Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0B7NGU2

Protein Details
Accession A0A0B7NGU2    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
188-207DDSPKSKKKHDDDGHGRGRGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
192-225KSKKKHDDDGHGRGRGRGMSRGRGGRGGRGRGGR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021475  DUF3128  
IPR027141  LSm4/Sm_D1/D3  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR047575  Sm  
IPR034102  Sm_D1  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0120114  C:Sm-like protein family complex  
GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF11326  DUF3128  
PF01423  LSM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
CDD cd01724  Sm_D1  
Amino Acid Sequences MTDNSSHEDKDAKAFFEEVEKEKKHDYETCSASQAFDAVFQCYTLGSQAINYYRYGTKKDCSGKWEDFKFCLKTKTKSSEIADAMLKERQAAKDHLKKRGRNSEEVWEARQFLMKLNNETVSVEMKNGTVVHGTITGVDMSMNTHLKTVKMTVKNRDPVSLDTLSIRGNTIRCVILPDSLPLDTLLIDDSPKSKKKHDDDGHGRGRGRGMSRGRGGRGGRGRGGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.24
3 0.28
4 0.31
5 0.27
6 0.33
7 0.33
8 0.34
9 0.38
10 0.4
11 0.38
12 0.4
13 0.42
14 0.41
15 0.45
16 0.44
17 0.44
18 0.42
19 0.37
20 0.31
21 0.26
22 0.17
23 0.16
24 0.14
25 0.12
26 0.12
27 0.12
28 0.12
29 0.11
30 0.11
31 0.08
32 0.08
33 0.06
34 0.07
35 0.11
36 0.13
37 0.14
38 0.14
39 0.17
40 0.2
41 0.22
42 0.26
43 0.26
44 0.26
45 0.33
46 0.39
47 0.39
48 0.4
49 0.45
50 0.48
51 0.53
52 0.56
53 0.51
54 0.47
55 0.5
56 0.49
57 0.44
58 0.46
59 0.43
60 0.42
61 0.47
62 0.51
63 0.49
64 0.52
65 0.52
66 0.51
67 0.46
68 0.43
69 0.36
70 0.3
71 0.28
72 0.22
73 0.19
74 0.13
75 0.14
76 0.14
77 0.16
78 0.19
79 0.26
80 0.34
81 0.4
82 0.48
83 0.54
84 0.57
85 0.62
86 0.68
87 0.64
88 0.6
89 0.58
90 0.56
91 0.55
92 0.52
93 0.45
94 0.36
95 0.32
96 0.27
97 0.26
98 0.18
99 0.13
100 0.19
101 0.18
102 0.19
103 0.19
104 0.2
105 0.18
106 0.18
107 0.17
108 0.13
109 0.11
110 0.1
111 0.09
112 0.08
113 0.09
114 0.08
115 0.08
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.05
125 0.05
126 0.04
127 0.04
128 0.07
129 0.09
130 0.08
131 0.1
132 0.1
133 0.11
134 0.12
135 0.15
136 0.2
137 0.28
138 0.33
139 0.4
140 0.47
141 0.54
142 0.54
143 0.53
144 0.48
145 0.42
146 0.43
147 0.36
148 0.28
149 0.22
150 0.22
151 0.19
152 0.17
153 0.15
154 0.12
155 0.12
156 0.13
157 0.14
158 0.13
159 0.13
160 0.17
161 0.17
162 0.17
163 0.17
164 0.17
165 0.17
166 0.17
167 0.17
168 0.13
169 0.12
170 0.1
171 0.09
172 0.08
173 0.06
174 0.07
175 0.07
176 0.1
177 0.17
178 0.24
179 0.27
180 0.33
181 0.42
182 0.49
183 0.59
184 0.64
185 0.68
186 0.72
187 0.78
188 0.8
189 0.76
190 0.7
191 0.6
192 0.55
193 0.49
194 0.43
195 0.41
196 0.39
197 0.42
198 0.49
199 0.53
200 0.53
201 0.55
202 0.54
203 0.55
204 0.57
205 0.55