Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6BWF3

Protein Details
Accession Q6BWF3    Localization Confidence High Confidence Score 20.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
159-202DIVSINKKLKKRNKDKKKKERDPKKKEDKKGKAKEEKKPAKPKSBasic
209-237TGDSTKAPPKAKKRNRNKKPEGENTNDKQHydrophilic
248-298SSDAPAKQPPKPKNKPHDSSKGKQDPKAKSKQDSKQKPKSAQDTKQKSNQDHydrophilic
301-330ASNANTPKNPKIKIKQKPKGQNPKPNTGLAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
165-287KKLKKRNKDKKKKERDPKKKEDKKGKAKEEKKPAKPKSGKATDKTGDSTKAPPKAKKRNRNKKPEGENTNDKQKQKQPTDAKESSDAPAKQPPKPKNKPHDSSKGKQDPKAKSKQDSKQKPKS
308-321KNPKIKIKQKPKGQ
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 12.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
KEGG dha:DEHA2B11792g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MSSVNGNSRTPTPKVGGKSTYINLKLTVRLLPPTLTKDQFIEQLNNYTDLLKDGSIIDDYYVQGCYPTKPYEKPTYSRAYLLFKNQTSLDQFMKEINGKSFIESETNDSLIPAIGKSLYNKMPIERPYNTATPSKKFEDDEFYKEFLSQLEANTNESFDIVSINKKLKKRNKDKKKKERDPKKKEDKKGKAKEEKKPAKPKSGKATDKTGDSTKAPPKAKKRNRNKKPEGENTNDKQKQKQPTDAKESSDAPAKQPPKPKNKPHDSSKGKQDPKAKSKQDSKQKPKSAQDTKQKSNQDSSASNANTPKNPKIKIKQKPKGQNPKPNTGLANNA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.48
3 0.46
4 0.44
5 0.47
6 0.46
7 0.51
8 0.47
9 0.43
10 0.39
11 0.38
12 0.37
13 0.33
14 0.33
15 0.27
16 0.27
17 0.27
18 0.26
19 0.28
20 0.31
21 0.36
22 0.33
23 0.33
24 0.32
25 0.33
26 0.36
27 0.36
28 0.34
29 0.29
30 0.34
31 0.34
32 0.33
33 0.31
34 0.26
35 0.23
36 0.2
37 0.19
38 0.12
39 0.11
40 0.1
41 0.11
42 0.11
43 0.11
44 0.1
45 0.1
46 0.1
47 0.1
48 0.1
49 0.09
50 0.1
51 0.1
52 0.12
53 0.15
54 0.2
55 0.24
56 0.28
57 0.35
58 0.44
59 0.49
60 0.5
61 0.52
62 0.55
63 0.52
64 0.51
65 0.47
66 0.43
67 0.4
68 0.44
69 0.45
70 0.37
71 0.38
72 0.35
73 0.35
74 0.32
75 0.33
76 0.27
77 0.21
78 0.21
79 0.19
80 0.22
81 0.22
82 0.2
83 0.18
84 0.21
85 0.2
86 0.2
87 0.21
88 0.19
89 0.18
90 0.17
91 0.2
92 0.17
93 0.18
94 0.16
95 0.15
96 0.14
97 0.12
98 0.11
99 0.06
100 0.05
101 0.06
102 0.06
103 0.08
104 0.13
105 0.15
106 0.18
107 0.19
108 0.2
109 0.25
110 0.29
111 0.33
112 0.3
113 0.31
114 0.32
115 0.33
116 0.34
117 0.34
118 0.33
119 0.32
120 0.35
121 0.34
122 0.32
123 0.32
124 0.31
125 0.33
126 0.34
127 0.35
128 0.33
129 0.31
130 0.29
131 0.27
132 0.25
133 0.17
134 0.16
135 0.12
136 0.1
137 0.12
138 0.12
139 0.14
140 0.14
141 0.14
142 0.11
143 0.1
144 0.09
145 0.06
146 0.07
147 0.05
148 0.07
149 0.09
150 0.14
151 0.18
152 0.22
153 0.31
154 0.39
155 0.49
156 0.59
157 0.68
158 0.75
159 0.82
160 0.9
161 0.92
162 0.95
163 0.95
164 0.95
165 0.95
166 0.95
167 0.94
168 0.94
169 0.94
170 0.92
171 0.91
172 0.91
173 0.9
174 0.9
175 0.89
176 0.88
177 0.88
178 0.86
179 0.86
180 0.86
181 0.85
182 0.84
183 0.85
184 0.79
185 0.8
186 0.78
187 0.76
188 0.75
189 0.76
190 0.72
191 0.65
192 0.68
193 0.59
194 0.55
195 0.51
196 0.43
197 0.35
198 0.31
199 0.34
200 0.31
201 0.37
202 0.4
203 0.44
204 0.52
205 0.61
206 0.69
207 0.74
208 0.79
209 0.83
210 0.88
211 0.92
212 0.92
213 0.91
214 0.9
215 0.9
216 0.86
217 0.83
218 0.81
219 0.75
220 0.76
221 0.71
222 0.63
223 0.6
224 0.59
225 0.61
226 0.58
227 0.63
228 0.62
229 0.64
230 0.72
231 0.68
232 0.64
233 0.58
234 0.54
235 0.46
236 0.44
237 0.37
238 0.3
239 0.35
240 0.36
241 0.38
242 0.45
243 0.52
244 0.55
245 0.65
246 0.73
247 0.75
248 0.82
249 0.85
250 0.85
251 0.87
252 0.85
253 0.82
254 0.82
255 0.82
256 0.77
257 0.75
258 0.74
259 0.74
260 0.75
261 0.78
262 0.74
263 0.73
264 0.77
265 0.8
266 0.83
267 0.84
268 0.85
269 0.85
270 0.87
271 0.87
272 0.86
273 0.87
274 0.86
275 0.85
276 0.85
277 0.84
278 0.82
279 0.82
280 0.8
281 0.73
282 0.7
283 0.65
284 0.59
285 0.51
286 0.48
287 0.49
288 0.43
289 0.42
290 0.41
291 0.41
292 0.42
293 0.46
294 0.5
295 0.49
296 0.54
297 0.6
298 0.66
299 0.72
300 0.76
301 0.82
302 0.83
303 0.85
304 0.9
305 0.92
306 0.92
307 0.92
308 0.93
309 0.89
310 0.9
311 0.83
312 0.78
313 0.71