Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C2XJ81

Protein Details
Accession A0A0C2XJ81    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
374-403KNTPGPPGKPGHGKKKQRRIEKQALKQGSABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
374-395KNTPGPPGKPGHGKKKQRRIEK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MATDSEFYPKDDHSWKTWMFQEYLQVRGPLTEENVMEYFEESFLFDRSSNNNVLRMQTQHADPNYRMSRLETENELRRFTGLEYALVHAQPPLFVIQRRDRLSPTEVRPTAVYFILNNVLYSGPDLYTLLATKLTNSLNMIQSSLDILRAARPDYTPRIGHVWPIVDVPSASSTLLAGKARNDTRQGSVVPGTPAAAGAGADTNNPSSQLPKQPQPDAINRTLEENEDKQIWEPFAFAFHGTRMEMERRRIQAMQTLAATAGTGSSSGPGGPTSNAAHNAMQQASNARGVGGGGMRGADNTTGRVAGNDAGVGGVGADADDASRRGRSTGGEHFRRSSAMQFSSSATSQQDGSLPSSSARPALSVPTADAPKLKNTPGPPGKPGHGKKKQRRIEKQALKQGSAQTPVPATPV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.4
3 0.42
4 0.47
5 0.45
6 0.42
7 0.39
8 0.44
9 0.39
10 0.42
11 0.39
12 0.34
13 0.3
14 0.28
15 0.28
16 0.21
17 0.21
18 0.21
19 0.18
20 0.21
21 0.21
22 0.21
23 0.2
24 0.18
25 0.16
26 0.12
27 0.12
28 0.09
29 0.1
30 0.1
31 0.11
32 0.11
33 0.14
34 0.17
35 0.21
36 0.26
37 0.27
38 0.31
39 0.31
40 0.33
41 0.33
42 0.33
43 0.32
44 0.3
45 0.3
46 0.33
47 0.35
48 0.37
49 0.34
50 0.41
51 0.41
52 0.39
53 0.37
54 0.33
55 0.36
56 0.35
57 0.38
58 0.34
59 0.38
60 0.45
61 0.47
62 0.45
63 0.39
64 0.35
65 0.33
66 0.27
67 0.27
68 0.19
69 0.18
70 0.18
71 0.2
72 0.21
73 0.2
74 0.19
75 0.13
76 0.13
77 0.11
78 0.1
79 0.11
80 0.12
81 0.15
82 0.22
83 0.28
84 0.37
85 0.4
86 0.42
87 0.41
88 0.43
89 0.46
90 0.47
91 0.44
92 0.46
93 0.44
94 0.43
95 0.41
96 0.38
97 0.35
98 0.27
99 0.23
100 0.12
101 0.14
102 0.16
103 0.15
104 0.14
105 0.12
106 0.11
107 0.11
108 0.11
109 0.1
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.08
116 0.07
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.12
121 0.12
122 0.12
123 0.13
124 0.16
125 0.17
126 0.18
127 0.17
128 0.14
129 0.13
130 0.14
131 0.13
132 0.1
133 0.07
134 0.07
135 0.09
136 0.1
137 0.11
138 0.11
139 0.12
140 0.16
141 0.2
142 0.24
143 0.22
144 0.23
145 0.26
146 0.25
147 0.26
148 0.24
149 0.2
150 0.16
151 0.16
152 0.15
153 0.11
154 0.1
155 0.09
156 0.08
157 0.08
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.15
167 0.17
168 0.19
169 0.21
170 0.21
171 0.22
172 0.24
173 0.23
174 0.2
175 0.19
176 0.19
177 0.16
178 0.14
179 0.13
180 0.1
181 0.09
182 0.07
183 0.06
184 0.04
185 0.03
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.05
191 0.05
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.1
196 0.18
197 0.21
198 0.26
199 0.3
200 0.31
201 0.37
202 0.39
203 0.43
204 0.41
205 0.41
206 0.38
207 0.34
208 0.34
209 0.29
210 0.26
211 0.22
212 0.18
213 0.16
214 0.14
215 0.14
216 0.13
217 0.14
218 0.13
219 0.11
220 0.1
221 0.08
222 0.09
223 0.09
224 0.09
225 0.08
226 0.08
227 0.09
228 0.08
229 0.09
230 0.11
231 0.17
232 0.2
233 0.24
234 0.29
235 0.31
236 0.33
237 0.34
238 0.32
239 0.31
240 0.29
241 0.26
242 0.2
243 0.18
244 0.15
245 0.14
246 0.13
247 0.08
248 0.06
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.05
257 0.06
258 0.06
259 0.08
260 0.1
261 0.12
262 0.14
263 0.16
264 0.16
265 0.17
266 0.19
267 0.18
268 0.16
269 0.14
270 0.15
271 0.14
272 0.15
273 0.13
274 0.1
275 0.09
276 0.09
277 0.1
278 0.08
279 0.07
280 0.05
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.07
286 0.07
287 0.08
288 0.08
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.1
293 0.09
294 0.09
295 0.08
296 0.07
297 0.06
298 0.06
299 0.05
300 0.04
301 0.03
302 0.02
303 0.02
304 0.02
305 0.02
306 0.03
307 0.04
308 0.05
309 0.06
310 0.08
311 0.09
312 0.1
313 0.11
314 0.14
315 0.19
316 0.28
317 0.37
318 0.42
319 0.45
320 0.47
321 0.46
322 0.46
323 0.42
324 0.37
325 0.34
326 0.3
327 0.29
328 0.27
329 0.29
330 0.3
331 0.29
332 0.26
333 0.2
334 0.18
335 0.17
336 0.17
337 0.17
338 0.15
339 0.18
340 0.17
341 0.17
342 0.17
343 0.18
344 0.18
345 0.17
346 0.16
347 0.14
348 0.14
349 0.17
350 0.19
351 0.17
352 0.19
353 0.23
354 0.24
355 0.24
356 0.26
357 0.24
358 0.29
359 0.32
360 0.33
361 0.33
362 0.34
363 0.44
364 0.5
365 0.53
366 0.51
367 0.53
368 0.57
369 0.61
370 0.67
371 0.68
372 0.69
373 0.75
374 0.8
375 0.86
376 0.89
377 0.89
378 0.92
379 0.91
380 0.92
381 0.91
382 0.91
383 0.91
384 0.87
385 0.78
386 0.73
387 0.7
388 0.64
389 0.58
390 0.49
391 0.41
392 0.38