65
54 0.68
55 0.71
56 0.74
57 0.79
58 0.84
59 0.81
60 0.78
61 0.74
62 0.7
63 0.63
64 0.53
65 0.43
66 0.33
67 0.32
68 0.27
69 0.21
70 0.19
71 0.16
72 0.15
73 0.15
74 0.17
75 0.15
76 0.18
77 0.2
78 0.24
79 0.3
80 0.3
81 0.32
82 0.32
83 0.35
84 0.34
85 0.31
86 0.26
87 0.22
88 0.23
89 0.24
90 0.25
91 0.2
92 0.17
93 0.17
94 0.17
95 0.17
96 0.16
97 0.11
98 0.1
99 0.12
100 0.12
101 0.15
102 0.17
103 0.19
104 0.24
105 0.33