FuNGI

A0A0B7NJE2

Protein Details

Accession

A0A0B7NJE2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
569-591	PQTVNMRKIATRKKRGSKALNKL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
559-594	RKNGAKAGGKRKAGPQTVNMRKIATRKKRGSKALNK

Subcellular Location(s)

nucl 12, cyto_nucl 10, mito 6, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016197 Chromo-like_dom_sf IPR000953 Chromo/chromo_shadow_dom IPR023780 Chromo_domain IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR041373 RT_RNaseH
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF00385 Chromo PF17917 RT_RNaseH
PROSITE	View protein in PROSITE PS50013 CHROMO_2 PS50994 INTEGRASE
CDD	cd00024 CD_CSD cd09274 RNase_HI_RT_Ty3

Amino Acid Sequences

MAPVISSVKPGVRLQVATDASLSGIGGLLYQVVDNEVRYLGMVSRKLSVSERNYSTTKRELLAIVYAFKKFHRWLYMRQFTLHVDHKSLIYLNVQDTPNSMMLNWYELIFAYDFDVVHIPGILNRIPDALSRLYEDDDAMARHLVGGSYASGTKKAKDVKNMYTDKRHAKKSVLSKVKIENGLKHKQLPRNCELLVSRALQYADMMTPPAEERDNLILRAHLLGHYGILNAYYXXXXVMTDYFSRFTVIRCLPDKRASSVAKELLQVFSLFGWPKALTMDSGTEFLGEAVASMLEIGGINRFLSLPYNPLGNSVAESWVKLIKGTTIKLLQGKRDQWESYIPWVNFCVNVKYARLHRSRPYAIVFNRQPNMLEDYSKLEPTLSLEKADEKLIDKRYRFVHDVVIPALSQRILETQKEDHKNYAKKHKVLNTPYPIGSKVMIKNVNRQNKLDERYEGPYRIHSITSNGSYVLMDRTGALLSRDVPTHHIVYKAAANSKPVSVDEFCNERYEIQAVIDHKGGPGNYVYKVHWKGHDSEEDHTWEPVEHFDSNKHIEIYWSRKNGAKAGGKRKAGPQTVNMRKIATRKKRGSKALNKL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.34
3	0.33
4	0.29
5	0.29
6	0.23
7	0.19
8	0.19
9	0.16
10	0.07
11	0.06
12	0.05
13	0.05
14	0.04
15	0.05
16	0.05
17	0.05
18	0.05
19	0.07
20	0.07
21	0.08
22	0.09
23	0.09
24	0.09
25	0.09
26	0.1
27	0.12
28	0.17
29	0.2
30	0.2
31	0.24
32	0.24
33	0.27
34	0.29
35	0.34
36	0.35
37	0.4
38	0.43
39	0.44
40	0.47
41	0.48
42	0.5
43	0.48
44	0.45
45	0.37
46	0.36
47	0.32
48	0.31
49	0.33
50	0.29
51	0.26
52	0.26
53	0.26
54	0.24
55	0.24
56	0.28
57	0.26
58	0.31
59	0.36
60	0.38
61	0.47
62	0.57
63	0.66
64	0.62
65	0.61
66	0.57
67	0.49
68	0.51
69	0.49
70	0.4
71	0.34
72	0.32
73	0.31
74	0.3
75	0.28
76	0.23
77	0.18
78	0.18
79	0.17
80	0.22
81	0.22
82	0.21
83	0.21
84	0.23
85	0.21
86	0.19
87	0.17
88	0.13
89	0.13
90	0.15
91	0.15
92	0.12
93	0.1
94	0.1
95	0.12
96	0.1
97	0.1
98	0.09
99	0.1
100	0.09
101	0.1
102	0.11
103	0.09
104	0.09
105	0.09
106	0.08
107	0.08
108	0.11
109	0.11
110	0.1
111	0.11
112	0.11
113	0.11
114	0.12
115	0.15
116	0.14
117	0.14
118	0.15
119	0.16
120	0.17
121	0.17
122	0.16
123	0.13
124	0.13
125	0.13
126	0.11
127	0.1
128	0.09
129	0.08
130	0.08
131	0.07
132	0.06
133	0.06
134	0.06
135	0.07
136	0.09
137	0.09
138	0.13
139	0.14
140	0.15
141	0.21
142	0.29
143	0.31
144	0.39
145	0.45
146	0.48
147	0.57
148	0.63
149	0.62
150	0.63
151	0.65
152	0.66
153	0.66
154	0.65
155	0.58
156	0.56
157	0.58
158	0.6
159	0.64
160	0.63
161	0.58
162	0.57
163	0.59
164	0.61
165	0.6
166	0.52
167	0.5
168	0.48
169	0.52
170	0.5
171	0.51
172	0.52
173	0.53
174	0.56
175	0.56
176	0.53
177	0.51
178	0.48
179	0.45
180	0.39
181	0.35
182	0.32
183	0.27
184	0.23
185	0.2
186	0.2
187	0.16
188	0.16
189	0.13
190	0.11
191	0.09
192	0.09
193	0.06
194	0.07
195	0.07
196	0.09
197	0.08
198	0.08
199	0.1
200	0.16
201	0.17
202	0.17
203	0.17
204	0.16
205	0.16
206	0.16
207	0.14
208	0.08
209	0.08
210	0.07
211	0.07
212	0.07
213	0.07
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.04
218	0.05
219	0.04
220	0.04
221	0.04
222	0.05
223	0.05
224	0.06
225	0.07
226	0.08
227	0.09
228	0.09
229	0.1
230	0.16
231	0.17
232	0.21
233	0.24
234	0.27
235	0.3
236	0.36
237	0.37
238	0.32
239	0.38
240	0.35
241	0.34
242	0.35
243	0.34
244	0.29
245	0.29
246	0.27
247	0.2
248	0.19
249	0.16
250	0.12
251	0.09
252	0.1
253	0.08
254	0.08
255	0.09
256	0.08
257	0.08
258	0.09
259	0.09
260	0.07
261	0.07
262	0.09
263	0.08
264	0.09
265	0.09
266	0.08
267	0.08
268	0.07
269	0.06
270	0.04
271	0.04
272	0.03
273	0.03
274	0.02
275	0.02
276	0.02
277	0.02
278	0.02
279	0.02
280	0.03
281	0.03
282	0.03
283	0.03
284	0.04
285	0.04
286	0.05
287	0.06
288	0.07
289	0.08
290	0.09
291	0.08
292	0.1
293	0.11
294	0.09
295	0.1
296	0.08
297	0.1
298	0.09
299	0.1
300	0.09
301	0.1
302	0.1
303	0.09
304	0.08
305	0.1
306	0.12
307	0.13
308	0.15
309	0.15
310	0.17
311	0.23
312	0.25
313	0.25
314	0.29
315	0.31
316	0.31
317	0.34
318	0.32
319	0.28
320	0.3
321	0.27
322	0.27
323	0.31
324	0.28
325	0.24
326	0.25
327	0.24
328	0.22
329	0.21
330	0.18
331	0.13
332	0.14
333	0.15
334	0.17
335	0.22
336	0.28
337	0.31
338	0.34
339	0.38
340	0.44
341	0.45
342	0.45
343	0.44
344	0.42
345	0.4
346	0.45
347	0.44
348	0.42
349	0.41
350	0.38
351	0.36
352	0.3
353	0.34
354	0.25
355	0.22
356	0.17
357	0.21
358	0.21
359	0.21
360	0.19
361	0.13
362	0.12
363	0.15
364	0.19
365	0.15
366	0.15
367	0.15
368	0.17
369	0.18
370	0.19
371	0.17
372	0.14
373	0.19
374	0.27
375	0.32
376	0.31
377	0.35
378	0.38
379	0.42
380	0.42
381	0.38
382	0.37
383	0.33
384	0.34
385	0.3
386	0.27
387	0.21
388	0.18
389	0.18
390	0.11
391	0.08
392	0.06
393	0.1
394	0.12
395	0.13
396	0.16
397	0.21
398	0.3
399	0.36
400	0.37
401	0.39
402	0.46
403	0.52
404	0.56
405	0.62
406	0.61
407	0.6
408	0.66
409	0.68
410	0.69
411	0.7
412	0.73
413	0.69
414	0.64
415	0.61
416	0.55
417	0.48
418	0.39
419	0.33
420	0.29
421	0.24
422	0.28
423	0.33
424	0.32
425	0.41
426	0.49
427	0.57
428	0.55
429	0.54
430	0.54
431	0.55
432	0.58
433	0.53
434	0.47
435	0.41
436	0.44
437	0.47
438	0.42
439	0.35
440	0.33
441	0.33
442	0.32
443	0.29
444	0.24
445	0.23
446	0.25
447	0.26
448	0.23
449	0.19
450	0.18
451	0.17
452	0.17
453	0.15
454	0.11
455	0.09
456	0.08
457	0.09
458	0.09
459	0.09
460	0.09
461	0.09
462	0.1
463	0.12
464	0.13
465	0.13
466	0.16
467	0.19
468	0.21
469	0.22
470	0.22
471	0.21
472	0.22
473	0.26
474	0.26
475	0.28
476	0.26
477	0.28
478	0.28
479	0.29
480	0.28
481	0.24
482	0.24
483	0.21
484	0.23
485	0.24
486	0.26
487	0.26
488	0.27
489	0.27
490	0.23
491	0.22
492	0.21
493	0.17
494	0.14
495	0.17
496	0.16
497	0.18
498	0.19
499	0.17
500	0.17
501	0.19
502	0.18
503	0.15
504	0.17
505	0.17
506	0.19
507	0.21
508	0.22
509	0.29
510	0.34
511	0.37
512	0.4
513	0.41
514	0.43
515	0.47
516	0.54
517	0.47
518	0.45
519	0.45
520	0.44
521	0.42
522	0.38
523	0.31
524	0.24
525	0.22
526	0.22
527	0.21
528	0.18
529	0.18
530	0.2
531	0.26
532	0.29
533	0.31
534	0.29
535	0.25
536	0.29
537	0.35
538	0.41
539	0.44
540	0.44
541	0.43
542	0.47
543	0.5
544	0.5
545	0.51
546	0.53
547	0.54
548	0.6
549	0.67
550	0.66
551	0.67
552	0.7
553	0.71
554	0.68
555	0.63
556	0.61
557	0.63
558	0.69
559	0.71
560	0.65
561	0.58
562	0.55
563	0.61
564	0.63
565	0.63
566	0.64
567	0.68
568	0.77
569	0.84
570	0.9
571	0.91

A0A0B7NJE2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer