Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9YDA9

Protein Details
Accession A0A0C9YDA9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
162-188FKHLEKDEKKSRKSKKSRRHNYSSSSEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
166-180EKDEKKSRKSKKSRR
Subcellular Location(s) mito 9, cyto_nucl 8, nucl 7.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045341  DUF6532  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF20149  DUF6532  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MTWRSTLKAKACEYVVWHYLLGGNRLAEENLANAQELIWGVKFVRDGVEDGTTRNMASPALAGLVIDFFYATLSALGNLFLEVFAREVPKPVVCLAATALRAAIDEYAIMGIRQDHQFESSTYSKVFMQLMAMQTKIDGNRKHAAMTRALRVNPKSYIGHAFKHLEKDEKKSRKSKKSRRHNYSSSSEDSPSSDDSSDNSHTSDDSGSDSSDESSLTQNSDNTSSTEMVQPPIPVVIPLEGVGDVTMEDDSTEGAIVEPILPVDYDGSDDVYAFQQFVTEGTAYVKDGNVPSKNCMFILSHHLTDKAREFYVRKVSGNPYKWQLSDFFTELFNYCFPIDFHLWQREKLQSCYQNSKTVKEYLYELNELWNMIGETDEGNKAYKFWFGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.41
3 0.34
4 0.31
5 0.26
6 0.28
7 0.28
8 0.26
9 0.21
10 0.18
11 0.18
12 0.19
13 0.19
14 0.16
15 0.14
16 0.13
17 0.13
18 0.13
19 0.12
20 0.11
21 0.11
22 0.11
23 0.11
24 0.11
25 0.08
26 0.09
27 0.09
28 0.11
29 0.12
30 0.11
31 0.13
32 0.13
33 0.14
34 0.16
35 0.21
36 0.19
37 0.2
38 0.22
39 0.2
40 0.19
41 0.18
42 0.16
43 0.11
44 0.11
45 0.11
46 0.08
47 0.08
48 0.08
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.05
54 0.05
55 0.04
56 0.04
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.05
68 0.05
69 0.05
70 0.06
71 0.06
72 0.09
73 0.09
74 0.12
75 0.14
76 0.14
77 0.15
78 0.15
79 0.17
80 0.15
81 0.15
82 0.14
83 0.17
84 0.16
85 0.15
86 0.14
87 0.11
88 0.11
89 0.11
90 0.09
91 0.05
92 0.04
93 0.04
94 0.05
95 0.05
96 0.04
97 0.05
98 0.05
99 0.09
100 0.1
101 0.11
102 0.11
103 0.13
104 0.15
105 0.15
106 0.2
107 0.19
108 0.19
109 0.18
110 0.19
111 0.17
112 0.18
113 0.18
114 0.12
115 0.12
116 0.13
117 0.16
118 0.16
119 0.16
120 0.13
121 0.13
122 0.15
123 0.16
124 0.2
125 0.19
126 0.23
127 0.28
128 0.28
129 0.3
130 0.32
131 0.32
132 0.33
133 0.34
134 0.35
135 0.34
136 0.35
137 0.38
138 0.36
139 0.37
140 0.31
141 0.31
142 0.26
143 0.24
144 0.3
145 0.28
146 0.28
147 0.28
148 0.3
149 0.28
150 0.32
151 0.32
152 0.32
153 0.31
154 0.37
155 0.44
156 0.49
157 0.54
158 0.58
159 0.67
160 0.7
161 0.8
162 0.82
163 0.83
164 0.86
165 0.9
166 0.9
167 0.89
168 0.85
169 0.81
170 0.76
171 0.7
172 0.63
173 0.54
174 0.45
175 0.36
176 0.3
177 0.25
178 0.19
179 0.16
180 0.12
181 0.1
182 0.1
183 0.13
184 0.14
185 0.13
186 0.13
187 0.12
188 0.11
189 0.12
190 0.11
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.07
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.07
200 0.06
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.09
206 0.1
207 0.12
208 0.12
209 0.11
210 0.13
211 0.12
212 0.13
213 0.15
214 0.15
215 0.14
216 0.15
217 0.14
218 0.12
219 0.11
220 0.1
221 0.07
222 0.07
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.05
251 0.04
252 0.05
253 0.06
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.07
261 0.07
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.08
266 0.07
267 0.07
268 0.08
269 0.09
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.12
275 0.18
276 0.21
277 0.22
278 0.26
279 0.28
280 0.29
281 0.27
282 0.27
283 0.22
284 0.19
285 0.27
286 0.27
287 0.26
288 0.26
289 0.29
290 0.27
291 0.3
292 0.32
293 0.27
294 0.24
295 0.27
296 0.28
297 0.32
298 0.42
299 0.42
300 0.38
301 0.4
302 0.47
303 0.52
304 0.55
305 0.53
306 0.49
307 0.49
308 0.48
309 0.45
310 0.39
311 0.34
312 0.34
313 0.31
314 0.26
315 0.22
316 0.23
317 0.22
318 0.21
319 0.17
320 0.15
321 0.13
322 0.13
323 0.13
324 0.17
325 0.21
326 0.23
327 0.29
328 0.37
329 0.38
330 0.39
331 0.44
332 0.46
333 0.46
334 0.48
335 0.51
336 0.5
337 0.55
338 0.63
339 0.62
340 0.63
341 0.62
342 0.61
343 0.56
344 0.54
345 0.48
346 0.4
347 0.4
348 0.38
349 0.4
350 0.38
351 0.33
352 0.31
353 0.3
354 0.29
355 0.24
356 0.19
357 0.14
358 0.12
359 0.12
360 0.09
361 0.09
362 0.12
363 0.14
364 0.13
365 0.15
366 0.15
367 0.16
368 0.16