Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9Y3C9

Protein Details
Accession A0A0C9Y3C9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
511-536WEQKLQTEDLRRRNGKRKREETEMSQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
522-528RRNGKRK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10.5, cyto 10, nucl 9, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR016059  DNA_ligase_ATP-dep_CS  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00697  DNA_LIGASE_A1  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
Amino Acid Sequences MEQFMVLWDPSKMLLQMYKVRARLDEAAMGFEAGGILVQARPRCGIPIEVPKSAKGRCPQHALELLDSCDRIWAETKYDGERAQIHVSYSSGGEMNISIFSKSKRDSTLDRVAVHPIIKEALSAMPSQPIILDAEMVAFSEQRNAIDEFWRIRGLIAHSAEGPRSKIISGKGEQAHDSHSLDTCPSLHSNCSSDSSDGLHLALVFFDVLLVGHASFLNVPYAMRRSVLESTVREIPGRAIIAKRELISSGPEIGIEIASKKLREVWAQKIVDCEEGLVLKSGESVYGDWRLPWVKLKKDYVPGHGDTIDLVVVAAGWDKDRARELRVPPSILTTFYVGALGNSSQMKANPDVKPHYIVYFTASYGMTREQLEEFNFWMRSDAVDSQEELSGLPYTYSMLQTLPKPSVFVASPILVELCGAGFTKSPQCKYYELRFPRITKTFRQSERSFTECLTLRELQTIAYAAVGREAQDVNEYGDLEEWSRRLWGKQSEDKMQSDKKPVKLLHSRDEWEQKLQTEDLRRRNGKRKREETEMSQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.21
3 0.29
4 0.36
5 0.42
6 0.43
7 0.44
8 0.43
9 0.45
10 0.44
11 0.39
12 0.37
13 0.31
14 0.3
15 0.29
16 0.27
17 0.22
18 0.16
19 0.13
20 0.07
21 0.06
22 0.03
23 0.04
24 0.06
25 0.1
26 0.11
27 0.13
28 0.15
29 0.16
30 0.18
31 0.19
32 0.22
33 0.26
34 0.36
35 0.39
36 0.44
37 0.45
38 0.46
39 0.5
40 0.48
41 0.48
42 0.46
43 0.49
44 0.5
45 0.56
46 0.55
47 0.57
48 0.61
49 0.57
50 0.52
51 0.46
52 0.42
53 0.36
54 0.34
55 0.26
56 0.22
57 0.19
58 0.16
59 0.17
60 0.17
61 0.19
62 0.23
63 0.26
64 0.26
65 0.3
66 0.29
67 0.28
68 0.29
69 0.29
70 0.3
71 0.28
72 0.25
73 0.23
74 0.23
75 0.21
76 0.18
77 0.15
78 0.11
79 0.1
80 0.09
81 0.08
82 0.08
83 0.09
84 0.1
85 0.09
86 0.11
87 0.13
88 0.18
89 0.2
90 0.23
91 0.25
92 0.3
93 0.35
94 0.41
95 0.49
96 0.49
97 0.48
98 0.45
99 0.44
100 0.42
101 0.37
102 0.29
103 0.2
104 0.17
105 0.15
106 0.14
107 0.11
108 0.1
109 0.11
110 0.11
111 0.11
112 0.12
113 0.12
114 0.12
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.09
119 0.08
120 0.06
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.06
125 0.05
126 0.05
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.12
131 0.13
132 0.14
133 0.16
134 0.19
135 0.18
136 0.2
137 0.2
138 0.17
139 0.16
140 0.18
141 0.19
142 0.22
143 0.21
144 0.2
145 0.21
146 0.22
147 0.23
148 0.21
149 0.19
150 0.13
151 0.13
152 0.13
153 0.15
154 0.17
155 0.22
156 0.22
157 0.29
158 0.31
159 0.31
160 0.32
161 0.29
162 0.29
163 0.25
164 0.24
165 0.18
166 0.16
167 0.15
168 0.14
169 0.14
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.12
175 0.14
176 0.15
177 0.16
178 0.19
179 0.19
180 0.17
181 0.17
182 0.18
183 0.16
184 0.15
185 0.13
186 0.1
187 0.08
188 0.08
189 0.07
190 0.05
191 0.04
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.02
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.12
213 0.14
214 0.16
215 0.18
216 0.17
217 0.19
218 0.22
219 0.23
220 0.19
221 0.18
222 0.16
223 0.15
224 0.14
225 0.13
226 0.1
227 0.11
228 0.13
229 0.15
230 0.14
231 0.13
232 0.13
233 0.12
234 0.12
235 0.12
236 0.11
237 0.09
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.07
242 0.06
243 0.05
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.1
249 0.12
250 0.17
251 0.21
252 0.25
253 0.33
254 0.33
255 0.34
256 0.33
257 0.32
258 0.28
259 0.23
260 0.17
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.07
265 0.06
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.06
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.11
277 0.12
278 0.12
279 0.19
280 0.23
281 0.26
282 0.31
283 0.36
284 0.38
285 0.46
286 0.48
287 0.46
288 0.46
289 0.42
290 0.38
291 0.34
292 0.29
293 0.2
294 0.18
295 0.12
296 0.07
297 0.05
298 0.03
299 0.03
300 0.03
301 0.03
302 0.03
303 0.03
304 0.05
305 0.06
306 0.07
307 0.11
308 0.13
309 0.17
310 0.24
311 0.27
312 0.35
313 0.37
314 0.38
315 0.34
316 0.37
317 0.33
318 0.27
319 0.25
320 0.17
321 0.14
322 0.13
323 0.13
324 0.09
325 0.08
326 0.08
327 0.07
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.1
333 0.12
334 0.16
335 0.22
336 0.23
337 0.27
338 0.31
339 0.32
340 0.34
341 0.33
342 0.3
343 0.24
344 0.22
345 0.21
346 0.18
347 0.16
348 0.15
349 0.14
350 0.13
351 0.13
352 0.13
353 0.12
354 0.11
355 0.12
356 0.11
357 0.13
358 0.15
359 0.15
360 0.15
361 0.17
362 0.17
363 0.16
364 0.16
365 0.14
366 0.13
367 0.15
368 0.16
369 0.15
370 0.15
371 0.16
372 0.16
373 0.16
374 0.16
375 0.12
376 0.12
377 0.09
378 0.09
379 0.08
380 0.06
381 0.07
382 0.08
383 0.09
384 0.08
385 0.08
386 0.11
387 0.14
388 0.18
389 0.19
390 0.18
391 0.19
392 0.18
393 0.21
394 0.18
395 0.18
396 0.17
397 0.15
398 0.15
399 0.14
400 0.14
401 0.1
402 0.1
403 0.08
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.06
409 0.09
410 0.17
411 0.22
412 0.25
413 0.27
414 0.3
415 0.34
416 0.41
417 0.47
418 0.49
419 0.51
420 0.57
421 0.61
422 0.61
423 0.65
424 0.66
425 0.62
426 0.59
427 0.62
428 0.62
429 0.62
430 0.68
431 0.62
432 0.62
433 0.64
434 0.59
435 0.52
436 0.43
437 0.43
438 0.37
439 0.37
440 0.34
441 0.3
442 0.28
443 0.29
444 0.29
445 0.22
446 0.2
447 0.19
448 0.13
449 0.12
450 0.12
451 0.09
452 0.11
453 0.1
454 0.1
455 0.12
456 0.12
457 0.11
458 0.13
459 0.14
460 0.14
461 0.15
462 0.15
463 0.13
464 0.14
465 0.14
466 0.13
467 0.15
468 0.13
469 0.12
470 0.15
471 0.17
472 0.18
473 0.25
474 0.33
475 0.39
476 0.48
477 0.55
478 0.6
479 0.65
480 0.66
481 0.66
482 0.66
483 0.63
484 0.64
485 0.65
486 0.61
487 0.64
488 0.63
489 0.64
490 0.66
491 0.67
492 0.66
493 0.66
494 0.64
495 0.63
496 0.7
497 0.64
498 0.6
499 0.57
500 0.5
501 0.46
502 0.45
503 0.43
504 0.44
505 0.5
506 0.53
507 0.6
508 0.66
509 0.71
510 0.79
511 0.82
512 0.83
513 0.85
514 0.86
515 0.83
516 0.84