Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E9CTM1

Protein Details
Accession E9CTM1    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
121-146KEKDAKPDRTEKSRKRKRHEAEDDLEBasic
155-176KEEEKDRKKRAAAKNEKRQRTDBasic
424-443VRQHYFSTRKNSPRCSRANSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
125-139AKPDRTEKSRKRKRH
152-172KIAKEEEKDRKKRAAAKNEKR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12394  RRM1_RBM34  
Amino Acid Sequences MGKKSRSKAKEEAAASNAAPGATTNNTGFSLLFGTKDATAVDPALASLFANSAGPVKSPEIVKSREQLSTHRREEPAEEHGSDGEAELADGDEEMPDAGAERVNDDEEDEEEEEEEEEEEKEKDAKPDRTEKSRKRKRHEAEDDLEESYMRKIAKEEEKDRKKRAAAKNEKRQRTDESPAADSEAGSSGPDEQKDDEESESDQEDEGPPPVHESLANTAEAAALEKSNRTVFLGNVSSEAIKSKSSKKALLAHLSSFFPSLPESSTPHKIESIRFRSTAFATAAVPKRAAFAKKDLMDSTTRSTNAYVVYTTAAAARKALSLNGTTVLDRHLRVDSIAHPAPIDHKRCVFVGNLGFVDEEAAASTDDQEKKRKKSATPSDVEEGLWRTFNENAGRVESVRVVRDPSTRVGKGFAYIQFHDQNGVRQHYFSTRKNSPRCSRANSASCARNGRQRSETTPRAPIRTG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.48
3 0.41
4 0.33
5 0.24
6 0.2
7 0.14
8 0.14
9 0.13
10 0.16
11 0.15
12 0.16
13 0.17
14 0.18
15 0.17
16 0.14
17 0.16
18 0.14
19 0.14
20 0.13
21 0.14
22 0.14
23 0.14
24 0.14
25 0.12
26 0.13
27 0.12
28 0.12
29 0.1
30 0.1
31 0.09
32 0.09
33 0.07
34 0.06
35 0.06
36 0.06
37 0.06
38 0.06
39 0.09
40 0.09
41 0.1
42 0.12
43 0.13
44 0.16
45 0.18
46 0.23
47 0.27
48 0.31
49 0.34
50 0.36
51 0.38
52 0.4
53 0.4
54 0.44
55 0.47
56 0.53
57 0.54
58 0.55
59 0.53
60 0.5
61 0.53
62 0.49
63 0.46
64 0.41
65 0.36
66 0.31
67 0.29
68 0.28
69 0.23
70 0.19
71 0.12
72 0.07
73 0.06
74 0.06
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.04
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.03
84 0.04
85 0.05
86 0.06
87 0.06
88 0.07
89 0.08
90 0.09
91 0.1
92 0.09
93 0.1
94 0.09
95 0.12
96 0.12
97 0.11
98 0.11
99 0.11
100 0.11
101 0.1
102 0.1
103 0.07
104 0.07
105 0.08
106 0.08
107 0.09
108 0.11
109 0.13
110 0.19
111 0.26
112 0.32
113 0.37
114 0.46
115 0.51
116 0.59
117 0.68
118 0.72
119 0.75
120 0.8
121 0.84
122 0.83
123 0.88
124 0.86
125 0.87
126 0.87
127 0.84
128 0.79
129 0.75
130 0.67
131 0.57
132 0.48
133 0.37
134 0.28
135 0.19
136 0.17
137 0.11
138 0.09
139 0.1
140 0.17
141 0.26
142 0.33
143 0.41
144 0.5
145 0.6
146 0.67
147 0.71
148 0.7
149 0.68
150 0.69
151 0.7
152 0.7
153 0.71
154 0.75
155 0.81
156 0.84
157 0.86
158 0.8
159 0.74
160 0.7
161 0.65
162 0.6
163 0.54
164 0.48
165 0.42
166 0.38
167 0.37
168 0.29
169 0.22
170 0.16
171 0.13
172 0.09
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.09
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.11
181 0.13
182 0.14
183 0.12
184 0.11
185 0.12
186 0.12
187 0.12
188 0.1
189 0.09
190 0.08
191 0.09
192 0.08
193 0.09
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.09
201 0.12
202 0.12
203 0.12
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.09
209 0.06
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.08
219 0.11
220 0.13
221 0.12
222 0.12
223 0.12
224 0.11
225 0.1
226 0.11
227 0.08
228 0.08
229 0.11
230 0.16
231 0.23
232 0.25
233 0.28
234 0.31
235 0.38
236 0.41
237 0.46
238 0.42
239 0.36
240 0.35
241 0.33
242 0.29
243 0.22
244 0.17
245 0.11
246 0.09
247 0.08
248 0.08
249 0.09
250 0.12
251 0.16
252 0.22
253 0.23
254 0.23
255 0.26
256 0.26
257 0.3
258 0.37
259 0.39
260 0.36
261 0.35
262 0.35
263 0.34
264 0.34
265 0.32
266 0.23
267 0.17
268 0.15
269 0.21
270 0.24
271 0.23
272 0.22
273 0.18
274 0.19
275 0.22
276 0.24
277 0.19
278 0.21
279 0.27
280 0.29
281 0.31
282 0.3
283 0.29
284 0.28
285 0.28
286 0.27
287 0.23
288 0.21
289 0.2
290 0.2
291 0.19
292 0.18
293 0.16
294 0.13
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.09
299 0.11
300 0.11
301 0.1
302 0.1
303 0.1
304 0.11
305 0.11
306 0.12
307 0.11
308 0.1
309 0.11
310 0.13
311 0.13
312 0.11
313 0.11
314 0.13
315 0.14
316 0.13
317 0.14
318 0.13
319 0.13
320 0.13
321 0.15
322 0.15
323 0.2
324 0.21
325 0.19
326 0.18
327 0.18
328 0.24
329 0.29
330 0.31
331 0.27
332 0.28
333 0.3
334 0.31
335 0.32
336 0.27
337 0.24
338 0.23
339 0.23
340 0.21
341 0.19
342 0.19
343 0.17
344 0.16
345 0.11
346 0.08
347 0.05
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.07
352 0.13
353 0.18
354 0.21
355 0.3
356 0.38
357 0.44
358 0.52
359 0.57
360 0.57
361 0.64
362 0.72
363 0.73
364 0.7
365 0.7
366 0.65
367 0.6
368 0.53
369 0.45
370 0.37
371 0.28
372 0.24
373 0.19
374 0.17
375 0.17
376 0.22
377 0.23
378 0.24
379 0.24
380 0.26
381 0.27
382 0.26
383 0.26
384 0.25
385 0.24
386 0.23
387 0.23
388 0.23
389 0.25
390 0.28
391 0.3
392 0.32
393 0.37
394 0.36
395 0.36
396 0.36
397 0.33
398 0.31
399 0.33
400 0.31
401 0.28
402 0.28
403 0.33
404 0.33
405 0.33
406 0.35
407 0.31
408 0.33
409 0.34
410 0.39
411 0.34
412 0.32
413 0.34
414 0.4
415 0.47
416 0.46
417 0.49
418 0.52
419 0.61
420 0.69
421 0.77
422 0.77
423 0.79
424 0.81
425 0.8
426 0.8
427 0.8
428 0.78
429 0.75
430 0.73
431 0.69
432 0.66
433 0.66
434 0.6
435 0.59
436 0.57
437 0.58
438 0.57
439 0.56
440 0.59
441 0.62
442 0.67
443 0.64
444 0.68
445 0.67