Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0B7MRC0

Protein Details
Accession A0A0B7MRC0    Localization Confidence High Confidence Score 22.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
172-194NGFRATQKAGKKKKKGSKATAAAHydrophilic
222-248EQYKEERKKLKEQQKRQREWQKKQDLDBasic
263-295RSRSRSRSYSRSRSRSRSRSRSRSRSRSRTASPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
179-189KAGKKKKKGSK
228-239RKKLKEQQKRQR
262-291SRSRSRSRSYSRSRSRSRSRSRSRSRSRSR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, mito_nucl 12, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040052  RBM17  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
IPR034653  SPF45_RRM  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12647  RRM_UHM_SPF45  
Amino Acid Sequences MSFSLYGALPPSKSDKSADNVKKEAAGGLYSSLPAPESGSTIFQSNNQSSSLSTATTATPAAAAAATVPNAPESFSVSNNQPPKQAGWSAINTFRPVLRRPTVQAKPKLNKPFIPAGATIVSTKTITKEDREKERQIESEEKKASSTDDHQKKNDNIDLRAIPLLTAVDDVNGFRATQKAGKKKKKGSKATAAAAAAAAAAPQPIVFNMLEDYDPHRPNDYEQYKEERKKLKEQQKRQREWQKKQDLDGLWSRSRSRSQSYSRSRSRSRSYSRSRSRSRSRSRSRSRSRSRTASPESHVPLAPKQETNAAKINVNETADDAYMRRLKMSQTQQPPRQQATLNPPELAEPYLTQHDPITNGRKDTPSQVILLTNMVGPGQVDDMLQEETAEECSKYGKVERCLIFEVPRGKISDDRSVRIFVQFSTIESAKNAIQDLNGRFFGGRVVSAIFFDIKRFETLDLAPSKDELYQAGHEGRGSEKWV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.29
3 0.34
4 0.44
5 0.5
6 0.51
7 0.51
8 0.51
9 0.5
10 0.45
11 0.41
12 0.32
13 0.24
14 0.18
15 0.17
16 0.16
17 0.14
18 0.14
19 0.12
20 0.11
21 0.1
22 0.11
23 0.1
24 0.11
25 0.12
26 0.14
27 0.15
28 0.16
29 0.17
30 0.19
31 0.26
32 0.26
33 0.26
34 0.24
35 0.24
36 0.23
37 0.26
38 0.22
39 0.16
40 0.14
41 0.14
42 0.14
43 0.14
44 0.14
45 0.1
46 0.09
47 0.08
48 0.08
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.08
56 0.08
57 0.09
58 0.1
59 0.09
60 0.13
61 0.14
62 0.16
63 0.19
64 0.21
65 0.28
66 0.34
67 0.35
68 0.33
69 0.33
70 0.34
71 0.35
72 0.35
73 0.31
74 0.3
75 0.33
76 0.35
77 0.38
78 0.38
79 0.34
80 0.33
81 0.31
82 0.3
83 0.29
84 0.33
85 0.32
86 0.34
87 0.38
88 0.47
89 0.53
90 0.58
91 0.64
92 0.66
93 0.69
94 0.74
95 0.79
96 0.74
97 0.69
98 0.65
99 0.65
100 0.57
101 0.52
102 0.44
103 0.37
104 0.33
105 0.3
106 0.24
107 0.17
108 0.15
109 0.12
110 0.13
111 0.12
112 0.15
113 0.16
114 0.21
115 0.3
116 0.36
117 0.46
118 0.52
119 0.55
120 0.55
121 0.58
122 0.56
123 0.52
124 0.55
125 0.49
126 0.5
127 0.48
128 0.44
129 0.39
130 0.36
131 0.33
132 0.26
133 0.3
134 0.31
135 0.37
136 0.42
137 0.44
138 0.51
139 0.52
140 0.55
141 0.53
142 0.46
143 0.39
144 0.39
145 0.37
146 0.32
147 0.3
148 0.23
149 0.18
150 0.14
151 0.12
152 0.07
153 0.08
154 0.06
155 0.05
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.06
162 0.08
163 0.09
164 0.14
165 0.22
166 0.3
167 0.41
168 0.51
169 0.59
170 0.69
171 0.76
172 0.81
173 0.84
174 0.82
175 0.82
176 0.79
177 0.73
178 0.66
179 0.58
180 0.47
181 0.37
182 0.28
183 0.17
184 0.1
185 0.07
186 0.03
187 0.03
188 0.02
189 0.02
190 0.03
191 0.03
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.08
199 0.12
200 0.16
201 0.18
202 0.18
203 0.19
204 0.19
205 0.21
206 0.3
207 0.3
208 0.27
209 0.28
210 0.36
211 0.42
212 0.46
213 0.51
214 0.49
215 0.49
216 0.55
217 0.63
218 0.65
219 0.68
220 0.74
221 0.78
222 0.81
223 0.83
224 0.83
225 0.84
226 0.84
227 0.83
228 0.83
229 0.82
230 0.74
231 0.7
232 0.67
233 0.57
234 0.5
235 0.46
236 0.41
237 0.32
238 0.31
239 0.3
240 0.26
241 0.28
242 0.28
243 0.27
244 0.3
245 0.35
246 0.44
247 0.52
248 0.58
249 0.62
250 0.66
251 0.66
252 0.65
253 0.66
254 0.65
255 0.63
256 0.64
257 0.67
258 0.7
259 0.75
260 0.78
261 0.79
262 0.79
263 0.81
264 0.82
265 0.83
266 0.83
267 0.84
268 0.85
269 0.88
270 0.9
271 0.9
272 0.9
273 0.91
274 0.89
275 0.86
276 0.83
277 0.77
278 0.75
279 0.71
280 0.66
281 0.58
282 0.55
283 0.5
284 0.44
285 0.41
286 0.33
287 0.29
288 0.29
289 0.28
290 0.22
291 0.2
292 0.26
293 0.26
294 0.28
295 0.32
296 0.28
297 0.27
298 0.27
299 0.28
300 0.23
301 0.22
302 0.19
303 0.13
304 0.13
305 0.12
306 0.11
307 0.1
308 0.12
309 0.15
310 0.15
311 0.15
312 0.15
313 0.17
314 0.25
315 0.32
316 0.37
317 0.44
318 0.54
319 0.6
320 0.67
321 0.72
322 0.66
323 0.62
324 0.54
325 0.5
326 0.51
327 0.52
328 0.46
329 0.4
330 0.37
331 0.34
332 0.34
333 0.28
334 0.19
335 0.11
336 0.12
337 0.15
338 0.15
339 0.15
340 0.15
341 0.15
342 0.17
343 0.22
344 0.28
345 0.26
346 0.29
347 0.31
348 0.33
349 0.34
350 0.36
351 0.36
352 0.3
353 0.28
354 0.27
355 0.25
356 0.23
357 0.22
358 0.17
359 0.12
360 0.1
361 0.09
362 0.07
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.05
368 0.05
369 0.07
370 0.08
371 0.08
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.09
376 0.1
377 0.08
378 0.08
379 0.1
380 0.11
381 0.12
382 0.19
383 0.24
384 0.28
385 0.37
386 0.39
387 0.42
388 0.45
389 0.45
390 0.41
391 0.4
392 0.41
393 0.35
394 0.35
395 0.33
396 0.31
397 0.34
398 0.36
399 0.4
400 0.39
401 0.39
402 0.39
403 0.4
404 0.39
405 0.38
406 0.34
407 0.24
408 0.25
409 0.22
410 0.21
411 0.24
412 0.24
413 0.21
414 0.2
415 0.23
416 0.18
417 0.19
418 0.19
419 0.13
420 0.15
421 0.21
422 0.24
423 0.27
424 0.26
425 0.25
426 0.24
427 0.24
428 0.24
429 0.19
430 0.15
431 0.11
432 0.13
433 0.13
434 0.13
435 0.15
436 0.15
437 0.14
438 0.15
439 0.16
440 0.16
441 0.18
442 0.19
443 0.18
444 0.19
445 0.21
446 0.27
447 0.28
448 0.28
449 0.27
450 0.26
451 0.26
452 0.23
453 0.23
454 0.17
455 0.17
456 0.18
457 0.22
458 0.23
459 0.23
460 0.22
461 0.23
462 0.24