Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D7A276

Protein Details
Accession A0A0D7A276    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-66IYKTGEKKKKDLEEEKREMABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-56RFIRGIYKTGEKKKK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 14.5, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000690  Matrin/U1-C_Znf_C2H2  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR013085  U1-CZ_Znf_C2H2  
IPR040023  WBP4  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06220  zf-U1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50171  ZF_MATRIN  
Amino Acid Sequences MSEYWVSTKRYFCKYCEIYIADDVPSRQQHENGLRHKGNRERFIRGIYKTGEKKKKDLEEEKREMAKIEQAAQAAYHADIGAGHSTHSSASAPVASGSKSVANKLPIKPSNPWTNYSTAQSLGYTDPDIGRQSAEAERHRTQGVAGEWQLVTPSMPNPAADPSPDEPIDVAETGVKRPAETSIDDMDTREYKIGKKRSVGLGDIYDPGVIPIKVKKYELNSRPAAPPTQPSTSATSTSAPQLADGKLKWTKVEWKKANEGLSEVVPPVKKEEDTPPASSTSVSPWVPVQDSSEDVSVKTEDAVAVGLAVAGKDEPANVKLEEDAPSEAKVSASISVKRESTEPPTSVPSKGSLFRKRTTPAGLRAGKRLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.56
3 0.56
4 0.52
5 0.46
6 0.46
7 0.45
8 0.36
9 0.34
10 0.3
11 0.29
12 0.3
13 0.3
14 0.28
15 0.29
16 0.36
17 0.43
18 0.51
19 0.51
20 0.58
21 0.58
22 0.61
23 0.67
24 0.68
25 0.67
26 0.68
27 0.66
28 0.63
29 0.62
30 0.65
31 0.64
32 0.57
33 0.54
34 0.48
35 0.53
36 0.55
37 0.62
38 0.64
39 0.6
40 0.65
41 0.68
42 0.73
43 0.74
44 0.76
45 0.76
46 0.77
47 0.8
48 0.8
49 0.74
50 0.65
51 0.57
52 0.47
53 0.42
54 0.34
55 0.31
56 0.27
57 0.23
58 0.23
59 0.22
60 0.21
61 0.16
62 0.13
63 0.1
64 0.07
65 0.06
66 0.06
67 0.07
68 0.09
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.09
75 0.08
76 0.07
77 0.07
78 0.08
79 0.08
80 0.09
81 0.1
82 0.09
83 0.09
84 0.1
85 0.13
86 0.14
87 0.16
88 0.18
89 0.23
90 0.29
91 0.32
92 0.4
93 0.4
94 0.43
95 0.46
96 0.48
97 0.53
98 0.5
99 0.5
100 0.44
101 0.44
102 0.42
103 0.4
104 0.35
105 0.25
106 0.23
107 0.19
108 0.18
109 0.14
110 0.14
111 0.11
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.11
116 0.1
117 0.09
118 0.09
119 0.11
120 0.13
121 0.18
122 0.2
123 0.25
124 0.27
125 0.29
126 0.29
127 0.26
128 0.23
129 0.23
130 0.21
131 0.18
132 0.17
133 0.17
134 0.16
135 0.16
136 0.16
137 0.11
138 0.1
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.08
143 0.08
144 0.09
145 0.11
146 0.11
147 0.11
148 0.14
149 0.13
150 0.16
151 0.16
152 0.15
153 0.13
154 0.13
155 0.14
156 0.1
157 0.08
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.11
162 0.1
163 0.09
164 0.09
165 0.11
166 0.11
167 0.12
168 0.14
169 0.13
170 0.15
171 0.15
172 0.15
173 0.15
174 0.13
175 0.13
176 0.11
177 0.1
178 0.13
179 0.21
180 0.28
181 0.29
182 0.31
183 0.34
184 0.38
185 0.4
186 0.37
187 0.31
188 0.26
189 0.24
190 0.22
191 0.18
192 0.13
193 0.1
194 0.09
195 0.09
196 0.07
197 0.07
198 0.09
199 0.13
200 0.15
201 0.16
202 0.19
203 0.24
204 0.34
205 0.38
206 0.42
207 0.41
208 0.42
209 0.44
210 0.43
211 0.38
212 0.3
213 0.29
214 0.27
215 0.27
216 0.25
217 0.24
218 0.28
219 0.27
220 0.28
221 0.25
222 0.21
223 0.19
224 0.2
225 0.19
226 0.14
227 0.13
228 0.14
229 0.14
230 0.16
231 0.15
232 0.19
233 0.2
234 0.21
235 0.21
236 0.21
237 0.3
238 0.36
239 0.46
240 0.48
241 0.5
242 0.57
243 0.61
244 0.61
245 0.52
246 0.45
247 0.36
248 0.3
249 0.25
250 0.18
251 0.17
252 0.15
253 0.14
254 0.16
255 0.16
256 0.15
257 0.18
258 0.24
259 0.3
260 0.33
261 0.36
262 0.34
263 0.34
264 0.34
265 0.31
266 0.25
267 0.2
268 0.22
269 0.19
270 0.18
271 0.17
272 0.2
273 0.2
274 0.2
275 0.19
276 0.15
277 0.17
278 0.18
279 0.19
280 0.17
281 0.16
282 0.17
283 0.15
284 0.13
285 0.11
286 0.1
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.06
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.05
301 0.08
302 0.09
303 0.12
304 0.12
305 0.13
306 0.14
307 0.16
308 0.18
309 0.18
310 0.19
311 0.18
312 0.18
313 0.19
314 0.17
315 0.16
316 0.14
317 0.13
318 0.15
319 0.18
320 0.22
321 0.24
322 0.28
323 0.29
324 0.3
325 0.31
326 0.31
327 0.34
328 0.36
329 0.35
330 0.34
331 0.4
332 0.41
333 0.4
334 0.37
335 0.33
336 0.31
337 0.37
338 0.43
339 0.46
340 0.5
341 0.53
342 0.59
343 0.59
344 0.61
345 0.62
346 0.61
347 0.59
348 0.63
349 0.67
350 0.63