Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0B7MXN5

Protein Details
Accession A0A0B7MXN5    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
205-225SSNRRYRSGSRSPSKNRYQRGHydrophilic
231-282DDYERRRNSRSRHRDDRSRSRDRYNSRRRSVSPDYRKRDRYRTGSRSRDGREBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
235-276RRRNSRSRHRDDRSRSRDRYNSRRRSVSPDYRKRDRYRTGSR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.333, cyto 3, cyto_mito 2.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MSNKKANNTLETWGNETTMNLNAIIYQNILSSPYFRSLYNKKTFHEIVDEIYNEAPFVKGTQPSTAFCCLFKMWTLRLTIKQIENMIDHVDSPYIRAIGFLYLRYVCAPAQLWDWFQYYLEDEEEITITSGVNPTKITIGKLCRMLITEQKFQGTMLPRIPVPIARDLEKKLKDYDMEKRKSSSGGNSRDDRDRDDRHYSRDRASSNRRYRSGSRSPSKNRYQRGDRDDLDDYERRRNSRSRHRDDRSRSRDRYNSRRRSVSPDYRKRDRYRTGSRSRDGRESGSRTYSRDSSKY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.27
3 0.25
4 0.23
5 0.19
6 0.17
7 0.13
8 0.12
9 0.13
10 0.14
11 0.14
12 0.12
13 0.1
14 0.1
15 0.1
16 0.12
17 0.1
18 0.11
19 0.13
20 0.17
21 0.18
22 0.18
23 0.26
24 0.32
25 0.41
26 0.49
27 0.51
28 0.47
29 0.54
30 0.55
31 0.5
32 0.48
33 0.39
34 0.33
35 0.33
36 0.33
37 0.26
38 0.25
39 0.22
40 0.16
41 0.15
42 0.12
43 0.07
44 0.09
45 0.11
46 0.13
47 0.15
48 0.2
49 0.22
50 0.24
51 0.28
52 0.31
53 0.28
54 0.25
55 0.26
56 0.22
57 0.2
58 0.22
59 0.22
60 0.19
61 0.22
62 0.26
63 0.26
64 0.3
65 0.33
66 0.35
67 0.33
68 0.33
69 0.32
70 0.3
71 0.27
72 0.24
73 0.21
74 0.16
75 0.15
76 0.12
77 0.12
78 0.09
79 0.1
80 0.1
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.1
86 0.1
87 0.1
88 0.11
89 0.11
90 0.11
91 0.12
92 0.12
93 0.09
94 0.11
95 0.11
96 0.1
97 0.12
98 0.13
99 0.13
100 0.14
101 0.16
102 0.14
103 0.13
104 0.13
105 0.12
106 0.12
107 0.11
108 0.09
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.07
113 0.06
114 0.05
115 0.04
116 0.04
117 0.07
118 0.06
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.09
123 0.1
124 0.11
125 0.13
126 0.16
127 0.19
128 0.21
129 0.21
130 0.19
131 0.2
132 0.2
133 0.23
134 0.25
135 0.25
136 0.23
137 0.24
138 0.23
139 0.22
140 0.24
141 0.21
142 0.19
143 0.16
144 0.17
145 0.16
146 0.17
147 0.17
148 0.15
149 0.14
150 0.17
151 0.17
152 0.18
153 0.21
154 0.24
155 0.31
156 0.31
157 0.31
158 0.27
159 0.27
160 0.27
161 0.29
162 0.36
163 0.38
164 0.41
165 0.4
166 0.41
167 0.4
168 0.4
169 0.37
170 0.36
171 0.35
172 0.38
173 0.42
174 0.44
175 0.46
176 0.49
177 0.49
178 0.45
179 0.43
180 0.4
181 0.41
182 0.47
183 0.47
184 0.48
185 0.56
186 0.53
187 0.51
188 0.52
189 0.49
190 0.49
191 0.56
192 0.59
193 0.61
194 0.66
195 0.64
196 0.64
197 0.66
198 0.66
199 0.66
200 0.66
201 0.65
202 0.67
203 0.73
204 0.76
205 0.81
206 0.8
207 0.78
208 0.77
209 0.77
210 0.76
211 0.76
212 0.75
213 0.66
214 0.63
215 0.59
216 0.52
217 0.48
218 0.44
219 0.38
220 0.39
221 0.42
222 0.38
223 0.4
224 0.45
225 0.5
226 0.56
227 0.65
228 0.66
229 0.73
230 0.8
231 0.85
232 0.88
233 0.9
234 0.88
235 0.87
236 0.83
237 0.81
238 0.81
239 0.81
240 0.82
241 0.82
242 0.83
243 0.8
244 0.83
245 0.77
246 0.77
247 0.78
248 0.78
249 0.78
250 0.78
251 0.79
252 0.8
253 0.87
254 0.85
255 0.85
256 0.84
257 0.82
258 0.83
259 0.85
260 0.85
261 0.85
262 0.85
263 0.84
264 0.79
265 0.78
266 0.7
267 0.66
268 0.65
269 0.61
270 0.59
271 0.58
272 0.55
273 0.5
274 0.52
275 0.52