Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D6ZYK0

Protein Details
Accession A0A0D6ZYK0    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
299-318QPDQKRQRKHGMKSMWRPSPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
865-877KTAKAKGKRGNSR
Subcellular Location(s) plas 18, extr 3, E.R. 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036860  SH2_dom_sf  
IPR035420  Spt6_SH2  
IPR017072  TF_Spt6  
Gene Ontology GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF14633  SH2_2  
Amino Acid Sequences MVIGTEVISTGTVVVMTVAPASAAAVPSFSGCAGPSFSGNASFCILDDGRSGRDNEADDSIEYDDEDDGDALDKEARERTHKEYAPECMQLVTSTLVHNSLLALHAPLPEEELEEAAMGVISQLPSRLRGHLVEGGSSSNLGTPLIEAVAFVLKLLFIDEMELGLKYCALHERKKALHAMYRHYGIHNEYFKEDLMGALKSVEMGADAMEWLTMKCKDQQLEEDVHGDEEPKMKKPSCISAYKVAKKGIVSHLARGFSIEPSMTVHYANDLDINPVAYAEQFLTEAEADHLVTVAIKLQPDQKRQRKHGMKSMWRPSPTQFSPDYIVACGVTFEQMFSADGLVSSFLLHLPWMKIALRSDIHQRSRMARHHQIRSMAIEHWIHLYKVESPLVLFVTPGAAWYFTWWAMRCGLCGIFDVAWWSAMLYLLADLIPPTLFTIAKQQHGGVVIRPSSKGISHLTVTWKADNQLYQHIDIMESNADPTGQTVGGLIIDKNHTYSDLNDLIVNHVQAMAHEVEELMMHKHFKLGKDDDLHTFLKNQLMANPAKSMYGFTLNRKCPGHFNLYFLANRNAPMRTWAPMVDQHMQQHQQQGMEHGQQQSQQQQASHSGGQQQQSMLSMHYHLPMLYPNAVKFVHKFDEVLAMLIILEVIARVRTLHSHVSDSPLDELRQLTPGTGILSCRSLPPELSHALQLGESAFQGLLAPPSTSAYSFGASPKNLDSPQLGNGLLSPITGALDLSVPFCDGDARTILFSKIQELQKANRGLKSMVYQLQVALKVAQTENAALKYAYKVLVARVPNESGPKASNNAVIVNVIARTPDGTGSSDHVLATPMAPVYNHADFPCIKYWYRSQWNQYLKSKEGVSKTAKAKGKRGNSRASRGINVTMQYVDDETGATVDGFRAGFIHSTAHSIFYLLRDRGLAPVTWGQATPPVITCYCNQLILKCPEMSYCTENWKAMFLATEIYPSWYKVHGQDMSCSLKHEDVTLDLLVKSTTDGHNVSSDYGIIAES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.05
3 0.06
4 0.06
5 0.05
6 0.05
7 0.05
8 0.06
9 0.07
10 0.07
11 0.07
12 0.07
13 0.08
14 0.09
15 0.09
16 0.09
17 0.08
18 0.08
19 0.09
20 0.11
21 0.12
22 0.13
23 0.14
24 0.15
25 0.2
26 0.2
27 0.2
28 0.2
29 0.19
30 0.18
31 0.21
32 0.2
33 0.16
34 0.18
35 0.19
36 0.2
37 0.23
38 0.25
39 0.21
40 0.25
41 0.26
42 0.25
43 0.26
44 0.24
45 0.22
46 0.22
47 0.21
48 0.18
49 0.15
50 0.14
51 0.11
52 0.09
53 0.1
54 0.08
55 0.07
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.11
60 0.11
61 0.12
62 0.17
63 0.2
64 0.26
65 0.3
66 0.37
67 0.44
68 0.47
69 0.51
70 0.51
71 0.56
72 0.55
73 0.52
74 0.46
75 0.36
76 0.33
77 0.27
78 0.25
79 0.19
80 0.14
81 0.13
82 0.13
83 0.13
84 0.13
85 0.12
86 0.11
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.1
92 0.11
93 0.12
94 0.12
95 0.13
96 0.12
97 0.13
98 0.12
99 0.11
100 0.1
101 0.09
102 0.09
103 0.07
104 0.06
105 0.04
106 0.04
107 0.05
108 0.05
109 0.06
110 0.08
111 0.09
112 0.13
113 0.15
114 0.18
115 0.19
116 0.2
117 0.25
118 0.28
119 0.28
120 0.25
121 0.24
122 0.23
123 0.2
124 0.19
125 0.15
126 0.1
127 0.1
128 0.09
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.05
135 0.06
136 0.08
137 0.07
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.06
144 0.04
145 0.06
146 0.06
147 0.07
148 0.07
149 0.08
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.06
154 0.08
155 0.15
156 0.2
157 0.26
158 0.32
159 0.4
160 0.43
161 0.48
162 0.52
163 0.49
164 0.51
165 0.49
166 0.5
167 0.48
168 0.48
169 0.45
170 0.4
171 0.38
172 0.35
173 0.38
174 0.35
175 0.31
176 0.29
177 0.29
178 0.28
179 0.26
180 0.23
181 0.16
182 0.13
183 0.12
184 0.11
185 0.09
186 0.09
187 0.08
188 0.08
189 0.06
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.05
198 0.04
199 0.08
200 0.09
201 0.11
202 0.16
203 0.21
204 0.23
205 0.26
206 0.31
207 0.32
208 0.34
209 0.34
210 0.31
211 0.26
212 0.25
213 0.22
214 0.18
215 0.15
216 0.17
217 0.18
218 0.21
219 0.26
220 0.27
221 0.31
222 0.34
223 0.42
224 0.42
225 0.46
226 0.45
227 0.5
228 0.59
229 0.62
230 0.63
231 0.55
232 0.51
233 0.46
234 0.47
235 0.43
236 0.42
237 0.36
238 0.38
239 0.4
240 0.38
241 0.37
242 0.34
243 0.29
244 0.2
245 0.2
246 0.13
247 0.1
248 0.12
249 0.14
250 0.13
251 0.12
252 0.11
253 0.12
254 0.12
255 0.12
256 0.12
257 0.1
258 0.11
259 0.11
260 0.11
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.06
265 0.07
266 0.06
267 0.06
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.06
282 0.07
283 0.07
284 0.09
285 0.17
286 0.24
287 0.33
288 0.44
289 0.5
290 0.59
291 0.65
292 0.75
293 0.76
294 0.77
295 0.77
296 0.77
297 0.78
298 0.79
299 0.81
300 0.77
301 0.7
302 0.65
303 0.59
304 0.58
305 0.49
306 0.43
307 0.35
308 0.31
309 0.32
310 0.32
311 0.29
312 0.2
313 0.19
314 0.15
315 0.13
316 0.11
317 0.07
318 0.07
319 0.06
320 0.06
321 0.05
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.05
336 0.06
337 0.06
338 0.07
339 0.09
340 0.09
341 0.11
342 0.12
343 0.16
344 0.16
345 0.17
346 0.26
347 0.32
348 0.34
349 0.36
350 0.37
351 0.39
352 0.46
353 0.51
354 0.5
355 0.52
356 0.57
357 0.59
358 0.61
359 0.58
360 0.52
361 0.48
362 0.42
363 0.33
364 0.29
365 0.23
366 0.2
367 0.19
368 0.18
369 0.15
370 0.13
371 0.14
372 0.12
373 0.15
374 0.15
375 0.11
376 0.11
377 0.12
378 0.12
379 0.11
380 0.08
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.06
389 0.08
390 0.07
391 0.1
392 0.1
393 0.11
394 0.14
395 0.14
396 0.13
397 0.13
398 0.13
399 0.11
400 0.11
401 0.11
402 0.08
403 0.08
404 0.09
405 0.08
406 0.08
407 0.07
408 0.06
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.03
413 0.03
414 0.03
415 0.03
416 0.03
417 0.03
418 0.03
419 0.03
420 0.03
421 0.04
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.14
426 0.16
427 0.18
428 0.19
429 0.18
430 0.19
431 0.21
432 0.21
433 0.14
434 0.15
435 0.15
436 0.15
437 0.15
438 0.15
439 0.14
440 0.13
441 0.14
442 0.13
443 0.13
444 0.13
445 0.15
446 0.18
447 0.21
448 0.22
449 0.2
450 0.19
451 0.18
452 0.19
453 0.18
454 0.16
455 0.19
456 0.19
457 0.19
458 0.18
459 0.17
460 0.16
461 0.14
462 0.14
463 0.08
464 0.06
465 0.06
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.05
471 0.04
472 0.04
473 0.04
474 0.04
475 0.05
476 0.05
477 0.05
478 0.05
479 0.06
480 0.06
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.07
485 0.08
486 0.12
487 0.12
488 0.12
489 0.12
490 0.12
491 0.13
492 0.13
493 0.12
494 0.08
495 0.07
496 0.06
497 0.06
498 0.08
499 0.06
500 0.06
501 0.06
502 0.06
503 0.05
504 0.06
505 0.06
506 0.05
507 0.05
508 0.06
509 0.06
510 0.09
511 0.12
512 0.13
513 0.19
514 0.21
515 0.25
516 0.28
517 0.3
518 0.29
519 0.31
520 0.3
521 0.24
522 0.22
523 0.19
524 0.17
525 0.16
526 0.14
527 0.12
528 0.15
529 0.16
530 0.16
531 0.16
532 0.14
533 0.13
534 0.13
535 0.12
536 0.09
537 0.15
538 0.16
539 0.2
540 0.29
541 0.3
542 0.35
543 0.35
544 0.35
545 0.33
546 0.35
547 0.38
548 0.3
549 0.32
550 0.3
551 0.32
552 0.31
553 0.29
554 0.28
555 0.19
556 0.2
557 0.19
558 0.17
559 0.14
560 0.17
561 0.16
562 0.15
563 0.15
564 0.15
565 0.15
566 0.17
567 0.22
568 0.21
569 0.22
570 0.22
571 0.24
572 0.26
573 0.25
574 0.27
575 0.24
576 0.22
577 0.2
578 0.22
579 0.21
580 0.21
581 0.23
582 0.2
583 0.19
584 0.21
585 0.22
586 0.24
587 0.24
588 0.22
589 0.2
590 0.2
591 0.23
592 0.23
593 0.22
594 0.19
595 0.21
596 0.23
597 0.24
598 0.24
599 0.2
600 0.17
601 0.18
602 0.17
603 0.13
604 0.1
605 0.1
606 0.1
607 0.11
608 0.11
609 0.09
610 0.09
611 0.1
612 0.11
613 0.13
614 0.13
615 0.12
616 0.15
617 0.16
618 0.16
619 0.16
620 0.19
621 0.18
622 0.18
623 0.18
624 0.15
625 0.21
626 0.2
627 0.19
628 0.14
629 0.11
630 0.1
631 0.1
632 0.09
633 0.03
634 0.03
635 0.02
636 0.02
637 0.02
638 0.03
639 0.03
640 0.04
641 0.06
642 0.09
643 0.14
644 0.15
645 0.18
646 0.19
647 0.23
648 0.23
649 0.23
650 0.22
651 0.19
652 0.18
653 0.16
654 0.16
655 0.12
656 0.14
657 0.13
658 0.11
659 0.1
660 0.1
661 0.11
662 0.1
663 0.1
664 0.09
665 0.11
666 0.11
667 0.11
668 0.13
669 0.12
670 0.12
671 0.14
672 0.17
673 0.17
674 0.18
675 0.18
676 0.16
677 0.16
678 0.15
679 0.13
680 0.09
681 0.07
682 0.06
683 0.06
684 0.05
685 0.05
686 0.05
687 0.05
688 0.06
689 0.06
690 0.06
691 0.06
692 0.08
693 0.08
694 0.08
695 0.1
696 0.1
697 0.1
698 0.11
699 0.14
700 0.16
701 0.16
702 0.17
703 0.17
704 0.2
705 0.2
706 0.2
707 0.2
708 0.18
709 0.2
710 0.21
711 0.19
712 0.15
713 0.15
714 0.15
715 0.12
716 0.1
717 0.07
718 0.05
719 0.05
720 0.05
721 0.05
722 0.04
723 0.05
724 0.06
725 0.06
726 0.06
727 0.06
728 0.06
729 0.07
730 0.08
731 0.07
732 0.08
733 0.09
734 0.1
735 0.11
736 0.12
737 0.12
738 0.13
739 0.13
740 0.14
741 0.2
742 0.22
743 0.26
744 0.28
745 0.32
746 0.37
747 0.45
748 0.44
749 0.4
750 0.4
751 0.35
752 0.35
753 0.34
754 0.32
755 0.29
756 0.27
757 0.25
758 0.24
759 0.26
760 0.24
761 0.22
762 0.17
763 0.13
764 0.14
765 0.14
766 0.15
767 0.12
768 0.13
769 0.15
770 0.15
771 0.15
772 0.13
773 0.14
774 0.13
775 0.15
776 0.13
777 0.12
778 0.12
779 0.14
780 0.2
781 0.2
782 0.21
783 0.22
784 0.23
785 0.24
786 0.27
787 0.26
788 0.22
789 0.23
790 0.23
791 0.23
792 0.23
793 0.24
794 0.21
795 0.21
796 0.19
797 0.17
798 0.15
799 0.13
800 0.12
801 0.08
802 0.07
803 0.06
804 0.07
805 0.07
806 0.08
807 0.09
808 0.1
809 0.11
810 0.14
811 0.16
812 0.16
813 0.15
814 0.15
815 0.14
816 0.13
817 0.12
818 0.1
819 0.08
820 0.08
821 0.08
822 0.1
823 0.15
824 0.16
825 0.18
826 0.17
827 0.19
828 0.2
829 0.24
830 0.27
831 0.25
832 0.24
833 0.27
834 0.33
835 0.4
836 0.48
837 0.52
838 0.53
839 0.59
840 0.67
841 0.71
842 0.73
843 0.7
844 0.63
845 0.61
846 0.57
847 0.53
848 0.49
849 0.48
850 0.46
851 0.47
852 0.49
853 0.54
854 0.57
855 0.56
856 0.61
857 0.62
858 0.67
859 0.69
860 0.72
861 0.74
862 0.75
863 0.78
864 0.78
865 0.73
866 0.67
867 0.59
868 0.56
869 0.49
870 0.42
871 0.36
872 0.28
873 0.24
874 0.2
875 0.18
876 0.14
877 0.11
878 0.1
879 0.08
880 0.08
881 0.08
882 0.07
883 0.06
884 0.06
885 0.07
886 0.07
887 0.07
888 0.07
889 0.08
890 0.09
891 0.09
892 0.11
893 0.1
894 0.14
895 0.14
896 0.16
897 0.15
898 0.15
899 0.15
900 0.17
901 0.24
902 0.21
903 0.21
904 0.2
905 0.21
906 0.23
907 0.24
908 0.2
909 0.17
910 0.22
911 0.23
912 0.22
913 0.22
914 0.19
915 0.22
916 0.24
917 0.21
918 0.19
919 0.21
920 0.21
921 0.23
922 0.23
923 0.26
924 0.26
925 0.29
926 0.27
927 0.27
928 0.34
929 0.37
930 0.41
931 0.34
932 0.33
933 0.31
934 0.33
935 0.34
936 0.3
937 0.29
938 0.32
939 0.34
940 0.36
941 0.34
942 0.33
943 0.29
944 0.25
945 0.24
946 0.16
947 0.16
948 0.14
949 0.16
950 0.14
951 0.18
952 0.18
953 0.18
954 0.2
955 0.19
956 0.22
957 0.23
958 0.31
959 0.33
960 0.33
961 0.37
962 0.41
963 0.45
964 0.43
965 0.42
966 0.37
967 0.34
968 0.32
969 0.3
970 0.25
971 0.2
972 0.23
973 0.21
974 0.2
975 0.17
976 0.17
977 0.15
978 0.14
979 0.13
980 0.13
981 0.14
982 0.17
983 0.18
984 0.19
985 0.23
986 0.23
987 0.24
988 0.21
989 0.19
990 0.15