FuNGI

A0A0C9YZQ2

Protein Details

Accession

A0A0C9YZQ2

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
5-29	FSESLLFHKKKPNVKKEPSTTPPSG	Hydrophilic
163-188	QKGKGNTNGKKKAQRKTRQVFKVPDD	Hydrophilic
237-259	FVPAHRWYKFHKKPKHHIPDLQE	Basic
588-613	ATSNGNAQPKPKKRKPLPSGPPTDGE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
164-179	KGKGNTNGKKKAQRKT
597-603	KPKKRKP

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, mito 4, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MAPKFSESLLFHKKKPNVKKEPSTTPPSGSQGTSTPGTPRKSVPPRPQPALPVADADDGTKLPDGEFSEYKLMSSALNGWKYDVMRFDSRKLIDVSTWEAPIKLNRKELRRQETVEEQVPVRPMLGPDGKPVIGTDGRIVMVDADGRPISNSTGEESVKEKDQKGKGNTNGKKKAQRKTRQVFKVPDDVRQLRREERYPWVMEDARRNEVWVGQLEEISKAETHALLMPAQQDVFKFVPAHRWYKFHKKPKHHIPDLQEAESIMARIQKNKDPERWLLHRRQGQGPSSATAAMFKADPDAVVGGAPLVYNAAQSRGPGGRSLMSVNRGSRGLDEDEEGNGRRVKKEDDAEGHMDEQLFDDDVADDDEHEAQDMDEDEAKELEERLKREYKLANKQREGYIDESEDEEGESQLTKDGKFLKKLVRKLDKNVAYESDEERDPYASSDENEEEEEPPLVTNEPAIQPQPQQTKTRPPSQQPPSKPSQPSVVNATNGVGSRAVSPAPAAGMGGHSVVAKRATSPKVPKSSVSRGNSPLGGTSSRAGSPTGSRATSPAASTSRSPVGLPPGSPATSQKRKATDDLSGAASPTATSNGNAQPKPKKRKPLPSGPPTDGELEEKMLIDWLQNTPNARTRDCIQHFTPYLTSEAKKARFTAMVKEVAQLKNSILILKSALRGESAAGSPVATGAT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.65
2	0.73
3	0.75
4	0.75
5	0.81
6	0.87
7	0.86
8	0.89
9	0.87
10	0.84
11	0.77
12	0.7
13	0.65
14	0.59
15	0.53
16	0.44
17	0.38
18	0.32
19	0.33
20	0.29
21	0.26
22	0.28
23	0.32
24	0.35
25	0.36
26	0.38
27	0.44
28	0.53
29	0.62
30	0.65
31	0.7
32	0.74
33	0.78
34	0.77
35	0.72
36	0.68
37	0.62
38	0.52
39	0.44
40	0.38
41	0.34
42	0.3
43	0.25
44	0.2
45	0.15
46	0.16
47	0.14
48	0.12
49	0.1
50	0.13
51	0.15
52	0.2
53	0.2
54	0.22
55	0.26
56	0.26
57	0.25
58	0.23
59	0.21
60	0.15
61	0.15
62	0.19
63	0.21
64	0.25
65	0.25
66	0.25
67	0.29
68	0.29
69	0.31
70	0.28
71	0.27
72	0.32
73	0.35
74	0.37
75	0.41
76	0.41
77	0.43
78	0.41
79	0.37
80	0.3
81	0.3
82	0.32
83	0.27
84	0.27
85	0.23
86	0.22
87	0.22
88	0.28
89	0.33
90	0.32
91	0.39
92	0.43
93	0.5
94	0.59
95	0.68
96	0.69
97	0.68
98	0.66
99	0.63
100	0.65
101	0.64
102	0.58
103	0.5
104	0.43
105	0.38
106	0.36
107	0.3
108	0.23
109	0.18
110	0.15
111	0.19
112	0.24
113	0.22
114	0.24
115	0.27
116	0.26
117	0.25
118	0.25
119	0.24
120	0.19
121	0.19
122	0.17
123	0.15
124	0.15
125	0.15
126	0.15
127	0.1
128	0.09
129	0.1
130	0.09
131	0.1
132	0.09
133	0.1
134	0.1
135	0.11
136	0.11
137	0.11
138	0.12
139	0.12
140	0.16
141	0.16
142	0.17
143	0.19
144	0.2
145	0.24
146	0.28
147	0.28
148	0.33
149	0.39
150	0.46
151	0.5
152	0.57
153	0.59
154	0.66
155	0.71
156	0.73
157	0.76
158	0.75
159	0.78
160	0.77
161	0.78
162	0.79
163	0.82
164	0.82
165	0.83
166	0.86
167	0.85
168	0.86
169	0.84
170	0.77
171	0.78
172	0.68
173	0.63
174	0.62
175	0.58
176	0.55
177	0.53
178	0.52
179	0.48
180	0.52
181	0.49
182	0.45
183	0.46
184	0.47
185	0.44
186	0.41
187	0.41
188	0.39
189	0.39
190	0.43
191	0.4
192	0.37
193	0.35
194	0.34
195	0.29
196	0.27
197	0.26
198	0.19
199	0.18
200	0.14
201	0.15
202	0.15
203	0.15
204	0.14
205	0.13
206	0.1
207	0.08
208	0.08
209	0.07
210	0.08
211	0.09
212	0.09
213	0.09
214	0.1
215	0.1
216	0.1
217	0.1
218	0.1
219	0.08
220	0.12
221	0.12
222	0.12
223	0.13
224	0.13
225	0.22
226	0.26
227	0.32
228	0.29
229	0.34
230	0.38
231	0.48
232	0.58
233	0.59
234	0.64
235	0.69
236	0.77
237	0.83
238	0.88
239	0.84
240	0.8
241	0.76
242	0.77
243	0.71
244	0.61
245	0.5
246	0.4
247	0.33
248	0.27
249	0.21
250	0.11
251	0.12
252	0.11
253	0.16
254	0.19
255	0.23
256	0.31
257	0.36
258	0.41
259	0.41
260	0.46
261	0.48
262	0.53
263	0.56
264	0.55
265	0.58
266	0.57
267	0.56
268	0.57
269	0.55
270	0.5
271	0.48
272	0.41
273	0.35
274	0.3
275	0.26
276	0.2
277	0.15
278	0.13
279	0.09
280	0.07
281	0.06
282	0.07
283	0.06
284	0.06
285	0.05
286	0.05
287	0.05
288	0.05
289	0.05
290	0.03
291	0.03
292	0.03
293	0.03
294	0.03
295	0.03
296	0.03
297	0.04
298	0.05
299	0.06
300	0.06
301	0.09
302	0.1
303	0.1
304	0.1
305	0.11
306	0.11
307	0.11
308	0.13
309	0.12
310	0.14
311	0.17
312	0.16
313	0.17
314	0.16
315	0.16
316	0.14
317	0.15
318	0.14
319	0.12
320	0.12
321	0.11
322	0.11
323	0.12
324	0.12
325	0.11
326	0.12
327	0.12
328	0.13
329	0.14
330	0.16
331	0.19
332	0.21
333	0.24
334	0.25
335	0.28
336	0.29
337	0.28
338	0.26
339	0.22
340	0.19
341	0.15
342	0.12
343	0.08
344	0.06
345	0.05
346	0.05
347	0.04
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.04
352	0.05
353	0.05
354	0.05
355	0.05
356	0.05
357	0.04
358	0.05
359	0.05
360	0.05
361	0.07
362	0.07
363	0.07
364	0.07
365	0.08
366	0.07
367	0.07
368	0.11
369	0.13
370	0.14
371	0.19
372	0.24
373	0.24
374	0.28
375	0.34
376	0.38
377	0.46
378	0.54
379	0.58
380	0.56
381	0.58
382	0.56
383	0.53
384	0.47
385	0.39
386	0.32
387	0.24
388	0.21
389	0.2
390	0.17
391	0.14
392	0.11
393	0.09
394	0.07
395	0.06
396	0.06
397	0.05
398	0.07
399	0.08
400	0.08
401	0.11
402	0.18
403	0.21
404	0.24
405	0.29
406	0.35
407	0.41
408	0.47
409	0.54
410	0.57
411	0.58
412	0.61
413	0.67
414	0.63
415	0.59
416	0.55
417	0.47
418	0.39
419	0.37
420	0.33
421	0.26
422	0.19
423	0.18
424	0.16
425	0.15
426	0.13
427	0.12
428	0.12
429	0.1
430	0.1
431	0.13
432	0.13
433	0.13
434	0.14
435	0.14
436	0.13
437	0.13
438	0.13
439	0.1
440	0.09
441	0.09
442	0.08
443	0.07
444	0.07
445	0.08
446	0.09
447	0.1
448	0.11
449	0.12
450	0.14
451	0.21
452	0.28
453	0.3
454	0.34
455	0.37
456	0.47
457	0.51
458	0.58
459	0.57
460	0.56
461	0.62
462	0.67
463	0.73
464	0.68
465	0.69
466	0.67
467	0.69
468	0.65
469	0.57
470	0.55
471	0.49
472	0.45
473	0.46
474	0.42
475	0.35
476	0.33
477	0.31
478	0.25
479	0.22
480	0.2
481	0.12
482	0.09
483	0.1
484	0.1
485	0.1
486	0.08
487	0.08
488	0.07
489	0.07
490	0.06
491	0.06
492	0.05
493	0.05
494	0.06
495	0.06
496	0.06
497	0.06
498	0.06
499	0.08
500	0.09
501	0.08
502	0.11
503	0.18
504	0.21
505	0.28
506	0.37
507	0.44
508	0.51
509	0.53
510	0.55
511	0.56
512	0.61
513	0.63
514	0.6
515	0.57
516	0.53
517	0.54
518	0.51
519	0.43
520	0.35
521	0.29
522	0.25
523	0.2
524	0.17
525	0.16
526	0.15
527	0.16
528	0.15
529	0.14
530	0.15
531	0.19
532	0.21
533	0.2
534	0.2
535	0.2
536	0.24
537	0.24
538	0.22
539	0.22
540	0.2
541	0.21
542	0.23
543	0.26
544	0.25
545	0.23
546	0.23
547	0.21
548	0.26
549	0.26
550	0.25
551	0.25
552	0.25
553	0.26
554	0.26
555	0.3
556	0.32
557	0.39
558	0.45
559	0.48
560	0.51
561	0.54
562	0.58
563	0.56
564	0.52
565	0.47
566	0.43
567	0.41
568	0.34
569	0.3
570	0.25
571	0.21
572	0.16
573	0.12
574	0.12
575	0.09
576	0.09
577	0.14
578	0.21
579	0.29
580	0.3
581	0.36
582	0.45
583	0.54
584	0.65
585	0.68
586	0.73
587	0.75
588	0.85
589	0.87
590	0.88
591	0.88
592	0.88
593	0.88
594	0.81
595	0.74
596	0.65
597	0.58
598	0.48
599	0.41
600	0.31
601	0.25
602	0.22
603	0.19
604	0.17
605	0.15
606	0.13
607	0.11
608	0.12
609	0.13
610	0.15
611	0.18
612	0.2
613	0.24
614	0.31
615	0.34
616	0.33
617	0.35
618	0.37
619	0.45
620	0.48
621	0.5
622	0.45
623	0.5
624	0.5
625	0.5
626	0.47
627	0.38
628	0.37
629	0.35
630	0.33
631	0.31
632	0.38
633	0.39
634	0.4
635	0.4
636	0.41
637	0.43
638	0.44
639	0.46
640	0.44
641	0.46
642	0.43
643	0.46
644	0.48
645	0.44
646	0.43
647	0.35
648	0.29
649	0.28
650	0.28
651	0.27
652	0.2
653	0.19
654	0.2
655	0.22
656	0.25
657	0.21
658	0.21
659	0.19
660	0.19
661	0.19
662	0.2
663	0.18
664	0.16
665	0.14
666	0.14
667	0.13

A0A0C9YZQ2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer