Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D7A6M1

Protein Details
Accession A0A0D7A6M1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
80-107AERAKMEEERRERQRKRRRDAGLNSDPEBasic
408-429GGTIFCSRKKWKAPNFPRGLFHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
88-98ERRERQRKRRR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12.5, cyto 7, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010347  Tdp1  
IPR003903  UIM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008081  F:phosphoric diester hydrolase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF06087  Tyr-DNA_phospho  
PF02809  UIM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50330  UIM  
CDD cd09123  PLDc_Tdp1_2  
Amino Acid Sequences MADESYDEDFERAIALSMQEQVQRNNVIDLTGDGDEDVSVERKFQEDVRKAVALSKADSQNSVSAPSQSRASARPSLFLAERAKMEEERRERQRKRRRDAGLNSDPEETGSVKRQNRTRSPSAKPSSSAVDTSDVFYNGSWRPTATRFSTPRRDGKATFRFTDVLGKKDEIAFAILSTYNLDLSWLYPFFDPSIPVILFMLLFHKSGRLRVVISTANLVDFDWRDIENFVWLQDIPRQENPSTMNAKDTQSFPAILQSVLRKLGVQAALDTMVQQGHPHLPLRCIDDLSKFWEFSAVKAHLVPSIVGKHTDWPNVIQTGHPRLMKAVRDMGLRAAGMRGLSLEYQGSSLGQYTSQWLNEFSHSARGESVEDWLRQSKKSREQMPLPALKIMFPTKRTVHQSALGEAGGGTIFCSRKKWKAPNFPRGLFHDSKSAGGPVLMHTKILVAKFTHSSHDGGHSDTETDEEPEEAQRPVGWAYVGSHNFSSAAWGTLSGSSFTPVLNVSNYEIGVVFPLRDAAALESVRVWQCPPPKYGRDDEPWIQEESAILAAAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.09
3 0.1
4 0.13
5 0.15
6 0.2
7 0.22
8 0.24
9 0.28
10 0.3
11 0.29
12 0.29
13 0.27
14 0.22
15 0.2
16 0.18
17 0.17
18 0.14
19 0.13
20 0.1
21 0.1
22 0.1
23 0.1
24 0.1
25 0.09
26 0.09
27 0.1
28 0.11
29 0.12
30 0.14
31 0.19
32 0.28
33 0.32
34 0.36
35 0.4
36 0.41
37 0.4
38 0.44
39 0.44
40 0.35
41 0.32
42 0.35
43 0.35
44 0.35
45 0.36
46 0.33
47 0.31
48 0.3
49 0.31
50 0.24
51 0.24
52 0.26
53 0.27
54 0.27
55 0.25
56 0.27
57 0.27
58 0.31
59 0.34
60 0.32
61 0.32
62 0.32
63 0.34
64 0.32
65 0.35
66 0.33
67 0.28
68 0.28
69 0.28
70 0.3
71 0.29
72 0.32
73 0.36
74 0.39
75 0.45
76 0.54
77 0.63
78 0.69
79 0.76
80 0.83
81 0.84
82 0.86
83 0.87
84 0.85
85 0.85
86 0.86
87 0.86
88 0.85
89 0.79
90 0.72
91 0.63
92 0.54
93 0.44
94 0.36
95 0.27
96 0.2
97 0.21
98 0.27
99 0.31
100 0.37
101 0.43
102 0.51
103 0.59
104 0.64
105 0.68
106 0.68
107 0.71
108 0.75
109 0.76
110 0.7
111 0.63
112 0.57
113 0.52
114 0.46
115 0.39
116 0.3
117 0.26
118 0.23
119 0.23
120 0.22
121 0.17
122 0.15
123 0.14
124 0.16
125 0.15
126 0.16
127 0.14
128 0.13
129 0.16
130 0.18
131 0.24
132 0.24
133 0.32
134 0.37
135 0.45
136 0.54
137 0.57
138 0.63
139 0.64
140 0.65
141 0.59
142 0.63
143 0.65
144 0.6
145 0.55
146 0.5
147 0.44
148 0.39
149 0.46
150 0.37
151 0.3
152 0.28
153 0.26
154 0.25
155 0.25
156 0.24
157 0.15
158 0.14
159 0.12
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.06
167 0.06
168 0.07
169 0.05
170 0.06
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.1
176 0.11
177 0.11
178 0.12
179 0.1
180 0.14
181 0.13
182 0.13
183 0.12
184 0.11
185 0.1
186 0.09
187 0.1
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.11
192 0.11
193 0.13
194 0.15
195 0.15
196 0.15
197 0.15
198 0.19
199 0.16
200 0.16
201 0.16
202 0.14
203 0.13
204 0.12
205 0.11
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.09
220 0.11
221 0.14
222 0.15
223 0.18
224 0.21
225 0.2
226 0.23
227 0.24
228 0.27
229 0.27
230 0.24
231 0.24
232 0.23
233 0.24
234 0.23
235 0.22
236 0.19
237 0.17
238 0.17
239 0.14
240 0.15
241 0.14
242 0.12
243 0.13
244 0.12
245 0.12
246 0.12
247 0.12
248 0.09
249 0.09
250 0.12
251 0.12
252 0.11
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.06
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.06
263 0.06
264 0.08
265 0.1
266 0.1
267 0.12
268 0.14
269 0.18
270 0.17
271 0.17
272 0.17
273 0.17
274 0.17
275 0.21
276 0.2
277 0.16
278 0.15
279 0.2
280 0.19
281 0.17
282 0.23
283 0.19
284 0.18
285 0.18
286 0.19
287 0.14
288 0.14
289 0.14
290 0.09
291 0.11
292 0.11
293 0.12
294 0.12
295 0.16
296 0.18
297 0.2
298 0.18
299 0.17
300 0.19
301 0.2
302 0.2
303 0.16
304 0.18
305 0.21
306 0.24
307 0.23
308 0.21
309 0.22
310 0.26
311 0.27
312 0.25
313 0.24
314 0.22
315 0.22
316 0.23
317 0.21
318 0.18
319 0.16
320 0.14
321 0.1
322 0.08
323 0.07
324 0.06
325 0.06
326 0.05
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.05
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.05
335 0.06
336 0.05
337 0.05
338 0.06
339 0.08
340 0.1
341 0.11
342 0.11
343 0.12
344 0.13
345 0.14
346 0.16
347 0.14
348 0.19
349 0.19
350 0.19
351 0.18
352 0.17
353 0.18
354 0.16
355 0.19
356 0.15
357 0.16
358 0.17
359 0.23
360 0.23
361 0.24
362 0.31
363 0.36
364 0.42
365 0.5
366 0.55
367 0.57
368 0.61
369 0.67
370 0.68
371 0.66
372 0.57
373 0.51
374 0.44
375 0.37
376 0.35
377 0.32
378 0.27
379 0.23
380 0.28
381 0.28
382 0.34
383 0.41
384 0.42
385 0.39
386 0.42
387 0.42
388 0.37
389 0.37
390 0.29
391 0.22
392 0.18
393 0.15
394 0.09
395 0.07
396 0.06
397 0.07
398 0.09
399 0.09
400 0.15
401 0.19
402 0.27
403 0.37
404 0.47
405 0.54
406 0.65
407 0.74
408 0.8
409 0.85
410 0.8
411 0.76
412 0.72
413 0.69
414 0.61
415 0.52
416 0.48
417 0.4
418 0.37
419 0.34
420 0.28
421 0.2
422 0.18
423 0.16
424 0.12
425 0.18
426 0.16
427 0.15
428 0.14
429 0.16
430 0.19
431 0.19
432 0.19
433 0.14
434 0.17
435 0.21
436 0.23
437 0.25
438 0.24
439 0.25
440 0.23
441 0.29
442 0.26
443 0.24
444 0.24
445 0.21
446 0.2
447 0.18
448 0.18
449 0.13
450 0.13
451 0.12
452 0.11
453 0.11
454 0.13
455 0.15
456 0.13
457 0.13
458 0.12
459 0.13
460 0.13
461 0.13
462 0.11
463 0.1
464 0.13
465 0.21
466 0.22
467 0.23
468 0.23
469 0.22
470 0.22
471 0.21
472 0.22
473 0.14
474 0.14
475 0.11
476 0.12
477 0.13
478 0.14
479 0.15
480 0.13
481 0.12
482 0.12
483 0.13
484 0.12
485 0.12
486 0.11
487 0.12
488 0.12
489 0.13
490 0.14
491 0.16
492 0.16
493 0.15
494 0.14
495 0.13
496 0.13
497 0.12
498 0.1
499 0.08
500 0.09
501 0.09
502 0.09
503 0.1
504 0.09
505 0.14
506 0.14
507 0.15
508 0.14
509 0.19
510 0.2
511 0.2
512 0.19
513 0.2
514 0.28
515 0.33
516 0.38
517 0.42
518 0.47
519 0.53
520 0.59
521 0.6
522 0.6
523 0.63
524 0.63
525 0.62
526 0.58
527 0.55
528 0.48
529 0.4
530 0.33
531 0.26
532 0.21