Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E9DBP4

Protein Details
Accession E9DBP4    Localization Confidence High Confidence Score 19.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-55QGTAPEQPLKRKRGRPRKEGGPAKPKPVVLDHTGQPRKRGRPRKYPLDTTAPPBasic
65-86DNLQKRGRGRPRKSDSLPPKPVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-46LKRKRGRPRKEGGPAKPKPVVLDHTGQPRKRGRPRK
69-107KRGRGRPRKSDSLPPKPVAAPGPEQGPEATPRRGRPRKE
128-136KRGRGRPKK
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 7, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
Amino Acid Sequences MVQGTAPEQPLKRKRGRPRKEGGPAKPKPVVLDHTGQPRKRGRPRKYPLDTTAPPAAKPQNVSDDNLQKRGRGRPRKSDSLPPKPVAAPGPEQGPEATPRRGRPRKEHGAQPAEVVPDVAAQTVMQSKRGRGRPKKSEGTIMTEEATQPVKAPSAPGRGRPKKFSTATSGSANGVAQQSSASSASNPLAKMVVGSYELKCATVENEWPHVAVGMEMTILESEETYGLGFIAGFNLGIVEGTMLLAADKDSLERLYNKMSKGENRSLYGTFGSNENDGDDGDEGRTFKKRKTSAASSKRLYMFWRGRQTGEGEIYSGRNNGHLDFSESKKIVRFNGVGGFPAMGNECKFSGVKRSDEVSVPPQPWSDFSERAAAEASAARWR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.8
3 0.87
4 0.87
5 0.88
6 0.89
7 0.9
8 0.9
9 0.89
10 0.89
11 0.84
12 0.81
13 0.77
14 0.67
15 0.6
16 0.55
17 0.5
18 0.44
19 0.44
20 0.42
21 0.48
22 0.55
23 0.54
24 0.56
25 0.6
26 0.65
27 0.7
28 0.76
29 0.74
30 0.77
31 0.85
32 0.88
33 0.88
34 0.86
35 0.82
36 0.81
37 0.73
38 0.68
39 0.67
40 0.57
41 0.48
42 0.46
43 0.44
44 0.37
45 0.38
46 0.36
47 0.36
48 0.37
49 0.4
50 0.41
51 0.46
52 0.47
53 0.53
54 0.49
55 0.43
56 0.46
57 0.53
58 0.56
59 0.58
60 0.62
61 0.65
62 0.73
63 0.8
64 0.8
65 0.81
66 0.8
67 0.8
68 0.79
69 0.7
70 0.65
71 0.56
72 0.54
73 0.46
74 0.4
75 0.32
76 0.26
77 0.28
78 0.25
79 0.25
80 0.22
81 0.2
82 0.21
83 0.22
84 0.26
85 0.27
86 0.33
87 0.43
88 0.51
89 0.56
90 0.6
91 0.67
92 0.71
93 0.73
94 0.75
95 0.74
96 0.73
97 0.66
98 0.59
99 0.51
100 0.41
101 0.35
102 0.27
103 0.17
104 0.11
105 0.11
106 0.08
107 0.06
108 0.05
109 0.06
110 0.11
111 0.12
112 0.16
113 0.17
114 0.21
115 0.29
116 0.37
117 0.47
118 0.51
119 0.61
120 0.66
121 0.73
122 0.78
123 0.72
124 0.73
125 0.65
126 0.62
127 0.55
128 0.46
129 0.37
130 0.29
131 0.27
132 0.2
133 0.19
134 0.11
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.08
139 0.11
140 0.13
141 0.22
142 0.23
143 0.31
144 0.41
145 0.49
146 0.53
147 0.57
148 0.58
149 0.57
150 0.58
151 0.53
152 0.5
153 0.45
154 0.45
155 0.41
156 0.37
157 0.28
158 0.27
159 0.23
160 0.17
161 0.13
162 0.1
163 0.07
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.07
168 0.05
169 0.05
170 0.07
171 0.08
172 0.1
173 0.1
174 0.09
175 0.09
176 0.08
177 0.08
178 0.07
179 0.06
180 0.06
181 0.08
182 0.08
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.09
189 0.09
190 0.12
191 0.12
192 0.15
193 0.14
194 0.15
195 0.14
196 0.13
197 0.12
198 0.08
199 0.06
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.02
226 0.02
227 0.02
228 0.02
229 0.02
230 0.02
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.04
236 0.05
237 0.06
238 0.08
239 0.09
240 0.11
241 0.18
242 0.22
243 0.23
244 0.27
245 0.3
246 0.35
247 0.41
248 0.47
249 0.43
250 0.42
251 0.44
252 0.39
253 0.37
254 0.32
255 0.25
256 0.18
257 0.16
258 0.16
259 0.13
260 0.13
261 0.12
262 0.11
263 0.1
264 0.1
265 0.09
266 0.08
267 0.08
268 0.09
269 0.09
270 0.11
271 0.18
272 0.19
273 0.22
274 0.31
275 0.34
276 0.41
277 0.49
278 0.58
279 0.62
280 0.7
281 0.76
282 0.69
283 0.72
284 0.66
285 0.59
286 0.51
287 0.5
288 0.48
289 0.48
290 0.55
291 0.5
292 0.5
293 0.51
294 0.51
295 0.46
296 0.41
297 0.32
298 0.23
299 0.23
300 0.23
301 0.22
302 0.21
303 0.15
304 0.15
305 0.16
306 0.16
307 0.17
308 0.17
309 0.22
310 0.25
311 0.28
312 0.34
313 0.33
314 0.34
315 0.34
316 0.37
317 0.33
318 0.36
319 0.33
320 0.28
321 0.34
322 0.33
323 0.31
324 0.28
325 0.26
326 0.19
327 0.19
328 0.17
329 0.13
330 0.13
331 0.14
332 0.13
333 0.15
334 0.16
335 0.16
336 0.24
337 0.27
338 0.3
339 0.32
340 0.35
341 0.36
342 0.38
343 0.41
344 0.39
345 0.41
346 0.38
347 0.36
348 0.35
349 0.33
350 0.33
351 0.35
352 0.34
353 0.29
354 0.3
355 0.36
356 0.34
357 0.34
358 0.33
359 0.26
360 0.22
361 0.22