FuNGI

A0A0C3BB06

Protein Details

Accession

A0A0C3BB06

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
95-116	AWSDRSPWRTPQKPQRTANSPS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
462-472	RLKRKERPRPK
722-732	RGGRGRGFNGR

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006630 La_HTH
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
PROSITE	View protein in PROSITE PS50961 HTH_LA

Amino Acid Sequences

MAAVGGAMDGSYAERAKKATVQSSFRNNIKPRIPHDAIEVPSASTSDTLDSSPAHSSVNTPATNLIIPPSIPVSSASSENTSPLPSANPLPPRNAWSDRSPWRTPQKPQRTANSPSVVTNGPAIHAVLESSVHETQHEPRSRLTSPAKAPTKINQPNDSDPFVVNYNLTSSSLADAQNWPQVGIATTSVSSPHHPKSSLPSVTPTTMLSTSHTPAKTGHEGENDGTPSKKSKGEKTKWVAIPPKELQAAADEATKRSRPGSTSSKSHSPHINGKGTRSQDENFEGRSGGRPVSRGDGPSPITAGNTRHDRNPSLTVPSTTSSRRVSPLNLTTSLPSVSNNATVQPTLAPESPLKPRAPSPSHAQLHNATSQQGGQNRPSFTFVEPVVPLHPPNRPSNHSRNPSQNPHYQPPPPMYAPGWPMPVYMMPYYPQNHYHYIPPSINPPTIASAQVQTEVAVSRSVRLKRKERPRPKDAVPLAGYRSTVAETLTPQVIGHALIFHTGEEEPSIAEITVLSRGDDSHSKIQTRDSWWSYGVDQQLILRRLKRQPALKSPLLTGQQLSEGPRINFEPEVESSKSTGVDSPIETAILNGANPDMRSAQQPIASTQSSNLPAPGAGPSAHDIGLAMGMPMPIPPMGMHPPPLLMGMHPPPPFLPSPVSAARMDWAPRDDLYVSAPSPSYPYPYPPYGYPPMNPSNGHNAGYSGDGQNRGTSRWRDERYPPRGGRGRGFNGRGRGFRGLTNPRSYNSQVPPSPGGSGQPAYPSQHLPTSAAVYISDPVFHPSMYPYSNTLPPSPFNEYPQAPEAPAAPINDSQARPPSPKPLTQLNFHLDNTQFKLLGQIEYYFSRDNVAKDKFERLGTDRSFAILPAYKTA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.14
3	0.17
4	0.23
5	0.28
6	0.34
7	0.41
8	0.46
9	0.52
10	0.61
11	0.66
12	0.65
13	0.69
14	0.66
15	0.66
16	0.68
17	0.68
18	0.64
19	0.67
20	0.65
21	0.56
22	0.58
23	0.57
24	0.5
25	0.46
26	0.41
27	0.31
28	0.28
29	0.27
30	0.2
31	0.13
32	0.12
33	0.1
34	0.11
35	0.11
36	0.12
37	0.12
38	0.14
39	0.16
40	0.16
41	0.15
42	0.14
43	0.16
44	0.21
45	0.28
46	0.26
47	0.24
48	0.24
49	0.26
50	0.26
51	0.24
52	0.19
53	0.13
54	0.13
55	0.14
56	0.15
57	0.13
58	0.13
59	0.15
60	0.17
61	0.17
62	0.2
63	0.2
64	0.21
65	0.21
66	0.22
67	0.22
68	0.19
69	0.17
70	0.16
71	0.16
72	0.15
73	0.19
74	0.24
75	0.32
76	0.33
77	0.38
78	0.4
79	0.42
80	0.47
81	0.48
82	0.45
83	0.42
84	0.49
85	0.54
86	0.59
87	0.59
88	0.6
89	0.65
90	0.69
91	0.74
92	0.76
93	0.77
94	0.79
95	0.83
96	0.83
97	0.8
98	0.79
99	0.77
100	0.72
101	0.62
102	0.54
103	0.5
104	0.41
105	0.34
106	0.31
107	0.22
108	0.17
109	0.16
110	0.15
111	0.12
112	0.11
113	0.1
114	0.07
115	0.07
116	0.08
117	0.12
118	0.13
119	0.12
120	0.13
121	0.15
122	0.22
123	0.31
124	0.36
125	0.33
126	0.35
127	0.41
128	0.42
129	0.48
130	0.47
131	0.46
132	0.46
133	0.54
134	0.57
135	0.54
136	0.55
137	0.54
138	0.59
139	0.6
140	0.61
141	0.57
142	0.57
143	0.62
144	0.63
145	0.59
146	0.5
147	0.41
148	0.36
149	0.31
150	0.26
151	0.19
152	0.15
153	0.13
154	0.13
155	0.13
156	0.12
157	0.11
158	0.11
159	0.14
160	0.14
161	0.14
162	0.15
163	0.17
164	0.2
165	0.19
166	0.18
167	0.15
168	0.15
169	0.14
170	0.13
171	0.12
172	0.09
173	0.09
174	0.09
175	0.1
176	0.11
177	0.14
178	0.18
179	0.22
180	0.25
181	0.26
182	0.27
183	0.34
184	0.42
185	0.42
186	0.38
187	0.38
188	0.38
189	0.38
190	0.37
191	0.3
192	0.23
193	0.21
194	0.2
195	0.18
196	0.18
197	0.19
198	0.24
199	0.24
200	0.21
201	0.22
202	0.28
203	0.31
204	0.3
205	0.32
206	0.29
207	0.31
208	0.31
209	0.33
210	0.28
211	0.24
212	0.22
213	0.19
214	0.2
215	0.21
216	0.26
217	0.26
218	0.35
219	0.45
220	0.52
221	0.61
222	0.64
223	0.71
224	0.69
225	0.72
226	0.7
227	0.61
228	0.62
229	0.54
230	0.51
231	0.42
232	0.39
233	0.31
234	0.25
235	0.24
236	0.17
237	0.19
238	0.15
239	0.15
240	0.19
241	0.2
242	0.18
243	0.18
244	0.2
245	0.18
246	0.24
247	0.32
248	0.34
249	0.39
250	0.44
251	0.51
252	0.5
253	0.53
254	0.51
255	0.47
256	0.5
257	0.52
258	0.55
259	0.48
260	0.5
261	0.52
262	0.49
263	0.46
264	0.4
265	0.34
266	0.29
267	0.33
268	0.31
269	0.26
270	0.23
271	0.22
272	0.19
273	0.21
274	0.18
275	0.16
276	0.15
277	0.15
278	0.16
279	0.2
280	0.21
281	0.2
282	0.19
283	0.22
284	0.23
285	0.22
286	0.21
287	0.17
288	0.16
289	0.17
290	0.17
291	0.18
292	0.23
293	0.24
294	0.27
295	0.3
296	0.31
297	0.32
298	0.36
299	0.32
300	0.32
301	0.32
302	0.29
303	0.28
304	0.27
305	0.26
306	0.22
307	0.25
308	0.22
309	0.22
310	0.23
311	0.23
312	0.24
313	0.27
314	0.31
315	0.31
316	0.3
317	0.29
318	0.27
319	0.26
320	0.25
321	0.18
322	0.13
323	0.12
324	0.11
325	0.12
326	0.12
327	0.12
328	0.12
329	0.12
330	0.12
331	0.1
332	0.1
333	0.11
334	0.11
335	0.11
336	0.11
337	0.15
338	0.19
339	0.23
340	0.22
341	0.21
342	0.24
343	0.31
344	0.34
345	0.34
346	0.36
347	0.42
348	0.44
349	0.43
350	0.42
351	0.36
352	0.35
353	0.35
354	0.29
355	0.19
356	0.17
357	0.17
358	0.18
359	0.19
360	0.19
361	0.2
362	0.25
363	0.25
364	0.26
365	0.27
366	0.25
367	0.22
368	0.22
369	0.18
370	0.16
371	0.16
372	0.15
373	0.14
374	0.13
375	0.13
376	0.13
377	0.15
378	0.16
379	0.21
380	0.25
381	0.27
382	0.33
383	0.43
384	0.5
385	0.52
386	0.53
387	0.58
388	0.6
389	0.64
390	0.62
391	0.6
392	0.56
393	0.56
394	0.55
395	0.49
396	0.45
397	0.4
398	0.39
399	0.32
400	0.28
401	0.24
402	0.22
403	0.23
404	0.22
405	0.2
406	0.16
407	0.16
408	0.14
409	0.14
410	0.14
411	0.11
412	0.1
413	0.08
414	0.12
415	0.14
416	0.15
417	0.18
418	0.19
419	0.22
420	0.23
421	0.26
422	0.25
423	0.27
424	0.25
425	0.22
426	0.23
427	0.23
428	0.22
429	0.19
430	0.17
431	0.16
432	0.16
433	0.16
434	0.13
435	0.11
436	0.11
437	0.11
438	0.1
439	0.08
440	0.08
441	0.07
442	0.07
443	0.07
444	0.07
445	0.08
446	0.14
447	0.19
448	0.25
449	0.32
450	0.39
451	0.47
452	0.58
453	0.67
454	0.73
455	0.77
456	0.78
457	0.78
458	0.75
459	0.76
460	0.66
461	0.62
462	0.53
463	0.46
464	0.4
465	0.34
466	0.3
467	0.2
468	0.19
469	0.12
470	0.11
471	0.09
472	0.07
473	0.07
474	0.09
475	0.09
476	0.08
477	0.08
478	0.07
479	0.07
480	0.07
481	0.06
482	0.05
483	0.05
484	0.05
485	0.05
486	0.05
487	0.06
488	0.06
489	0.06
490	0.05
491	0.06
492	0.05
493	0.05
494	0.05
495	0.04
496	0.04
497	0.04
498	0.04
499	0.06
500	0.06
501	0.06
502	0.06
503	0.06
504	0.09
505	0.12
506	0.15
507	0.2
508	0.22
509	0.24
510	0.24
511	0.27
512	0.3
513	0.31
514	0.34
515	0.3
516	0.29
517	0.29
518	0.3
519	0.27
520	0.27
521	0.24
522	0.17
523	0.15
524	0.15
525	0.2
526	0.22
527	0.23
528	0.21
529	0.26
530	0.31
531	0.38
532	0.42
533	0.43
534	0.48
535	0.56
536	0.61
537	0.58
538	0.55
539	0.49
540	0.49
541	0.43
542	0.36
543	0.27
544	0.2
545	0.18
546	0.18
547	0.19
548	0.16
549	0.17
550	0.17
551	0.18
552	0.18
553	0.18
554	0.17
555	0.16
556	0.16
557	0.14
558	0.19
559	0.18
560	0.18
561	0.17
562	0.18
563	0.18
564	0.15
565	0.15
566	0.12
567	0.12
568	0.12
569	0.13
570	0.12
571	0.12
572	0.11
573	0.1
574	0.09
575	0.08
576	0.07
577	0.05
578	0.06
579	0.06
580	0.06
581	0.08
582	0.08
583	0.08
584	0.11
585	0.14
586	0.16
587	0.17
588	0.18
589	0.18
590	0.22
591	0.22
592	0.2
593	0.18
594	0.2
595	0.2
596	0.2
597	0.18
598	0.14
599	0.13
600	0.14
601	0.14
602	0.1
603	0.08
604	0.09
605	0.1
606	0.11
607	0.11
608	0.1
609	0.1
610	0.08
611	0.08
612	0.07
613	0.05
614	0.04
615	0.04
616	0.04
617	0.04
618	0.05
619	0.04
620	0.05
621	0.05
622	0.09
623	0.13
624	0.14
625	0.17
626	0.16
627	0.17
628	0.17
629	0.18
630	0.14
631	0.1
632	0.14
633	0.15
634	0.21
635	0.21
636	0.21
637	0.2
638	0.24
639	0.24
640	0.21
641	0.21
642	0.16
643	0.22
644	0.23
645	0.26
646	0.23
647	0.23
648	0.22
649	0.21
650	0.21
651	0.18
652	0.18
653	0.17
654	0.16
655	0.18
656	0.18
657	0.15
658	0.17
659	0.17
660	0.15
661	0.15
662	0.15
663	0.12
664	0.15
665	0.15
666	0.17
667	0.16
668	0.21
669	0.25
670	0.27
671	0.3
672	0.28
673	0.34
674	0.36
675	0.37
676	0.34
677	0.35
678	0.37
679	0.39
680	0.38
681	0.35
682	0.38
683	0.38
684	0.38
685	0.31
686	0.27
687	0.24
688	0.25
689	0.24
690	0.17
691	0.17
692	0.17
693	0.18
694	0.21
695	0.21
696	0.21
697	0.26
698	0.28
699	0.34
700	0.41
701	0.45
702	0.47
703	0.57
704	0.65
705	0.65
706	0.71
707	0.65
708	0.65
709	0.69
710	0.67
711	0.64
712	0.62
713	0.63
714	0.61
715	0.64
716	0.6
717	0.6
718	0.61
719	0.57
720	0.52
721	0.5
722	0.43
723	0.41
724	0.44
725	0.45
726	0.47
727	0.52
728	0.5
729	0.46
730	0.51
731	0.51
732	0.5
733	0.47
734	0.49
735	0.43
736	0.46
737	0.48
738	0.43
739	0.42
740	0.34
741	0.3
742	0.25
743	0.24
744	0.2
745	0.21
746	0.21
747	0.23
748	0.25
749	0.26
750	0.24
751	0.27
752	0.27
753	0.25
754	0.25
755	0.25
756	0.23
757	0.21
758	0.18
759	0.16
760	0.17
761	0.15
762	0.14
763	0.11
764	0.14
765	0.14
766	0.13
767	0.13
768	0.14
769	0.18
770	0.19
771	0.2
772	0.21
773	0.24
774	0.29
775	0.31
776	0.32
777	0.3
778	0.32
779	0.36
780	0.4
781	0.38
782	0.38
783	0.43
784	0.4
785	0.42
786	0.44
787	0.39
788	0.31
789	0.3
790	0.27
791	0.23
792	0.25
793	0.21
794	0.2
795	0.19
796	0.23
797	0.28
798	0.27
799	0.28
800	0.33
801	0.36
802	0.37
803	0.39
804	0.45
805	0.45
806	0.49
807	0.5
808	0.53
809	0.54
810	0.55
811	0.59
812	0.55
813	0.54
814	0.49
815	0.5
816	0.42
817	0.44
818	0.43
819	0.39
820	0.33
821	0.28
822	0.34
823	0.3
824	0.3
825	0.26
826	0.22
827	0.22
828	0.24
829	0.28
830	0.23
831	0.21
832	0.23
833	0.24
834	0.26
835	0.31
836	0.34
837	0.37
838	0.38
839	0.45
840	0.45
841	0.45
842	0.47
843	0.43
844	0.48
845	0.44
846	0.45
847	0.38
848	0.36
849	0.34
850	0.28
851	0.29
852	0.25

A0A0C3BB06

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer