Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A0B7MZH9

Protein Details
Accession A0A0B7MZH9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
589-620EHTKSKLIQIVKKKRRKNYKRTIEHKQTHTVLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
600-609KKKRRKNYKR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 14.333, cyto 10, mito_nucl 9.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006595  CTLH_C  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR036164  L21-like_sf  
IPR028909  L21p-like  
IPR006594  LisH  
IPR001787  Ribosomal_L21  
IPR045184  SMU1  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0016607  C:nuclear speck  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17814  LisH_TPL  
PF00829  Ribosomal_L21p  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50897  CTLH  
PS50896  LISH  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MSIEIESEDVIRLILQFLKENNYPEAAQALEQETTVKLNTVENREAFIKEIRQGEWDIVLKRTTDLRISPRKLMDLYEQVILELAELRELGAARTLLRQTEPMFILKQSHPERYLRLEHTLSRSMFDAKDNYPPGVTKEKRRAAIAQSAEVAVVEPARLVSLLEDCVKWQQHQGLLPLGSEFDLFRGSDQAQETEDDAFANNNYTNIKVCAEKTYAECTAFSPNGLYLVSGSVDGFIEVWNYKSGKLRKDLKYQAEENLMAMDQAVISLNFSADSEMLASGSTDGKIAIWKVQTGYCTRRFSPAHGQGVTSVCFNKDASQILSCSYDHSVKIHNVKSGKLVISFEGHTSFVNSVMYSSDNTQIITASSDETIKIWDITTGACLHSVQPQMGVPVQTVSPITNDAAAHRMVAVLGNNTAIVLNDKGKVLQKIVNKSDSKFITGTVSHQGTLLYILAEDSFMHCFKISTGELVGQLKVCEEEVIGLARHPFTNVIAVNNALRQVQTSAYDTNATVQKLRDQLRYYAVAEIAGRPYLITKNDKVIVNRLNDVKVGDVLKLDKVRELGSKDYTLKGSPYVPETVFNINATVIEHTKSKLIQIVKKKRRKNYKRTIEHKQTHTVLRISDVDVL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.12
3 0.15
4 0.17
5 0.24
6 0.26
7 0.29
8 0.3
9 0.3
10 0.29
11 0.26
12 0.26
13 0.21
14 0.18
15 0.18
16 0.18
17 0.15
18 0.14
19 0.15
20 0.14
21 0.14
22 0.14
23 0.13
24 0.11
25 0.17
26 0.23
27 0.29
28 0.34
29 0.33
30 0.36
31 0.37
32 0.37
33 0.33
34 0.32
35 0.29
36 0.29
37 0.32
38 0.29
39 0.3
40 0.3
41 0.29
42 0.29
43 0.3
44 0.27
45 0.26
46 0.26
47 0.24
48 0.25
49 0.27
50 0.25
51 0.24
52 0.28
53 0.36
54 0.45
55 0.49
56 0.54
57 0.52
58 0.54
59 0.5
60 0.48
61 0.45
62 0.41
63 0.38
64 0.34
65 0.31
66 0.27
67 0.27
68 0.23
69 0.16
70 0.12
71 0.1
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.1
80 0.1
81 0.15
82 0.16
83 0.16
84 0.17
85 0.2
86 0.19
87 0.25
88 0.25
89 0.24
90 0.24
91 0.23
92 0.28
93 0.26
94 0.34
95 0.33
96 0.37
97 0.38
98 0.39
99 0.42
100 0.43
101 0.49
102 0.43
103 0.44
104 0.41
105 0.42
106 0.45
107 0.48
108 0.42
109 0.36
110 0.34
111 0.31
112 0.29
113 0.28
114 0.26
115 0.21
116 0.29
117 0.3
118 0.29
119 0.27
120 0.26
121 0.28
122 0.34
123 0.36
124 0.38
125 0.46
126 0.52
127 0.54
128 0.56
129 0.57
130 0.51
131 0.56
132 0.49
133 0.41
134 0.35
135 0.32
136 0.28
137 0.23
138 0.18
139 0.1
140 0.08
141 0.05
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.06
149 0.08
150 0.1
151 0.1
152 0.11
153 0.16
154 0.17
155 0.17
156 0.19
157 0.21
158 0.23
159 0.26
160 0.27
161 0.27
162 0.26
163 0.25
164 0.21
165 0.18
166 0.15
167 0.12
168 0.1
169 0.06
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.09
174 0.09
175 0.13
176 0.14
177 0.14
178 0.14
179 0.15
180 0.15
181 0.13
182 0.13
183 0.1
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.09
188 0.08
189 0.08
190 0.09
191 0.09
192 0.1
193 0.11
194 0.12
195 0.12
196 0.13
197 0.16
198 0.17
199 0.18
200 0.19
201 0.23
202 0.23
203 0.22
204 0.21
205 0.19
206 0.22
207 0.2
208 0.18
209 0.14
210 0.12
211 0.12
212 0.12
213 0.1
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.04
224 0.05
225 0.05
226 0.06
227 0.08
228 0.09
229 0.11
230 0.18
231 0.22
232 0.26
233 0.34
234 0.42
235 0.46
236 0.56
237 0.62
238 0.61
239 0.63
240 0.6
241 0.55
242 0.49
243 0.43
244 0.33
245 0.26
246 0.19
247 0.13
248 0.11
249 0.07
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.03
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.05
269 0.05
270 0.04
271 0.04
272 0.05
273 0.06
274 0.06
275 0.08
276 0.08
277 0.09
278 0.1
279 0.11
280 0.13
281 0.16
282 0.21
283 0.26
284 0.29
285 0.29
286 0.35
287 0.34
288 0.37
289 0.44
290 0.45
291 0.43
292 0.4
293 0.4
294 0.35
295 0.36
296 0.31
297 0.22
298 0.14
299 0.1
300 0.1
301 0.1
302 0.1
303 0.1
304 0.11
305 0.11
306 0.12
307 0.12
308 0.12
309 0.14
310 0.12
311 0.12
312 0.12
313 0.12
314 0.12
315 0.13
316 0.15
317 0.17
318 0.23
319 0.23
320 0.25
321 0.25
322 0.25
323 0.26
324 0.26
325 0.23
326 0.19
327 0.17
328 0.14
329 0.15
330 0.15
331 0.13
332 0.12
333 0.11
334 0.1
335 0.11
336 0.1
337 0.08
338 0.08
339 0.07
340 0.06
341 0.06
342 0.07
343 0.07
344 0.08
345 0.1
346 0.1
347 0.11
348 0.1
349 0.1
350 0.09
351 0.1
352 0.08
353 0.06
354 0.07
355 0.07
356 0.07
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.08
366 0.08
367 0.07
368 0.08
369 0.08
370 0.08
371 0.13
372 0.14
373 0.12
374 0.12
375 0.12
376 0.13
377 0.14
378 0.14
379 0.09
380 0.09
381 0.09
382 0.08
383 0.09
384 0.08
385 0.07
386 0.08
387 0.08
388 0.09
389 0.09
390 0.09
391 0.11
392 0.11
393 0.1
394 0.09
395 0.08
396 0.06
397 0.07
398 0.07
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.05
406 0.06
407 0.07
408 0.08
409 0.09
410 0.1
411 0.12
412 0.15
413 0.16
414 0.17
415 0.21
416 0.25
417 0.33
418 0.37
419 0.43
420 0.42
421 0.42
422 0.46
423 0.42
424 0.4
425 0.32
426 0.28
427 0.24
428 0.23
429 0.24
430 0.23
431 0.23
432 0.19
433 0.19
434 0.19
435 0.15
436 0.15
437 0.13
438 0.06
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.06
445 0.08
446 0.08
447 0.09
448 0.09
449 0.09
450 0.09
451 0.15
452 0.14
453 0.13
454 0.14
455 0.15
456 0.17
457 0.18
458 0.19
459 0.14
460 0.13
461 0.12
462 0.12
463 0.1
464 0.08
465 0.06
466 0.07
467 0.07
468 0.09
469 0.08
470 0.09
471 0.1
472 0.11
473 0.11
474 0.11
475 0.11
476 0.1
477 0.15
478 0.15
479 0.15
480 0.15
481 0.16
482 0.16
483 0.17
484 0.17
485 0.12
486 0.11
487 0.11
488 0.11
489 0.12
490 0.13
491 0.15
492 0.15
493 0.16
494 0.17
495 0.16
496 0.2
497 0.22
498 0.21
499 0.2
500 0.2
501 0.24
502 0.3
503 0.35
504 0.37
505 0.36
506 0.39
507 0.41
508 0.44
509 0.4
510 0.35
511 0.31
512 0.25
513 0.22
514 0.21
515 0.18
516 0.14
517 0.13
518 0.1
519 0.12
520 0.15
521 0.19
522 0.23
523 0.24
524 0.3
525 0.36
526 0.39
527 0.4
528 0.44
529 0.45
530 0.43
531 0.46
532 0.43
533 0.39
534 0.36
535 0.34
536 0.28
537 0.25
538 0.22
539 0.18
540 0.17
541 0.17
542 0.21
543 0.24
544 0.23
545 0.22
546 0.23
547 0.25
548 0.28
549 0.3
550 0.3
551 0.31
552 0.36
553 0.36
554 0.37
555 0.37
556 0.33
557 0.31
558 0.29
559 0.27
560 0.25
561 0.25
562 0.27
563 0.25
564 0.26
565 0.27
566 0.29
567 0.28
568 0.26
569 0.23
570 0.18
571 0.18
572 0.17
573 0.17
574 0.14
575 0.14
576 0.16
577 0.16
578 0.19
579 0.2
580 0.21
581 0.24
582 0.3
583 0.36
584 0.46
585 0.56
586 0.64
587 0.73
588 0.8
589 0.84
590 0.88
591 0.91
592 0.91
593 0.91
594 0.92
595 0.93
596 0.92
597 0.93
598 0.93
599 0.91
600 0.86
601 0.84
602 0.79
603 0.74
604 0.72
605 0.63
606 0.53
607 0.48
608 0.44