Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C2XB17

Protein Details
Accession A0A0C2XB17    Localization Confidence Low Confidence Score 8.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
192-216VSSRGSRRARSQSRSRSQSRSRSRSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 9.5, mito 8, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MANTTVWGAKAIHGANPQSLVEHVIRLRIWESTYWKEECFALTAVSLIDKAIKLNAIGGVYDNTKPTQFISLLLKLLQIQPEKEILVEYLLVEEFKYLRALAAMYIRMTFRAAEVYELLEPLLNDYRKLRMLSMSGFSLTYMDEFIDKLLHEERVCDIILPRLPKRETLEETEGLAPRKSALMDAMEEKQSVSSRGSRRARSQSRSRSQSRSRSRSISRSPSLAASAEDGAEDRYVSRSPSRSRSRSASPAQMDTTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.26
3 0.28
4 0.26
5 0.22
6 0.21
7 0.2
8 0.16
9 0.19
10 0.17
11 0.19
12 0.19
13 0.2
14 0.21
15 0.19
16 0.2
17 0.2
18 0.26
19 0.29
20 0.34
21 0.34
22 0.33
23 0.33
24 0.32
25 0.28
26 0.24
27 0.19
28 0.14
29 0.12
30 0.12
31 0.11
32 0.1
33 0.09
34 0.06
35 0.08
36 0.07
37 0.08
38 0.08
39 0.09
40 0.08
41 0.09
42 0.11
43 0.1
44 0.09
45 0.1
46 0.11
47 0.12
48 0.13
49 0.13
50 0.12
51 0.13
52 0.13
53 0.13
54 0.15
55 0.13
56 0.15
57 0.19
58 0.2
59 0.21
60 0.21
61 0.2
62 0.18
63 0.19
64 0.21
65 0.17
66 0.16
67 0.16
68 0.17
69 0.17
70 0.16
71 0.14
72 0.1
73 0.09
74 0.08
75 0.07
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.06
84 0.05
85 0.05
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.08
90 0.09
91 0.08
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.1
96 0.08
97 0.07
98 0.08
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.09
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.06
107 0.06
108 0.07
109 0.11
110 0.1
111 0.1
112 0.11
113 0.14
114 0.15
115 0.16
116 0.15
117 0.12
118 0.13
119 0.14
120 0.15
121 0.13
122 0.11
123 0.11
124 0.1
125 0.09
126 0.08
127 0.06
128 0.05
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.08
137 0.1
138 0.09
139 0.1
140 0.11
141 0.12
142 0.12
143 0.11
144 0.1
145 0.12
146 0.15
147 0.18
148 0.19
149 0.24
150 0.25
151 0.28
152 0.32
153 0.35
154 0.36
155 0.38
156 0.41
157 0.36
158 0.37
159 0.36
160 0.34
161 0.28
162 0.25
163 0.18
164 0.14
165 0.14
166 0.12
167 0.1
168 0.09
169 0.09
170 0.11
171 0.13
172 0.15
173 0.15
174 0.15
175 0.15
176 0.15
177 0.14
178 0.14
179 0.14
180 0.19
181 0.23
182 0.33
183 0.4
184 0.44
185 0.51
186 0.61
187 0.67
188 0.68
189 0.74
190 0.75
191 0.78
192 0.82
193 0.8
194 0.79
195 0.79
196 0.81
197 0.82
198 0.79
199 0.75
200 0.75
201 0.75
202 0.75
203 0.75
204 0.74
205 0.67
206 0.62
207 0.58
208 0.51
209 0.46
210 0.37
211 0.29
212 0.22
213 0.18
214 0.15
215 0.13
216 0.12
217 0.11
218 0.1
219 0.09
220 0.08
221 0.1
222 0.11
223 0.14
224 0.19
225 0.26
226 0.32
227 0.42
228 0.52
229 0.55
230 0.61
231 0.65
232 0.67
233 0.69
234 0.69
235 0.69
236 0.63
237 0.63