Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D7AIW6

Protein Details
Accession A0A0D7AIW6    Localization Confidence Low Confidence Score 6.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-48LLPPSKKKHGHERSLTQIKFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 15, nucl 5, cyto 5, cyto_nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027525  eIF3i  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0016282  C:eukaryotic 43S preinitiation complex  
GO:0033290  C:eukaryotic 48S preinitiation complex  
GO:0005852  C:eukaryotic translation initiation factor 3 complex  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0001732  P:formation of cytoplasmic translation initiation complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MQTAAINRSNQRSTVWMKALAENIAEPLLLPPSKKKHGHERSLTQIKFNADGDLLFSSSKDQLINVWFSRNGERLGTYSGHNGTVWTIDVDSESKYMVSGAADNTLRLWQVATGKCLYTWEFPTAVKSVSFSENDRQVVCITEQRMGFQCAIRVFNINRDEGSKQSAEPAYMFNPIGSKATVTAFTNMPKILVTGHESGKVALFNYETGEEIRSNERAHSDVVTDLQMSSDRSFFVTSSKDKCARIHDMKTLMVIKTFPTETPLNSAALTPNKPYVLLGGGQDAMSVTTTSLRQGKFETRFWHQVFEEEVGRVKGHFGPINTLAVHPAGTCYASGGEDGFVRVHHFDRSYFDAKPYGDLEDQILS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.43
3 0.4
4 0.4
5 0.42
6 0.43
7 0.37
8 0.33
9 0.24
10 0.22
11 0.17
12 0.15
13 0.11
14 0.09
15 0.13
16 0.13
17 0.15
18 0.21
19 0.29
20 0.38
21 0.45
22 0.5
23 0.57
24 0.66
25 0.75
26 0.77
27 0.76
28 0.78
29 0.82
30 0.76
31 0.68
32 0.62
33 0.54
34 0.47
35 0.4
36 0.31
37 0.21
38 0.21
39 0.19
40 0.16
41 0.15
42 0.11
43 0.11
44 0.11
45 0.12
46 0.14
47 0.12
48 0.11
49 0.13
50 0.17
51 0.22
52 0.21
53 0.23
54 0.23
55 0.25
56 0.29
57 0.28
58 0.26
59 0.22
60 0.22
61 0.2
62 0.23
63 0.22
64 0.19
65 0.21
66 0.21
67 0.2
68 0.19
69 0.17
70 0.14
71 0.14
72 0.13
73 0.09
74 0.08
75 0.07
76 0.08
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.08
81 0.08
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.11
89 0.12
90 0.12
91 0.12
92 0.13
93 0.12
94 0.1
95 0.1
96 0.08
97 0.15
98 0.17
99 0.19
100 0.19
101 0.19
102 0.19
103 0.21
104 0.21
105 0.18
106 0.18
107 0.18
108 0.18
109 0.18
110 0.2
111 0.2
112 0.18
113 0.15
114 0.14
115 0.14
116 0.15
117 0.16
118 0.16
119 0.2
120 0.23
121 0.24
122 0.23
123 0.22
124 0.19
125 0.2
126 0.18
127 0.17
128 0.14
129 0.17
130 0.17
131 0.18
132 0.19
133 0.19
134 0.19
135 0.16
136 0.18
137 0.16
138 0.17
139 0.16
140 0.17
141 0.16
142 0.22
143 0.23
144 0.21
145 0.19
146 0.21
147 0.21
148 0.19
149 0.22
150 0.15
151 0.13
152 0.16
153 0.16
154 0.14
155 0.14
156 0.14
157 0.12
158 0.13
159 0.13
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.09
165 0.08
166 0.07
167 0.07
168 0.09
169 0.09
170 0.1
171 0.1
172 0.11
173 0.13
174 0.11
175 0.11
176 0.1
177 0.09
178 0.07
179 0.08
180 0.11
181 0.12
182 0.13
183 0.14
184 0.15
185 0.15
186 0.15
187 0.14
188 0.1
189 0.08
190 0.08
191 0.06
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.09
197 0.08
198 0.1
199 0.11
200 0.12
201 0.13
202 0.13
203 0.13
204 0.13
205 0.14
206 0.13
207 0.12
208 0.1
209 0.11
210 0.1
211 0.09
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.09
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.1
221 0.1
222 0.11
223 0.14
224 0.18
225 0.22
226 0.27
227 0.31
228 0.33
229 0.35
230 0.39
231 0.44
232 0.47
233 0.47
234 0.47
235 0.45
236 0.43
237 0.44
238 0.4
239 0.31
240 0.25
241 0.21
242 0.16
243 0.16
244 0.17
245 0.13
246 0.15
247 0.16
248 0.16
249 0.21
250 0.21
251 0.19
252 0.18
253 0.19
254 0.18
255 0.22
256 0.23
257 0.19
258 0.21
259 0.2
260 0.2
261 0.19
262 0.17
263 0.14
264 0.14
265 0.12
266 0.11
267 0.12
268 0.11
269 0.11
270 0.1
271 0.08
272 0.07
273 0.07
274 0.05
275 0.07
276 0.08
277 0.11
278 0.17
279 0.17
280 0.18
281 0.22
282 0.3
283 0.33
284 0.38
285 0.4
286 0.42
287 0.51
288 0.51
289 0.53
290 0.44
291 0.42
292 0.4
293 0.38
294 0.32
295 0.24
296 0.25
297 0.21
298 0.21
299 0.18
300 0.17
301 0.17
302 0.2
303 0.22
304 0.21
305 0.25
306 0.27
307 0.3
308 0.28
309 0.26
310 0.22
311 0.19
312 0.19
313 0.13
314 0.12
315 0.1
316 0.1
317 0.09
318 0.09
319 0.1
320 0.1
321 0.1
322 0.09
323 0.09
324 0.09
325 0.11
326 0.1
327 0.09
328 0.12
329 0.14
330 0.15
331 0.18
332 0.19
333 0.2
334 0.25
335 0.32
336 0.33
337 0.33
338 0.34
339 0.35
340 0.34
341 0.36
342 0.32
343 0.3
344 0.27
345 0.26