Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A0D7A1V4

Protein Details
Accession A0A0D7A1V4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
780-820QKRFTRATHIQTIKRRHDKAKGRPVERKQHKELTEKNKRIIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
793-815KRRHDKAKGRPVERKQHKELTEK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MAGYNRTRYSEDLLEKHKDDPPSFAVNLYTDHWTMNGGSIFKYENQIAAVLEDIREHRIPVDFLDLFDEAKVPFYDGCMIVEILDHRLANDSPEEILQATRTLLFPNGETVWADICSLNQKHGGKWTDIDALKVEARLLLATSPPLCLDPDPHLTRVANHVLRVSTPLTPLSLKRKASIIDSEDDETGKIRKAKIMQFMNPRQHTKYTPNYKRLVYIDADRRRQATALQESQQRSSMQVQAATQYPHTAQTQTHQQVQTNVTHPQVTSLQQHMNGAVHPTPAQRAATPAQHTGASAPQIPVSQTPSSVVGQPTHANTQVPFTNGQPAFPTNLQAPSAAQQPSYAAGVQPHPTPAPSVNPTTNGINHQNATRVSSPRVASQPTPSRQGYVTPQIAPAPLAPAMAAAPSTQQRYMSSPHITSTPPRRSSQTPQQQPMGYSSPQRPGQPQVQGPMNVRTPPQATGVHTPQMTAQQRTAYGNLSRQQSPYLQQQQQHQPQQQSQQPQQPQQQPQPQQRAIPQQQSAIHPQQQNALPHIAGVQQQPQQSGLTNAYAQRLLWQQHAQRQQQMALNQIRAQHQQQQQQLNGLGRGVGVTAAARARPAQPGGMPQQQQAQLNGVLAQAQAQAQAQAQQRQSMYAAQAAQAVQGLTTNAAQQQQQLPGTAQPSLQQQQYMYYYQQMMQNPNMQWMRGAVSPAQQAALATLRQRQQQQQQQQQAQQQVQQQQANASGGAIQRSCKSTRMRSRGYTVESSAVTFVFPELFERKRRKESGQAWSFLLTDRSQKRFTRATHIQTIKRRHDKAKGRPVERKQHKELTEKNKRIIYA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.51
3 0.53
4 0.52
5 0.5
6 0.44
7 0.43
8 0.42
9 0.42
10 0.41
11 0.38
12 0.35
13 0.29
14 0.3
15 0.27
16 0.25
17 0.19
18 0.19
19 0.18
20 0.17
21 0.17
22 0.19
23 0.19
24 0.16
25 0.16
26 0.17
27 0.19
28 0.2
29 0.24
30 0.2
31 0.18
32 0.18
33 0.19
34 0.17
35 0.16
36 0.15
37 0.12
38 0.11
39 0.12
40 0.13
41 0.17
42 0.17
43 0.17
44 0.17
45 0.2
46 0.2
47 0.2
48 0.26
49 0.21
50 0.21
51 0.24
52 0.23
53 0.2
54 0.19
55 0.19
56 0.11
57 0.14
58 0.13
59 0.11
60 0.11
61 0.12
62 0.16
63 0.15
64 0.16
65 0.15
66 0.15
67 0.13
68 0.15
69 0.15
70 0.13
71 0.15
72 0.14
73 0.12
74 0.16
75 0.16
76 0.16
77 0.16
78 0.15
79 0.13
80 0.14
81 0.14
82 0.12
83 0.12
84 0.11
85 0.11
86 0.1
87 0.11
88 0.11
89 0.12
90 0.14
91 0.14
92 0.14
93 0.17
94 0.17
95 0.16
96 0.16
97 0.16
98 0.15
99 0.14
100 0.14
101 0.1
102 0.11
103 0.18
104 0.18
105 0.19
106 0.25
107 0.26
108 0.27
109 0.35
110 0.38
111 0.32
112 0.33
113 0.34
114 0.36
115 0.34
116 0.34
117 0.27
118 0.26
119 0.25
120 0.24
121 0.2
122 0.12
123 0.13
124 0.11
125 0.11
126 0.08
127 0.08
128 0.1
129 0.11
130 0.11
131 0.11
132 0.12
133 0.12
134 0.12
135 0.14
136 0.17
137 0.25
138 0.28
139 0.28
140 0.31
141 0.3
142 0.31
143 0.34
144 0.38
145 0.31
146 0.29
147 0.3
148 0.27
149 0.27
150 0.29
151 0.25
152 0.18
153 0.17
154 0.17
155 0.16
156 0.18
157 0.22
158 0.28
159 0.33
160 0.33
161 0.33
162 0.36
163 0.36
164 0.37
165 0.39
166 0.34
167 0.3
168 0.31
169 0.31
170 0.28
171 0.27
172 0.23
173 0.18
174 0.16
175 0.17
176 0.18
177 0.17
178 0.21
179 0.28
180 0.34
181 0.42
182 0.47
183 0.5
184 0.57
185 0.64
186 0.69
187 0.68
188 0.67
189 0.61
190 0.59
191 0.56
192 0.53
193 0.55
194 0.57
195 0.6
196 0.64
197 0.64
198 0.61
199 0.62
200 0.56
201 0.5
202 0.41
203 0.4
204 0.43
205 0.46
206 0.5
207 0.46
208 0.46
209 0.42
210 0.4
211 0.35
212 0.33
213 0.33
214 0.34
215 0.36
216 0.41
217 0.42
218 0.43
219 0.44
220 0.35
221 0.3
222 0.28
223 0.28
224 0.23
225 0.23
226 0.22
227 0.21
228 0.23
229 0.22
230 0.19
231 0.16
232 0.15
233 0.16
234 0.16
235 0.16
236 0.14
237 0.16
238 0.26
239 0.28
240 0.34
241 0.33
242 0.33
243 0.36
244 0.38
245 0.39
246 0.31
247 0.31
248 0.25
249 0.25
250 0.23
251 0.21
252 0.21
253 0.19
254 0.2
255 0.21
256 0.22
257 0.22
258 0.23
259 0.21
260 0.19
261 0.17
262 0.16
263 0.13
264 0.12
265 0.12
266 0.12
267 0.13
268 0.14
269 0.15
270 0.12
271 0.15
272 0.17
273 0.21
274 0.23
275 0.23
276 0.22
277 0.21
278 0.21
279 0.18
280 0.17
281 0.14
282 0.13
283 0.12
284 0.11
285 0.11
286 0.12
287 0.12
288 0.15
289 0.14
290 0.12
291 0.13
292 0.15
293 0.15
294 0.17
295 0.17
296 0.14
297 0.15
298 0.17
299 0.17
300 0.17
301 0.17
302 0.15
303 0.14
304 0.16
305 0.16
306 0.16
307 0.15
308 0.13
309 0.21
310 0.21
311 0.21
312 0.19
313 0.19
314 0.2
315 0.2
316 0.2
317 0.13
318 0.15
319 0.15
320 0.13
321 0.13
322 0.11
323 0.16
324 0.15
325 0.13
326 0.12
327 0.12
328 0.12
329 0.13
330 0.11
331 0.07
332 0.08
333 0.1
334 0.12
335 0.12
336 0.12
337 0.11
338 0.11
339 0.12
340 0.12
341 0.14
342 0.15
343 0.18
344 0.18
345 0.2
346 0.22
347 0.22
348 0.22
349 0.21
350 0.22
351 0.2
352 0.2
353 0.19
354 0.2
355 0.19
356 0.21
357 0.21
358 0.2
359 0.2
360 0.24
361 0.24
362 0.24
363 0.26
364 0.25
365 0.22
366 0.28
367 0.34
368 0.32
369 0.37
370 0.33
371 0.32
372 0.3
373 0.32
374 0.28
375 0.27
376 0.27
377 0.22
378 0.22
379 0.21
380 0.21
381 0.19
382 0.15
383 0.09
384 0.07
385 0.07
386 0.06
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.03
392 0.05
393 0.07
394 0.08
395 0.08
396 0.09
397 0.1
398 0.12
399 0.15
400 0.18
401 0.19
402 0.18
403 0.18
404 0.19
405 0.19
406 0.22
407 0.28
408 0.33
409 0.33
410 0.35
411 0.38
412 0.41
413 0.47
414 0.53
415 0.54
416 0.53
417 0.53
418 0.55
419 0.52
420 0.48
421 0.44
422 0.37
423 0.28
424 0.24
425 0.24
426 0.26
427 0.28
428 0.28
429 0.26
430 0.27
431 0.31
432 0.33
433 0.32
434 0.29
435 0.3
436 0.31
437 0.31
438 0.31
439 0.27
440 0.23
441 0.22
442 0.2
443 0.19
444 0.17
445 0.19
446 0.17
447 0.18
448 0.22
449 0.24
450 0.25
451 0.24
452 0.23
453 0.2
454 0.26
455 0.26
456 0.23
457 0.21
458 0.2
459 0.21
460 0.22
461 0.23
462 0.17
463 0.16
464 0.19
465 0.23
466 0.25
467 0.25
468 0.24
469 0.25
470 0.24
471 0.26
472 0.31
473 0.35
474 0.35
475 0.37
476 0.43
477 0.51
478 0.58
479 0.61
480 0.57
481 0.52
482 0.52
483 0.56
484 0.53
485 0.5
486 0.48
487 0.49
488 0.49
489 0.51
490 0.56
491 0.57
492 0.58
493 0.6
494 0.63
495 0.63
496 0.67
497 0.69
498 0.63
499 0.58
500 0.57
501 0.59
502 0.56
503 0.54
504 0.46
505 0.41
506 0.42
507 0.42
508 0.44
509 0.38
510 0.39
511 0.35
512 0.34
513 0.35
514 0.37
515 0.36
516 0.32
517 0.28
518 0.22
519 0.2
520 0.2
521 0.16
522 0.14
523 0.14
524 0.16
525 0.18
526 0.2
527 0.2
528 0.2
529 0.19
530 0.17
531 0.18
532 0.15
533 0.13
534 0.13
535 0.14
536 0.15
537 0.14
538 0.14
539 0.15
540 0.17
541 0.18
542 0.2
543 0.24
544 0.27
545 0.34
546 0.43
547 0.42
548 0.44
549 0.44
550 0.43
551 0.42
552 0.39
553 0.4
554 0.35
555 0.34
556 0.3
557 0.32
558 0.31
559 0.31
560 0.33
561 0.34
562 0.36
563 0.41
564 0.46
565 0.48
566 0.46
567 0.46
568 0.46
569 0.39
570 0.33
571 0.26
572 0.2
573 0.14
574 0.13
575 0.09
576 0.06
577 0.04
578 0.04
579 0.05
580 0.06
581 0.06
582 0.07
583 0.08
584 0.1
585 0.13
586 0.13
587 0.14
588 0.14
589 0.19
590 0.25
591 0.3
592 0.3
593 0.28
594 0.33
595 0.36
596 0.36
597 0.32
598 0.29
599 0.22
600 0.22
601 0.21
602 0.15
603 0.12
604 0.1
605 0.09
606 0.08
607 0.07
608 0.08
609 0.07
610 0.08
611 0.08
612 0.15
613 0.18
614 0.23
615 0.24
616 0.27
617 0.27
618 0.27
619 0.28
620 0.24
621 0.22
622 0.19
623 0.19
624 0.15
625 0.17
626 0.16
627 0.15
628 0.13
629 0.12
630 0.08
631 0.08
632 0.08
633 0.07
634 0.07
635 0.08
636 0.09
637 0.11
638 0.12
639 0.15
640 0.18
641 0.22
642 0.22
643 0.22
644 0.22
645 0.23
646 0.24
647 0.21
648 0.18
649 0.16
650 0.22
651 0.24
652 0.24
653 0.23
654 0.22
655 0.25
656 0.28
657 0.28
658 0.22
659 0.22
660 0.23
661 0.24
662 0.29
663 0.28
664 0.29
665 0.3
666 0.36
667 0.33
668 0.4
669 0.38
670 0.33
671 0.29
672 0.26
673 0.26
674 0.2
675 0.22
676 0.15
677 0.19
678 0.21
679 0.2
680 0.19
681 0.17
682 0.15
683 0.15
684 0.16
685 0.13
686 0.13
687 0.19
688 0.22
689 0.27
690 0.33
691 0.39
692 0.46
693 0.55
694 0.63
695 0.68
696 0.74
697 0.76
698 0.77
699 0.76
700 0.73
701 0.66
702 0.61
703 0.57
704 0.54
705 0.54
706 0.49
707 0.44
708 0.39
709 0.39
710 0.35
711 0.28
712 0.21
713 0.18
714 0.17
715 0.19
716 0.18
717 0.16
718 0.18
719 0.23
720 0.24
721 0.28
722 0.34
723 0.42
724 0.52
725 0.59
726 0.64
727 0.66
728 0.7
729 0.71
730 0.7
731 0.64
732 0.55
733 0.5
734 0.42
735 0.38
736 0.32
737 0.24
738 0.18
739 0.14
740 0.12
741 0.09
742 0.08
743 0.11
744 0.16
745 0.2
746 0.29
747 0.39
748 0.46
749 0.55
750 0.61
751 0.63
752 0.69
753 0.74
754 0.76
755 0.74
756 0.7
757 0.62
758 0.58
759 0.51
760 0.42
761 0.36
762 0.27
763 0.28
764 0.33
765 0.37
766 0.42
767 0.45
768 0.5
769 0.55
770 0.57
771 0.58
772 0.6
773 0.62
774 0.66
775 0.71
776 0.72
777 0.73
778 0.8
779 0.8
780 0.81
781 0.8
782 0.78
783 0.8
784 0.82
785 0.84
786 0.85
787 0.85
788 0.84
789 0.87
790 0.88
791 0.89
792 0.89
793 0.88
794 0.85
795 0.85
796 0.82
797 0.82
798 0.82
799 0.82
800 0.83
801 0.8
802 0.79