Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7TN58

Protein Details
Accession A7TN58    Localization Confidence High Confidence Score 22.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-33MSETKPLEKKNKKTGNRYFRRGKKGSGKNKDGIBasic
59-91ANKDKVNNKSDKSKRRRRRNKKKNVGKNGDEEIBasic
269-333AGADNKKDGSKKKKKKKKNKKKKSEKIKESEDTNVNKGPSNVKNKKIRKNKQKGSNSQKENHNNSHydrophilic
343-368LEAAGKKELQRRKKLQKKNEMELSLNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-44EKKNKKTGNRYFRRGKKGSGKNKDGIEGKTGASKPGK
64-84VNNKSDKSKRRRRRNKKKNVG
274-322KKDGSKKKKKKKKNKKKKSEKIKESEDTNVNKGPSNVKNKKIRKNKQKG
349-359KELQRRKKLQK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
KEGG vpo:Kpol_1053p12  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MSETKPLEKKNKKTGNRYFRRGKKGSGKNKDGIEGKTGASKPGKDGSNGGTVASNNPMANKDKVNNKSDKSKRRRRRNKKKNVGKNGDEEISGHKLVLRLLPPNLTEEKFWEIVTPALDKLENYEIESSYFVQGEYTNKPFQDPSYSRCYIIFKKFDKLKEAAQKLATVNFMDDKIDSAIARIRISPYNKSISVIPPNRPSRRSIEGTVESDSLFKTFIQSLQIMEEEKNHYEYSEVSLFKSLKKELSKRNELANVMNKRREQALIELAGADNKKDGSKKKKKKKKNKKKKSEKIKESEDTNVNKGPSNVKNKKIRKNKQKGSNSQKENHNNSIEKNNNIVILEAAGKKELQRRKKLQKKNEMELSLNKLASLPSKNVEASSETNKQPSKMKILKRPEN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.9
2 0.9
3 0.9
4 0.9
5 0.9
6 0.89
7 0.91
8 0.84
9 0.83
10 0.82
11 0.83
12 0.84
13 0.84
14 0.82
15 0.78
16 0.76
17 0.73
18 0.68
19 0.59
20 0.53
21 0.44
22 0.37
23 0.38
24 0.36
25 0.35
26 0.34
27 0.33
28 0.32
29 0.38
30 0.39
31 0.32
32 0.35
33 0.33
34 0.36
35 0.34
36 0.31
37 0.25
38 0.24
39 0.24
40 0.23
41 0.22
42 0.15
43 0.16
44 0.19
45 0.21
46 0.24
47 0.27
48 0.3
49 0.37
50 0.44
51 0.5
52 0.54
53 0.55
54 0.62
55 0.68
56 0.73
57 0.74
58 0.79
59 0.82
60 0.86
61 0.93
62 0.94
63 0.96
64 0.96
65 0.97
66 0.97
67 0.97
68 0.97
69 0.97
70 0.95
71 0.88
72 0.83
73 0.77
74 0.66
75 0.55
76 0.45
77 0.38
78 0.32
79 0.27
80 0.2
81 0.17
82 0.16
83 0.17
84 0.2
85 0.18
86 0.17
87 0.19
88 0.21
89 0.2
90 0.23
91 0.26
92 0.23
93 0.21
94 0.21
95 0.24
96 0.22
97 0.21
98 0.18
99 0.15
100 0.16
101 0.17
102 0.15
103 0.11
104 0.11
105 0.12
106 0.1
107 0.13
108 0.15
109 0.14
110 0.14
111 0.16
112 0.15
113 0.16
114 0.17
115 0.15
116 0.12
117 0.12
118 0.1
119 0.09
120 0.1
121 0.13
122 0.16
123 0.19
124 0.2
125 0.2
126 0.21
127 0.21
128 0.21
129 0.28
130 0.26
131 0.26
132 0.32
133 0.33
134 0.33
135 0.34
136 0.37
137 0.34
138 0.39
139 0.43
140 0.37
141 0.44
142 0.49
143 0.49
144 0.5
145 0.46
146 0.45
147 0.47
148 0.47
149 0.42
150 0.38
151 0.38
152 0.33
153 0.33
154 0.26
155 0.17
156 0.15
157 0.13
158 0.12
159 0.1
160 0.09
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.07
165 0.07
166 0.1
167 0.1
168 0.11
169 0.11
170 0.12
171 0.16
172 0.19
173 0.22
174 0.22
175 0.25
176 0.25
177 0.25
178 0.25
179 0.24
180 0.31
181 0.31
182 0.32
183 0.36
184 0.44
185 0.47
186 0.47
187 0.46
188 0.42
189 0.44
190 0.44
191 0.38
192 0.36
193 0.36
194 0.36
195 0.35
196 0.3
197 0.23
198 0.2
199 0.18
200 0.12
201 0.09
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.11
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.12
214 0.13
215 0.13
216 0.15
217 0.13
218 0.13
219 0.12
220 0.12
221 0.14
222 0.16
223 0.16
224 0.14
225 0.18
226 0.19
227 0.21
228 0.23
229 0.21
230 0.22
231 0.28
232 0.35
233 0.41
234 0.5
235 0.56
236 0.55
237 0.59
238 0.57
239 0.52
240 0.5
241 0.5
242 0.49
243 0.46
244 0.48
245 0.44
246 0.41
247 0.41
248 0.37
249 0.3
250 0.25
251 0.25
252 0.21
253 0.21
254 0.2
255 0.18
256 0.19
257 0.17
258 0.13
259 0.09
260 0.08
261 0.1
262 0.15
263 0.24
264 0.32
265 0.44
266 0.55
267 0.66
268 0.76
269 0.85
270 0.91
271 0.95
272 0.95
273 0.95
274 0.96
275 0.96
276 0.97
277 0.97
278 0.97
279 0.97
280 0.96
281 0.93
282 0.91
283 0.84
284 0.76
285 0.72
286 0.68
287 0.6
288 0.53
289 0.48
290 0.39
291 0.36
292 0.34
293 0.34
294 0.35
295 0.42
296 0.46
297 0.51
298 0.61
299 0.69
300 0.78
301 0.82
302 0.85
303 0.85
304 0.89
305 0.9
306 0.9
307 0.92
308 0.92
309 0.92
310 0.91
311 0.88
312 0.84
313 0.84
314 0.83
315 0.8
316 0.76
317 0.72
318 0.64
319 0.6
320 0.63
321 0.57
322 0.5
323 0.46
324 0.4
325 0.34
326 0.32
327 0.29
328 0.19
329 0.15
330 0.17
331 0.15
332 0.14
333 0.13
334 0.14
335 0.18
336 0.26
337 0.34
338 0.39
339 0.49
340 0.59
341 0.7
342 0.8
343 0.86
344 0.89
345 0.91
346 0.91
347 0.9
348 0.89
349 0.82
350 0.76
351 0.72
352 0.69
353 0.63
354 0.53
355 0.43
356 0.35
357 0.31
358 0.32
359 0.3
360 0.25
361 0.22
362 0.26
363 0.27
364 0.27
365 0.27
366 0.26
367 0.27
368 0.31
369 0.36
370 0.34
371 0.41
372 0.43
373 0.44
374 0.47
375 0.48
376 0.51
377 0.53
378 0.61
379 0.63