FuNGI

A0A0C9XS18

Protein Details

Accession

A0A0C9XS18

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
213-240	QPLINRLSKPPCCRKCRGKHSTEQHIDQ	Hydrophilic
259-294	GAPYQRQQPQQQQQHQQPSRGKGRSRRGRGHGQGRG	Hydrophilic
438-463	LSHDHTSSKNSRRRRRGIKVTLQEFH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
278-290	RGKGRSRRGRGHG
449-453	RRRRR

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 10.5, cyto 6.5, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF14223 Retrotran_gag_2 PF00665 rve PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE

Amino Acid Sequences

MADQKETSVSKNIPCLNGSNYASWKAMIKGYFMTLDVWGVVDGTIALPGGPDASIAAWHTKNQRGMGTILLYCDPVISVSLDSKSTAKDMWDHLATTYGAPMAVSAYTDFLRLMKLRINPNDDLGSKLAEFNMVLGALATQQLAIAEPLQCMILCGAFSDKWGQGPVNILSSVQAKDLKINDVIARLKELSSHRTGQSNLPKLESRIQATSSQPLINRLSKPPCCRKCRGKHSTEQHIDQGQSSQGHGSFRGRGQNHGGAPYQRQQPQQQQQHQQPSRGKGRSRRGRGHGQGRGGFHTVDFSDIPEESQEYSQEYDQEYNDQEETGQYDDQYDKGYESYNVEVTALDINTANRFEDFEEDITPVPTYNPEPVEQLILAHVLFVSAIQPTELVFGYYRVFPFTCHNGTSDSNIGHNRPESSEAQVQLWVDSDVPREELLSHDHTSSKNSRRRRRGIKVTLQEFHASVSEHRYPEPVRYVNIPDDYRLDVLGASGFSYGCNDDEFSLYPCELEVNPSTNFVSKNCMWMLDSGCSHHVTPYRKDFMTYSVINETQFAGTAGNEPVCLRGRGTVVLRLENGKYLTLREVIHGDFSKRLCSQNQLLKSGYTATATKRHEVIRTPDGRVVLKAECLSTLRLHWFYGVPVHSSSVLQTVDLGIVTKDDYTLWHNCLGHPGVSVMKNCKRHIKGIPAELIAKPLNSCQGCAQGKLASDPFHPSDKRASAPLALVHGDLLELPNESYYRSRYVLTLLDDYSSFGFCLYLRQKSDTLARFTEWLATVERQCGCMLKTFRSDRGGEFMGNEFKSLLNSKGIVHELSIAHQPQQNGRAEWFNCTILEKAGSIRHHACVPKRFWNFAFDSALHVYNRTPLRRCNWKTPCELFLGKIPDISYLRVFGCLAYVWIPKELRKDKLEPHAEEMVFLGYEVATKGYRFLHGQKVIIARTAKFVEDVFPYCTDDRKGYKSDNHDQPVTDQPPEDEEIPTDEQMDNGPDQPMDGRPQSRSQSPEDFNPPRNGDEDQYPGPPDIPPQRATPCSNQPPSQNIPQKRPMPREFNHRITRPPLRPGNVYGERRHPTEIEREIRDKQDALHDILRKTEEGAERIKSAIRERRFEDLYSHQDAERFRQAKEAEQPPPSTEDQPSAGPSRFPGALEETSKEMSFAQILSAHVKQAPEQYRDVLRLPKPEQTRWFDAMRDELKLIEERKVWTLVKPPSGRKLVKSRWVFAVKSDGRYKARLIAKGFTQEYGIDFEDTFSPVARFETVRILLAHAVQNNWEMEAVDVKTAFLYGKLDEEIYMEQLEGFKVKGQEHMVYRLLRSLYGLKQAALSWNKELHQSLL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.41
3	0.38
4	0.42
5	0.41
6	0.38
7	0.37
8	0.37
9	0.36
10	0.33
11	0.32
12	0.26
13	0.29
14	0.24
15	0.23
16	0.22
17	0.24
18	0.24
19	0.22
20	0.21
21	0.16
22	0.16
23	0.13
24	0.12
25	0.1
26	0.09
27	0.08
28	0.06
29	0.06
30	0.05
31	0.05
32	0.05
33	0.05
34	0.04
35	0.05
36	0.05
37	0.05
38	0.05
39	0.05
40	0.05
41	0.07
42	0.08
43	0.14
44	0.15
45	0.2
46	0.27
47	0.33
48	0.38
49	0.4
50	0.41
51	0.38
52	0.38
53	0.37
54	0.34
55	0.29
56	0.26
57	0.23
58	0.21
59	0.18
60	0.16
61	0.13
62	0.09
63	0.09
64	0.09
65	0.09
66	0.12
67	0.14
68	0.14
69	0.16
70	0.17
71	0.17
72	0.18
73	0.18
74	0.17
75	0.2
76	0.23
77	0.28
78	0.28
79	0.27
80	0.26
81	0.28
82	0.26
83	0.22
84	0.19
85	0.13
86	0.11
87	0.1
88	0.1
89	0.08
90	0.07
91	0.07
92	0.07
93	0.09
94	0.09
95	0.1
96	0.1
97	0.1
98	0.14
99	0.14
100	0.16
101	0.2
102	0.26
103	0.35
104	0.42
105	0.47
106	0.45
107	0.47
108	0.51
109	0.45
110	0.42
111	0.34
112	0.3
113	0.24
114	0.23
115	0.19
116	0.15
117	0.14
118	0.11
119	0.11
120	0.08
121	0.08
122	0.07
123	0.07
124	0.06
125	0.07
126	0.06
127	0.05
128	0.05
129	0.05
130	0.06
131	0.06
132	0.08
133	0.08
134	0.08
135	0.09
136	0.09
137	0.09
138	0.09
139	0.09
140	0.08
141	0.07
142	0.08
143	0.1
144	0.1
145	0.12
146	0.15
147	0.15
148	0.16
149	0.18
150	0.18
151	0.16
152	0.21
153	0.21
154	0.2
155	0.19
156	0.18
157	0.17
158	0.2
159	0.19
160	0.18
161	0.2
162	0.17
163	0.22
164	0.24
165	0.26
166	0.24
167	0.26
168	0.24
169	0.26
170	0.29
171	0.25
172	0.26
173	0.24
174	0.23
175	0.26
176	0.28
177	0.29
178	0.31
179	0.35
180	0.33
181	0.37
182	0.39
183	0.42
184	0.49
185	0.51
186	0.47
187	0.47
188	0.47
189	0.46
190	0.51
191	0.47
192	0.41
193	0.36
194	0.37
195	0.37
196	0.37
197	0.39
198	0.34
199	0.32
200	0.29
201	0.31
202	0.34
203	0.35
204	0.36
205	0.39
206	0.45
207	0.5
208	0.58
209	0.65
210	0.69
211	0.71
212	0.77
213	0.8
214	0.82
215	0.86
216	0.87
217	0.84
218	0.84
219	0.86
220	0.88
221	0.84
222	0.77
223	0.71
224	0.65
225	0.57
226	0.48
227	0.4
228	0.32
229	0.26
230	0.23
231	0.19
232	0.17
233	0.17
234	0.18
235	0.19
236	0.2
237	0.23
238	0.31
239	0.29
240	0.32
241	0.37
242	0.41
243	0.4
244	0.39
245	0.39
246	0.33
247	0.36
248	0.4
249	0.41
250	0.4
251	0.43
252	0.47
253	0.55
254	0.62
255	0.68
256	0.7
257	0.72
258	0.76
259	0.82
260	0.79
261	0.77
262	0.73
263	0.71
264	0.72
265	0.69
266	0.67
267	0.66
268	0.73
269	0.75
270	0.78
271	0.79
272	0.76
273	0.8
274	0.82
275	0.83
276	0.78
277	0.74
278	0.69
279	0.62
280	0.58
281	0.49
282	0.4
283	0.3
284	0.26
285	0.19
286	0.17
287	0.15
288	0.12
289	0.12
290	0.12
291	0.12
292	0.1
293	0.11
294	0.11
295	0.11
296	0.11
297	0.11
298	0.13
299	0.13
300	0.15
301	0.16
302	0.16
303	0.16
304	0.18
305	0.18
306	0.18
307	0.18
308	0.16
309	0.14
310	0.12
311	0.13
312	0.13
313	0.11
314	0.09
315	0.11
316	0.12
317	0.12
318	0.14
319	0.13
320	0.11
321	0.11
322	0.13
323	0.12
324	0.14
325	0.16
326	0.14
327	0.14
328	0.14
329	0.13
330	0.12
331	0.13
332	0.1
333	0.09
334	0.09
335	0.09
336	0.11
337	0.12
338	0.11
339	0.09
340	0.1
341	0.1
342	0.13
343	0.14
344	0.13
345	0.14
346	0.14
347	0.15
348	0.15
349	0.14
350	0.11
351	0.09
352	0.1
353	0.1
354	0.13
355	0.15
356	0.15
357	0.17
358	0.17
359	0.18
360	0.16
361	0.15
362	0.11
363	0.1
364	0.09
365	0.07
366	0.06
367	0.05
368	0.04
369	0.04
370	0.04
371	0.04
372	0.04
373	0.04
374	0.04
375	0.04
376	0.06
377	0.06
378	0.07
379	0.07
380	0.08
381	0.09
382	0.11
383	0.11
384	0.12
385	0.12
386	0.12
387	0.17
388	0.22
389	0.23
390	0.22
391	0.23
392	0.24
393	0.25
394	0.27
395	0.25
396	0.2
397	0.2
398	0.22
399	0.22
400	0.2
401	0.21
402	0.19
403	0.17
404	0.21
405	0.19
406	0.22
407	0.25
408	0.24
409	0.24
410	0.24
411	0.22
412	0.18
413	0.18
414	0.13
415	0.09
416	0.09
417	0.1
418	0.09
419	0.1
420	0.1
421	0.09
422	0.09
423	0.1
424	0.13
425	0.16
426	0.16
427	0.16
428	0.18
429	0.19
430	0.24
431	0.31
432	0.36
433	0.39
434	0.48
435	0.57
436	0.65
437	0.75
438	0.8
439	0.83
440	0.84
441	0.87
442	0.87
443	0.86
444	0.82
445	0.74
446	0.66
447	0.56
448	0.45
449	0.36
450	0.27
451	0.18
452	0.13
453	0.17
454	0.19
455	0.19
456	0.19
457	0.21
458	0.21
459	0.24
460	0.3
461	0.25
462	0.23
463	0.25
464	0.28
465	0.28
466	0.32
467	0.28
468	0.23
469	0.24
470	0.23
471	0.21
472	0.17
473	0.14
474	0.09
475	0.09
476	0.08
477	0.06
478	0.05
479	0.05
480	0.05
481	0.05
482	0.06
483	0.06
484	0.06
485	0.06
486	0.07
487	0.07
488	0.08
489	0.09
490	0.1
491	0.11
492	0.1
493	0.1
494	0.09
495	0.1
496	0.09
497	0.11
498	0.1
499	0.12
500	0.13
501	0.14
502	0.15
503	0.15
504	0.16
505	0.14
506	0.18
507	0.16
508	0.19
509	0.18
510	0.18
511	0.16
512	0.18
513	0.2
514	0.17
515	0.16
516	0.14
517	0.16
518	0.16
519	0.16
520	0.16
521	0.2
522	0.21
523	0.26
524	0.31
525	0.35
526	0.33
527	0.34
528	0.32
529	0.31
530	0.32
531	0.27
532	0.22
533	0.21
534	0.21
535	0.2
536	0.2
537	0.17
538	0.11
539	0.11
540	0.09
541	0.06
542	0.06
543	0.08
544	0.08
545	0.07
546	0.07
547	0.07
548	0.09
549	0.11
550	0.11
551	0.09
552	0.11
553	0.11
554	0.14
555	0.15
556	0.17
557	0.17
558	0.18
559	0.18
560	0.18
561	0.17
562	0.17
563	0.16
564	0.12
565	0.11
566	0.11
567	0.12
568	0.13
569	0.13
570	0.12
571	0.13
572	0.13
573	0.15
574	0.15
575	0.15
576	0.15
577	0.16
578	0.18
579	0.17
580	0.2
581	0.18
582	0.21
583	0.26
584	0.3
585	0.33
586	0.32
587	0.31
588	0.29
589	0.28
590	0.25
591	0.2
592	0.14
593	0.12
594	0.12
595	0.19
596	0.2
597	0.21
598	0.23
599	0.24
600	0.25
601	0.27
602	0.31
603	0.32
604	0.33
605	0.34
606	0.33
607	0.32
608	0.31
609	0.27
610	0.24
611	0.16
612	0.14
613	0.13
614	0.11
615	0.1
616	0.1
617	0.11
618	0.09
619	0.1
620	0.12
621	0.12
622	0.12
623	0.12
624	0.12
625	0.11
626	0.14
627	0.13
628	0.12
629	0.11
630	0.12
631	0.11
632	0.11
633	0.11
634	0.1
635	0.09
636	0.08
637	0.07
638	0.07
639	0.06
640	0.06
641	0.06
642	0.03
643	0.04
644	0.04
645	0.04
646	0.04
647	0.04
648	0.05
649	0.08
650	0.1
651	0.11
652	0.14
653	0.15
654	0.15
655	0.18
656	0.17
657	0.14
658	0.13
659	0.12
660	0.11
661	0.13
662	0.14
663	0.17
664	0.22
665	0.27
666	0.29
667	0.36
668	0.36
669	0.4
670	0.43
671	0.47
672	0.46
673	0.45
674	0.46
675	0.39
676	0.39
677	0.33
678	0.31
679	0.21
680	0.17
681	0.13
682	0.1
683	0.15
684	0.13
685	0.14
686	0.12
687	0.2
688	0.21
689	0.21
690	0.22
691	0.18
692	0.18
693	0.19
694	0.2
695	0.12
696	0.13
697	0.15
698	0.16
699	0.19
700	0.19
701	0.19
702	0.23
703	0.23
704	0.24
705	0.22
706	0.21
707	0.17
708	0.18
709	0.17
710	0.13
711	0.12
712	0.11
713	0.09
714	0.08
715	0.07
716	0.06
717	0.05
718	0.04
719	0.04
720	0.04
721	0.04
722	0.05
723	0.06
724	0.07
725	0.08
726	0.11
727	0.12
728	0.13
729	0.12
730	0.15
731	0.16
732	0.17
733	0.17
734	0.15
735	0.14
736	0.14
737	0.14
738	0.12
739	0.1
740	0.07
741	0.06
742	0.06
743	0.05
744	0.12
745	0.14
746	0.18
747	0.19
748	0.22
749	0.23
750	0.24
751	0.32
752	0.29
753	0.3
754	0.27
755	0.26
756	0.24
757	0.24
758	0.24
759	0.18
760	0.15
761	0.13
762	0.14
763	0.14
764	0.17
765	0.17
766	0.15
767	0.15
768	0.15
769	0.13
770	0.18
771	0.2
772	0.19
773	0.26
774	0.28
775	0.31
776	0.33
777	0.34
778	0.28
779	0.31
780	0.29
781	0.22
782	0.2
783	0.19
784	0.2
785	0.18
786	0.18
787	0.13
788	0.12
789	0.13
790	0.14
791	0.13
792	0.1
793	0.11
794	0.11
795	0.13
796	0.15
797	0.13
798	0.12
799	0.13
800	0.12
801	0.13
802	0.16
803	0.14
804	0.15
805	0.17
806	0.17
807	0.17
808	0.23
809	0.24
810	0.22
811	0.23
812	0.27
813	0.25
814	0.28
815	0.27
816	0.22
817	0.2
818	0.2
819	0.19
820	0.14
821	0.14
822	0.11
823	0.11
824	0.14
825	0.15
826	0.18
827	0.19
828	0.2
829	0.23
830	0.26
831	0.31
832	0.34
833	0.38
834	0.43
835	0.45
836	0.47
837	0.44
838	0.45
839	0.42
840	0.38
841	0.37
842	0.27
843	0.28
844	0.26
845	0.27
846	0.21
847	0.19
848	0.16
849	0.19
850	0.23
851	0.24
852	0.25
853	0.28
854	0.34
855	0.45
856	0.5
857	0.54
858	0.58
859	0.6
860	0.65
861	0.64
862	0.6
863	0.54
864	0.5
865	0.4
866	0.37
867	0.36
868	0.28
869	0.26
870	0.23
871	0.22
872	0.22
873	0.23
874	0.18
875	0.15
876	0.15
877	0.15
878	0.14
879	0.1
880	0.1
881	0.08
882	0.08
883	0.09
884	0.1
885	0.1
886	0.14
887	0.15
888	0.17
889	0.26
890	0.3
891	0.34
892	0.37
893	0.41
894	0.43
895	0.52
896	0.58
897	0.51
898	0.51
899	0.51
900	0.47
901	0.42
902	0.36
903	0.27
904	0.18
905	0.16
906	0.11
907	0.04
908	0.05
909	0.05
910	0.06
911	0.06
912	0.06
913	0.08
914	0.09
915	0.11
916	0.13
917	0.17
918	0.25
919	0.28
920	0.28
921	0.3
922	0.33
923	0.32
924	0.34
925	0.31
926	0.23
927	0.24
928	0.24
929	0.21
930	0.18
931	0.17
932	0.15
933	0.17
934	0.18
935	0.17
936	0.17
937	0.19
938	0.19
939	0.21
940	0.21
941	0.22
942	0.24
943	0.26
944	0.29
945	0.31
946	0.37
947	0.43
948	0.51
949	0.55
950	0.56
951	0.53
952	0.49
953	0.48
954	0.51
955	0.45
956	0.36
957	0.27
958	0.23
959	0.24
960	0.26
961	0.24
962	0.15
963	0.13
964	0.16
965	0.18
966	0.17
967	0.16
968	0.14
969	0.13
970	0.14
971	0.15
972	0.11
973	0.11
974	0.11
975	0.09
976	0.1
977	0.11
978	0.12
979	0.15
980	0.18
981	0.19
982	0.21
983	0.28
984	0.31
985	0.34
986	0.36
987	0.37
988	0.42
989	0.42
990	0.45
991	0.49
992	0.51
993	0.5
994	0.54
995	0.5
996	0.43
997	0.43
998	0.39
999	0.31
1000	0.3
1001	0.3
1002	0.25
1003	0.25
1004	0.25
1005	0.23
1006	0.22
1007	0.19
1008	0.21
1009	0.24
1010	0.26
1011	0.26
1012	0.3
1013	0.34
1014	0.38
1015	0.42
1016	0.44
1017	0.46
1018	0.51
1019	0.55
1020	0.54
1021	0.53
1022	0.55
1023	0.56
1024	0.59
1025	0.58
1026	0.55
1027	0.57
1028	0.62
1029	0.67
1030	0.69
1031	0.72
1032	0.7
1033	0.7
1034	0.69
1035	0.72
1036	0.71
1037	0.73
1038	0.73
1039	0.67
1040	0.64
1041	0.63
1042	0.68
1043	0.63
1044	0.63
1045	0.61
1046	0.56
1047	0.56
1048	0.55
1049	0.57
1050	0.56
1051	0.56
1052	0.51
1053	0.53
1054	0.52
1055	0.51
1056	0.49
1057	0.41
1058	0.35
1059	0.39
1060	0.44
1061	0.42
1062	0.43
1063	0.46
1064	0.47
1065	0.49
1066	0.48
1067	0.4
1068	0.33
1069	0.35
1070	0.33
1071	0.33
1072	0.35
1073	0.37
1074	0.35
1075	0.37
1076	0.37
1077	0.29
1078	0.27
1079	0.28
1080	0.26
1081	0.24
1082	0.28
1083	0.27
1084	0.26
1085	0.27
1086	0.28
1087	0.25
1088	0.3
1089	0.36
1090	0.38
1091	0.41
1092	0.43
1093	0.5
1094	0.5
1095	0.48
1096	0.45
1097	0.43
1098	0.44
1099	0.44
1100	0.42
1101	0.36
1102	0.37
1103	0.37
1104	0.37
1105	0.4
1106	0.35
1107	0.3
1108	0.35
1109	0.36
1110	0.39
1111	0.47
1112	0.49
1113	0.45
1114	0.48
1115	0.49
1116	0.44
1117	0.48
1118	0.44
1119	0.38
1120	0.32
1121	0.29
1122	0.27
1123	0.27
1124	0.28
1125	0.28
1126	0.25
1127	0.23
1128	0.22
1129	0.22
1130	0.21
1131	0.2
1132	0.19
1133	0.2
1134	0.23
1135	0.25
1136	0.26
1137	0.25
1138	0.26
1139	0.26
1140	0.23
1141	0.18
1142	0.15
1143	0.14
1144	0.12
1145	0.11
1146	0.11
1147	0.13
1148	0.17
1149	0.17
1150	0.18
1151	0.19
1152	0.19
1153	0.2
1154	0.27
1155	0.33
1156	0.32
1157	0.34
1158	0.36
1159	0.38
1160	0.4
1161	0.42
1162	0.41
1163	0.38
1164	0.43
1165	0.44
1166	0.47
1167	0.5
1168	0.54
1169	0.59
1170	0.59
1171	0.61
1172	0.57
1173	0.56
1174	0.51
1175	0.47
1176	0.48
1177	0.41
1178	0.36
1179	0.29
1180	0.26
1181	0.26
1182	0.29
1183	0.28
1184	0.25
1185	0.26
1186	0.26
1187	0.29
1188	0.33
1189	0.32
1190	0.3
1191	0.37
1192	0.39
1193	0.45
1194	0.5
1195	0.52
1196	0.56
1197	0.64
1198	0.64
1199	0.63
1200	0.67
1201	0.67
1202	0.7
1203	0.7
1204	0.65
1205	0.65
1206	0.68
1207	0.61
1208	0.53
1209	0.55
1210	0.49
1211	0.5
1212	0.52
1213	0.5
1214	0.47
1215	0.5
1216	0.49
1217	0.46
1218	0.49
1219	0.48
1220	0.46
1221	0.44
1222	0.44
1223	0.5
1224	0.49
1225	0.41
1226	0.35
1227	0.3
1228	0.28
1229	0.27
1230	0.24
1231	0.17
1232	0.16
1233	0.17
1234	0.17
1235	0.17
1236	0.16
1237	0.13
1238	0.12
1239	0.11
1240	0.13
1241	0.14
1242	0.14
1243	0.14
1244	0.22
1245	0.22
1246	0.24
1247	0.24
1248	0.24
1249	0.23
1250	0.26
1251	0.28
1252	0.22
1253	0.22
1254	0.2
1255	0.23
1256	0.21
1257	0.2
1258	0.17
1259	0.13
1260	0.12
1261	0.16
1262	0.16
1263	0.14
1264	0.14
1265	0.14
1266	0.13
1267	0.14
1268	0.13
1269	0.1
1270	0.11
1271	0.1
1272	0.12
1273	0.13
1274	0.14
1275	0.13
1276	0.16
1277	0.16
1278	0.15
1279	0.15
1280	0.12
1281	0.12
1282	0.12
1283	0.13
1284	0.11
1285	0.11
1286	0.13
1287	0.16
1288	0.17
1289	0.23
1290	0.26
1291	0.32
1292	0.35
1293	0.4
1294	0.42
1295	0.4
1296	0.4
1297	0.4
1298	0.36
1299	0.3
1300	0.29
1301	0.3
1302	0.28
1303	0.34
1304	0.35
1305	0.3
1306	0.31
1307	0.32
1308	0.37
1309	0.36
1310	0.35
1311	0.32
1312	0.35
1313	0.36
1314	0.39

A0A0C9XS18

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer