Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0B7NCJ9

Protein Details
Accession A0A0B7NCJ9    Localization Confidence Low Confidence Score 8.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
371-393IQFCKGCQRYKVRNDNHRQPLKPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 9.5, mito 6, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043502  DNA/RNA_pol_sf  
IPR001584  Integrase_cat-core  
IPR043128  Rev_trsase/Diguanyl_cyclase  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR000477  RT_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0015074  P:DNA integration  
Pfam View protein in Pfam  
PF00078  RVT_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50994  INTEGRASE  
PS50878  RT_POL  
CDD cd01647  RT_LTR  
Amino Acid Sequences MKDEFPLPLIPDLLRKLRGYKYFSSCDLKSGFWQLPLNEQDGSRKRTAFQANGRLYEFTSLPYGISTRPSSFARLMTIVLKGLPRTINFCDDTLIFSYTYKQHVEDVKRVLERLNNYNLKITIKKCQCFQHEVKFLGFMVSGEGIRSNPEKIAVVKDWKAPGSKKALLRFLRFACFYYKFINCLSGKARPLYNLLKQEQAFTWGKEEQQAFDLLKQELMTLPTXXXXIRIQIGLMIYIVMHHLALKSILATKLPRGRIARWIVEFQEYHPFNIIIHQKGLENADADALSRLDQNNQVNELVCYEEDDRLVSVIPLALIEQVLKHVYNQPTEGHLGIDKTLEKITNKETTSDYITENAKNQQGWWDTQDIDVKNWIQFCKGCQRYKVRNDNHRQPLKPITPTRIGEIWASDIAIFTESEHGNWFILVLKEYLTKWVIAVPLKRYDTTSIEQVLLYEVVLKYGLLERIISDDGSSSISDGMDTVMRRLGIARSLTSVEHTQSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.32
3 0.36
4 0.42
5 0.49
6 0.5
7 0.54
8 0.56
9 0.57
10 0.61
11 0.62
12 0.55
13 0.52
14 0.48
15 0.41
16 0.37
17 0.39
18 0.35
19 0.33
20 0.36
21 0.31
22 0.37
23 0.38
24 0.37
25 0.31
26 0.3
27 0.35
28 0.39
29 0.44
30 0.41
31 0.39
32 0.38
33 0.45
34 0.53
35 0.51
36 0.53
37 0.57
38 0.58
39 0.6
40 0.6
41 0.52
42 0.45
43 0.39
44 0.31
45 0.22
46 0.19
47 0.16
48 0.14
49 0.14
50 0.15
51 0.13
52 0.18
53 0.19
54 0.19
55 0.23
56 0.24
57 0.28
58 0.29
59 0.29
60 0.28
61 0.25
62 0.25
63 0.23
64 0.22
65 0.18
66 0.18
67 0.18
68 0.15
69 0.17
70 0.19
71 0.18
72 0.22
73 0.24
74 0.28
75 0.28
76 0.28
77 0.27
78 0.24
79 0.26
80 0.23
81 0.21
82 0.16
83 0.15
84 0.18
85 0.19
86 0.22
87 0.2
88 0.19
89 0.22
90 0.3
91 0.35
92 0.38
93 0.4
94 0.43
95 0.43
96 0.42
97 0.39
98 0.36
99 0.36
100 0.35
101 0.4
102 0.38
103 0.38
104 0.41
105 0.41
106 0.4
107 0.41
108 0.37
109 0.37
110 0.41
111 0.43
112 0.45
113 0.51
114 0.52
115 0.55
116 0.59
117 0.59
118 0.58
119 0.58
120 0.53
121 0.46
122 0.41
123 0.33
124 0.27
125 0.16
126 0.11
127 0.09
128 0.09
129 0.08
130 0.08
131 0.07
132 0.1
133 0.11
134 0.11
135 0.1
136 0.11
137 0.12
138 0.13
139 0.18
140 0.19
141 0.24
142 0.25
143 0.29
144 0.3
145 0.3
146 0.33
147 0.3
148 0.32
149 0.34
150 0.38
151 0.39
152 0.42
153 0.49
154 0.49
155 0.51
156 0.52
157 0.47
158 0.45
159 0.41
160 0.37
161 0.33
162 0.31
163 0.29
164 0.28
165 0.27
166 0.24
167 0.24
168 0.3
169 0.24
170 0.25
171 0.26
172 0.26
173 0.27
174 0.28
175 0.28
176 0.23
177 0.28
178 0.29
179 0.32
180 0.33
181 0.33
182 0.36
183 0.35
184 0.35
185 0.3
186 0.32
187 0.27
188 0.21
189 0.23
190 0.19
191 0.19
192 0.22
193 0.22
194 0.17
195 0.16
196 0.18
197 0.15
198 0.15
199 0.18
200 0.13
201 0.13
202 0.12
203 0.12
204 0.1
205 0.11
206 0.1
207 0.08
208 0.08
209 0.1
210 0.11
211 0.11
212 0.1
213 0.09
214 0.09
215 0.08
216 0.08
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.04
221 0.05
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.08
234 0.12
235 0.17
236 0.18
237 0.23
238 0.24
239 0.25
240 0.32
241 0.35
242 0.35
243 0.31
244 0.32
245 0.28
246 0.28
247 0.27
248 0.21
249 0.26
250 0.22
251 0.21
252 0.2
253 0.19
254 0.16
255 0.22
256 0.24
257 0.16
258 0.16
259 0.16
260 0.15
261 0.16
262 0.18
263 0.13
264 0.1
265 0.09
266 0.09
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.07
274 0.08
275 0.13
276 0.15
277 0.16
278 0.17
279 0.18
280 0.16
281 0.16
282 0.15
283 0.11
284 0.09
285 0.1
286 0.09
287 0.09
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.08
292 0.08
293 0.06
294 0.05
295 0.05
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.05
304 0.06
305 0.06
306 0.07
307 0.14
308 0.16
309 0.18
310 0.2
311 0.19
312 0.21
313 0.22
314 0.21
315 0.15
316 0.14
317 0.13
318 0.12
319 0.12
320 0.1
321 0.1
322 0.11
323 0.13
324 0.13
325 0.15
326 0.19
327 0.24
328 0.25
329 0.25
330 0.26
331 0.26
332 0.29
333 0.28
334 0.24
335 0.21
336 0.23
337 0.23
338 0.24
339 0.25
340 0.24
341 0.22
342 0.22
343 0.25
344 0.25
345 0.25
346 0.26
347 0.24
348 0.22
349 0.24
350 0.3
351 0.24
352 0.23
353 0.24
354 0.23
355 0.22
356 0.25
357 0.23
358 0.2
359 0.2
360 0.23
361 0.3
362 0.37
363 0.4
364 0.45
365 0.54
366 0.61
367 0.71
368 0.78
369 0.76
370 0.79
371 0.84
372 0.87
373 0.88
374 0.86
375 0.77
376 0.72
377 0.72
378 0.67
379 0.66
380 0.61
381 0.57
382 0.56
383 0.56
384 0.55
385 0.47
386 0.42
387 0.34
388 0.3
389 0.26
390 0.18
391 0.17
392 0.13
393 0.11
394 0.1
395 0.1
396 0.09
397 0.06
398 0.11
399 0.11
400 0.12
401 0.14
402 0.14
403 0.13
404 0.13
405 0.13
406 0.11
407 0.12
408 0.13
409 0.11
410 0.12
411 0.14
412 0.15
413 0.19
414 0.17
415 0.16
416 0.15
417 0.17
418 0.2
419 0.23
420 0.27
421 0.28
422 0.35
423 0.37
424 0.38
425 0.38
426 0.38
427 0.39
428 0.37
429 0.38
430 0.32
431 0.3
432 0.29
433 0.27
434 0.24
435 0.19
436 0.15
437 0.14
438 0.11
439 0.11
440 0.11
441 0.1
442 0.1
443 0.14
444 0.16
445 0.12
446 0.13
447 0.13
448 0.17
449 0.18
450 0.17
451 0.13
452 0.12
453 0.12
454 0.14
455 0.13
456 0.1
457 0.1
458 0.1
459 0.09
460 0.08
461 0.09
462 0.11
463 0.12
464 0.12
465 0.14
466 0.14
467 0.15
468 0.17
469 0.18
470 0.2
471 0.22
472 0.22
473 0.23
474 0.24
475 0.25
476 0.27
477 0.28