Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D7AFZ1

Protein Details
Accession A0A0D7AFZ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
144-164TNDIEKKYKFHRKRTNEIEGDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
63-70KQARKRRR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MESLQSEATKQKFNARESARLARQMKLAETLREKADAEERGEDVDRLKNWEWTIEENDEWEKKQARKRRRADFEFHDDAHAARRRYKKDLDVLKPDLRAYDQLKEEATNSLISLAGEPSASNTLIYGDHKPSEEAIDRVVGKVTNDIEKKYKFHRKRTNEIEGDITYINEQNRVFNKKIARYYDKYTTEIRDSFERGTAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.5
3 0.54
4 0.55
5 0.63
6 0.58
7 0.6
8 0.59
9 0.52
10 0.51
11 0.46
12 0.41
13 0.39
14 0.38
15 0.35
16 0.37
17 0.37
18 0.35
19 0.34
20 0.33
21 0.28
22 0.31
23 0.28
24 0.26
25 0.25
26 0.24
27 0.24
28 0.24
29 0.23
30 0.19
31 0.2
32 0.18
33 0.22
34 0.23
35 0.24
36 0.24
37 0.26
38 0.26
39 0.25
40 0.28
41 0.25
42 0.24
43 0.22
44 0.25
45 0.23
46 0.23
47 0.23
48 0.25
49 0.28
50 0.36
51 0.43
52 0.5
53 0.6
54 0.68
55 0.74
56 0.79
57 0.79
58 0.78
59 0.76
60 0.74
61 0.68
62 0.59
63 0.49
64 0.39
65 0.34
66 0.33
67 0.31
68 0.23
69 0.26
70 0.32
71 0.35
72 0.41
73 0.44
74 0.42
75 0.46
76 0.54
77 0.53
78 0.54
79 0.55
80 0.52
81 0.49
82 0.44
83 0.36
84 0.27
85 0.25
86 0.2
87 0.19
88 0.17
89 0.17
90 0.17
91 0.17
92 0.17
93 0.14
94 0.13
95 0.09
96 0.08
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.06
101 0.05
102 0.05
103 0.04
104 0.04
105 0.05
106 0.06
107 0.07
108 0.06
109 0.06
110 0.07
111 0.08
112 0.1
113 0.11
114 0.12
115 0.13
116 0.14
117 0.14
118 0.14
119 0.16
120 0.16
121 0.14
122 0.13
123 0.15
124 0.15
125 0.15
126 0.16
127 0.13
128 0.11
129 0.14
130 0.14
131 0.18
132 0.19
133 0.22
134 0.27
135 0.29
136 0.33
137 0.39
138 0.49
139 0.5
140 0.6
141 0.68
142 0.71
143 0.78
144 0.84
145 0.85
146 0.77
147 0.71
148 0.65
149 0.54
150 0.48
151 0.38
152 0.29
153 0.2
154 0.19
155 0.17
156 0.17
157 0.16
158 0.2
159 0.26
160 0.32
161 0.33
162 0.36
163 0.43
164 0.47
165 0.54
166 0.57
167 0.59
168 0.58
169 0.64
170 0.68
171 0.64
172 0.59
173 0.56
174 0.53
175 0.51
176 0.48
177 0.44
178 0.4
179 0.39
180 0.38