Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D0A536

Protein Details
Accession A0A0D0A536    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MELPLRHRKFRTKLCRNFVTGKCHydrophilic
115-136ASPPSWQPGRKKYPCRHFTRTGHydrophilic
357-376SEFPFRPPKHQQVGHVRRITHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 10, cyto_nucl 9, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045877  ZFP36-like  
IPR041367  Znf-CCCH_4  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003729  F:mRNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PF18044  zf-CCCH_4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MELPLRHRKFRTKLCRNFVTGKCDYGEKCTFIHPTLAFPPQQQQSTSFFAVPSYPNWNASPPLPELMYPTQGSPLGGPLQSFAAHPQEISSIGDEQRASSLLLSTPSSVNTGYIASPPSWQPGRKKYPCRHFTRTGGWCPAGNRCKFIHDYSAVKSMKGGSSVIPHNSDAYNEDGRTISGGVRMAVLPAFNRSNQMNQSNQRPWYPYTGSVEPCSEWTTPSGFYWPVPCSVPHPFPVNTIHPPLAPTMGTGQGGYAQYPCAPDAYHLPAGAYEIAGTTYFPIVNAQPFCYDQAMPAPGYYQDCYQPRSVFPGFHSGETPSPYGSPEENYCGPLSQIGSESSPAQESQVAMDSHIDESEFPFRPPKHQQVGHVRRITVVVKKVDGPSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.87
3 0.84
4 0.83
5 0.78
6 0.76
7 0.67
8 0.59
9 0.51
10 0.49
11 0.43
12 0.41
13 0.4
14 0.33
15 0.32
16 0.34
17 0.35
18 0.31
19 0.37
20 0.3
21 0.3
22 0.33
23 0.36
24 0.33
25 0.32
26 0.38
27 0.37
28 0.39
29 0.36
30 0.35
31 0.35
32 0.39
33 0.4
34 0.32
35 0.27
36 0.25
37 0.26
38 0.24
39 0.22
40 0.23
41 0.22
42 0.24
43 0.26
44 0.27
45 0.27
46 0.27
47 0.28
48 0.23
49 0.24
50 0.21
51 0.2
52 0.24
53 0.24
54 0.26
55 0.23
56 0.21
57 0.22
58 0.22
59 0.22
60 0.16
61 0.16
62 0.15
63 0.15
64 0.14
65 0.12
66 0.13
67 0.13
68 0.13
69 0.13
70 0.14
71 0.14
72 0.14
73 0.14
74 0.13
75 0.14
76 0.15
77 0.14
78 0.12
79 0.13
80 0.15
81 0.15
82 0.14
83 0.14
84 0.14
85 0.12
86 0.1
87 0.1
88 0.09
89 0.11
90 0.11
91 0.11
92 0.11
93 0.11
94 0.12
95 0.11
96 0.11
97 0.1
98 0.1
99 0.09
100 0.1
101 0.11
102 0.1
103 0.12
104 0.12
105 0.17
106 0.19
107 0.23
108 0.29
109 0.38
110 0.49
111 0.56
112 0.66
113 0.7
114 0.77
115 0.82
116 0.84
117 0.82
118 0.78
119 0.75
120 0.74
121 0.71
122 0.66
123 0.61
124 0.53
125 0.47
126 0.41
127 0.44
128 0.42
129 0.36
130 0.34
131 0.3
132 0.34
133 0.35
134 0.35
135 0.32
136 0.27
137 0.29
138 0.29
139 0.37
140 0.33
141 0.3
142 0.28
143 0.24
144 0.21
145 0.2
146 0.17
147 0.09
148 0.13
149 0.16
150 0.17
151 0.17
152 0.17
153 0.17
154 0.16
155 0.16
156 0.13
157 0.15
158 0.15
159 0.13
160 0.13
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.11
165 0.07
166 0.07
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.06
174 0.05
175 0.08
176 0.09
177 0.08
178 0.1
179 0.11
180 0.14
181 0.17
182 0.2
183 0.23
184 0.25
185 0.32
186 0.34
187 0.35
188 0.34
189 0.33
190 0.31
191 0.31
192 0.3
193 0.26
194 0.27
195 0.29
196 0.28
197 0.27
198 0.26
199 0.21
200 0.21
201 0.2
202 0.15
203 0.12
204 0.12
205 0.12
206 0.12
207 0.12
208 0.13
209 0.11
210 0.11
211 0.14
212 0.14
213 0.14
214 0.14
215 0.14
216 0.16
217 0.2
218 0.22
219 0.21
220 0.24
221 0.23
222 0.25
223 0.29
224 0.3
225 0.27
226 0.28
227 0.27
228 0.23
229 0.23
230 0.21
231 0.18
232 0.13
233 0.11
234 0.1
235 0.11
236 0.11
237 0.1
238 0.09
239 0.11
240 0.11
241 0.11
242 0.09
243 0.08
244 0.09
245 0.1
246 0.1
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.12
251 0.17
252 0.18
253 0.17
254 0.17
255 0.16
256 0.17
257 0.17
258 0.12
259 0.06
260 0.05
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.05
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.08
269 0.08
270 0.14
271 0.15
272 0.15
273 0.16
274 0.17
275 0.19
276 0.2
277 0.18
278 0.14
279 0.18
280 0.19
281 0.17
282 0.16
283 0.15
284 0.15
285 0.17
286 0.18
287 0.15
288 0.2
289 0.22
290 0.25
291 0.29
292 0.29
293 0.27
294 0.34
295 0.34
296 0.29
297 0.28
298 0.35
299 0.32
300 0.31
301 0.32
302 0.27
303 0.28
304 0.29
305 0.28
306 0.19
307 0.17
308 0.18
309 0.19
310 0.18
311 0.19
312 0.18
313 0.23
314 0.24
315 0.25
316 0.25
317 0.22
318 0.21
319 0.2
320 0.18
321 0.14
322 0.14
323 0.14
324 0.15
325 0.16
326 0.16
327 0.15
328 0.16
329 0.14
330 0.14
331 0.14
332 0.13
333 0.14
334 0.18
335 0.17
336 0.16
337 0.18
338 0.18
339 0.17
340 0.17
341 0.15
342 0.1
343 0.13
344 0.2
345 0.19
346 0.19
347 0.27
348 0.28
349 0.36
350 0.45
351 0.52
352 0.55
353 0.58
354 0.67
355 0.7
356 0.79
357 0.81
358 0.77
359 0.67
360 0.58
361 0.58
362 0.53
363 0.49
364 0.46
365 0.41
366 0.38
367 0.42