Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9YCU1

Protein Details
Accession A0A0C9YCU1    Localization Confidence Low Confidence Score 5.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MATSRAKTQKREPATRRTQAWHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 22.5, cyto_mito 12.5, nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
Amino Acid Sequences MATSRAKTQKREPATRRTQAWTGARASPTFSPANPPARLPNGPPPSNQGAFPPLAGANGSRAQDPPQPQPQDRIVQSLTGLIVRPPPSLLPPSQIAVQGTTITLTTKGGLRYEGAVSSTGPEGDKQGITLKDVKEISKPGTPLKDTLFLPSSSIDTWQSGPADAKVPNGDSFRTDAEISNKAKLARERELQAWKSPEDASSGAAAVHEGLGDEATFGPGAGANVSWDQFAVNEQMFGVTTSFNEEFYTTKLDRNAPDFKEREKKAQRIASEIMGSTTNNPHLAEERGLAIDDSGINEEDKYGAVVRGANAYVPPGARRQPQQTAGASTTTGTPPKPEIPKVSVNGPDGNVVTGQKETTPPTAKSTSPAPSTSSATKPPADPVPAFRDFVTNERQRLTQKKQALVKSEMDKRKAELIKFSQTFKLNKPIPDDLVSILAKDEEKQRLIREKASHDAGSVTARAIGTPATLSTSSSASRMPQVPAKVVAEAARKAASPANVPTKPAPSTPAATSAKLPALKPAEAGKTNGKVAGMYIQPIPPFKGSKARSPAPQANGSASNTAVPTSPTSAANRLNANASSFRPNPKANAFTPGPTSPIPSAASASASASPKPKAEESSPATPNPFFGPKVVLKKGLGLVNVKDEFNPFKSNKDAEAGSVSAIWPYSGKRYSHMFPNVQHQTPQQPTSMAPPGPPPVAHPVYEEGEQRFVYIPYYHGQHVMHGMAPPPPGAYVSSPFMQPMPYPPGMPPNGQPMYAASPMQMPPPQYMPPPGTYPPPPNGAGPRPSMPPTPTPMHAHPYYHQSPQLQHAVPYPMMIPPGGPGGPPHPYEGGPAPPPMGGVGHA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.84
3 0.79
4 0.76
5 0.7
6 0.68
7 0.67
8 0.62
9 0.56
10 0.53
11 0.51
12 0.45
13 0.44
14 0.37
15 0.36
16 0.32
17 0.28
18 0.3
19 0.35
20 0.42
21 0.4
22 0.4
23 0.42
24 0.46
25 0.49
26 0.46
27 0.5
28 0.51
29 0.52
30 0.51
31 0.52
32 0.53
33 0.51
34 0.46
35 0.39
36 0.34
37 0.32
38 0.31
39 0.26
40 0.19
41 0.18
42 0.18
43 0.15
44 0.14
45 0.18
46 0.19
47 0.18
48 0.19
49 0.22
50 0.28
51 0.33
52 0.37
53 0.42
54 0.49
55 0.49
56 0.55
57 0.57
58 0.59
59 0.55
60 0.53
61 0.44
62 0.38
63 0.36
64 0.32
65 0.26
66 0.19
67 0.18
68 0.13
69 0.18
70 0.19
71 0.19
72 0.18
73 0.19
74 0.22
75 0.26
76 0.27
77 0.25
78 0.26
79 0.27
80 0.28
81 0.29
82 0.26
83 0.22
84 0.22
85 0.18
86 0.15
87 0.14
88 0.12
89 0.1
90 0.1
91 0.09
92 0.09
93 0.12
94 0.14
95 0.14
96 0.15
97 0.16
98 0.18
99 0.19
100 0.18
101 0.16
102 0.15
103 0.14
104 0.14
105 0.14
106 0.12
107 0.11
108 0.11
109 0.12
110 0.14
111 0.14
112 0.13
113 0.19
114 0.18
115 0.21
116 0.27
117 0.25
118 0.29
119 0.31
120 0.31
121 0.3
122 0.33
123 0.33
124 0.32
125 0.34
126 0.33
127 0.38
128 0.39
129 0.37
130 0.37
131 0.39
132 0.34
133 0.38
134 0.35
135 0.28
136 0.27
137 0.25
138 0.24
139 0.18
140 0.2
141 0.16
142 0.14
143 0.16
144 0.17
145 0.17
146 0.16
147 0.17
148 0.16
149 0.19
150 0.18
151 0.19
152 0.18
153 0.19
154 0.22
155 0.22
156 0.21
157 0.19
158 0.21
159 0.2
160 0.2
161 0.19
162 0.18
163 0.21
164 0.27
165 0.27
166 0.28
167 0.29
168 0.28
169 0.32
170 0.35
171 0.37
172 0.37
173 0.4
174 0.41
175 0.45
176 0.52
177 0.5
178 0.51
179 0.48
180 0.41
181 0.38
182 0.35
183 0.29
184 0.24
185 0.22
186 0.17
187 0.14
188 0.14
189 0.11
190 0.1
191 0.1
192 0.07
193 0.06
194 0.05
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.05
202 0.05
203 0.04
204 0.04
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.06
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.06
215 0.06
216 0.08
217 0.09
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.08
225 0.06
226 0.06
227 0.11
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.12
233 0.13
234 0.19
235 0.15
236 0.18
237 0.21
238 0.24
239 0.26
240 0.31
241 0.37
242 0.34
243 0.41
244 0.4
245 0.43
246 0.49
247 0.49
248 0.54
249 0.55
250 0.58
251 0.59
252 0.62
253 0.57
254 0.53
255 0.53
256 0.45
257 0.37
258 0.31
259 0.24
260 0.19
261 0.18
262 0.14
263 0.14
264 0.13
265 0.13
266 0.13
267 0.12
268 0.14
269 0.16
270 0.15
271 0.13
272 0.13
273 0.12
274 0.12
275 0.11
276 0.09
277 0.07
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.08
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.08
297 0.08
298 0.09
299 0.08
300 0.09
301 0.11
302 0.14
303 0.18
304 0.22
305 0.27
306 0.32
307 0.36
308 0.39
309 0.38
310 0.38
311 0.35
312 0.31
313 0.25
314 0.2
315 0.18
316 0.14
317 0.14
318 0.11
319 0.11
320 0.13
321 0.19
322 0.22
323 0.24
324 0.26
325 0.3
326 0.35
327 0.35
328 0.37
329 0.35
330 0.33
331 0.32
332 0.28
333 0.24
334 0.19
335 0.18
336 0.14
337 0.1
338 0.09
339 0.08
340 0.08
341 0.07
342 0.09
343 0.1
344 0.15
345 0.19
346 0.19
347 0.24
348 0.26
349 0.26
350 0.26
351 0.28
352 0.27
353 0.25
354 0.25
355 0.23
356 0.23
357 0.25
358 0.26
359 0.25
360 0.24
361 0.24
362 0.24
363 0.22
364 0.23
365 0.22
366 0.22
367 0.2
368 0.2
369 0.24
370 0.25
371 0.25
372 0.23
373 0.22
374 0.2
375 0.23
376 0.27
377 0.24
378 0.24
379 0.24
380 0.26
381 0.29
382 0.36
383 0.39
384 0.38
385 0.4
386 0.44
387 0.49
388 0.51
389 0.52
390 0.48
391 0.46
392 0.45
393 0.48
394 0.47
395 0.44
396 0.41
397 0.36
398 0.41
399 0.4
400 0.34
401 0.32
402 0.31
403 0.36
404 0.37
405 0.38
406 0.34
407 0.35
408 0.37
409 0.33
410 0.38
411 0.33
412 0.34
413 0.37
414 0.34
415 0.32
416 0.32
417 0.3
418 0.21
419 0.21
420 0.19
421 0.14
422 0.13
423 0.11
424 0.09
425 0.09
426 0.13
427 0.12
428 0.14
429 0.16
430 0.19
431 0.27
432 0.29
433 0.33
434 0.32
435 0.33
436 0.35
437 0.37
438 0.34
439 0.26
440 0.24
441 0.2
442 0.17
443 0.14
444 0.1
445 0.08
446 0.08
447 0.07
448 0.07
449 0.06
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.06
455 0.06
456 0.07
457 0.08
458 0.09
459 0.09
460 0.1
461 0.09
462 0.12
463 0.14
464 0.14
465 0.17
466 0.17
467 0.18
468 0.2
469 0.2
470 0.16
471 0.15
472 0.17
473 0.16
474 0.16
475 0.15
476 0.14
477 0.13
478 0.14
479 0.15
480 0.13
481 0.12
482 0.16
483 0.23
484 0.23
485 0.25
486 0.26
487 0.27
488 0.27
489 0.26
490 0.25
491 0.19
492 0.21
493 0.2
494 0.26
495 0.25
496 0.24
497 0.25
498 0.23
499 0.24
500 0.24
501 0.23
502 0.2
503 0.22
504 0.21
505 0.21
506 0.23
507 0.24
508 0.23
509 0.26
510 0.24
511 0.24
512 0.24
513 0.23
514 0.2
515 0.15
516 0.15
517 0.16
518 0.12
519 0.11
520 0.12
521 0.13
522 0.14
523 0.15
524 0.16
525 0.14
526 0.16
527 0.16
528 0.24
529 0.25
530 0.32
531 0.39
532 0.41
533 0.43
534 0.49
535 0.53
536 0.49
537 0.5
538 0.43
539 0.39
540 0.38
541 0.34
542 0.27
543 0.21
544 0.18
545 0.14
546 0.13
547 0.11
548 0.09
549 0.09
550 0.11
551 0.12
552 0.13
553 0.15
554 0.19
555 0.21
556 0.24
557 0.24
558 0.22
559 0.23
560 0.21
561 0.22
562 0.2
563 0.19
564 0.22
565 0.23
566 0.27
567 0.3
568 0.31
569 0.33
570 0.36
571 0.39
572 0.34
573 0.38
574 0.35
575 0.31
576 0.34
577 0.31
578 0.28
579 0.23
580 0.26
581 0.19
582 0.2
583 0.2
584 0.16
585 0.17
586 0.14
587 0.15
588 0.12
589 0.13
590 0.14
591 0.14
592 0.16
593 0.17
594 0.18
595 0.19
596 0.22
597 0.23
598 0.23
599 0.24
600 0.31
601 0.34
602 0.4
603 0.42
604 0.4
605 0.4
606 0.36
607 0.35
608 0.3
609 0.27
610 0.19
611 0.17
612 0.22
613 0.25
614 0.33
615 0.34
616 0.34
617 0.31
618 0.34
619 0.37
620 0.34
621 0.31
622 0.26
623 0.25
624 0.28
625 0.3
626 0.27
627 0.23
628 0.23
629 0.24
630 0.24
631 0.3
632 0.24
633 0.25
634 0.31
635 0.32
636 0.31
637 0.31
638 0.28
639 0.23
640 0.25
641 0.22
642 0.17
643 0.16
644 0.14
645 0.11
646 0.1
647 0.09
648 0.07
649 0.08
650 0.14
651 0.19
652 0.2
653 0.23
654 0.28
655 0.31
656 0.4
657 0.46
658 0.44
659 0.41
660 0.51
661 0.54
662 0.5
663 0.49
664 0.43
665 0.44
666 0.45
667 0.44
668 0.35
669 0.3
670 0.29
671 0.33
672 0.37
673 0.28
674 0.24
675 0.26
676 0.28
677 0.29
678 0.28
679 0.24
680 0.27
681 0.28
682 0.28
683 0.26
684 0.27
685 0.28
686 0.31
687 0.31
688 0.24
689 0.25
690 0.24
691 0.23
692 0.21
693 0.18
694 0.18
695 0.16
696 0.16
697 0.15
698 0.19
699 0.18
700 0.21
701 0.2
702 0.2
703 0.22
704 0.21
705 0.2
706 0.18
707 0.18
708 0.18
709 0.18
710 0.17
711 0.14
712 0.13
713 0.12
714 0.13
715 0.15
716 0.15
717 0.18
718 0.19
719 0.19
720 0.19
721 0.19
722 0.18
723 0.16
724 0.19
725 0.23
726 0.23
727 0.24
728 0.24
729 0.32
730 0.33
731 0.35
732 0.32
733 0.34
734 0.34
735 0.33
736 0.32
737 0.27
738 0.3
739 0.29
740 0.27
741 0.18
742 0.2
743 0.21
744 0.25
745 0.24
746 0.21
747 0.22
748 0.25
749 0.28
750 0.26
751 0.31
752 0.31
753 0.32
754 0.35
755 0.34
756 0.36
757 0.4
758 0.43
759 0.41
760 0.43
761 0.41
762 0.4
763 0.45
764 0.46
765 0.45
766 0.44
767 0.43
768 0.43
769 0.45
770 0.45
771 0.41
772 0.4
773 0.42
774 0.42
775 0.43
776 0.46
777 0.46
778 0.49
779 0.48
780 0.47
781 0.44
782 0.48
783 0.47
784 0.45
785 0.46
786 0.43
787 0.43
788 0.46
789 0.51
790 0.43
791 0.41
792 0.41
793 0.41
794 0.37
795 0.34
796 0.29
797 0.21
798 0.21
799 0.19
800 0.15
801 0.11
802 0.15
803 0.14
804 0.13
805 0.14
806 0.17
807 0.23
808 0.24
809 0.26
810 0.24
811 0.24
812 0.28
813 0.3
814 0.32
815 0.29
816 0.29
817 0.27
818 0.24
819 0.24
820 0.21