Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3B5Q0

Protein Details
Accession A0A0C3B5Q0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MSKTTTRTTGQKRKHDEISAHydrophilic
307-329DDDDGPPKKKKKRADGPGVQAKNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
313-321PKKKKKRAD
398-411RGAKGRGGGKARDK
Subcellular Location(s) mito 23.5, cyto_mito 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR045144  TAF4  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
CDD cd08045  TAF4  
Amino Acid Sequences MSKTTTRTTGQKRKHDEISAASPIAAPSPGSINMAGMGMNGAQRQWDPSAQYDANGYQNAYYMAAQNAQNGYGGNPQQMMYAMQQAQAAMAASGGAGASGSNAGMAGGPSQPGRGNESVDRSTYNQLKDAMAVGGVSLREEEESLHRPRRIPNTYTGHDRTKTQDFLEPNFLLELFRTVAKHHKLKGITPDVLTLAGLAVQERLRGIVERANAASEHAWKTGAGGQLHAIAGDATSDAPGEAVSMYADGKTPVFDRNLRRDVGMQLLAIEKIEKAEEMRVRKERKERVEQARQSGNANQAANAEGDDDDDGPPKKKKKRADGPGVQAKNMSEETKKKLSNNVANAAAGFADKYKWMSSGGARPTPRSGAGGAGGGGAGGSGSGGVIGSAWGGWGGTGRGAKGRGGGKARDKERTVGMRDVLFVVERERGHGAGRGSARGWS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.76
3 0.7
4 0.67
5 0.64
6 0.59
7 0.51
8 0.43
9 0.36
10 0.31
11 0.27
12 0.2
13 0.13
14 0.09
15 0.12
16 0.13
17 0.14
18 0.14
19 0.13
20 0.13
21 0.13
22 0.12
23 0.08
24 0.08
25 0.07
26 0.08
27 0.08
28 0.08
29 0.09
30 0.1
31 0.13
32 0.15
33 0.18
34 0.19
35 0.22
36 0.3
37 0.28
38 0.29
39 0.28
40 0.28
41 0.28
42 0.27
43 0.24
44 0.16
45 0.17
46 0.17
47 0.16
48 0.14
49 0.12
50 0.12
51 0.16
52 0.16
53 0.19
54 0.19
55 0.18
56 0.18
57 0.16
58 0.16
59 0.18
60 0.19
61 0.17
62 0.17
63 0.17
64 0.17
65 0.17
66 0.18
67 0.13
68 0.18
69 0.17
70 0.18
71 0.18
72 0.17
73 0.16
74 0.15
75 0.14
76 0.07
77 0.06
78 0.04
79 0.04
80 0.04
81 0.03
82 0.03
83 0.02
84 0.02
85 0.03
86 0.03
87 0.03
88 0.03
89 0.03
90 0.03
91 0.04
92 0.04
93 0.05
94 0.05
95 0.06
96 0.07
97 0.08
98 0.1
99 0.11
100 0.17
101 0.17
102 0.2
103 0.22
104 0.28
105 0.28
106 0.27
107 0.28
108 0.25
109 0.31
110 0.32
111 0.3
112 0.28
113 0.28
114 0.27
115 0.25
116 0.24
117 0.17
118 0.12
119 0.1
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.06
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.06
128 0.07
129 0.1
130 0.15
131 0.21
132 0.27
133 0.29
134 0.31
135 0.37
136 0.46
137 0.48
138 0.46
139 0.49
140 0.51
141 0.52
142 0.58
143 0.56
144 0.52
145 0.47
146 0.46
147 0.41
148 0.39
149 0.38
150 0.31
151 0.32
152 0.29
153 0.3
154 0.35
155 0.3
156 0.25
157 0.23
158 0.22
159 0.17
160 0.14
161 0.13
162 0.07
163 0.08
164 0.08
165 0.09
166 0.16
167 0.22
168 0.27
169 0.28
170 0.33
171 0.34
172 0.37
173 0.44
174 0.42
175 0.38
176 0.34
177 0.32
178 0.27
179 0.25
180 0.22
181 0.13
182 0.07
183 0.05
184 0.05
185 0.04
186 0.05
187 0.05
188 0.06
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.07
194 0.09
195 0.09
196 0.11
197 0.11
198 0.11
199 0.1
200 0.11
201 0.11
202 0.11
203 0.12
204 0.11
205 0.11
206 0.1
207 0.11
208 0.14
209 0.17
210 0.14
211 0.13
212 0.13
213 0.14
214 0.14
215 0.12
216 0.09
217 0.05
218 0.05
219 0.04
220 0.04
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.07
239 0.09
240 0.11
241 0.17
242 0.22
243 0.3
244 0.34
245 0.34
246 0.34
247 0.33
248 0.32
249 0.3
250 0.25
251 0.16
252 0.13
253 0.14
254 0.13
255 0.11
256 0.1
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.05
261 0.06
262 0.11
263 0.16
264 0.2
265 0.26
266 0.34
267 0.38
268 0.44
269 0.53
270 0.56
271 0.59
272 0.66
273 0.69
274 0.71
275 0.77
276 0.75
277 0.72
278 0.69
279 0.62
280 0.54
281 0.48
282 0.43
283 0.37
284 0.33
285 0.27
286 0.22
287 0.22
288 0.19
289 0.16
290 0.12
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.08
295 0.07
296 0.11
297 0.12
298 0.15
299 0.21
300 0.29
301 0.37
302 0.44
303 0.53
304 0.6
305 0.7
306 0.77
307 0.82
308 0.82
309 0.84
310 0.86
311 0.79
312 0.68
313 0.58
314 0.48
315 0.4
316 0.33
317 0.26
318 0.21
319 0.25
320 0.31
321 0.37
322 0.4
323 0.39
324 0.45
325 0.52
326 0.55
327 0.56
328 0.54
329 0.48
330 0.45
331 0.43
332 0.35
333 0.25
334 0.17
335 0.11
336 0.07
337 0.06
338 0.07
339 0.09
340 0.09
341 0.1
342 0.12
343 0.14
344 0.18
345 0.26
346 0.31
347 0.36
348 0.37
349 0.39
350 0.4
351 0.4
352 0.37
353 0.31
354 0.25
355 0.2
356 0.2
357 0.18
358 0.15
359 0.12
360 0.11
361 0.08
362 0.07
363 0.05
364 0.03
365 0.02
366 0.02
367 0.02
368 0.02
369 0.02
370 0.02
371 0.02
372 0.02
373 0.03
374 0.03
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.04
381 0.05
382 0.08
383 0.1
384 0.11
385 0.15
386 0.16
387 0.17
388 0.22
389 0.25
390 0.29
391 0.33
392 0.4
393 0.46
394 0.54
395 0.59
396 0.61
397 0.6
398 0.57
399 0.61
400 0.61
401 0.57
402 0.54
403 0.52
404 0.44
405 0.43
406 0.4
407 0.32
408 0.25
409 0.2
410 0.17
411 0.19
412 0.18
413 0.2
414 0.21
415 0.21
416 0.22
417 0.25
418 0.24
419 0.26
420 0.29
421 0.28