Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C2X425

Protein Details
Accession A0A0C2X425    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
479-516NETSEEKRARKQAVKKERQERRKEKKGTKNLFSTERKQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
259-265AKKRRRK
484-509EKRARKQAVKKERQERRKEKKGTKNL
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPPKSKSIFRQPGAKNFQLVHRSQRDPLIHDPDASEHVLKEYERKNAKGKVSSLGDEAAATDSSRAPGEAALYGIYFDDREYDYTQHLRQVGVEESGVDAILIEAPSRHPHKSNKARDFDLIPKEALPSQQEIPRTYDSGQAIESSIAGFQPDMDPHLRQTLEALDDDAFVDPAVDDDLFADLLADGELEEGEELNFEFHEDGIQEEAKENDETDDWQSRFAKFKLEQKKRVNAGSEMDGVSEGGDTLGRLPSLSVAGAKKRRRKGTSDASGYSMSSSSMFRNEGLTRLDEQFERFEEEYASDNDDDMEDDADSHSTTSAPELIATRDDFDAVMDEFLAQEQVGKKLQQKIGDTPMDRLNTVRRALVESTSEKEERERREALLDRLDEGETPIPMPVDVDEKKERWDCETILTTYSNLENHPRLLRLTQPRRTQKIQLDPRTGLPSVAEIEPVDLQEISESEDSDGDLGGTSTITRPKNETSEEKRARKQAVKKERQERRKEKKGTKNLFSTERKQQNKTLATKEKAGVRKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.64
3 0.56
4 0.6
5 0.57
6 0.53
7 0.53
8 0.52
9 0.53
10 0.52
11 0.58
12 0.54
13 0.52
14 0.57
15 0.55
16 0.49
17 0.46
18 0.44
19 0.38
20 0.38
21 0.35
22 0.27
23 0.19
24 0.19
25 0.2
26 0.2
27 0.25
28 0.27
29 0.34
30 0.39
31 0.43
32 0.49
33 0.55
34 0.62
35 0.61
36 0.58
37 0.57
38 0.56
39 0.53
40 0.47
41 0.4
42 0.33
43 0.26
44 0.24
45 0.17
46 0.13
47 0.11
48 0.1
49 0.1
50 0.11
51 0.11
52 0.1
53 0.09
54 0.09
55 0.11
56 0.1
57 0.1
58 0.09
59 0.09
60 0.09
61 0.08
62 0.08
63 0.07
64 0.06
65 0.08
66 0.09
67 0.12
68 0.14
69 0.16
70 0.2
71 0.25
72 0.26
73 0.28
74 0.28
75 0.26
76 0.24
77 0.26
78 0.23
79 0.2
80 0.18
81 0.14
82 0.13
83 0.13
84 0.11
85 0.08
86 0.06
87 0.04
88 0.06
89 0.06
90 0.05
91 0.06
92 0.07
93 0.14
94 0.18
95 0.2
96 0.25
97 0.33
98 0.45
99 0.55
100 0.64
101 0.68
102 0.7
103 0.7
104 0.68
105 0.65
106 0.62
107 0.57
108 0.49
109 0.4
110 0.34
111 0.33
112 0.31
113 0.28
114 0.22
115 0.19
116 0.2
117 0.23
118 0.26
119 0.26
120 0.29
121 0.29
122 0.3
123 0.27
124 0.29
125 0.27
126 0.25
127 0.23
128 0.19
129 0.17
130 0.15
131 0.14
132 0.08
133 0.07
134 0.06
135 0.06
136 0.05
137 0.05
138 0.06
139 0.07
140 0.09
141 0.11
142 0.12
143 0.13
144 0.18
145 0.17
146 0.16
147 0.17
148 0.16
149 0.16
150 0.15
151 0.15
152 0.11
153 0.11
154 0.12
155 0.1
156 0.08
157 0.06
158 0.06
159 0.04
160 0.04
161 0.05
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.08
200 0.1
201 0.12
202 0.18
203 0.17
204 0.2
205 0.21
206 0.22
207 0.26
208 0.25
209 0.28
210 0.25
211 0.34
212 0.42
213 0.5
214 0.58
215 0.61
216 0.69
217 0.65
218 0.66
219 0.6
220 0.51
221 0.44
222 0.36
223 0.31
224 0.23
225 0.19
226 0.15
227 0.12
228 0.1
229 0.08
230 0.05
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.05
241 0.05
242 0.07
243 0.08
244 0.14
245 0.22
246 0.29
247 0.36
248 0.43
249 0.51
250 0.53
251 0.57
252 0.6
253 0.63
254 0.65
255 0.62
256 0.56
257 0.5
258 0.47
259 0.41
260 0.33
261 0.22
262 0.14
263 0.09
264 0.09
265 0.07
266 0.08
267 0.09
268 0.09
269 0.12
270 0.12
271 0.13
272 0.14
273 0.15
274 0.15
275 0.16
276 0.17
277 0.14
278 0.15
279 0.14
280 0.14
281 0.17
282 0.15
283 0.14
284 0.13
285 0.14
286 0.14
287 0.14
288 0.15
289 0.11
290 0.1
291 0.1
292 0.1
293 0.09
294 0.07
295 0.07
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.04
304 0.05
305 0.05
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.07
310 0.08
311 0.09
312 0.1
313 0.1
314 0.09
315 0.1
316 0.09
317 0.08
318 0.09
319 0.07
320 0.07
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.03
327 0.06
328 0.07
329 0.09
330 0.11
331 0.14
332 0.18
333 0.26
334 0.29
335 0.32
336 0.34
337 0.36
338 0.42
339 0.45
340 0.41
341 0.36
342 0.39
343 0.35
344 0.32
345 0.29
346 0.27
347 0.26
348 0.26
349 0.25
350 0.2
351 0.23
352 0.24
353 0.24
354 0.23
355 0.2
356 0.22
357 0.25
358 0.25
359 0.22
360 0.27
361 0.31
362 0.32
363 0.36
364 0.35
365 0.32
366 0.38
367 0.42
368 0.4
369 0.4
370 0.35
371 0.31
372 0.3
373 0.29
374 0.22
375 0.2
376 0.18
377 0.11
378 0.11
379 0.1
380 0.09
381 0.09
382 0.09
383 0.07
384 0.13
385 0.14
386 0.19
387 0.23
388 0.24
389 0.3
390 0.34
391 0.34
392 0.32
393 0.35
394 0.3
395 0.31
396 0.35
397 0.3
398 0.28
399 0.28
400 0.24
401 0.21
402 0.22
403 0.17
404 0.14
405 0.19
406 0.19
407 0.22
408 0.24
409 0.24
410 0.24
411 0.25
412 0.32
413 0.38
414 0.46
415 0.51
416 0.58
417 0.67
418 0.72
419 0.75
420 0.75
421 0.73
422 0.74
423 0.76
424 0.75
425 0.72
426 0.67
427 0.66
428 0.62
429 0.54
430 0.43
431 0.33
432 0.25
433 0.22
434 0.2
435 0.17
436 0.12
437 0.13
438 0.13
439 0.13
440 0.12
441 0.09
442 0.09
443 0.09
444 0.09
445 0.11
446 0.11
447 0.11
448 0.11
449 0.11
450 0.11
451 0.1
452 0.1
453 0.07
454 0.06
455 0.06
456 0.05
457 0.05
458 0.06
459 0.08
460 0.15
461 0.17
462 0.19
463 0.23
464 0.28
465 0.34
466 0.4
467 0.47
468 0.49
469 0.59
470 0.67
471 0.71
472 0.73
473 0.75
474 0.78
475 0.77
476 0.77
477 0.77
478 0.79
479 0.81
480 0.84
481 0.87
482 0.89
483 0.91
484 0.92
485 0.93
486 0.92
487 0.92
488 0.92
489 0.92
490 0.93
491 0.94
492 0.92
493 0.9
494 0.88
495 0.84
496 0.83
497 0.8
498 0.76
499 0.76
500 0.76
501 0.75
502 0.71
503 0.7
504 0.7
505 0.72
506 0.72
507 0.72
508 0.72
509 0.69
510 0.7
511 0.68
512 0.67