Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6BY19

Protein Details
Accession Q6BY19    Localization Confidence High Confidence Score 24
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-33MAKSSTKSAKADKKQVKSKKQVKKQESSSESSSHydrophilic
103-129EEEAPKKEAKKDTKKVAKKEVKKEASSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-21KADKKQVKSKKQ
107-125PKKEAKKDTKKVAKKEVKK
406-406R
418-418R
423-424GR
Subcellular Location(s) nucl 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG dha:DEHA2A13134g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12447  RRM1_gar2  
Amino Acid Sequences MAKSSTKSAKADKKQVKSKKQVKKQESSSESSSSSSSESESSSSSESDSDSSDEEKEEEKKVSSDSDSSSDSESEAEVKKEKKDDSSDSDSDSSSSDSDSSDEEEAPKKEAKKDTKKVAKKEVKKEASSSSSSSSSESDSDSSSSSSSSSDSDSDSDSDSEEEEKDSKKRKVEESSEEVEESTEEPVSKKPKTNEEPATLFVGRLSWSIDDEWLRREFEPVGGVISARVIMERSTGKSRGYGYVDFDSKSAAEKALQEYQGKELDGRPINLDMSTGKPHASNPNTDRAKQFGDVPSAPSDTLFVGNLSFNAERDSLFNTFGEYGTVVSCRIPTHPDTQQPKGFGYVQFSSVDEAKAALEALNGEYLDGRACRLDFSTPRDNSNAPRGGFGGNRGGRGDFGGNRGGRGGFGGRGDFGGRGGFGGRERSAPPRSAPNSAEFKGTKKTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.88
3 0.89
4 0.89
5 0.9
6 0.9
7 0.91
8 0.92
9 0.91
10 0.91
11 0.89
12 0.89
13 0.85
14 0.8
15 0.74
16 0.67
17 0.58
18 0.49
19 0.41
20 0.31
21 0.26
22 0.2
23 0.17
24 0.15
25 0.15
26 0.14
27 0.15
28 0.16
29 0.16
30 0.16
31 0.15
32 0.14
33 0.14
34 0.14
35 0.14
36 0.14
37 0.14
38 0.15
39 0.15
40 0.15
41 0.16
42 0.18
43 0.2
44 0.22
45 0.22
46 0.22
47 0.23
48 0.23
49 0.25
50 0.24
51 0.24
52 0.24
53 0.25
54 0.26
55 0.26
56 0.26
57 0.22
58 0.2
59 0.17
60 0.15
61 0.16
62 0.15
63 0.16
64 0.2
65 0.23
66 0.27
67 0.32
68 0.34
69 0.36
70 0.41
71 0.45
72 0.48
73 0.53
74 0.5
75 0.48
76 0.47
77 0.41
78 0.35
79 0.29
80 0.22
81 0.14
82 0.14
83 0.1
84 0.09
85 0.1
86 0.1
87 0.12
88 0.12
89 0.12
90 0.14
91 0.18
92 0.19
93 0.21
94 0.25
95 0.25
96 0.31
97 0.39
98 0.48
99 0.54
100 0.62
101 0.69
102 0.76
103 0.81
104 0.82
105 0.84
106 0.84
107 0.83
108 0.84
109 0.84
110 0.81
111 0.75
112 0.7
113 0.65
114 0.6
115 0.53
116 0.45
117 0.37
118 0.31
119 0.29
120 0.27
121 0.22
122 0.19
123 0.17
124 0.16
125 0.14
126 0.13
127 0.13
128 0.13
129 0.12
130 0.11
131 0.1
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.1
138 0.1
139 0.11
140 0.12
141 0.12
142 0.13
143 0.12
144 0.11
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.09
149 0.1
150 0.1
151 0.13
152 0.18
153 0.25
154 0.29
155 0.33
156 0.38
157 0.43
158 0.5
159 0.54
160 0.56
161 0.54
162 0.54
163 0.5
164 0.45
165 0.38
166 0.3
167 0.23
168 0.16
169 0.11
170 0.07
171 0.06
172 0.07
173 0.11
174 0.16
175 0.18
176 0.23
177 0.26
178 0.35
179 0.4
180 0.48
181 0.5
182 0.5
183 0.49
184 0.46
185 0.46
186 0.36
187 0.31
188 0.22
189 0.17
190 0.12
191 0.11
192 0.1
193 0.06
194 0.07
195 0.07
196 0.09
197 0.1
198 0.1
199 0.13
200 0.13
201 0.15
202 0.14
203 0.15
204 0.14
205 0.13
206 0.13
207 0.1
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.06
212 0.05
213 0.05
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.06
219 0.07
220 0.1
221 0.13
222 0.15
223 0.15
224 0.17
225 0.19
226 0.21
227 0.23
228 0.21
229 0.21
230 0.23
231 0.24
232 0.22
233 0.2
234 0.17
235 0.13
236 0.14
237 0.11
238 0.08
239 0.08
240 0.1
241 0.13
242 0.17
243 0.19
244 0.19
245 0.19
246 0.21
247 0.21
248 0.2
249 0.17
250 0.14
251 0.19
252 0.2
253 0.2
254 0.19
255 0.18
256 0.18
257 0.17
258 0.17
259 0.11
260 0.11
261 0.13
262 0.13
263 0.12
264 0.12
265 0.15
266 0.23
267 0.24
268 0.29
269 0.29
270 0.39
271 0.41
272 0.42
273 0.42
274 0.36
275 0.37
276 0.3
277 0.32
278 0.25
279 0.28
280 0.26
281 0.27
282 0.26
283 0.24
284 0.23
285 0.18
286 0.16
287 0.11
288 0.12
289 0.09
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.08
294 0.1
295 0.1
296 0.09
297 0.11
298 0.11
299 0.11
300 0.12
301 0.15
302 0.13
303 0.14
304 0.14
305 0.13
306 0.14
307 0.13
308 0.13
309 0.09
310 0.09
311 0.08
312 0.09
313 0.08
314 0.07
315 0.08
316 0.09
317 0.1
318 0.13
319 0.16
320 0.22
321 0.27
322 0.36
323 0.41
324 0.48
325 0.5
326 0.48
327 0.46
328 0.43
329 0.41
330 0.33
331 0.33
332 0.27
333 0.25
334 0.24
335 0.23
336 0.22
337 0.2
338 0.18
339 0.13
340 0.11
341 0.1
342 0.09
343 0.09
344 0.07
345 0.06
346 0.06
347 0.07
348 0.08
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.09
354 0.08
355 0.09
356 0.09
357 0.09
358 0.11
359 0.12
360 0.18
361 0.21
362 0.28
363 0.38
364 0.38
365 0.41
366 0.43
367 0.44
368 0.42
369 0.47
370 0.46
371 0.37
372 0.37
373 0.35
374 0.34
375 0.33
376 0.31
377 0.32
378 0.27
379 0.29
380 0.28
381 0.27
382 0.25
383 0.26
384 0.28
385 0.2
386 0.21
387 0.26
388 0.25
389 0.25
390 0.27
391 0.24
392 0.2
393 0.2
394 0.19
395 0.14
396 0.16
397 0.16
398 0.15
399 0.16
400 0.17
401 0.15
402 0.13
403 0.12
404 0.1
405 0.1
406 0.1
407 0.11
408 0.12
409 0.18
410 0.18
411 0.2
412 0.23
413 0.3
414 0.34
415 0.36
416 0.38
417 0.43
418 0.46
419 0.49
420 0.49
421 0.5
422 0.53
423 0.5
424 0.54
425 0.45
426 0.44
427 0.48