Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3BDU2

Protein Details
Accession A0A0C3BDU2    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
110-129DDSPSRKKKNEKPKAAIPKIBasic
265-289TQEIASGKRNRKKKSSKKDGFYAFQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
115-126RKKKNEKPKAAI
271-283GKRNRKKKSSKKD
301-322LKKKFDAERSKVEKAKQGRKFR
Subcellular Location(s) cyto 16, cyto_nucl 13.5, nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR040447  RRM_Rrp7  
IPR040446  RRP7  
IPR024326  RRP7_C  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF17799  RRM_Rrp7  
PF12923  RRP7  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MQKLSDFGVLPIAYTPQVIHYLYIRAHITKSKAGAAIDEFPPNRTLFVVNIPPDATERELITLFSKPGTVERVAFAGHDRVEGFVDEETSDEEAAESLNMEEMEINDDGDDSPSRKKKNEKPKAAIPKIIPLPTVSLRHLRRTGSIGHLIFTSPQGLASVLSLPESALPLTWPKFKAASAAEPSGLAHYLAKYRSLRPALSAVKEHADSSMEVYEHKQALANRNTSKYRKGDAIVDEDGFTLVTRGGAYGQTLGGGVGVASKKFTQEIASGKRNRKKKSSKKDGFYAFQVREKKIQEQISLKKKFDAERSKVEKAKQGRKFRPY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.11
4 0.15
5 0.15
6 0.15
7 0.15
8 0.19
9 0.19
10 0.24
11 0.24
12 0.22
13 0.24
14 0.28
15 0.3
16 0.31
17 0.33
18 0.32
19 0.32
20 0.31
21 0.31
22 0.29
23 0.29
24 0.27
25 0.31
26 0.27
27 0.26
28 0.28
29 0.26
30 0.23
31 0.2
32 0.19
33 0.14
34 0.2
35 0.25
36 0.24
37 0.25
38 0.25
39 0.24
40 0.24
41 0.25
42 0.21
43 0.16
44 0.15
45 0.15
46 0.15
47 0.16
48 0.16
49 0.16
50 0.14
51 0.13
52 0.13
53 0.11
54 0.13
55 0.17
56 0.17
57 0.16
58 0.16
59 0.17
60 0.16
61 0.16
62 0.15
63 0.15
64 0.13
65 0.13
66 0.12
67 0.12
68 0.13
69 0.13
70 0.12
71 0.08
72 0.09
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.07
79 0.07
80 0.06
81 0.06
82 0.05
83 0.04
84 0.04
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.08
91 0.07
92 0.07
93 0.06
94 0.07
95 0.07
96 0.08
97 0.09
98 0.08
99 0.15
100 0.21
101 0.24
102 0.29
103 0.38
104 0.46
105 0.57
106 0.66
107 0.69
108 0.71
109 0.78
110 0.84
111 0.78
112 0.74
113 0.64
114 0.6
115 0.54
116 0.47
117 0.38
118 0.27
119 0.27
120 0.24
121 0.26
122 0.21
123 0.25
124 0.26
125 0.31
126 0.33
127 0.31
128 0.29
129 0.29
130 0.29
131 0.25
132 0.29
133 0.24
134 0.21
135 0.21
136 0.19
137 0.17
138 0.15
139 0.12
140 0.06
141 0.06
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.06
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.07
157 0.08
158 0.12
159 0.12
160 0.13
161 0.14
162 0.14
163 0.18
164 0.17
165 0.21
166 0.21
167 0.21
168 0.2
169 0.19
170 0.19
171 0.16
172 0.14
173 0.09
174 0.06
175 0.06
176 0.09
177 0.09
178 0.14
179 0.15
180 0.17
181 0.23
182 0.25
183 0.25
184 0.24
185 0.31
186 0.3
187 0.3
188 0.3
189 0.25
190 0.24
191 0.25
192 0.23
193 0.16
194 0.14
195 0.12
196 0.12
197 0.13
198 0.1
199 0.1
200 0.12
201 0.15
202 0.14
203 0.14
204 0.15
205 0.16
206 0.25
207 0.3
208 0.35
209 0.35
210 0.4
211 0.46
212 0.46
213 0.5
214 0.46
215 0.43
216 0.41
217 0.39
218 0.4
219 0.37
220 0.39
221 0.34
222 0.3
223 0.28
224 0.24
225 0.22
226 0.16
227 0.13
228 0.07
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.06
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.06
241 0.05
242 0.05
243 0.04
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.09
248 0.1
249 0.11
250 0.12
251 0.12
252 0.12
253 0.16
254 0.24
255 0.31
256 0.4
257 0.47
258 0.56
259 0.63
260 0.69
261 0.71
262 0.74
263 0.77
264 0.79
265 0.83
266 0.85
267 0.88
268 0.87
269 0.89
270 0.86
271 0.79
272 0.76
273 0.73
274 0.65
275 0.62
276 0.6
277 0.54
278 0.53
279 0.53
280 0.51
281 0.51
282 0.53
283 0.53
284 0.56
285 0.62
286 0.66
287 0.69
288 0.64
289 0.61
290 0.61
291 0.6
292 0.61
293 0.62
294 0.58
295 0.62
296 0.69
297 0.72
298 0.73
299 0.71
300 0.69
301 0.68
302 0.72
303 0.71
304 0.74