Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0B7NBH1

Protein Details
Accession A0A0B7NBH1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-45IVKKRRSSGPHRKLPIHIKNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
28-37KKRRSSGPHR
Subcellular Location(s) mito 16, nucl 8, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR001523  Paired_dom  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR038717  Tc1-like_DDE_dom  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF13358  DDE_3  
PF00292  PAX  
Amino Acid Sequences MSPTTRNTTKKQTTSADSLNLPTAGIVKKRRSSGPHRKLPIHIKNLIVDKCLRKDSMRKSEVAKLYDVSWQTVDNIVEKYVQKGTVEPKKQGGSREKNIKIKDDQSQFIQEILDENCTLTLGRIKEKLFDRFPEMREYDLSISGLFRHIVEHIGFTLKKTKPVEEKRNDPTTIAKRNAYVENMQFDGVSYKTNCIFVDEAGFNANLIRGQGWSKKGESSIVKTKTKRAINVSILAAISYQGVESVQAKMVAGGTTAAIFCEFVKSVMASLDKNNAAPHNFVMDNARIHTAPIVKDLFQNSRHKLHLLPPYSPFLNAIEECFSKLKTLVKRKPGLTGEAFLKHISECSNEIARENCKAWVEYSIQFFSDCLNNKEIY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.66
3 0.6
4 0.52
5 0.47
6 0.43
7 0.36
8 0.28
9 0.21
10 0.21
11 0.2
12 0.25
13 0.31
14 0.36
15 0.42
16 0.47
17 0.54
18 0.58
19 0.65
20 0.7
21 0.73
22 0.75
23 0.76
24 0.76
25 0.78
26 0.81
27 0.8
28 0.76
29 0.7
30 0.62
31 0.6
32 0.63
33 0.56
34 0.48
35 0.45
36 0.43
37 0.44
38 0.45
39 0.42
40 0.39
41 0.47
42 0.54
43 0.59
44 0.56
45 0.54
46 0.55
47 0.61
48 0.63
49 0.56
50 0.47
51 0.37
52 0.35
53 0.37
54 0.33
55 0.26
56 0.2
57 0.18
58 0.18
59 0.2
60 0.19
61 0.16
62 0.16
63 0.15
64 0.18
65 0.18
66 0.2
67 0.19
68 0.2
69 0.18
70 0.21
71 0.29
72 0.35
73 0.39
74 0.39
75 0.42
76 0.45
77 0.48
78 0.52
79 0.54
80 0.53
81 0.58
82 0.65
83 0.67
84 0.7
85 0.7
86 0.67
87 0.62
88 0.58
89 0.57
90 0.52
91 0.47
92 0.43
93 0.44
94 0.38
95 0.33
96 0.29
97 0.2
98 0.17
99 0.16
100 0.14
101 0.1
102 0.1
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.07
107 0.11
108 0.11
109 0.14
110 0.18
111 0.19
112 0.25
113 0.29
114 0.35
115 0.34
116 0.34
117 0.39
118 0.4
119 0.41
120 0.42
121 0.39
122 0.33
123 0.31
124 0.31
125 0.25
126 0.21
127 0.19
128 0.12
129 0.12
130 0.11
131 0.11
132 0.08
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.08
140 0.11
141 0.11
142 0.12
143 0.2
144 0.19
145 0.25
146 0.26
147 0.3
148 0.37
149 0.47
150 0.57
151 0.55
152 0.61
153 0.62
154 0.67
155 0.62
156 0.53
157 0.51
158 0.48
159 0.49
160 0.44
161 0.38
162 0.33
163 0.36
164 0.37
165 0.31
166 0.26
167 0.2
168 0.19
169 0.19
170 0.18
171 0.14
172 0.13
173 0.12
174 0.09
175 0.09
176 0.08
177 0.09
178 0.09
179 0.11
180 0.11
181 0.11
182 0.11
183 0.09
184 0.13
185 0.11
186 0.11
187 0.11
188 0.1
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.07
197 0.11
198 0.14
199 0.16
200 0.17
201 0.18
202 0.18
203 0.22
204 0.23
205 0.25
206 0.31
207 0.36
208 0.41
209 0.41
210 0.47
211 0.51
212 0.52
213 0.51
214 0.48
215 0.49
216 0.46
217 0.48
218 0.42
219 0.35
220 0.31
221 0.26
222 0.2
223 0.13
224 0.09
225 0.06
226 0.05
227 0.03
228 0.03
229 0.04
230 0.05
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.08
236 0.08
237 0.07
238 0.07
239 0.06
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.1
254 0.12
255 0.1
256 0.12
257 0.17
258 0.17
259 0.18
260 0.19
261 0.2
262 0.2
263 0.2
264 0.19
265 0.18
266 0.18
267 0.17
268 0.19
269 0.19
270 0.19
271 0.19
272 0.2
273 0.16
274 0.16
275 0.19
276 0.19
277 0.17
278 0.2
279 0.2
280 0.19
281 0.23
282 0.26
283 0.29
284 0.32
285 0.39
286 0.39
287 0.43
288 0.44
289 0.42
290 0.41
291 0.43
292 0.46
293 0.41
294 0.4
295 0.38
296 0.42
297 0.41
298 0.39
299 0.32
300 0.24
301 0.26
302 0.23
303 0.21
304 0.2
305 0.2
306 0.22
307 0.22
308 0.21
309 0.17
310 0.19
311 0.25
312 0.31
313 0.41
314 0.48
315 0.56
316 0.64
317 0.64
318 0.7
319 0.67
320 0.64
321 0.56
322 0.52
323 0.47
324 0.43
325 0.43
326 0.34
327 0.31
328 0.24
329 0.22
330 0.19
331 0.17
332 0.16
333 0.2
334 0.25
335 0.24
336 0.26
337 0.3
338 0.31
339 0.33
340 0.33
341 0.32
342 0.29
343 0.3
344 0.29
345 0.29
346 0.3
347 0.29
348 0.34
349 0.31
350 0.29
351 0.28
352 0.27
353 0.25
354 0.27
355 0.27
356 0.26