FuNGI

A0A0C9Y028

Protein Details

Accession

A0A0C9Y028

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
274-381	SDDERSREKKRKRGSSKMKEPRKLKRRKTKDDSESESDDRSKTKKRKKNSKREEDSDDDSSAKSSRKRKRRSKHSDSSSEDESEEDRKKKHKRKSKKRRDTSSDEDSE	Basic
385-419	EDRDRKSTSKSKSSKSKKSSSKKLSTVKRQHSPSP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
279-326	SREKKRKRGSSKMKEPRKLKRRKTKDDSESESDDRSKTKKRKKNSKRE
335-347	AKSSRKRKRRSKH
359-372	DRKKKHKRKSKKRR
389-408	RKSTSKSKSSKSKKSSSKKL

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MSNRKLSADELKLHQAALSANDKILPVQETVKLIPDAAARTAAINFLLGAGMFKALANAGGVTALRAVAKNEIEIKKDMTPEEAMVLSHIQASGNEGIWTKHLKAKTELHQTVIDRCLKSLAQKQLVKSIKAVRHPTRKIYMLAHLEPSVELTGGPWYTDNELDAEFIKLLSSACLHYIRDRSFPKQSSKRVAQNQIRLYAIGAAPSYPSAQQIQHFLSKSKITETELGVEHVEMLLRVLELDGEIEKIPAFSANAWSPPSDSEDGSDSESDSSDDERSREKKRKRGSSKMKEPRKLKRRKTKDDSESESDDRSKTKKRKKNSKREEDSDDDSSAKSSRKRKRRSKHSDSSSEDESEEDRKKKHKRKSKKRRDTSSDEDSESSEEDRDRKSTSKSKSSKSKKSSSKKLSTVKRQHSPSPDLRDELSGGAFVYRAIRQERVVLGWSQAPCGRCPVFDFCRDKGPTNPQECVYFEDWFALGANSQKDTATAAVKVEV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.31
3	0.26
4	0.26
5	0.26
6	0.2
7	0.19
8	0.21
9	0.2
10	0.19
11	0.21
12	0.17
13	0.15
14	0.17
15	0.2
16	0.22
17	0.22
18	0.26
19	0.24
20	0.22
21	0.22
22	0.22
23	0.21
24	0.19
25	0.2
26	0.16
27	0.17
28	0.17
29	0.15
30	0.12
31	0.1
32	0.09
33	0.07
34	0.07
35	0.06
36	0.06
37	0.06
38	0.06
39	0.06
40	0.05
41	0.06
42	0.06
43	0.06
44	0.06
45	0.06
46	0.05
47	0.06
48	0.06
49	0.06
50	0.06
51	0.07
52	0.07
53	0.08
54	0.09
55	0.13
56	0.13
57	0.16
58	0.24
59	0.26
60	0.28
61	0.3
62	0.32
63	0.31
64	0.33
65	0.32
66	0.26
67	0.25
68	0.22
69	0.22
70	0.19
71	0.16
72	0.14
73	0.14
74	0.11
75	0.1
76	0.1
77	0.08
78	0.07
79	0.11
80	0.11
81	0.11
82	0.12
83	0.12
84	0.12
85	0.15
86	0.18
87	0.17
88	0.21
89	0.23
90	0.25
91	0.31
92	0.38
93	0.44
94	0.52
95	0.51
96	0.49
97	0.51
98	0.49
99	0.47
100	0.46
101	0.43
102	0.32
103	0.31
104	0.31
105	0.27
106	0.32
107	0.35
108	0.37
109	0.4
110	0.44
111	0.45
112	0.51
113	0.55
114	0.5
115	0.46
116	0.46
117	0.42
118	0.47
119	0.55
120	0.55
121	0.61
122	0.64
123	0.65
124	0.63
125	0.61
126	0.56
127	0.5
128	0.48
129	0.44
130	0.41
131	0.37
132	0.32
133	0.29
134	0.25
135	0.24
136	0.16
137	0.1
138	0.08
139	0.06
140	0.08
141	0.08
142	0.08
143	0.07
144	0.08
145	0.09
146	0.1
147	0.1
148	0.09
149	0.09
150	0.09
151	0.09
152	0.09
153	0.07
154	0.07
155	0.07
156	0.06
157	0.06
158	0.06
159	0.06
160	0.06
161	0.09
162	0.1
163	0.11
164	0.15
165	0.2
166	0.22
167	0.28
168	0.31
169	0.34
170	0.4
171	0.44
172	0.51
173	0.53
174	0.58
175	0.6
176	0.63
177	0.67
178	0.67
179	0.72
180	0.69
181	0.69
182	0.65
183	0.59
184	0.53
185	0.44
186	0.36
187	0.28
188	0.21
189	0.14
190	0.1
191	0.08
192	0.08
193	0.08
194	0.08
195	0.06
196	0.07
197	0.08
198	0.1
199	0.11
200	0.14
201	0.16
202	0.2
203	0.2
204	0.2
205	0.21
206	0.21
207	0.21
208	0.19
209	0.19
210	0.17
211	0.19
212	0.19
213	0.2
214	0.18
215	0.18
216	0.16
217	0.14
218	0.12
219	0.09
220	0.08
221	0.04
222	0.04
223	0.03
224	0.03
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.03
231	0.04
232	0.04
233	0.04
234	0.04
235	0.04
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.04
240	0.07
241	0.08
242	0.09
243	0.1
244	0.1
245	0.1
246	0.11
247	0.14
248	0.12
249	0.12
250	0.11
251	0.13
252	0.13
253	0.14
254	0.13
255	0.1
256	0.09
257	0.09
258	0.08
259	0.07
260	0.08
261	0.08
262	0.09
263	0.1
264	0.15
265	0.2
266	0.28
267	0.37
268	0.43
269	0.5
270	0.59
271	0.69
272	0.73
273	0.79
274	0.83
275	0.84
276	0.88
277	0.9
278	0.9
279	0.87
280	0.86
281	0.85
282	0.85
283	0.84
284	0.83
285	0.84
286	0.86
287	0.88
288	0.89
289	0.89
290	0.88
291	0.86
292	0.83
293	0.77
294	0.71
295	0.62
296	0.55
297	0.45
298	0.37
299	0.31
300	0.28
301	0.33
302	0.37
303	0.47
304	0.52
305	0.62
306	0.72
307	0.81
308	0.88
309	0.89
310	0.91
311	0.89
312	0.88
313	0.85
314	0.79
315	0.73
316	0.65
317	0.55
318	0.44
319	0.35
320	0.29
321	0.24
322	0.22
323	0.23
324	0.3
325	0.38
326	0.48
327	0.59
328	0.68
329	0.77
330	0.85
331	0.9
332	0.91
333	0.92
334	0.91
335	0.9
336	0.85
337	0.8
338	0.71
339	0.61
340	0.51
341	0.41
342	0.33
343	0.29
344	0.29
345	0.27
346	0.28
347	0.36
348	0.46
349	0.55
350	0.64
351	0.68
352	0.74
353	0.82
354	0.9
355	0.93
356	0.93
357	0.95
358	0.96
359	0.94
360	0.91
361	0.88
362	0.86
363	0.78
364	0.69
365	0.59
366	0.49
367	0.41
368	0.33
369	0.26
370	0.18
371	0.15
372	0.16
373	0.17
374	0.19
375	0.21
376	0.23
377	0.3
378	0.37
379	0.43
380	0.51
381	0.56
382	0.63
383	0.71
384	0.78
385	0.81
386	0.81
387	0.83
388	0.83
389	0.86
390	0.88
391	0.88
392	0.87
393	0.86
394	0.87
395	0.87
396	0.87
397	0.88
398	0.86
399	0.84
400	0.8
401	0.78
402	0.77
403	0.75
404	0.72
405	0.71
406	0.65
407	0.58
408	0.54
409	0.48
410	0.42
411	0.34
412	0.26
413	0.17
414	0.13
415	0.11
416	0.1
417	0.08
418	0.1
419	0.1
420	0.14
421	0.17
422	0.19
423	0.2
424	0.25
425	0.26
426	0.26
427	0.27
428	0.24
429	0.23
430	0.26
431	0.25
432	0.24
433	0.25
434	0.24
435	0.23
436	0.29
437	0.28
438	0.23
439	0.27
440	0.33
441	0.35
442	0.43
443	0.48
444	0.43
445	0.52
446	0.54
447	0.53
448	0.53
449	0.58
450	0.58
451	0.58
452	0.59
453	0.52
454	0.52
455	0.5
456	0.49
457	0.41
458	0.33
459	0.28
460	0.26
461	0.24
462	0.2
463	0.2
464	0.14
465	0.12
466	0.15
467	0.17
468	0.16
469	0.17
470	0.17
471	0.16
472	0.18
473	0.2
474	0.18
475	0.17

A0A0C9Y028

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer