FuNGI

A0A0B7NKW4

Protein Details

Accession

A0A0B7NKW4

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
135-155	DNTNEKCIKDKKNNKPTTIKI	Hydrophilic
451-493	ANADSNTKRKRAPKSVNKRKVATREERSSKRHARLIDKRRPTT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
462-495	KRKRAPKSVNKRKVATREERSSKRHARLIDKRRP

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016197 Chromo-like_dom_sf IPR000953 Chromo/chromo_shadow_dom IPR023780 Chromo_domain IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR041588 Integrase_H2C2 IPR041373 RT_RNaseH
Pfam	View protein in Pfam PF00385 Chromo PF17921 Integrase_H2C2 PF17917 RT_RNaseH
PROSITE	View protein in PROSITE PS50013 CHROMO_2
CDD	cd00024 CD_CSD cd09274 RNase_HI_RT_Ty3

Amino Acid Sequences

MVVXXXXPNEQRYGSTKRELLAVVYAFTKFRQWLWGEKFHLFLDNRGLLYIHSQEKLSRMIENFYETIFEFDFDITYTSGMDNILADRLSRIFVPGTKKLEGSGTLARKATYSKRAIESVETSCDNNTDTDQNKRQKIDNTNEKCIKDKKNNKPTTIKITSPNETGIEKIICDESNKQTVENHYTNNNNELKRESSVDKEDKEMFIYASYLEIYETPQSEEQKKELLEKSHLLGHYGITAMEQIIHEEYQMHWKGLRKDIEHYVKNCSKCRVFNLVMFARLPNELKDYSNEKDKIKRIDKILVPAIKEQIVRTHKADNAYFMKRNKILEKPFPIGASVMIKNVKSKNSKTDPKYEGIFYIRGYILKDKSNTFLSRDVPTSQIKLIDKSPDPIDEQDPTEIEYEVQAILNHRGKAPNYEYLVRWKGFDSSWDTWEVPANFDSKEPIKLYWSRLGAANADSNTKRKRAPKSVNKRKVATREERSSKRHARLIDKRRPTTTP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.38
3	0.34
4	0.34
5	0.29
6	0.23
7	0.22
8	0.22
9	0.19
10	0.19
11	0.21
12	0.16
13	0.17
14	0.23
15	0.25
16	0.34
17	0.4
18	0.48
19	0.49
20	0.5
21	0.51
22	0.44
23	0.49
24	0.4
25	0.35
26	0.34
27	0.33
28	0.31
29	0.29
30	0.28
31	0.21
32	0.24
33	0.27
34	0.23
35	0.21
36	0.22
37	0.23
38	0.26
39	0.3
40	0.27
41	0.26
42	0.24
43	0.26
44	0.27
45	0.3
46	0.27
47	0.23
48	0.23
49	0.18
50	0.2
51	0.16
52	0.15
53	0.12
54	0.11
55	0.11
56	0.1
57	0.11
58	0.09
59	0.08
60	0.08
61	0.08
62	0.08
63	0.08
64	0.07
65	0.07
66	0.07
67	0.08
68	0.08
69	0.08
70	0.09
71	0.09
72	0.1
73	0.1
74	0.11
75	0.11
76	0.16
77	0.22
78	0.28
79	0.32
80	0.33
81	0.33
82	0.32
83	0.33
84	0.3
85	0.28
86	0.29
87	0.28
88	0.3
89	0.3
90	0.29
91	0.28
92	0.31
93	0.33
94	0.34
95	0.35
96	0.37
97	0.39
98	0.42
99	0.42
100	0.42
101	0.39
102	0.33
103	0.32
104	0.28
105	0.25
106	0.23
107	0.22
108	0.19
109	0.16
110	0.15
111	0.17
112	0.18
113	0.26
114	0.35
115	0.42
116	0.46
117	0.48
118	0.51
119	0.53
120	0.6
121	0.61
122	0.64
123	0.63
124	0.67
125	0.71
126	0.67
127	0.65
128	0.64
129	0.63
130	0.63
131	0.67
132	0.68
133	0.73
134	0.8
135	0.8
136	0.81
137	0.77
138	0.77
139	0.71
140	0.63
141	0.6
142	0.58
143	0.54
144	0.47
145	0.43
146	0.35
147	0.3
148	0.27
149	0.22
150	0.16
151	0.13
152	0.12
153	0.12
154	0.11
155	0.13
156	0.16
157	0.17
158	0.23
159	0.24
160	0.23
161	0.24
162	0.28
163	0.33
164	0.31
165	0.29
166	0.27
167	0.31
168	0.31
169	0.36
170	0.37
171	0.3
172	0.29
173	0.3
174	0.28
175	0.26
176	0.28
177	0.23
178	0.22
179	0.28
180	0.31
181	0.3
182	0.31
183	0.31
184	0.28
185	0.27
186	0.24
187	0.16
188	0.12
189	0.12
190	0.08
191	0.07
192	0.07
193	0.05
194	0.05
195	0.05
196	0.06
197	0.07
198	0.08
199	0.09
200	0.11
201	0.14
202	0.17
203	0.19
204	0.19
205	0.21
206	0.21
207	0.24
208	0.25
209	0.25
210	0.25
211	0.25
212	0.25
213	0.26
214	0.25
215	0.21
216	0.18
217	0.15
218	0.12
219	0.11
220	0.1
221	0.06
222	0.06
223	0.05
224	0.05
225	0.05
226	0.05
227	0.05
228	0.05
229	0.05
230	0.06
231	0.06
232	0.13
233	0.14
234	0.13
235	0.15
236	0.19
237	0.23
238	0.28
239	0.32
240	0.26
241	0.29
242	0.37
243	0.43
244	0.43
245	0.41
246	0.43
247	0.43
248	0.46
249	0.45
250	0.42
251	0.38
252	0.35
253	0.39
254	0.39
255	0.36
256	0.34
257	0.38
258	0.35
259	0.32
260	0.31
261	0.26
262	0.19
263	0.18
264	0.17
265	0.1
266	0.12
267	0.12
268	0.12
269	0.16
270	0.19
271	0.2
272	0.28
273	0.3
274	0.3
275	0.36
276	0.4
277	0.46
278	0.47
279	0.5
280	0.45
281	0.5
282	0.49
283	0.48
284	0.49
285	0.42
286	0.38
287	0.35
288	0.33
289	0.28
290	0.26
291	0.21
292	0.23
293	0.24
294	0.25
295	0.26
296	0.29
297	0.28
298	0.32
299	0.32
300	0.3
301	0.32
302	0.34
303	0.37
304	0.35
305	0.39
306	0.37
307	0.41
308	0.4
309	0.42
310	0.43
311	0.46
312	0.5
313	0.48
314	0.46
315	0.43
316	0.39
317	0.31
318	0.26
319	0.22
320	0.16
321	0.16
322	0.17
323	0.17
324	0.21
325	0.24
326	0.29
327	0.31
328	0.34
329	0.41
330	0.48
331	0.58
332	0.58
333	0.64
334	0.61
335	0.59
336	0.58
337	0.49
338	0.43
339	0.37
340	0.33
341	0.24
342	0.24
343	0.2
344	0.19
345	0.2
346	0.22
347	0.22
348	0.25
349	0.28
350	0.25
351	0.28
352	0.33
353	0.33
354	0.31
355	0.32
356	0.3
357	0.31
358	0.32
359	0.3
360	0.28
361	0.29
362	0.28
363	0.25
364	0.27
365	0.26
366	0.26
367	0.27
368	0.3
369	0.29
370	0.3
371	0.31
372	0.27
373	0.28
374	0.29
375	0.29
376	0.25
377	0.25
378	0.23
379	0.22
380	0.21
381	0.19
382	0.16
383	0.13
384	0.11
385	0.1
386	0.09
387	0.09
388	0.09
389	0.1
390	0.17
391	0.22
392	0.23
393	0.24
394	0.28
395	0.29
396	0.35
397	0.37
398	0.37
399	0.37
400	0.39
401	0.39
402	0.44
403	0.49
404	0.42
405	0.38
406	0.32
407	0.3
408	0.28
409	0.3
410	0.3
411	0.27
412	0.29
413	0.31
414	0.31
415	0.29
416	0.35
417	0.31
418	0.25
419	0.23
420	0.23
421	0.19
422	0.19
423	0.24
424	0.19
425	0.24
426	0.23
427	0.23
428	0.28
429	0.32
430	0.37
431	0.4
432	0.4
433	0.36
434	0.38
435	0.38
436	0.34
437	0.32
438	0.32
439	0.25
440	0.29
441	0.3
442	0.34
443	0.37
444	0.39
445	0.43
446	0.47
447	0.56
448	0.61
449	0.7
450	0.74
451	0.81
452	0.88
453	0.92
454	0.91
455	0.88
456	0.86
457	0.85
458	0.83
459	0.82
460	0.81
461	0.81
462	0.83
463	0.85
464	0.82
465	0.82
466	0.81
467	0.79
468	0.75
469	0.72
470	0.73
471	0.75
472	0.8
473	0.8
474	0.81
475	0.8

A0A0B7NKW4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer