Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0B7NCH7

Protein Details
Accession A0A0B7NCH7    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-45ADEQTTPRKRTFRKFTYRGIDLHydrophilic
57-80MELVHCRARRRFQRGLKRKPMGLIHydrophilic
158-180ATSSSKFVPLKKKSRQPKFSFDIHydrophilic
531-552EEKDAKKAQKGKKVQRDKEYGVBasic
730-765SEPIDAPFKSQKRKRGNFKKGTNKKRKDPLKIIKRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
64-93ARRRFQRGLKRKPMGLIKKLRAAKKNAPAG
536-543KKAQKGKK
738-765KSQKRKRGNFKKGTNKKRKDPLKIIKRR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR002222  Ribosomal_S19  
IPR023575  Ribosomal_S19_S15_SF  
IPR005713  Ribosomal_S19A/S15e  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
Gene Ontology GO:0015935  C:small ribosomal subunit  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PF00203  Ribosomal_S19  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd17961  DEADc_DDX56  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MPYYQGFARNREFEQNGANSTMQADEQTTPRKRTFRKFTYRGIDLDQLLDLSSEQFMELVHCRARRRFQRGLKRKPMGLIKKLRAAKKNAPAGEKPEVVKTHLRNMIIVPEMIGSIVGVYNGKVFNQVEIKPEMTGHYLAEFSISYKPVKHGRPGIGATSSSKFVPLKKKSRQPKFSFDIFVSLSSYPQIYTMADQTFATFDFDPRLARAVAQLNFTRPTPIQAQGIPLALAGKDILARARTGSGKTAAYAMPIVQKILAAKESLVVEPSIKALILVPTRELAEQVTSHINKLLVYANQLIKVVNLAGQTSAQLQRPLLAEKPDIVVATPSKALSHLEANNMDLKKSLENLVIDEADLVLSFGYEDDVRKILSYLPKIYQSFLMSATFTKEIEELTALVLRKPAILALEDTKEENDSLTQYVVKCTEFEKFMFAFVIIKLRLIKGKILLFVNDIDRSYKLKLFLEQFSIKSCVLNSELPLNSRYHIVEEFNRGIYDYLIATDESELKGEQDSDDEDEDIQEDIEKQEGKDEEKDAKKAQKGKKVQRDKEYGVSRGVDFQGVAAVINFDFPTSAKAYTHRIGRTARGGQRGMSLSFIVTKDLVEDKKEVARGKDIYDDSVYLRVKKQQEAKGAELKPYSFEKKNVSGFKYRVEDALKAVNKVAVKEARIKEIKREIMNSEKLKAHFEDKPKDLEFLRHDHALQPAKVQDHLKHIPSYLMPRIAVPTAMANSEPIDAPFKSQKRKRGNFKKGTNKKRKDPLKIIKRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.44
3 0.4
4 0.38
5 0.35
6 0.27
7 0.26
8 0.25
9 0.18
10 0.15
11 0.15
12 0.14
13 0.19
14 0.29
15 0.34
16 0.39
17 0.46
18 0.54
19 0.6
20 0.68
21 0.74
22 0.75
23 0.79
24 0.81
25 0.84
26 0.83
27 0.79
28 0.71
29 0.66
30 0.6
31 0.5
32 0.44
33 0.35
34 0.26
35 0.22
36 0.19
37 0.13
38 0.09
39 0.08
40 0.07
41 0.07
42 0.06
43 0.06
44 0.1
45 0.12
46 0.15
47 0.2
48 0.24
49 0.3
50 0.38
51 0.48
52 0.55
53 0.61
54 0.67
55 0.72
56 0.79
57 0.85
58 0.89
59 0.9
60 0.86
61 0.81
62 0.79
63 0.79
64 0.77
65 0.76
66 0.75
67 0.7
68 0.72
69 0.76
70 0.76
71 0.73
72 0.72
73 0.71
74 0.7
75 0.73
76 0.69
77 0.69
78 0.65
79 0.64
80 0.62
81 0.56
82 0.48
83 0.46
84 0.43
85 0.4
86 0.44
87 0.4
88 0.43
89 0.44
90 0.43
91 0.37
92 0.37
93 0.37
94 0.31
95 0.28
96 0.19
97 0.15
98 0.14
99 0.13
100 0.12
101 0.06
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.08
108 0.08
109 0.09
110 0.13
111 0.13
112 0.16
113 0.21
114 0.22
115 0.24
116 0.26
117 0.27
118 0.23
119 0.24
120 0.22
121 0.19
122 0.19
123 0.15
124 0.13
125 0.13
126 0.12
127 0.13
128 0.11
129 0.1
130 0.13
131 0.14
132 0.14
133 0.15
134 0.21
135 0.28
136 0.32
137 0.38
138 0.41
139 0.45
140 0.5
141 0.5
142 0.48
143 0.43
144 0.4
145 0.36
146 0.3
147 0.27
148 0.2
149 0.22
150 0.2
151 0.24
152 0.33
153 0.4
154 0.48
155 0.56
156 0.66
157 0.73
158 0.82
159 0.87
160 0.83
161 0.83
162 0.79
163 0.75
164 0.7
165 0.59
166 0.53
167 0.43
168 0.37
169 0.3
170 0.23
171 0.18
172 0.15
173 0.15
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.08
178 0.09
179 0.13
180 0.13
181 0.13
182 0.13
183 0.13
184 0.13
185 0.13
186 0.14
187 0.1
188 0.1
189 0.12
190 0.13
191 0.13
192 0.13
193 0.15
194 0.13
195 0.12
196 0.16
197 0.2
198 0.21
199 0.24
200 0.25
201 0.25
202 0.27
203 0.26
204 0.26
205 0.19
206 0.21
207 0.2
208 0.22
209 0.22
210 0.21
211 0.23
212 0.21
213 0.22
214 0.18
215 0.15
216 0.12
217 0.1
218 0.09
219 0.06
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.08
227 0.12
228 0.13
229 0.14
230 0.16
231 0.17
232 0.17
233 0.17
234 0.18
235 0.15
236 0.14
237 0.13
238 0.12
239 0.13
240 0.13
241 0.12
242 0.1
243 0.11
244 0.11
245 0.12
246 0.12
247 0.08
248 0.08
249 0.1
250 0.11
251 0.11
252 0.11
253 0.1
254 0.09
255 0.09
256 0.1
257 0.07
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.1
262 0.11
263 0.11
264 0.11
265 0.12
266 0.13
267 0.13
268 0.12
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.1
273 0.15
274 0.15
275 0.15
276 0.16
277 0.16
278 0.14
279 0.16
280 0.17
281 0.11
282 0.13
283 0.17
284 0.17
285 0.17
286 0.18
287 0.16
288 0.13
289 0.13
290 0.11
291 0.08
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.09
298 0.12
299 0.11
300 0.12
301 0.12
302 0.14
303 0.15
304 0.17
305 0.16
306 0.15
307 0.15
308 0.14
309 0.16
310 0.14
311 0.12
312 0.11
313 0.1
314 0.09
315 0.09
316 0.09
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.09
321 0.09
322 0.13
323 0.13
324 0.15
325 0.15
326 0.16
327 0.21
328 0.2
329 0.19
330 0.15
331 0.15
332 0.13
333 0.13
334 0.14
335 0.11
336 0.11
337 0.12
338 0.13
339 0.12
340 0.11
341 0.1
342 0.08
343 0.05
344 0.05
345 0.04
346 0.02
347 0.02
348 0.02
349 0.02
350 0.03
351 0.03
352 0.04
353 0.05
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.07
358 0.09
359 0.13
360 0.15
361 0.17
362 0.18
363 0.22
364 0.23
365 0.23
366 0.22
367 0.19
368 0.17
369 0.16
370 0.15
371 0.11
372 0.1
373 0.12
374 0.1
375 0.09
376 0.09
377 0.08
378 0.07
379 0.07
380 0.07
381 0.05
382 0.05
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.09
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.06
392 0.06
393 0.07
394 0.09
395 0.1
396 0.1
397 0.1
398 0.1
399 0.1
400 0.09
401 0.08
402 0.07
403 0.06
404 0.07
405 0.07
406 0.08
407 0.08
408 0.09
409 0.1
410 0.1
411 0.1
412 0.1
413 0.12
414 0.12
415 0.12
416 0.14
417 0.13
418 0.14
419 0.13
420 0.12
421 0.11
422 0.1
423 0.14
424 0.1
425 0.11
426 0.11
427 0.12
428 0.14
429 0.14
430 0.15
431 0.15
432 0.17
433 0.19
434 0.19
435 0.19
436 0.17
437 0.18
438 0.19
439 0.15
440 0.14
441 0.12
442 0.13
443 0.14
444 0.15
445 0.16
446 0.16
447 0.16
448 0.2
449 0.23
450 0.23
451 0.27
452 0.27
453 0.26
454 0.26
455 0.28
456 0.24
457 0.21
458 0.19
459 0.15
460 0.15
461 0.16
462 0.14
463 0.16
464 0.17
465 0.18
466 0.2
467 0.18
468 0.16
469 0.17
470 0.16
471 0.13
472 0.14
473 0.15
474 0.16
475 0.21
476 0.22
477 0.21
478 0.2
479 0.18
480 0.17
481 0.15
482 0.13
483 0.08
484 0.07
485 0.07
486 0.07
487 0.07
488 0.07
489 0.08
490 0.07
491 0.08
492 0.07
493 0.07
494 0.08
495 0.08
496 0.07
497 0.07
498 0.08
499 0.09
500 0.1
501 0.1
502 0.09
503 0.09
504 0.1
505 0.09
506 0.07
507 0.06
508 0.06
509 0.06
510 0.08
511 0.09
512 0.08
513 0.13
514 0.14
515 0.17
516 0.19
517 0.22
518 0.28
519 0.31
520 0.35
521 0.35
522 0.41
523 0.44
524 0.5
525 0.55
526 0.56
527 0.63
528 0.7
529 0.75
530 0.8
531 0.82
532 0.82
533 0.83
534 0.77
535 0.76
536 0.71
537 0.62
538 0.54
539 0.47
540 0.38
541 0.34
542 0.3
543 0.21
544 0.16
545 0.13
546 0.11
547 0.09
548 0.09
549 0.06
550 0.06
551 0.05
552 0.06
553 0.06
554 0.05
555 0.05
556 0.05
557 0.08
558 0.1
559 0.11
560 0.11
561 0.14
562 0.2
563 0.24
564 0.31
565 0.29
566 0.32
567 0.34
568 0.37
569 0.42
570 0.45
571 0.46
572 0.45
573 0.45
574 0.41
575 0.43
576 0.41
577 0.34
578 0.27
579 0.22
580 0.16
581 0.18
582 0.18
583 0.14
584 0.12
585 0.11
586 0.12
587 0.17
588 0.18
589 0.17
590 0.18
591 0.19
592 0.23
593 0.27
594 0.28
595 0.26
596 0.31
597 0.31
598 0.31
599 0.36
600 0.33
601 0.31
602 0.3
603 0.28
604 0.23
605 0.28
606 0.28
607 0.23
608 0.25
609 0.29
610 0.32
611 0.38
612 0.45
613 0.45
614 0.53
615 0.57
616 0.6
617 0.62
618 0.59
619 0.57
620 0.5
621 0.43
622 0.38
623 0.38
624 0.39
625 0.33
626 0.36
627 0.38
628 0.43
629 0.51
630 0.55
631 0.54
632 0.55
633 0.53
634 0.56
635 0.54
636 0.48
637 0.44
638 0.41
639 0.37
640 0.31
641 0.39
642 0.34
643 0.3
644 0.3
645 0.29
646 0.27
647 0.26
648 0.31
649 0.25
650 0.26
651 0.34
652 0.36
653 0.42
654 0.48
655 0.48
656 0.5
657 0.55
658 0.6
659 0.54
660 0.56
661 0.52
662 0.54
663 0.62
664 0.56
665 0.52
666 0.5
667 0.47
668 0.47
669 0.45
670 0.41
671 0.39
672 0.45
673 0.49
674 0.46
675 0.52
676 0.5
677 0.5
678 0.46
679 0.47
680 0.43
681 0.4
682 0.42
683 0.37
684 0.36
685 0.36
686 0.42
687 0.42
688 0.38
689 0.36
690 0.36
691 0.35
692 0.39
693 0.41
694 0.37
695 0.39
696 0.44
697 0.44
698 0.42
699 0.41
700 0.39
701 0.39
702 0.42
703 0.39
704 0.36
705 0.32
706 0.31
707 0.34
708 0.31
709 0.28
710 0.22
711 0.2
712 0.17
713 0.18
714 0.17
715 0.15
716 0.15
717 0.16
718 0.16
719 0.13
720 0.16
721 0.15
722 0.2
723 0.29
724 0.35
725 0.45
726 0.51
727 0.6
728 0.67
729 0.77
730 0.83
731 0.85
732 0.89
733 0.89
734 0.93
735 0.94
736 0.94
737 0.95
738 0.95
739 0.93
740 0.92
741 0.92
742 0.92
743 0.91
744 0.91
745 0.91