Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E9D9B2

Protein Details
Accession E9D9B2    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
575-594TPEERANRKREELRRQLESKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
313-332PPKQTKRSKGLGIIGSKSPK
352-368PKAKSSGFGRIGGRKLK
414-469SKPQKPKSTGREESDKPSPPPKNKSTMAGAGRVLGQIGGKKKDKGPKPEESKSKSK
581-604NRKREELRRQLESKSGPAKKKRRF
Subcellular Location(s) mito_nucl 14, nucl 13.5, mito 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MRPLWKRLPLEGQSLSPALYISFTTGSNGYELLLTDLAHVWSECLTRKQILVNSSKYDTTIDPNQDDDQYFVLLQKIDDALSGKKGSRLSLRGQKHGNGLNLSTETDLPSPLEPLTWKMDLSQLRQAAFTKHVFLPVLREAASTESRMRSLIDKLKEKDWALGKLFDKIEASGIDLSTVFPSLTGVRHGRRESVFSQASKMIKGVAPFDENAWNSECMEQSPNESIKETIIKDFSATESPLDLETVENMNDDWWTRIRDSDSAIVGPVASRKVATKNPPPKPAEEISTESDDDFEGKTRESTASPEPPRPTAPPKQTKRSKGLGIIGSKSPKKELPAEGSTGYDLSMQPEKPKAKSSGFGRIGGRKLKAPRVEDTNSDSSTESDVPPGAFTKKPLAQELSTESGDEADLALRPSKPQKPKSTGREESDKPSPPPKNKSTMAGAGRVLGQIGGKKKDKGPKPEESKSKSKQPPQENIDDTSTHDQVEPSHATAPKMAKRESKLGMIGGGKSPRKQAATKSQAIIPSIATRKGEASDKGNGPIFIKTEQSEAPKRSKSPTLQIQAPQKEGSVPTNETPEERANRKREELRRQLESKSGPAKKKRRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.35
3 0.25
4 0.21
5 0.14
6 0.12
7 0.11
8 0.1
9 0.11
10 0.11
11 0.13
12 0.13
13 0.14
14 0.14
15 0.13
16 0.11
17 0.1
18 0.11
19 0.11
20 0.11
21 0.1
22 0.11
23 0.12
24 0.12
25 0.12
26 0.12
27 0.1
28 0.11
29 0.14
30 0.16
31 0.19
32 0.22
33 0.24
34 0.26
35 0.31
36 0.34
37 0.38
38 0.42
39 0.44
40 0.45
41 0.46
42 0.45
43 0.4
44 0.38
45 0.32
46 0.31
47 0.33
48 0.33
49 0.31
50 0.34
51 0.35
52 0.35
53 0.34
54 0.29
55 0.22
56 0.18
57 0.17
58 0.15
59 0.15
60 0.13
61 0.12
62 0.13
63 0.13
64 0.11
65 0.12
66 0.14
67 0.14
68 0.17
69 0.2
70 0.18
71 0.22
72 0.23
73 0.26
74 0.31
75 0.33
76 0.38
77 0.45
78 0.5
79 0.53
80 0.56
81 0.56
82 0.55
83 0.56
84 0.52
85 0.45
86 0.4
87 0.36
88 0.32
89 0.3
90 0.24
91 0.19
92 0.17
93 0.15
94 0.15
95 0.13
96 0.12
97 0.13
98 0.11
99 0.12
100 0.11
101 0.14
102 0.18
103 0.17
104 0.17
105 0.16
106 0.23
107 0.26
108 0.29
109 0.33
110 0.31
111 0.31
112 0.32
113 0.33
114 0.29
115 0.3
116 0.27
117 0.24
118 0.22
119 0.24
120 0.24
121 0.23
122 0.25
123 0.23
124 0.24
125 0.19
126 0.18
127 0.17
128 0.2
129 0.21
130 0.18
131 0.19
132 0.18
133 0.19
134 0.19
135 0.2
136 0.18
137 0.23
138 0.29
139 0.33
140 0.39
141 0.41
142 0.44
143 0.48
144 0.46
145 0.45
146 0.42
147 0.41
148 0.35
149 0.39
150 0.37
151 0.38
152 0.37
153 0.32
154 0.28
155 0.22
156 0.22
157 0.15
158 0.17
159 0.11
160 0.11
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.08
165 0.09
166 0.06
167 0.05
168 0.06
169 0.07
170 0.08
171 0.12
172 0.16
173 0.19
174 0.25
175 0.26
176 0.3
177 0.3
178 0.34
179 0.31
180 0.35
181 0.36
182 0.3
183 0.32
184 0.31
185 0.31
186 0.27
187 0.25
188 0.19
189 0.16
190 0.17
191 0.16
192 0.14
193 0.15
194 0.14
195 0.16
196 0.19
197 0.18
198 0.18
199 0.18
200 0.17
201 0.16
202 0.17
203 0.15
204 0.12
205 0.14
206 0.12
207 0.13
208 0.17
209 0.18
210 0.17
211 0.18
212 0.17
213 0.16
214 0.2
215 0.19
216 0.16
217 0.16
218 0.15
219 0.15
220 0.15
221 0.15
222 0.13
223 0.12
224 0.1
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.09
229 0.08
230 0.06
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.07
240 0.08
241 0.1
242 0.1
243 0.12
244 0.14
245 0.14
246 0.17
247 0.18
248 0.17
249 0.15
250 0.15
251 0.13
252 0.11
253 0.1
254 0.09
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.07
259 0.12
260 0.17
261 0.23
262 0.32
263 0.41
264 0.48
265 0.55
266 0.56
267 0.54
268 0.54
269 0.49
270 0.42
271 0.36
272 0.33
273 0.27
274 0.28
275 0.26
276 0.2
277 0.19
278 0.16
279 0.13
280 0.09
281 0.08
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.08
286 0.09
287 0.09
288 0.12
289 0.15
290 0.23
291 0.25
292 0.29
293 0.3
294 0.31
295 0.32
296 0.32
297 0.35
298 0.34
299 0.42
300 0.47
301 0.52
302 0.61
303 0.67
304 0.7
305 0.7
306 0.67
307 0.6
308 0.54
309 0.53
310 0.48
311 0.42
312 0.38
313 0.34
314 0.33
315 0.32
316 0.28
317 0.25
318 0.21
319 0.22
320 0.24
321 0.26
322 0.28
323 0.29
324 0.3
325 0.29
326 0.27
327 0.25
328 0.2
329 0.16
330 0.11
331 0.08
332 0.09
333 0.11
334 0.11
335 0.13
336 0.2
337 0.22
338 0.23
339 0.27
340 0.29
341 0.28
342 0.34
343 0.36
344 0.4
345 0.4
346 0.42
347 0.41
348 0.41
349 0.43
350 0.41
351 0.38
352 0.33
353 0.35
354 0.38
355 0.4
356 0.39
357 0.38
358 0.41
359 0.42
360 0.4
361 0.41
362 0.39
363 0.33
364 0.31
365 0.28
366 0.22
367 0.22
368 0.21
369 0.15
370 0.12
371 0.12
372 0.11
373 0.11
374 0.12
375 0.12
376 0.11
377 0.13
378 0.18
379 0.22
380 0.24
381 0.26
382 0.28
383 0.26
384 0.28
385 0.3
386 0.28
387 0.24
388 0.23
389 0.19
390 0.16
391 0.15
392 0.12
393 0.08
394 0.05
395 0.05
396 0.06
397 0.08
398 0.08
399 0.11
400 0.18
401 0.26
402 0.35
403 0.43
404 0.52
405 0.58
406 0.67
407 0.74
408 0.78
409 0.77
410 0.73
411 0.73
412 0.66
413 0.64
414 0.62
415 0.57
416 0.5
417 0.52
418 0.55
419 0.54
420 0.6
421 0.59
422 0.6
423 0.57
424 0.58
425 0.54
426 0.54
427 0.49
428 0.43
429 0.38
430 0.31
431 0.29
432 0.25
433 0.2
434 0.12
435 0.11
436 0.11
437 0.16
438 0.22
439 0.24
440 0.27
441 0.34
442 0.42
443 0.49
444 0.56
445 0.58
446 0.62
447 0.68
448 0.74
449 0.78
450 0.76
451 0.78
452 0.74
453 0.77
454 0.75
455 0.75
456 0.75
457 0.75
458 0.78
459 0.74
460 0.77
461 0.69
462 0.64
463 0.58
464 0.49
465 0.45
466 0.4
467 0.34
468 0.26
469 0.23
470 0.2
471 0.18
472 0.23
473 0.21
474 0.17
475 0.22
476 0.23
477 0.23
478 0.28
479 0.33
480 0.33
481 0.37
482 0.39
483 0.41
484 0.44
485 0.51
486 0.49
487 0.47
488 0.43
489 0.38
490 0.38
491 0.33
492 0.3
493 0.28
494 0.32
495 0.3
496 0.3
497 0.34
498 0.35
499 0.37
500 0.39
501 0.43
502 0.47
503 0.53
504 0.57
505 0.55
506 0.53
507 0.52
508 0.5
509 0.42
510 0.32
511 0.31
512 0.29
513 0.29
514 0.27
515 0.25
516 0.25
517 0.27
518 0.31
519 0.27
520 0.28
521 0.33
522 0.34
523 0.37
524 0.38
525 0.36
526 0.33
527 0.32
528 0.3
529 0.23
530 0.24
531 0.21
532 0.22
533 0.24
534 0.3
535 0.35
536 0.38
537 0.45
538 0.48
539 0.5
540 0.52
541 0.57
542 0.56
543 0.58
544 0.63
545 0.63
546 0.63
547 0.67
548 0.71
549 0.68
550 0.65
551 0.56
552 0.46
553 0.43
554 0.39
555 0.36
556 0.32
557 0.3
558 0.29
559 0.34
560 0.34
561 0.32
562 0.34
563 0.38
564 0.4
565 0.43
566 0.5
567 0.52
568 0.58
569 0.65
570 0.7
571 0.72
572 0.76
573 0.79
574 0.78
575 0.8
576 0.77
577 0.72
578 0.7
579 0.65
580 0.62
581 0.62
582 0.62
583 0.63
584 0.7