Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D7A6K3

Protein Details
Accession A0A0D7A6K3    Localization Confidence High Confidence Score 16.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
494-513EDTRTERRRVEERRARHRDSBasic
543-569KARKAVMKAERQSRRANKKATKEQFSVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
123-130SKGGKGKG
533-564RPRGESKEDKKARKAVMKAERQSRRANKKATK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPSKSKSIFRQPTAQHFQLVHRSQRDPLIHDPEASQHVLKPFVRENEKKACFAFGKTRAELEALLAIPDGGTGGQRSNIGEAALYGVYFDDTEYDYMQHLRQVEVQEDDVDSVWVEAPAPSKSKGGKGKGKDAASLELRDETKQARDLPKEVFASSSELLRTYESQQAVPDSIAGFQPDMDPHLRQVLEALEDDAFVDDDLEDGFFGELVADGERGTDEVVEFEFQEEDVSEGKGAAEASPGGAEEDELDGVDLPWEQRFDRFQKAQKAANARGPGSDDEPNSEAGDTINGLPSLSVLGGRRRRWKGTSDASGYSMSSSALYRTEALQTLDEQFDQMMLKEYNEDEEDDEDPPDSDSENDAPELITSRDDFATMMNEFLDDYEILGRRLKPKLGGETGVEKLDTFRRAFGEVRQVDLDRVDDNDVDDDDLFSDDDEDKYDRWDCETILCMSTYSNLENHPKIISARSLSDKRHKGSVPQISLDPKTGIPIVASEDTRTERRRVEERRARHRDSDASGTETETEHNQRRATVTRPRGESKEDKKARKAVMKAERQSRRANKKATKEQFSVERTRAGGAGVGAMAERLRKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.62
3 0.55
4 0.56
5 0.57
6 0.57
7 0.55
8 0.52
9 0.52
10 0.5
11 0.56
12 0.54
13 0.5
14 0.52
15 0.52
16 0.47
17 0.46
18 0.44
19 0.4
20 0.4
21 0.37
22 0.29
23 0.24
24 0.25
25 0.31
26 0.31
27 0.32
28 0.34
29 0.41
30 0.49
31 0.51
32 0.55
33 0.6
34 0.62
35 0.6
36 0.54
37 0.52
38 0.44
39 0.45
40 0.47
41 0.45
42 0.48
43 0.47
44 0.47
45 0.41
46 0.41
47 0.35
48 0.27
49 0.23
50 0.16
51 0.14
52 0.13
53 0.11
54 0.1
55 0.09
56 0.08
57 0.04
58 0.05
59 0.05
60 0.07
61 0.08
62 0.1
63 0.11
64 0.12
65 0.13
66 0.12
67 0.11
68 0.1
69 0.11
70 0.1
71 0.09
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.06
78 0.07
79 0.08
80 0.09
81 0.1
82 0.11
83 0.13
84 0.13
85 0.15
86 0.14
87 0.15
88 0.18
89 0.2
90 0.21
91 0.21
92 0.22
93 0.2
94 0.19
95 0.18
96 0.14
97 0.12
98 0.1
99 0.08
100 0.07
101 0.06
102 0.06
103 0.07
104 0.09
105 0.11
106 0.14
107 0.15
108 0.18
109 0.2
110 0.28
111 0.35
112 0.42
113 0.48
114 0.51
115 0.59
116 0.63
117 0.62
118 0.58
119 0.52
120 0.49
121 0.44
122 0.39
123 0.31
124 0.28
125 0.27
126 0.24
127 0.24
128 0.2
129 0.2
130 0.23
131 0.28
132 0.31
133 0.33
134 0.36
135 0.37
136 0.4
137 0.39
138 0.35
139 0.3
140 0.24
141 0.25
142 0.22
143 0.21
144 0.16
145 0.15
146 0.15
147 0.16
148 0.17
149 0.15
150 0.2
151 0.2
152 0.2
153 0.2
154 0.21
155 0.2
156 0.18
157 0.16
158 0.1
159 0.1
160 0.1
161 0.09
162 0.08
163 0.07
164 0.08
165 0.08
166 0.1
167 0.11
168 0.11
169 0.12
170 0.16
171 0.16
172 0.14
173 0.15
174 0.14
175 0.13
176 0.13
177 0.13
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.08
182 0.07
183 0.05
184 0.05
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.03
190 0.04
191 0.04
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.06
212 0.05
213 0.06
214 0.05
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.05
243 0.06
244 0.06
245 0.08
246 0.12
247 0.16
248 0.23
249 0.27
250 0.33
251 0.41
252 0.44
253 0.47
254 0.47
255 0.5
256 0.46
257 0.46
258 0.42
259 0.33
260 0.3
261 0.28
262 0.25
263 0.21
264 0.21
265 0.16
266 0.16
267 0.16
268 0.16
269 0.15
270 0.13
271 0.1
272 0.08
273 0.08
274 0.06
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.04
283 0.05
284 0.06
285 0.13
286 0.19
287 0.23
288 0.32
289 0.35
290 0.39
291 0.4
292 0.43
293 0.44
294 0.45
295 0.48
296 0.43
297 0.4
298 0.39
299 0.36
300 0.32
301 0.25
302 0.18
303 0.11
304 0.08
305 0.07
306 0.06
307 0.06
308 0.07
309 0.07
310 0.08
311 0.09
312 0.1
313 0.1
314 0.1
315 0.1
316 0.12
317 0.12
318 0.11
319 0.09
320 0.08
321 0.08
322 0.07
323 0.07
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.09
328 0.09
329 0.1
330 0.11
331 0.11
332 0.08
333 0.1
334 0.11
335 0.11
336 0.11
337 0.09
338 0.09
339 0.09
340 0.08
341 0.07
342 0.06
343 0.07
344 0.08
345 0.09
346 0.09
347 0.08
348 0.08
349 0.08
350 0.09
351 0.08
352 0.07
353 0.07
354 0.09
355 0.09
356 0.09
357 0.09
358 0.08
359 0.1
360 0.09
361 0.09
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.08
367 0.05
368 0.05
369 0.08
370 0.09
371 0.1
372 0.13
373 0.15
374 0.18
375 0.21
376 0.22
377 0.24
378 0.28
379 0.33
380 0.33
381 0.33
382 0.31
383 0.32
384 0.32
385 0.28
386 0.24
387 0.17
388 0.16
389 0.19
390 0.2
391 0.16
392 0.16
393 0.17
394 0.2
395 0.21
396 0.23
397 0.29
398 0.26
399 0.28
400 0.28
401 0.27
402 0.25
403 0.25
404 0.22
405 0.13
406 0.13
407 0.12
408 0.1
409 0.1
410 0.11
411 0.1
412 0.1
413 0.1
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.07
418 0.06
419 0.07
420 0.07
421 0.08
422 0.1
423 0.11
424 0.1
425 0.13
426 0.17
427 0.15
428 0.18
429 0.19
430 0.17
431 0.18
432 0.21
433 0.2
434 0.18
435 0.17
436 0.14
437 0.13
438 0.15
439 0.15
440 0.13
441 0.12
442 0.15
443 0.21
444 0.22
445 0.23
446 0.21
447 0.21
448 0.21
449 0.23
450 0.23
451 0.2
452 0.23
453 0.29
454 0.34
455 0.39
456 0.47
457 0.52
458 0.5
459 0.56
460 0.53
461 0.51
462 0.56
463 0.59
464 0.54
465 0.49
466 0.5
467 0.47
468 0.47
469 0.43
470 0.35
471 0.25
472 0.24
473 0.22
474 0.18
475 0.14
476 0.13
477 0.15
478 0.17
479 0.17
480 0.15
481 0.18
482 0.22
483 0.27
484 0.3
485 0.3
486 0.31
487 0.37
488 0.46
489 0.5
490 0.58
491 0.61
492 0.68
493 0.75
494 0.8
495 0.8
496 0.76
497 0.74
498 0.7
499 0.66
500 0.64
501 0.55
502 0.5
503 0.44
504 0.39
505 0.34
506 0.28
507 0.24
508 0.21
509 0.26
510 0.29
511 0.33
512 0.33
513 0.34
514 0.38
515 0.41
516 0.43
517 0.46
518 0.49
519 0.52
520 0.57
521 0.61
522 0.61
523 0.64
524 0.68
525 0.66
526 0.68
527 0.69
528 0.71
529 0.73
530 0.77
531 0.78
532 0.76
533 0.73
534 0.73
535 0.74
536 0.76
537 0.76
538 0.79
539 0.79
540 0.75
541 0.8
542 0.8
543 0.8
544 0.79
545 0.81
546 0.8
547 0.82
548 0.88
549 0.88
550 0.85
551 0.78
552 0.76
553 0.74
554 0.72
555 0.69
556 0.6
557 0.54
558 0.47
559 0.45
560 0.39
561 0.3
562 0.25
563 0.17
564 0.16
565 0.11
566 0.1
567 0.09
568 0.09
569 0.09